MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011080	GC	4	8	426528	426535	0 %	0 %	50 %	50 %	194444712
9002	NC_011080	GGT	2	6	426553	426558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444712
9003	NC_011080	GGC	2	6	426586	426591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444712
9004	NC_011080	GC	3	6	426590	426595	0 %	0 %	50 %	50 %	194444712
9005	NC_011080	CGG	2	6	426627	426632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444712
9006	NC_011080	GCT	2	6	426673	426678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9007	NC_011080	TGA	2	6	426679	426684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444712
9008	NC_011080	GCGCAG	2	12	426692	426703	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	194444712
9009	NC_011080	CTG	2	6	426722	426727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9010	NC_011080	CAG	2	6	426794	426799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9011	NC_011080	GTGGC	2	10	426821	426830	0 %	20 %	60 %	20 %	194444712
9012	NC_011080	CGG	2	6	426907	426912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444712
9013	NC_011080	GGC	2	6	426953	426958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444712
9014	NC_011080	GGCG	2	8	426961	426968	0 %	0 %	75 %	25 %	194444712
9015	NC_011080	GTC	2	6	427001	427006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9016	NC_011080	GGCA	2	8	427039	427046	25 %	0 %	50 %	25 %	194444712
9017	NC_011080	TGG	2	6	427097	427102	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444712
9018	NC_011080	A	6	6	427166	427171	100 %	0 %	0 %	0 %	194444712
9019	NC_011080	TC	3	6	427201	427206	0 %	50 %	0 %	50 %	194444712
9020	NC_011080	ATT	2	6	427299	427304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194444712
9021	NC_011080	CG	3	6	427343	427348	0 %	0 %	50 %	50 %	194444712
9022	NC_011080	GAC	2	6	427352	427357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9023	NC_011080	GCC	2	6	427483	427488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444712
9024	NC_011080	CGA	2	6	427513	427518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9025	NC_011080	GAT	2	6	427628	427633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194444712
9026	NC_011080	AGA	2	6	427675	427680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444712
9027	NC_011080	GGC	2	6	427804	427809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444712
9028	NC_011080	GC	3	6	427808	427813	0 %	0 %	50 %	50 %	194444712
9029	NC_011080	TGG	2	6	427839	427844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194444712
9030	NC_011080	GTC	2	6	427866	427871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9031	NC_011080	CGC	2	6	427928	427933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194444712
9032	NC_011080	CGT	2	6	427995	428000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9033	NC_011080	GCA	2	6	428002	428007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444712
9034	NC_011080	G	7	7	428088	428094	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9035	NC_011080	GC	3	6	428115	428120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9036	NC_011080	CGGCGC	2	12	428192	428203	0 %	0 %	50 %	50 %	194442596
9037	NC_011080	TTC	2	6	428238	428243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442596
9038	NC_011080	GCCA	2	8	428253	428260	25 %	0 %	25 %	50 %	194442596
9039	NC_011080	AGC	2	6	428262	428267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442596
9040	NC_011080	GCA	2	6	428342	428347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194442596
9041	NC_011080	GCCG	2	8	428361	428368	0 %	0 %	50 %	50 %	194442596
9042	NC_011080	TCG	2	6	428401	428406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442596
9043	NC_011080	CGG	2	6	428431	428436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442596
9044	NC_011080	GCT	2	6	428488	428493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442596
9045	NC_011080	AGAA	2	8	428510	428517	75 %	0 %	25 %	0 %	194442596
9046	NC_011080	TGG	2	6	428528	428533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194442596
9047	NC_011080	ATT	2	6	428542	428547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194442596
9048	NC_011080	CGG	2	6	428564	428569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442596
9049	NC_011080	TCCA	2	8	428601	428608	25 %	25 %	0 %	50 %	194442596
9050	NC_011080	GCC	3	9	428641	428649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442596
9051	NC_011080	CGC	2	6	428717	428722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194442596
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9053	NC_011080	CCA	2	6	428813	428818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194442596
9054	NC_011080	TCT	2	6	428824	428829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442596
9055	NC_011080	TCA	2	6	428851	428856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442596
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9057	NC_011080	GCT	2	6	428930	428935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442596
9058	NC_011080	GGCAT	2	10	428959	428968	20 %	20 %	40 %	20 %	194442596
9059	NC_011080	TCG	2	6	428983	428988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442596
9060	NC_011080	TTC	3	9	428991	428999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442596
9061	NC_011080	GC	3	6	429055	429060	0 %	0 %	50 %	50 %	194442596
9062	NC_011080	GGC	2	6	429080	429085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442596
