MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254 chromosome

Total Repeats: 101857

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011080	CGAG	2	8	254239	254246	25 %	0 %	50 %	25 %	194443587
5502	NC_011080	GCC	2	6	254300	254305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443587
5503	NC_011080	GCT	2	6	254309	254314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443587
5504	NC_011080	TGG	2	6	254358	254363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443587
5505	NC_011080	GGC	2	6	254387	254392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443587
5506	NC_011080	CAG	2	6	254471	254476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443587
5507	NC_011080	CAGA	2	8	254512	254519	50 %	0 %	25 %	25 %	194443587
5508	NC_011080	CAG	2	6	254525	254530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443587
5509	NC_011080	CGTA	2	8	254543	254550	25 %	25 %	25 %	25 %	194443587
5510	NC_011080	ATA	2	6	254581	254586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194443587
5511	NC_011080	CAG	2	6	254591	254596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443587
5512	NC_011080	CGC	2	6	254680	254685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443587
5513	NC_011080	GCC	2	6	254693	254698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194443587
5514	NC_011080	CAA	2	6	254759	254764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194443587
5515	NC_011080	CCAG	2	8	254833	254840	25 %	0 %	25 %	50 %	194443587
5516	NC_011080	GC	3	6	254889	254894	0 %	0 %	50 %	50 %	194443587
5517	NC_011080	AGGG	2	8	254924	254931	25 %	0 %	75 %	0 %	194443587
5518	NC_011080	TGG	2	6	255000	255005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011080	CT	3	6	255117	255122	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_011080	GCC	2	6	255124	255129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_011080	ATT	2	6	255211	255216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194443962
5522	NC_011080	CGT	2	6	255217	255222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443962
5523	NC_011080	GT	3	6	255221	255226	0 %	50 %	50 %	0 %	194443962
5524	NC_011080	GAT	2	6	255227	255232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443962
5525	NC_011080	ACG	2	6	255426	255431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443962
5526	NC_011080	CAT	2	6	255445	255450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194443962
5527	NC_011080	GCA	2	6	255454	255459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443962
5528	NC_011080	TTC	2	6	255467	255472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443962
5529	NC_011080	CCTTCG	2	12	255525	255536	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194443962
5530	NC_011080	GGC	2	6	255551	255556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443962
5531	NC_011080	CT	3	6	255612	255617	0 %	50 %	0 %	50 %	194443962
5532	NC_011080	CGA	2	6	255661	255666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194443962
5533	NC_011080	CAC	2	6	255776	255781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194443962
5534	NC_011080	AGGC	2	8	255828	255835	25 %	0 %	50 %	25 %	194443962
5535	NC_011080	GTT	2	6	255847	255852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194443962
5536	NC_011080	GGT	2	6	255893	255898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194443962
5537	NC_011080	T	6	6	255967	255972	0 %	100 %	0 %	0 %	194443962
5538	NC_011080	GAT	2	6	256027	256032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_011080	AAT	2	6	256039	256044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_011080	TCAG	2	8	256067	256074	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5541	NC_011080	GCC	2	6	256195	256200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_011080	CAA	2	6	256244	256249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_011080	GC	3	6	256283	256288	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_011080	AC	3	6	256314	256319	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5545	NC_011080	AAC	2	6	256352	256357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_011080	AC	4	8	256356	256363	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5547	NC_011080	GC	3	6	256553	256558	0 %	0 %	50 %	50 %	194442333
5548	NC_011080	CAT	2	6	256572	256577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194442333
5549	NC_011080	CTGAA	2	10	256619	256628	40 %	20 %	20 %	20 %	194442333
5550	NC_011080	AAGCG	2	10	256683	256692	40 %	0 %	40 %	20 %	194442333
5551	NC_011080	GCT	2	6	256702	256707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442333
5552	NC_011080	TTC	2	6	256723	256728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194442333
5553	NC_011080	GCTG	2	8	256739	256746	0 %	25 %	50 %	25 %	194442333
5554	NC_011080	AAGA	2	8	256846	256853	75 %	0 %	25 %	0 %	194442333
5555	NC_011080	AAC	2	6	256984	256989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194442333
5556	NC_011080	GAA	2	6	257155	257160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194442333
5557	NC_011080	TAA	2	6	257179	257184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194442333
5558	NC_011080	GGC	2	6	257223	257228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_011080	GTA	2	6	257336	257341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_011080	ATG	2	6	257496	257501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194443244
5561	NC_011080	A	6	6	257508	257513	100 %	0 %	0 %	0 %	194443244
5562	NC_011080	CTGA	2	8	257517	257524	25 %	25 %	25 %	25 %	194443244
5563	NC_011080	GCG	2	6	257583	257588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194443244
5564	NC_011080	A	6	6	257589	257594	100 %	0 %	0 %	0 %	194443244
