MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 42366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_011072	ATC	2	6	47681	47686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397931
1002	NC_011072	ATAG	2	8	47815	47822	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_011072	TGA	2	6	47858	47863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_011072	A	6	6	47885	47890	100 %	0 %	0 %	0 %	194397123
1005	NC_011072	GAA	2	6	47917	47922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397123
1006	NC_011072	TGC	2	6	47955	47960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397123
1007	NC_011072	CTG	2	6	48149	48154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397123
1008	NC_011072	TGGCT	2	10	48213	48222	0 %	40 %	40 %	20 %	194397123
1009	NC_011072	CT	3	6	48249	48254	0 %	50 %	0 %	50 %	194397123
1010	NC_011072	AAGA	2	8	48256	48263	75 %	0 %	25 %	0 %	194397123
1011	NC_011072	TTCGGA	2	12	48297	48308	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	194397123
1012	NC_011072	CTCAT	2	10	48317	48326	20 %	40 %	0 %	40 %	194397123
1013	NC_011072	TCG	2	6	48327	48332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397123
1014	NC_011072	GGT	2	6	48388	48393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397123
1015	NC_011072	TCCG	2	8	48452	48459	0 %	25 %	25 %	50 %	194397123
1016	NC_011072	GTT	2	6	48490	48495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397123
1017	NC_011072	TCT	2	6	48499	48504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397123
1018	NC_011072	TGA	2	6	48576	48581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397123
1019	NC_011072	GAT	2	6	48610	48615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194397123
1020	NC_011072	TTC	2	6	48771	48776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397123
1021	NC_011072	GAA	2	6	48802	48807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397123
1022	NC_011072	AAATG	2	10	48819	48828	60 %	20 %	20 %	0 %	194397123
1023	NC_011072	CTG	2	6	48914	48919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397123
1024	NC_011072	TGG	2	6	48953	48958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397123
1025	NC_011072	AAC	2	6	48978	48983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194397123
1026	NC_011072	TCG	2	6	48987	48992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397123
1027	NC_011072	AAG	2	6	49010	49015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397123
1028	NC_011072	GAA	2	6	49129	49134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397123
1029	NC_011072	TTGA	2	8	49186	49193	25 %	50 %	25 %	0 %	194397123
1030	NC_011072	GGT	2	6	49225	49230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397123
1031	NC_011072	CT	3	6	49268	49273	0 %	50 %	0 %	50 %	194397123
1032	NC_011072	GAA	2	6	49282	49287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397123
1033	NC_011072	GAA	2	6	49306	49311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397123
1034	NC_011072	A	6	6	49360	49365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_011072	GTT	2	6	49426	49431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398379
1036	NC_011072	TGG	2	6	49488	49493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398379
1037	NC_011072	TGG	2	6	49497	49502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398379
1038	NC_011072	TG	3	6	49624	49629	0 %	50 %	50 %	0 %	194398379
1039	NC_011072	TG	3	6	49634	49639	0 %	50 %	50 %	0 %	194398379
1040	NC_011072	CAT	2	6	49647	49652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398379
1041	NC_011072	TGC	2	6	49653	49658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398379
1042	NC_011072	GAA	2	6	49701	49706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398379
1043	NC_011072	AGCTA	2	10	49713	49722	40 %	20 %	20 %	20 %	194398379
1044	NC_011072	TG	3	6	49753	49758	0 %	50 %	50 %	0 %	194398379
1045	NC_011072	TGC	2	6	49767	49772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398379
1046	NC_011072	GAC	2	6	49819	49824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398379
1047	NC_011072	CGGT	2	8	49844	49851	0 %	25 %	50 %	25 %	194398379
1048	NC_011072	GGT	2	6	49887	49892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398379
1049	NC_011072	TTC	2	6	49904	49909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398379
1050	NC_011072	TCG	2	6	49956	49961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398379
1051	NC_011072	TCA	2	6	50072	50077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398379
1052	NC_011072	AAG	2	6	50078	50083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398379
1053	NC_011072	GGT	2	6	50113	50118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398379
1054	NC_011072	GCT	2	6	50161	50166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398379
1055	NC_011072	TGA	2	6	50172	50177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398379
1056	NC_011072	GAA	2	6	50239	50244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398379
1057	NC_011072	TTG	2	6	50320	50325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398379
