MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 13557

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011071	CCAT	2	8	136	143	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011071	GATG	2	8	214	221	25 %	25 %	50 %	0 %	194363779
3	NC_011071	GTCG	2	8	1012	1019	0 %	25 %	50 %	25 %	194363779
4	NC_011071	GCCT	2	8	1404	1411	0 %	25 %	25 %	50 %	194363779
5	NC_011071	TGCC	2	8	1459	1466	0 %	25 %	25 %	50 %	194363779
6	NC_011071	CCCG	2	8	2030	2037	0 %	0 %	25 %	75 %	194363780
7	NC_011071	GCAG	2	8	2116	2123	25 %	0 %	50 %	25 %	194363780
8	NC_011071	TGCG	2	8	2610	2617	0 %	25 %	50 %	25 %	194363780
9	NC_011071	CCTG	2	8	3028	3035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011071	CGAT	2	8	3235	3242	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011071	CGTG	2	8	3816	3823	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011071	GGGC	2	8	4433	4440	0 %	0 %	75 %	25 %	194363781
13	NC_011071	AGGC	2	8	4480	4487	25 %	0 %	50 %	25 %	194363781
14	NC_011071	GCCT	2	8	4776	4783	0 %	25 %	25 %	50 %	194363781
15	NC_011071	CCAG	2	8	6173	6180	25 %	0 %	25 %	50 %	194363782
16	NC_011071	CGAA	2	8	6269	6276	50 %	0 %	25 %	25 %	194363782
17	NC_011071	TCGA	2	8	6952	6959	25 %	25 %	25 %	25 %	194363782
18	NC_011071	TGCG	2	8	7232	7239	0 %	25 %	50 %	25 %	194363782
19	NC_011071	TCGA	2	8	7309	7316	25 %	25 %	25 %	25 %	194363782
20	NC_011071	GCCT	2	8	8203	8210	0 %	25 %	25 %	50 %	194363783
21	NC_011071	CACC	2	8	8636	8643	25 %	0 %	0 %	75 %	194363784
22	NC_011071	CGCC	2	8	8970	8977	0 %	0 %	25 %	75 %	194363784
23	NC_011071	GCAG	2	8	9180	9187	25 %	0 %	50 %	25 %	194363784
24	NC_011071	CCAC	2	8	9266	9273	25 %	0 %	0 %	75 %	194363784
25	NC_011071	TCGA	2	8	9495	9502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_011071	CGAT	2	8	10520	10527	25 %	25 %	25 %	25 %	194363785
27	NC_011071	ACCT	2	8	10567	10574	25 %	25 %	0 %	50 %	194363785
28	NC_011071	AAGT	2	8	10693	10700	50 %	25 %	25 %	0 %	194363785
29	NC_011071	TCGA	2	8	11229	11236	25 %	25 %	25 %	25 %	194363786
30	NC_011071	TCGA	2	8	12179	12186	25 %	25 %	25 %	25 %	194363787
31	NC_011071	GGTG	2	8	12202	12209	0 %	25 %	75 %	0 %	194363787
32	NC_011071	AGTA	2	8	12393	12400	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011071	GCGA	2	8	13103	13110	25 %	0 %	50 %	25 %	194363789
34	NC_011071	ACCA	2	8	13151	13158	50 %	0 %	0 %	50 %	194363789
35	NC_011071	CTGG	2	8	13450	13457	0 %	25 %	50 %	25 %	194363790
36	NC_011071	GCCC	2	8	13701	13708	0 %	0 %	25 %	75 %	194363790
37	NC_011071	CTGG	2	8	13786	13793	0 %	25 %	50 %	25 %	194363790
38	NC_011071	CCAC	2	8	14035	14042	25 %	0 %	0 %	75 %	194363790
39	NC_011071	CACC	2	8	14086	14093	25 %	0 %	0 %	75 %	194363790
40	NC_011071	GGAT	2	8	14283	14290	25 %	25 %	50 %	0 %	194363790
41	NC_011071	CCAT	2	8	14385	14392	25 %	25 %	0 %	50 %	194363790
42	NC_011071	CTGG	2	8	14434	14441	0 %	25 %	50 %	25 %	194363790
43	NC_011071	GGCC	2	8	14812	14819	0 %	0 %	50 %	50 %	194363790
44	NC_011071	GCCT	2	8	15291	15298	0 %	25 %	25 %	50 %	194363792
45	NC_011071	CACG	2	8	16718	16725	25 %	0 %	25 %	50 %	194363793
46	NC_011071	AGGA	2	8	17147	17154	50 %	0 %	50 %	0 %	194363793
47	NC_011071	CTAC	3	12	17196	17207	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_011071	TCGC	2	8	17210	17217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_011071	CCGA	2	8	17578	17585	25 %	0 %	25 %	50 %	194363794
50	NC_011071	TTGG	2	8	18101	18108	0 %	50 %	50 %	0 %	194363794
51	NC_011071	CGCT	2	8	18520	18527	0 %	25 %	25 %	50 %	194363794
52	NC_011071	CCAG	2	8	18995	19002	25 %	0 %	25 %	50 %	194363794
53	NC_011071	GTTC	2	8	19554	19561	0 %	50 %	25 %	25 %	194363794
54	NC_011071	ATCC	2	8	19593	19600	25 %	25 %	0 %	50 %	194363794
55	NC_011071	GACC	2	8	19801	19808	25 %	0 %	25 %	50 %	194363794
56	NC_011071	ATCG	2	8	19935	19942	25 %	25 %	25 %	25 %	194363794
57	NC_011071	ACGG	2	8	20017	20024	25 %	0 %	50 %	25 %	194363794
58	NC_011071	GTCG	2	8	20696	20703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011071	CCAT	2	8	20761	20768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011071	TCTG	2	8	21386	21393	0 %	50 %	25 %	25 %	194363795
