MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 1542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011072	AAAAG	2	10	541	550	80 %	0 %	20 %	0 %	194398133
2	NC_011072	GAAAT	2	10	702	711	60 %	20 %	20 %	0 %	194398133
3	NC_011072	AAAAT	2	10	1484	1493	80 %	20 %	0 %	0 %	194398133
4	NC_011072	GTAAA	2	10	2642	2651	60 %	20 %	20 %	0 %	194397554
5	NC_011072	AAAAT	2	10	3029	3038	80 %	20 %	0 %	0 %	194396943
6	NC_011072	TGAAA	2	10	3170	3179	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011072	AAACA	2	10	4431	4440	80 %	0 %	0 %	20 %	194397946
8	NC_011072	TCAAT	2	10	6058	6067	40 %	40 %	0 %	20 %	194397105
9	NC_011072	TTTTC	2	10	6098	6107	0 %	80 %	0 %	20 %	194397105
10	NC_011072	TAAAT	2	10	6616	6625	60 %	40 %	0 %	0 %	194397105
11	NC_011072	ACTCT	2	10	6697	6706	20 %	40 %	0 %	40 %	194397105
12	NC_011072	AAACG	2	10	7940	7949	60 %	0 %	20 %	20 %	194397105
13	NC_011072	TTGGT	2	10	8169	8178	0 %	60 %	40 %	0 %	194397105
14	NC_011072	CAATT	2	10	8238	8247	40 %	40 %	0 %	20 %	194397105
15	NC_011072	AGGAA	2	10	9254	9263	60 %	0 %	40 %	0 %	194397494
16	NC_011072	ATTGA	2	10	10672	10681	40 %	40 %	20 %	0 %	194398531
17	NC_011072	ATTCT	2	10	12805	12814	20 %	60 %	0 %	20 %	194396790
18	NC_011072	ATGCT	2	10	14033	14042	20 %	40 %	20 %	20 %	194396790
19	NC_011072	TCGTG	2	10	16421	16430	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011072	GTTAA	2	10	17142	17151	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011072	GGGAG	2	10	17660	17669	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011072	AGGGA	2	10	19871	19880	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011072	AAGCT	2	10	20429	20438	40 %	20 %	20 %	20 %	194398170
24	NC_011072	ATGGT	2	10	22145	22154	20 %	40 %	40 %	0 %	194397970
25	NC_011072	CTTTT	2	10	23313	23322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_011072	AATCA	2	10	30181	30190	60 %	20 %	0 %	20 %	194398646
27	NC_011072	AGCAG	2	10	30852	30861	40 %	0 %	40 %	20 %	194397391
28	NC_011072	TAAAG	2	10	34055	34064	60 %	20 %	20 %	0 %	194398373
29	NC_011072	CAGAT	2	10	40215	40224	40 %	20 %	20 %	20 %	194397308
30	NC_011072	TTTAC	2	10	40917	40926	20 %	60 %	0 %	20 %	194397308
31	NC_011072	AGAGG	2	10	41779	41788	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011072	GTGAC	2	10	44403	44412	20 %	20 %	40 %	20 %	194397931
33	NC_011072	GTGAT	2	10	45393	45402	20 %	40 %	40 %	0 %	194397931
34	NC_011072	GCTTG	2	10	46387	46396	0 %	40 %	40 %	20 %	194397931
35	NC_011072	CCTAC	2	10	47344	47353	20 %	20 %	0 %	60 %	194397931
36	NC_011072	TGGCT	2	10	48213	48222	0 %	40 %	40 %	20 %	194397123
37	NC_011072	CTCAT	2	10	48317	48326	20 %	40 %	0 %	40 %	194397123
38	NC_011072	AAATG	2	10	48819	48828	60 %	20 %	20 %	0 %	194397123
39	NC_011072	AGCTA	2	10	49713	49722	40 %	20 %	20 %	20 %	194398379
40	NC_011072	CCTTG	2	10	52603	52612	0 %	40 %	20 %	40 %	194396916
41	NC_011072	TCAAA	2	10	52797	52806	60 %	20 %	0 %	20 %	194396916
42	NC_011072	AGTGG	2	10	55164	55173	20 %	20 %	60 %	0 %	194398140
43	NC_011072	GGGTG	2	10	55202	55211	0 %	20 %	80 %	0 %	194398140
44	NC_011072	CTATT	2	10	56169	56178	20 %	60 %	0 %	20 %	194397662
45	NC_011072	GAAGC	2	10	56359	56368	40 %	0 %	40 %	20 %	194397662
46	NC_011072	GCTTG	2	10	56814	56823	0 %	40 %	40 %	20 %	194398324
47	NC_011072	GCTTT	2	10	58243	58252	0 %	60 %	20 %	20 %	194398622