9063	NC_011080	GCAG	2	8	429158	429165	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9064	NC_011080	CTT	2	6	429228	429233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9065	NC_011080	TA	3	6	429235	429240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9066	NC_011080	GTT	2	6	429294	429299	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9067	NC_011080	ATT	2	6	429344	429349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194445610
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9069	NC_011080	T	7	7	429400	429406	0 %	100 %	0 %	0 %	194445610
9070	NC_011080	TTA	2	6	429459	429464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194446643
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9073	NC_011080	CTT	2	6	429542	429547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194446643
9074	NC_011080	GAG	2	6	429608	429613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9075	NC_011080	CTA	2	6	429702	429707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967504
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9080	NC_011080	TGA	3	9	430030	430038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967504
9081	NC_011080	GAT	2	6	430073	430078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967504
9082	NC_011080	CTG	2	6	430161	430166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967504
9083	NC_011080	TAATAT	2	12	430201	430212	50 %	50 %	0 %	0 %	448967504
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9088	NC_011080	GTC	2	6	430514	430519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448967504
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9090	NC_011080	TGG	2	6	430594	430599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448967504
9091	NC_011080	GAT	3	9	430607	430615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967504
9092	NC_011080	GCG	2	6	430667	430672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967504
9093	NC_011080	ATG	2	6	430710	430715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967504
9094	NC_011080	ATG	2	6	430752	430757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967504
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9097	NC_011080	AAT	2	6	430817	430822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448967504
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9101	NC_011080	TGA	2	6	431050	431055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448967504
9102	NC_011080	GGT	2	6	431090	431095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448967504
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9104	NC_011080	TGATAC	2	12	431140	431151	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	448967504
9105	NC_011080	ATA	2	6	431181	431186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448967504
9106	NC_011080	GT	3	6	431205	431210	0 %	50 %	50 %	0 %	448967504
9107	NC_011080	CAA	2	6	431353	431358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448967504
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9111	NC_011080	CAT	2	6	431803	431808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448967504
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9120	NC_011080	CGG	3	9	432448	432456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967504
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9122	NC_011080	ATT	2	6	432575	432580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9371	NC_011080	ACC	2	6	444189	444194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194445892
9372	NC_011080	GGA	2	6	444215	444220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194445892
9373	NC_011080	CCT	2	6	444292	444297	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194445892
9374	NC_011080	GC	3	6	444298	444303	0 %	0 %	50 %	50 %	194445892
9375	NC_011080	GCG	2	6	444339	444344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194445892
9376	NC_011080	TCT	2	6	444460	444465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194445892
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9378	NC_011080	TGA	2	6	444553	444558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443102
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9383	NC_011080	GGC	2	6	444842	444847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442630
9384	NC_011080	GCG	2	6	444961	444966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442630
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9391	NC_011080	ATT	3	9	445148	445156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9392	NC_011080	GAT	2	6	445181	445186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9431	NC_011080	TTAAT	2	10	446982	446991	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9432	NC_011080	CAG	2	6	447064	447069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194444639
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9492	NC_011080	CAGCA	2	10	449567	449576	40 %	0 %	20 %	40 %	194442734
9493	NC_011080	GAA	2	6	449616	449621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442734
9494	NC_011080	GA	4	8	449634	449641	50 %	0 %	50 %	0 %	194442734
9495	NC_011080	GTCA	2	8	449655	449662	25 %	25 %	25 %	25 %	194442734
9496	NC_011080	GCG	2	6	449678	449683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442734
9497	NC_011080	ATA	2	6	449749	449754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442734
9498	NC_011080	CAT	2	6	449790	449795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442734
9499	NC_011080	GGC	2	6	449850	449855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442734
9500	NC_011080	AAG	2	6	449884	449889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442734

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