MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 42366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_011072	TGT	2	6	193462	193467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397396
4003	NC_011072	TAAAGG	2	12	193486	193497	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	194397396
4004	NC_011072	ACC	2	6	193560	193565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194397396
4005	NC_011072	GTC	2	6	193566	193571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397396
4006	NC_011072	GTG	2	6	193638	193643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397396
4007	NC_011072	GTT	2	6	193679	193684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397396
4008	NC_011072	CAG	2	6	193755	193760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397396
4009	NC_011072	ATA	2	6	193774	193779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397396
4010	NC_011072	ATT	2	6	193816	193821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397434
4011	NC_011072	AAG	2	6	193836	193841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397434
4012	NC_011072	GTT	2	6	193850	193855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397434
4013	NC_011072	ATC	2	6	193910	193915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397434
4014	NC_011072	AC	3	6	193943	193948	50 %	0 %	0 %	50 %	194397434
4015	NC_011072	GGT	2	6	193976	193981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397434
4016	NC_011072	CAC	2	6	194040	194045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194397434
4017	NC_011072	GTG	4	12	194052	194063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397434
4018	NC_011072	TCG	2	6	194116	194121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397434
4019	NC_011072	CTG	2	6	194208	194213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397434
4020	NC_011072	GCA	2	6	194231	194236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397434
4021	NC_011072	GAA	2	6	194270	194275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397434
4022	NC_011072	CTT	2	6	194375	194380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397434
4023	NC_011072	CA	3	6	194383	194388	50 %	0 %	0 %	50 %	194397434
4024	NC_011072	AGC	2	6	194389	194394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397434
4025	NC_011072	GAG	2	6	194408	194413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397434
4026	NC_011072	ATG	2	6	194435	194440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397745
4027	NC_011072	A	6	6	194446	194451	100 %	0 %	0 %	0 %	194397745
4028	NC_011072	TCA	2	6	194456	194461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397745
4029	NC_011072	CA	3	6	194522	194527	50 %	0 %	0 %	50 %	194397745
4030	NC_011072	CAAG	2	8	194538	194545	50 %	0 %	25 %	25 %	194397745
4031	NC_011072	GCT	2	6	194554	194559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397745
4032	NC_011072	A	6	6	194653	194658	100 %	0 %	0 %	0 %	194397745
4033	NC_011072	ATC	2	6	194662	194667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397745
4034	NC_011072	GTT	2	6	194697	194702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397745
4035	NC_011072	TGC	2	6	194703	194708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397745
4036	NC_011072	AAT	2	6	194717	194722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194397745
4037	NC_011072	AGG	2	6	194726	194731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_011072	CAA	3	9	194761	194769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194396931
4039	NC_011072	CTT	2	6	194788	194793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194396931
4040	NC_011072	CAA	2	6	194812	194817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194396931
4041	NC_011072	TTG	2	6	194839	194844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194396931
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4043	NC_011072	GGT	2	6	194901	194906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194396931
4044	NC_011072	TAA	2	6	194945	194950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194396931
4045	NC_011072	GTT	2	6	194967	194972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194396931
4046	NC_011072	TACAC	2	10	195019	195028	40 %	20 %	0 %	40 %	194396931
4047	NC_011072	CAT	2	6	195047	195052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194396931
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4049	NC_011072	TGC	2	6	195206	195211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396931
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4051	NC_011072	GGT	3	9	195435	195443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194396931
4052	NC_011072	TCGT	2	8	195547	195554	0 %	50 %	25 %	25 %	194396931
4053	NC_011072	ATA	2	6	195569	195574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194396931
4054	NC_011072	ACA	2	6	195649	195654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_011072	A	6	6	195691	195696	100 %	0 %	0 %	0 %	194396819
4056	NC_011072	TCG	2	6	195704	195709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396819
4057	NC_011072	TGA	2	6	195719	195724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396819
4058	NC_011072	A	6	6	195724	195729	100 %	0 %	0 %	0 %	194396819
4059	NC_011072	GAAAA	2	10	195751	195760	80 %	0 %	20 %	0 %	194396819
4060	NC_011072	A	6	6	195757	195762	100 %	0 %	0 %	0 %	194396819
4061	NC_011072	TTA	2	6	195764	195769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194396819
4062	NC_011072	CGT	2	6	195781	195786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396819
4063	NC_011072	GACG	2	8	195832	195839	25 %	0 %	50 %	25 %	194396819