1058	NC_011072	AAGA	2	8	50359	50366	75 %	0 %	25 %	0 %	194398379
1059	NC_011072	A	7	7	50391	50397	100 %	0 %	0 %	0 %	194398379
1060	NC_011072	GAA	2	6	50445	50450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398070
1061	NC_011072	AGC	2	6	50509	50514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398070
1062	NC_011072	AGC	2	6	50573	50578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398070
1063	NC_011072	GAA	2	6	50595	50600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398070
1064	NC_011072	TCA	2	6	50812	50817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398070
1065	NC_011072	TGA	2	6	50843	50848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398070
1066	NC_011072	AGT	2	6	50906	50911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398070
1067	NC_011072	TGA	2	6	50939	50944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_011072	TTG	2	6	50983	50988	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_011072	A	7	7	51029	51035	100 %	0 %	0 %	0 %	194396879
1070	NC_011072	TTA	2	6	51068	51073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194396879
1071	NC_011072	GTTT	2	8	51239	51246	0 %	75 %	25 %	0 %	194396879
1072	NC_011072	TTACTG	2	12	51497	51508	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	194396879
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1074	NC_011072	A	6	6	51617	51622	100 %	0 %	0 %	0 %	194396916
1075	NC_011072	TTGG	2	8	51624	51631	0 %	50 %	50 %	0 %	194396916
1076	NC_011072	GAT	2	6	51698	51703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396916
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1078	NC_011072	TCG	2	6	51778	51783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396916
1079	NC_011072	ACA	2	6	51816	51821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194396916
1080	NC_011072	TGG	2	6	51843	51848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194396916
1081	NC_011072	TGG	2	6	51925	51930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194396916
1082	NC_011072	CAG	2	6	51948	51953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194396916
1083	NC_011072	CTG	2	6	51990	51995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396916
1084	NC_011072	AGC	2	6	52063	52068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194396916
1085	NC_011072	CA	3	6	52082	52087	50 %	0 %	0 %	50 %	194396916
1086	NC_011072	AAGC	2	8	52138	52145	50 %	0 %	25 %	25 %	194396916
1087	NC_011072	CAAG	2	8	52174	52181	50 %	0 %	25 %	25 %	194396916
1088	NC_011072	CAA	2	6	52205	52210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194396916
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1094	NC_011072	TGG	2	6	52459	52464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194396916
1095	NC_011072	GTC	2	6	52469	52474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396916
1096	NC_011072	TGC	2	6	52492	52497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396916
1097	NC_011072	ATC	2	6	52532	52537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194396916
1098	NC_011072	GCTA	2	8	52564	52571	25 %	25 %	25 %	25 %	194396916
1099	NC_011072	CCTTG	2	10	52603	52612	0 %	40 %	20 %	40 %	194396916
1100	NC_011072	GTG	2	6	52724	52729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194396916
1101	NC_011072	TCAAA	2	10	52797	52806	60 %	20 %	0 %	20 %	194396916
1102	NC_011072	TAT	2	6	52810	52815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194396916
1103	NC_011072	AACC	2	8	52858	52865	50 %	0 %	0 %	50 %	194396916
1104	NC_011072	CTT	2	6	52939	52944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194396916
1105	NC_011072	GAA	2	6	52964	52969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396916
1106	NC_011072	CAT	2	6	52993	52998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194396916
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1108	NC_011072	AAG	2	6	53097	53102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396916
1109	NC_011072	GAA	2	6	53111	53116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_011072	TTTC	2	8	53122	53129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_011072	T	6	6	53131	53136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_011072	T	6	6	53174	53179	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_011072	ATA	2	6	53183	53188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_011072	AAT	2	6	53195	53200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_011072	TTG	2	6	53230	53235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398590
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1119	NC_011072	ATG	2	6	53404	53409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194398590
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1253	NC_011072	TCA	2	6	59965	59970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398622
1254	NC_011072	ATC	2	6	60006	60011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398622
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1260	NC_011072	TGCT	2	8	60378	60385	0 %	50 %	25 %	25 %	194398622
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