48	NC_011072	TCTGG	2	10	58849	58858	0 %	40 %	40 %	20 %	194398622
49	NC_011072	AGCAT	2	10	59803	59812	40 %	20 %	20 %	20 %	194398622
50	NC_011072	TACCA	2	10	60501	60510	40 %	20 %	0 %	40 %	194398622
51	NC_011072	TTCCT	2	10	61518	61527	0 %	60 %	0 %	40 %	194398622
52	NC_011072	TTTAT	2	10	62098	62107	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011072	TTGGT	2	10	65473	65482	0 %	60 %	40 %	0 %	194398074
54	NC_011072	CTTCA	2	10	66528	66537	20 %	40 %	0 %	40 %	194398754
55	NC_011072	AATCA	2	10	66640	66649	60 %	20 %	0 %	20 %	194397103
56	NC_011072	ATTCA	2	10	68019	68028	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011072	AGCTC	2	10	68863	68872	20 %	20 %	20 %	40 %	194396654
58	NC_011072	TAATA	2	10	70541	70550	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011072	CAAGT	2	10	73011	73020	40 %	20 %	20 %	20 %	194396933
60	NC_011072	GTTAT	2	10	75030	75039	20 %	60 %	20 %	0 %	194396933
61	NC_011072	CTAGT	2	10	77997	78006	20 %	40 %	20 %	20 %	194396979
62	NC_011072	TGATA	2	10	79079	79088	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011072	TATCA	2	10	80785	80794	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011072	TCTAT	2	10	81667	81676	20 %	60 %	0 %	20 %	194397672
65	NC_011072	AGAAA	2	10	82592	82601	80 %	0 %	20 %	0 %	194397672
66	NC_011072	GAAAG	2	10	82644	82653	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011072	TGACT	2	10	85273	85282	20 %	40 %	20 %	20 %	194397775
68	NC_011072	ATAAA	2	10	90120	90129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011072	TAACC	2	10	90218	90227	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_011072	ATTCT	2	10	90393	90402	20 %	60 %	0 %	20 %	194396701
71	NC_011072	TTACT	2	10	94162	94171	20 %	60 %	0 %	20 %	194398717
72	NC_011072	TGGGA	2	10	94816	94825	20 %	20 %	60 %	0 %	194398717
73	NC_011072	CAACC	2	10	94872	94881	40 %	0 %	0 %	60 %	194398717
74	NC_011072	TGCTT	2	10	95536	95545	0 %	60 %	20 %	20 %	194398179
75	NC_011072	TGGCT	2	10	95719	95728	0 %	40 %	40 %	20 %	194398179
76	NC_011072	AGATA	2	10	99686	99695	60 %	20 %	20 %	0 %	194396777
77	NC_011072	GTTTG	2	10	99853	99862	0 %	60 %	40 %	0 %	194396777
78	NC_011072	TATTT	2	10	101802	101811	20 %	80 %	0 %	0 %	194398751
79	NC_011072	AAAGC	2	10	104757	104766	60 %	0 %	20 %	20 %	194398391
80	NC_011072	GGCTT	2	10	106181	106190	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_011072	CACAA	2	10	106519	106528	60 %	0 %	0 %	40 %	194398499
82	NC_011072	GGAAT	2	10	108013	108022	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011072	AGGAT	2	10	108578	108587	40 %	20 %	40 %	0 %	194398015
84	NC_011072	CTTTG	2	10	109887	109896	0 %	60 %	20 %	20 %	194398015
85	NC_011072	TCCTC	2	10	110013	110022	0 %	40 %	0 %	60 %	194398015
86	NC_011072	AAATT	2	10	114843	114852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011072	AGGAT	2	10	114874	114883	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011072	GCTTT	2	10	115908	115917	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011072	TATTG	2	10	115945	115954	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011072	ATTTT	2	10	116043	116052	20 %	80 %	0 %	0 %	194397809
91	NC_011072	TTGGA	2	10	116490	116499	20 %	40 %	40 %	0 %	194397809
92	NC_011072	TAAAA	2	10	121862	121871	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011072	ATTAA	2	10	125497	125506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011072	CGTGG	2	10	126322	126331	0 %	20 %	60 %	20 %	194398405