5565	NC_011080	GCT	2	6	257607	257612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443244
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5571	NC_011080	GCAA	2	8	257961	257968	50 %	0 %	25 %	25 %	194443244
5572	NC_011080	CTG	2	6	257998	258003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443244
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5574	NC_011080	GAA	2	6	258098	258103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194443244
5575	NC_011080	CTG	2	6	258171	258176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194443244
5576	NC_011080	GACT	2	8	258245	258252	25 %	25 %	25 %	25 %	194443244
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5580	NC_011080	CTT	2	6	258318	258323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_011080	CT	3	6	258331	258336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_011080	GAAA	2	8	258426	258433	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_011080	GCG	2	6	258484	258489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194444852
5584	NC_011080	TGGTG	2	10	258587	258596	0 %	40 %	60 %	0 %	194444852
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5589	NC_011080	TCTG	2	8	258833	258840	0 %	50 %	25 %	25 %	194444852
5590	NC_011080	TTC	2	6	258858	258863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194444852
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5592	NC_011080	GC	3	6	259105	259110	0 %	0 %	50 %	50 %	194444852
5593	NC_011080	CGT	2	6	259113	259118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194444852
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5595	NC_011080	AAG	2	6	259135	259140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194444852
5596	NC_011080	AAT	2	6	259156	259161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194444852
5597	NC_011080	TTA	2	6	259209	259214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_011080	TG	3	6	259259	259264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_011080	GTCTG	2	10	259268	259277	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5600	NC_011080	CTG	2	6	259412	259417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445385
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5606	NC_011080	CTG	2	6	259730	259735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445385
5607	NC_011080	TCG	2	6	259765	259770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194445385
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5611	NC_011080	TGAT	2	8	259862	259869	25 %	50 %	25 %	0 %	194445385
5612	NC_011080	GTG	2	6	259915	259920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_011080	AGA	2	6	259936	259941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_011080	GCG	2	6	259960	259965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_011080	GCA	2	6	260048	260053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448967497
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5622	NC_011080	GGC	2	6	260268	260273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967497
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5624	NC_011080	GGC	2	6	260298	260303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967497
5625	NC_011080	GGC	2	6	260337	260342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448967497
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5645	NC_011080	T	6	6	261324	261329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5646	NC_011080	A	6	6	261502	261507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5746	NC_011080	TCT	2	6	266747	266752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443720
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5748	NC_011080	TCT	2	6	266888	266893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194443720
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5868	NC_011080	GAT	2	6	273434	273439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194445238
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5941	NC_011080	GCAG	2	8	276326	276333	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5942	NC_011080	A	6	6	276369	276374	100 %	0 %	0 %	0 %	194443133
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5978	NC_011080	T	6	6	278501	278506	0 %	100 %	0 %	0 %	194442764
5979	NC_011080	GCTG	2	8	278521	278528	0 %	25 %	50 %	25 %	194442764
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5985	NC_011080	GGC	2	6	278711	278716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442764
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5988	NC_011080	TGA	3	9	278952	278960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442764
5989	NC_011080	CT	3	6	278973	278978	0 %	50 %	0 %	50 %	194442764
5990	NC_011080	CGG	2	6	279013	279018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442764
5991	NC_011080	CTG	2	6	279128	279133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442764
5992	NC_011080	GCG	2	6	279246	279251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442764
5993	NC_011080	GGC	2	6	279304	279309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442764
5994	NC_011080	ATG	2	6	279377	279382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442764
5995	NC_011080	CGG	2	6	279432	279437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194442764
5996	NC_011080	TGC	2	6	279441	279446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194442764
5997	NC_011080	GATT	2	8	279465	279472	25 %	50 %	25 %	0 %	194442764
5998	NC_011080	TGA	2	6	279574	279579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194442764
5999	NC_011080	GCCGAT	2	12	279626	279637	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	194442764
6000	NC_011080	GATG	2	8	279688	279695	25 %	25 %	50 %	0 %	194442764

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