MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pneumoniae G54 chromosome

Total Repeats: 42366

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011072	CTAT	2	8	23039	23046	25 %	50 %	0 %	25 %	194397970
502	NC_011072	AGA	2	6	23067	23072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397970
503	NC_011072	TCG	2	6	23127	23132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397970
504	NC_011072	TTGG	2	8	23143	23150	0 %	50 %	50 %	0 %	194397970
505	NC_011072	AACA	2	8	23189	23196	75 %	0 %	0 %	25 %	194397970
506	NC_011072	AAG	2	6	23275	23280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_011072	CCT	2	6	23282	23287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_011072	TTG	2	6	23291	23296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_011072	CTTTT	2	10	23313	23322	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
510	NC_011072	ATA	2	6	23325	23330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_011072	CTT	2	6	23361	23366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_011072	ATA	3	9	23386	23394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_011072	TAT	2	6	23427	23432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398441
514	NC_011072	GAA	2	6	23439	23444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398441
515	NC_011072	AAG	2	6	23446	23451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398441
516	NC_011072	GAGG	2	8	23459	23466	25 %	0 %	75 %	0 %	194398441
517	NC_011072	GA	3	6	23471	23476	50 %	0 %	50 %	0 %	194398441
518	NC_011072	TG	3	6	23517	23522	0 %	50 %	50 %	0 %	194398441
519	NC_011072	AGCG	2	8	23578	23585	25 %	0 %	50 %	25 %	194398441
520	NC_011072	ATGC	2	8	23589	23596	25 %	25 %	25 %	25 %	194398441
521	NC_011072	TGAG	2	8	23626	23633	25 %	25 %	50 %	0 %	194398441
522	NC_011072	GCT	2	6	23761	23766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194396984
523	NC_011072	ATC	2	6	23804	23809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194396984
524	NC_011072	T	7	7	23864	23870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_011072	A	6	6	23883	23888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_011072	ATA	2	6	23922	23927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_011072	GGA	2	6	23965	23970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
528	NC_011072	CAG	2	6	23974	23979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_011072	TG	3	6	23997	24002	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
530	NC_011072	T	6	6	24006	24011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_011072	AATA	2	8	24025	24032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_011072	AAT	2	6	24039	24044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_011072	ATA	2	6	24057	24062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_011072	GTT	2	6	24188	24193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397504
535	NC_011072	GA	3	6	24201	24206	50 %	0 %	50 %	0 %	194397504
536	NC_011072	TTC	2	6	24274	24279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194397504
537	NC_011072	AAG	2	6	24290	24295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397504
538	NC_011072	TTAA	2	8	24305	24312	50 %	50 %	0 %	0 %	194397504
539	NC_011072	ATT	2	6	24336	24341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397504
540	NC_011072	GAA	2	6	24382	24387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397504
541	NC_011072	GTT	2	6	24404	24409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194397504
542	NC_011072	TGG	2	6	24493	24498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397504
543	NC_011072	TA	3	6	24582	24587	50 %	50 %	0 %	0 %	194398233
544	NC_011072	GCA	2	6	24629	24634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194398233
545	NC_011072	AAT	2	6	24677	24682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	194398233
546	NC_011072	TCT	2	6	24687	24692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398233
547	NC_011072	TTA	2	6	24765	24770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398233
548	NC_011072	AGA	2	6	24819	24824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398233
549	NC_011072	ATGT	2	8	24911	24918	25 %	50 %	25 %	0 %	194398233
550	NC_011072	GTT	2	6	24948	24953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398233
551	NC_011072	GATT	2	8	24995	25002	25 %	50 %	25 %	0 %	194398233
552	NC_011072	A	6	6	25060	25065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_011072	TCT	2	6	25141	25146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_011072	AGGTTG	2	12	25157	25168	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	194397801
555	NC_011072	GT	3	6	25187	25192	0 %	50 %	50 %	0 %	194397801
556	NC_011072	GGA	2	6	25272	25277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397801
557	NC_011072	GAG	2	6	25420	25425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194397801
558	NC_011072	CAG	2	6	25432	25437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194397801
559	NC_011072	ATT	2	6	25552	25557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194397801
560	NC_011072	TCCA	2	8	25561	25568	25 %	25 %	0 %	50 %	194397801
561	NC_011072	CAT	2	6	25572	25577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397801