95	NC_011072	GTGAA	2	10	127324	127333	40 %	20 %	40 %	0 %	194396719
96	NC_011072	GAAGT	2	10	131862	131871	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011072	GTTTG	2	10	132102	132111	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011072	ATGAC	2	10	132249	132258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_011072	GAAAA	2	10	132839	132848	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011072	TTGGA	2	10	133124	133133	20 %	40 %	40 %	0 %	194397265
101	NC_011072	TGCTC	2	10	136844	136853	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011072	ATGTT	2	10	145130	145139	20 %	60 %	20 %	0 %	194397525
103	NC_011072	ACAAA	2	10	145645	145654	80 %	0 %	0 %	20 %	194397525
104	NC_011072	TTTTC	2	10	147057	147066	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011072	GAAAT	2	10	148546	148555	60 %	20 %	20 %	0 %	194397734
106	NC_011072	TTAGT	2	10	149418	149427	20 %	60 %	20 %	0 %	194398440
107	NC_011072	CTTGC	2	10	149774	149783	0 %	40 %	20 %	40 %	194398440
108	NC_011072	GGCCT	2	10	150491	150500	0 %	20 %	40 %	40 %	194397064
109	NC_011072	CTGTT	2	10	151059	151068	0 %	60 %	20 %	20 %	194397064
110	NC_011072	AGAAA	2	10	152595	152604	80 %	0 %	20 %	0 %	194398677
111	NC_011072	TATAC	2	10	154556	154565	40 %	40 %	0 %	20 %	194398410
112	NC_011072	AGATC	2	10	154861	154870	40 %	20 %	20 %	20 %	194397643
113	NC_011072	TTTGT	2	10	156870	156879	0 %	80 %	20 %	0 %	194396688
114	NC_011072	ACTAT	2	10	160876	160885	40 %	40 %	0 %	20 %	194397433
115	NC_011072	TGAAA	2	10	162277	162286	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011072	TTGAG	2	10	163456	163465	20 %	40 %	40 %	0 %	194397394
117	NC_011072	ATTTC	2	10	163803	163812	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011072	AAGTA	2	10	168212	168221	60 %	20 %	20 %	0 %	194396788
119	NC_011072	TTGAT	2	10	169371	169380	20 %	60 %	20 %	0 %	194398327
120	NC_011072	TCACT	2	10	169746	169755	20 %	40 %	0 %	40 %	194397666
121	NC_011072	ATTTT	2	10	170069	170078	20 %	80 %	0 %	0 %	194397666
122	NC_011072	TTAAG	2	10	170421	170430	40 %	40 %	20 %	0 %	194397666
123	NC_011072	CCCTG	2	10	171053	171062	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
124	NC_011072	TCAGG	2	10	171336	171345	20 %	20 %	40 %	20 %	194397075
125	NC_011072	GCCTT	2	10	172950	172959	0 %	40 %	20 %	40 %	194397969
126	NC_011072	AAATG	2	10	173063	173072	60 %	20 %	20 %	0 %	194397969
127	NC_011072	TTCCC	2	10	173506	173515	0 %	40 %	0 %	60 %	194397811
128	NC_011072	TCTCT	2	10	177053	177062	0 %	60 %	0 %	40 %	194398387
129	NC_011072	GAAAG	2	10	179069	179078	60 %	0 %	40 %	0 %	194398387
130	NC_011072	AGTTA	2	10	180349	180358	40 %	40 %	20 %	0 %	194397994
131	NC_011072	TGGAG	2	10	181039	181048	20 %	20 %	60 %	0 %	194397658
132	NC_011072	AAATC	2	10	181581	181590	60 %	20 %	0 %	20 %	194397095
133	NC_011072	GCAGA	2	10	183400	183409	40 %	0 %	40 %	20 %	194397996
134	NC_011072	ATGAT	2	10	186439	186448	40 %	40 %	20 %	0 %	194396754
135	NC_011072	GTAGA	2	10	186610	186619	40 %	20 %	40 %	0 %	194398472
136	NC_011072	TTTAG	2	10	187095	187104	20 %	60 %	20 %	0 %	194398472
137	NC_011072	CTTTT	2	10	187569	187578	0 %	80 %	0 %	20 %	194398472
138	NC_011072	GTCTG	2	10	188046	188055	0 %	40 %	40 %	20 %	194398472
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