4064	NC_011072	AAG	2	6	195863	195868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396819
4065	NC_011072	GAC	2	6	195931	195936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194396819
4066	NC_011072	GCAATC	2	12	196074	196085	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194398165
4067	NC_011072	CAAA	2	8	196099	196106	75 %	0 %	0 %	25 %	194398165
4068	NC_011072	GCT	2	6	196107	196112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398165
4069	NC_011072	ATC	2	6	196116	196121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398165
4070	NC_011072	TTTGG	2	10	196164	196173	0 %	60 %	40 %	0 %	194398165
4071	NC_011072	GTA	2	6	196188	196193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398165
4072	NC_011072	CAA	2	6	196268	196273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398165
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4078	NC_011072	ACATCA	2	12	196621	196632	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	194398748
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4080	NC_011072	CGT	2	6	196713	196718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398748
4081	NC_011072	CA	3	6	196848	196853	50 %	0 %	0 %	50 %	194398748
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4083	NC_011072	TAC	2	6	196892	196897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398748
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4087	NC_011072	CGT	2	6	197010	197015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396695
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4089	NC_011072	GCT	2	6	197127	197132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396695
4090	NC_011072	GTG	2	6	197161	197166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194396695
4091	NC_011072	CA	3	6	197191	197196	50 %	0 %	0 %	50 %	194396695
4092	NC_011072	AAG	2	6	197458	197463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396812
4093	NC_011072	A	6	6	197490	197495	100 %	0 %	0 %	0 %	194396812
4094	NC_011072	GCT	2	6	197520	197525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396812
4095	NC_011072	AACA	2	8	197539	197546	75 %	0 %	0 %	25 %	194396812
4096	NC_011072	A	6	6	197565	197570	100 %	0 %	0 %	0 %	194396812
4097	NC_011072	ATA	2	6	197609	197614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194396812
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4100	NC_011072	GACAA	2	10	197691	197700	60 %	0 %	20 %	20 %	194398616
4101	NC_011072	ACC	2	6	197728	197733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194398616
4102	NC_011072	ACT	2	6	197755	197760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398616
4103	NC_011072	A	6	6	197763	197768	100 %	0 %	0 %	0 %	194398616
4104	NC_011072	ATG	2	6	197779	197784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398616
4105	NC_011072	AAG	2	6	197800	197805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398616
4106	NC_011072	CGTA	2	8	197813	197820	25 %	25 %	25 %	25 %	194398616
4107	NC_011072	GTT	2	6	197871	197876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398616
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4109	NC_011072	TCA	2	6	197887	197892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398616
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4111	NC_011072	TGG	2	6	197997	198002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398017
4112	NC_011072	TGG	2	6	198066	198071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398017
4113	NC_011072	A	6	6	198079	198084	100 %	0 %	0 %	0 %	194398017
4114	NC_011072	GTT	2	6	198091	198096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398017
4115	NC_011072	TCGT	2	8	198107	198114	0 %	50 %	25 %	25 %	194398017
4116	NC_011072	TCG	2	6	198129	198134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398017
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4119	NC_011072	CTC	2	6	198197	198202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194398017
4120	NC_011072	A	7	7	198377	198383	100 %	0 %	0 %	0 %	194397606
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4258	NC_011072	ATCGA	2	10	204869	204878	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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4273	NC_011072	AGG	2	6	205647	205652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4350	NC_011072	TCTGT	2	10	209027	209036	0 %	60 %	20 %	20 %	194397385
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4362	NC_011072	TTTA	2	8	209429	209436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_011072	ATA	2	6	209457	209462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4364	NC_011072	TTTTA	2	10	209494	209503	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_011072	TCAT	2	8	209504	209511	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4366	NC_011072	ATA	2	6	209515	209520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4493	NC_011072	TAT	2	6	215966	215971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398744
4494	NC_011072	TGG	2	6	215978	215983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398744
4495	NC_011072	TTA	2	6	216021	216026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398744
4496	NC_011072	TTG	2	6	216064	216069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398744
4497	NC_011072	AT	3	6	216137	216142	50 %	50 %	0 %	0 %	194398744
4498	NC_011072	CAG	2	6	216145	216150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398744
4499	NC_011072	AAG	2	6	216209	216214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398744
4500	NC_011072	AAGTC	2	10	216224	216233	40 %	20 %	20 %	20 %	194398744

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