562	NC_011072	AAG	2	6	25697	25702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194397801
563	NC_011072	TGG	2	6	25736	25741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397801
564	NC_011072	CAC	2	6	25771	25776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194397801
565	NC_011072	GGC	2	6	25852	25857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194397801
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567	NC_011072	TCC	2	6	25921	25926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194397801
568	NC_011072	TAC	2	6	26013	26018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194397801
569	NC_011072	CTG	2	6	26114	26119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397801
570	NC_011072	GTG	2	6	26120	26125	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194397801
571	NC_011072	GA	3	6	26240	26245	50 %	0 %	50 %	0 %	194397801
572	NC_011072	GCT	2	6	26284	26289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194397801
573	NC_011072	AGG	2	6	26474	26479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
574	NC_011072	GGT	2	6	26665	26670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194398261
575	NC_011072	TTCG	2	8	26690	26697	0 %	50 %	25 %	25 %	194398261
576	NC_011072	CAA	2	6	26713	26718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194398261
577	NC_011072	AG	3	6	26728	26733	50 %	0 %	50 %	0 %	194398261
578	NC_011072	AGA	2	6	26859	26864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398261
579	NC_011072	AGAA	2	8	26994	27001	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011072	GAA	2	6	27009	27014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396909
581	NC_011072	CTA	2	6	27060	27065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194396909
582	NC_011072	ACGG	2	8	27067	27074	25 %	0 %	50 %	25 %	194396909
583	NC_011072	CT	3	6	27125	27130	0 %	50 %	0 %	50 %	194396909
584	NC_011072	A	6	6	27172	27177	100 %	0 %	0 %	0 %	194396909
585	NC_011072	AAG	2	6	27190	27195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396909
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587	NC_011072	TA	3	6	27262	27267	50 %	50 %	0 %	0 %	194396909
588	NC_011072	AGA	2	6	27345	27350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194396909
589	NC_011072	ATT	2	6	27360	27365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194396909
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592	NC_011072	GTA	2	6	27463	27468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194396909
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597	NC_011072	ATG	2	6	27678	27683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_011072	CTT	2	6	27705	27710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_011072	TTGA	2	8	27717	27724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
600	NC_011072	AT	3	6	27787	27792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_011072	GGA	2	6	27796	27801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
602	NC_011072	TCT	2	6	27839	27844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194398096
603	NC_011072	GA	3	6	27924	27929	50 %	0 %	50 %	0 %	194398096
604	NC_011072	GAA	2	6	27944	27949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398096
605	NC_011072	TGT	2	6	28069	28074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398096
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610	NC_011072	TGGT	2	8	28290	28297	0 %	50 %	50 %	0 %	194398096
611	NC_011072	TAT	2	6	28381	28386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	194398096
612	NC_011072	CGT	2	6	28394	28399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194398096
613	NC_011072	CAT	2	6	28435	28440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194398096
614	NC_011072	TTGA	2	8	28469	28476	25 %	50 %	25 %	0 %	194398096
615	NC_011072	TGAT	2	8	28482	28489	25 %	50 %	25 %	0 %	194398096
616	NC_011072	TTCT	2	8	28572	28579	0 %	75 %	0 %	25 %	194398096
617	NC_011072	GTT	2	6	28625	28630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194398096
618	NC_011072	ATCT	2	8	28640	28647	25 %	50 %	0 %	25 %	194398096
619	NC_011072	AGA	2	6	28651	28656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194398096
620	NC_011072	TGAT	2	8	28662	28669	25 %	50 %	25 %	0 %	194398096
621	NC_011072	CGTA	2	8	28714	28721	25 %	25 %	25 %	25 %	194398096
622	NC_011072	A	7	7	28763	28769	100 %	0 %	0 %	0 %	194398096
623	NC_011072	GAT	2	6	28788	28793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_011072	T	6	6	28801	28806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_011072	T	6	6	28811	28816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_011072	AATA	2	8	28820	28827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_011072	TAG	2	6	28830	28835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_011072	ATA	2	6	28872	28877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_011072	AGA	2	6	28883	28888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_011072	TCA	2	6	28903	28908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_011072	CAT	2	6	28923	28928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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633	NC_011072	TTC	2	6	29035	29040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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