MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011080	T	6	6	22746	22751	0 %	100 %	0 %	0 %	194445060
502	NC_011080	CT	3	6	22788	22793	0 %	50 %	0 %	50 %	194445060
503	NC_011080	GGT	2	6	22941	22946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194445060
504	NC_011080	CTA	2	6	22948	22953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194445060
505	NC_011080	CGG	2	6	22988	22993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445060
506	NC_011080	CTGG	2	8	22994	23001	0 %	25 %	50 %	25 %	194445060
507	NC_011080	TAT	2	6	23019	23024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445060
508	NC_011080	ATA	2	6	23045	23050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194445060
509	NC_011080	TTA	2	6	23160	23165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_011080	TCTTAA	2	12	23197	23208	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
511	NC_011080	TTAT	2	8	23259	23266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_011080	A	7	7	23332	23338	100 %	0 %	0 %	0 %	194444266
513	NC_011080	TGA	2	6	23339	23344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444266
514	NC_011080	ACG	2	6	23345	23350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444266
515	NC_011080	ATA	2	6	23363	23368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444266
516	NC_011080	CTTTT	2	10	23387	23396	0 %	80 %	0 %	20 %	194444266
517	NC_011080	T	6	6	23393	23398	0 %	100 %	0 %	0 %	194444266
518	NC_011080	CAG	2	6	23401	23406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444266
519	NC_011080	TTG	2	6	23446	23451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444266
520	NC_011080	TTTA	2	8	23492	23499	25 %	75 %	0 %	0 %	194444266
521	NC_011080	GTT	2	6	23542	23547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194444266
522	NC_011080	ATG	2	6	23558	23563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444266
523	NC_011080	AT	3	6	23576	23581	50 %	50 %	0 %	0 %	194444266
524	NC_011080	CG	3	6	23646	23651	0 %	0 %	50 %	50 %	194444266
525	NC_011080	ACG	2	6	23747	23752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444266
526	NC_011080	TGA	2	6	23783	23788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444266
527	NC_011080	GC	4	8	23789	23796	0 %	0 %	50 %	50 %	194444266
528	NC_011080	GCT	2	6	23841	23846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444266
529	NC_011080	TCTG	2	8	23949	23956	0 %	50 %	25 %	25 %	194444266
530	NC_011080	A	7	7	23961	23967	100 %	0 %	0 %	0 %	194444266
531	NC_011080	GGC	2	6	23993	23998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444266
532	NC_011080	AT	3	6	24050	24055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011080	GTT	2	6	24110	24115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011080	AAG	2	6	24191	24196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_011080	GAT	2	6	24226	24231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_011080	TAA	2	6	24253	24258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_011080	TAA	2	6	24260	24265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_011080	ACG	2	6	24300	24305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_011080	AAG	2	6	24347	24352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_011080	T	6	6	24357	24362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_011080	GAA	2	6	24392	24397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011080	CAG	2	6	24402	24407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_011080	A	6	6	24418	24423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011080	TGAA	2	8	24459	24466	50 %	25 %	25 %	0 %	194443119
545	NC_011080	TGT	2	6	24514	24519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443119
546	NC_011080	TAC	2	6	24536	24541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443119
547	NC_011080	CGGTA	2	10	24554	24563	20 %	20 %	40 %	20 %	194443119
548	NC_011080	CGC	2	6	24587	24592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443119
549	NC_011080	CTGTT	2	10	24593	24602	0 %	60 %	20 %	20 %	194443119
550	NC_011080	TGG	2	6	24673	24678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443119
551	NC_011080	AGA	2	6	24689	24694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443119
552	NC_011080	CCAG	2	8	24730	24737	25 %	0 %	25 %	50 %	194443119
553	NC_011080	GCG	2	6	24741	24746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443119
554	NC_011080	CGA	2	6	24817	24822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443119
555	NC_011080	T	7	7	25018	25024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_011080	CG	3	6	25057	25062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_011080	A	8	8	25108	25115	100 %	0 %	0 %	0 %	194443678
558	NC_011080	ATT	2	6	25134	25139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443678
559	NC_011080	CTG	2	6	25144	25149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443678
560	NC_011080	CGG	2	6	25151	25156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443678
561	NC_011080	CCT	2	6	25238	25243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194443678
562	NC_011080	ATT	2	6	25249	25254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443678
563	NC_011080	TTC	2	6	25257	25262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443678
564	NC_011080	T	7	7	25274	25280	0 %	100 %	0 %	0 %	194443678
565	NC_011080	CGC	2	6	25337	25342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443678
566	NC_011080	CT	3	6	25343	25348	0 %	50 %	0 %	50 %	194443678
567	NC_011080	A	6	6	25363	25368	100 %	0 %	0 %	0 %	194443678
568	NC_011080	AT	3	6	25373	25378	50 %	50 %	0 %	0 %	194443678
569	NC_011080	TAT	2	6	25383	25388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443678
570	NC_011080	ACCG	2	8	25407	25414	25 %	0 %	25 %	50 %	194443678
571	NC_011080	TATTT	2	10	25427	25436	20 %	80 %	0 %	0 %	194443678
572	NC_011080	AAAT	2	8	25467	25474	75 %	25 %	0 %	0 %	194443678
573	NC_011080	TATT	2	8	25520	25527	25 %	75 %	0 %	0 %	194443678
574	NC_011080	TAC	2	6	25624	25629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443678
575	NC_011080	A	6	6	25660	25665	100 %	0 %	0 %	0 %	194443678
576	NC_011080	CCG	2	6	25684	25689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443678
577	NC_011080	ACG	2	6	25759	25764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443678
578	NC_011080	ATG	2	6	25788	25793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443678
579	NC_011080	TCTG	2	8	25924	25931	0 %	50 %	25 %	25 %	194446095
580	NC_011080	GGC	2	6	25981	25986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
581	NC_011080	ACG	2	6	26063	26068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
582	NC_011080	GC	3	6	26076	26081	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
583	NC_011080	GCCT	2	8	26105	26112	0 %	25 %	25 %	50 %	194446095
584	NC_011080	GGC	3	9	26173	26181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
585	NC_011080	GCC	2	6	26216	26221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446095
586	NC_011080	GCA	2	6	26242	26247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
587	NC_011080	GGC	2	6	26272	26277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
588	NC_011080	GGC	2	6	26390	26395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
589	NC_011080	ACT	2	6	26463	26468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446095
590	NC_011080	GCG	2	6	26487	26492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
591	NC_011080	AGCGAC	2	12	26501	26512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
592	NC_011080	GCA	2	6	26515	26520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
593	NC_011080	ATT	2	6	26599	26604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446095
594	NC_011080	CCTT	2	8	26611	26618	0 %	50 %	0 %	50 %	194446095
595	NC_011080	GAC	2	6	26642	26647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
596	NC_011080	CAT	2	6	26740	26745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446095
597	NC_011080	GCC	2	6	26761	26766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446095
598	NC_011080	CCG	2	6	26799	26804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446095
599	NC_011080	GCG	2	6	26808	26813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
600	NC_011080	CCG	2	6	26874	26879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446095
601	NC_011080	GGC	2	6	26901	26906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
602	NC_011080	GCG	2	6	26915	26920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
603	NC_011080	AGT	2	6	26945	26950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
604	NC_011080	TCAG	2	8	26970	26977	25 %	25 %	25 %	25 %	194446095
605	NC_011080	GCG	2	6	27066	27071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
606	NC_011080	ATA	2	6	27135	27140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194446095
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608	NC_011080	ATT	2	6	27336	27341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446095
609	NC_011080	TAT	2	6	27350	27355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446095
610	NC_011080	AGG	2	6	27359	27364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194446095
611	NC_011080	TTA	2	6	27417	27422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446095
612	NC_011080	TGA	2	6	27451	27456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
613	NC_011080	TTG	2	6	27467	27472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446095
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615	NC_011080	GAT	2	6	27611	27616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446095
616	NC_011080	CTG	2	6	27710	27715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194446095
617	NC_011080	ACA	2	6	27735	27740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446095
618	NC_011080	GCG	2	6	27777	27782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
619	NC_011080	CAG	2	6	27857	27862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194446095
620	NC_011080	GCG	2	6	27879	27884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194446095
621	NC_011080	TGG	2	6	27888	27893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194446095
622	NC_011080	AGCC	2	8	27917	27924	25 %	0 %	25 %	50 %	194446095
623	NC_011080	CG	3	6	28006	28011	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
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628	NC_011080	CCGA	2	8	28124	28131	25 %	0 %	25 %	50 %	194446095
629	NC_011080	GC	3	6	28134	28139	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
630	NC_011080	GC	3	6	28170	28175	0 %	0 %	50 %	50 %	194446095
631	NC_011080	ACGGTG	2	12	28226	28237	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194446095
632	NC_011080	TTG	2	6	28260	28265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446095
633	NC_011080	GCGTC	2	10	28350	28359	0 %	20 %	40 %	40 %	194446095
634	NC_011080	ATC	2	6	28362	28367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194446095
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639	NC_011080	GT	3	6	28484	28489	0 %	50 %	50 %	0 %	194446333
640	NC_011080	ATTA	2	8	28517	28524	50 %	50 %	0 %	0 %	194446333
641	NC_011080	A	6	6	28584	28589	100 %	0 %	0 %	0 %	194446333
642	NC_011080	GT	3	6	28613	28618	0 %	50 %	50 %	0 %	194446333
643	NC_011080	CCG	2	6	28620	28625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446333
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646	NC_011080	ATG	2	6	28803	28808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194446333
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648	NC_011080	CCG	2	6	28938	28943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194446333
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651	NC_011080	ACA	2	6	29357	29362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194446333
652	NC_011080	GAC	2	6	29495	29500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444519
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654	NC_011080	ATG	2	6	29805	29810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444519
655	NC_011080	AAT	2	6	29831	29836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444519
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664	NC_011080	GCG	2	6	30254	30259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445269
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756	NC_011080	A	6	6	33919	33924	100 %	0 %	0 %	0 %	194446304
757	NC_011080	TA	3	6	33931	33936	50 %	50 %	0 %	0 %	194446304
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761	NC_011080	GTT	2	6	34086	34091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194446304
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889	NC_011080	T	7	7	39897	39903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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