61	NC_011071	TGGC	2	8	21591	21598	0 %	25 %	50 %	25 %	194363795
62	NC_011071	CAGG	2	8	21867	21874	25 %	0 %	50 %	25 %	194363795
63	NC_011071	ACCA	2	8	21930	21937	50 %	0 %	0 %	50 %	194363795
64	NC_011071	GCAG	2	8	21993	22000	25 %	0 %	50 %	25 %	194363795
65	NC_011071	GACT	2	8	22067	22074	25 %	25 %	25 %	25 %	194363795
66	NC_011071	CGGC	2	8	23058	23065	0 %	0 %	50 %	50 %	194363796
67	NC_011071	CGCC	2	8	23521	23528	0 %	0 %	25 %	75 %	194363797
68	NC_011071	GCAG	2	8	23560	23567	25 %	0 %	50 %	25 %	194363797
69	NC_011071	CCTT	2	8	24374	24381	0 %	50 %	0 %	50 %	194363798
70	NC_011071	TGCT	2	8	24605	24612	0 %	50 %	25 %	25 %	194363798
71	NC_011071	GGCT	2	8	24776	24783	0 %	25 %	50 %	25 %	194363798
72	NC_011071	CGGC	2	8	25013	25020	0 %	0 %	50 %	50 %	194363798
73	NC_011071	CGTG	2	8	25121	25128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011071	CCTT	2	8	25175	25182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011071	CCAT	2	8	25254	25261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_011071	CGGC	2	8	26314	26321	0 %	0 %	50 %	50 %	194363799
77	NC_011071	ATCG	2	8	26388	26395	25 %	25 %	25 %	25 %	194363799
78	NC_011071	GCGT	2	8	26738	26745	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_011071	CTGC	2	8	26795	26802	0 %	25 %	25 %	50 %	194363800
80	NC_011071	GCCA	2	8	26922	26929	25 %	0 %	25 %	50 %	194363800
81	NC_011071	GCCG	2	8	26949	26956	0 %	0 %	50 %	50 %	194363800
82	NC_011071	AGCC	2	8	27341	27348	25 %	0 %	25 %	50 %	194363800
83	NC_011071	TGGC	2	8	27392	27399	0 %	25 %	50 %	25 %	194363800
84	NC_011071	GATC	2	8	27749	27756	25 %	25 %	25 %	25 %	194363800
85	NC_011071	AGCC	2	8	28130	28137	25 %	0 %	25 %	50 %	194363800
86	NC_011071	GCAC	2	8	28283	28290	25 %	0 %	25 %	50 %	194363800
87	NC_011071	TACC	2	8	28376	28383	25 %	25 %	0 %	50 %	194363800
88	NC_011071	GCCG	2	8	28875	28882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_011071	CGGC	2	8	28929	28936	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_011071	CGGC	2	8	29004	29011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011071	CGGC	2	8	29078	29085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011071	CCGT	2	8	29610	29617	0 %	25 %	25 %	50 %	194363802
93	NC_011071	CGGC	2	8	30033	30040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011071	TCGT	2	8	30421	30428	0 %	50 %	25 %	25 %	194363803
95	NC_011071	CGCA	2	8	31635	31642	25 %	0 %	25 %	50 %	194363804
96	NC_011071	AGCA	2	8	32215	32222	50 %	0 %	25 %	25 %	194363804
97	NC_011071	AAGG	2	8	32566	32573	50 %	0 %	50 %	0 %	194363804
98	NC_011071	GATC	2	8	32994	33001	25 %	25 %	25 %	25 %	194363804
99	NC_011071	AGGC	2	8	33176	33183	25 %	0 %	50 %	25 %	194363804
100	NC_011071	GCCG	2	8	33527	33534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_011071	CAGC	2	8	33894	33901	25 %	0 %	25 %	50 %	194363805
102	NC_011071	CGGT	2	8	34229	34236	0 %	25 %	50 %	25 %	194363806
103	NC_011071	CTTC	2	8	34752	34759	0 %	50 %	0 %	50 %	194363806
104	NC_011071	CCTT	2	8	34925	34932	0 %	50 %	0 %	50 %	194363806
105	NC_011071	CGCC	2	8	35085	35092	0 %	0 %	25 %	75 %	194363806
106	NC_011071	TTCA	2	8	35827	35834	25 %	50 %	0 %	25 %	194363807
107	NC_011071	CTCC	2	8	36307	36314	0 %	25 %	0 %	75 %	194363808
108	NC_011071	ACCG	2	8	36434	36441	25 %	0 %	25 %	50 %	194363808
109	NC_011071	GCAC	2	8	36448	36455	25 %	0 %	25 %	50 %	194363808
110	NC_011071	CGAA	2	8	36714	36721	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_011071	ACTC	2	8	36770	36777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011071	TCCT	2	8	37081	37088	0 %	50 %	0 %	50 %	194363809
113	NC_011071	CTCG	2	8	37428	37435	0 %	25 %	25 %	50 %	194363809
114	NC_011071	TGCG	2	8	37682	37689	0 %	25 %	50 %	25 %	194363809
115	NC_011071	GCAG	2	8	37945	37952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011071	CGCC	2	8	38081	38088	0 %	0 %	25 %	75 %	194363810
117	NC_011071	GGCA	2	8	38729	38736	25 %	0 %	50 %	25 %	194363810
118	NC_011071	GCCT	2	8	39143	39150	0 %	25 %	25 %	50 %	194363811
119	NC_011071	TGCT	2	8	39693	39700	0 %	50 %	25 %	25 %	194363812
120	NC_011071	GCCG	2	8	39712	39719	0 %	0 %	50 %	50 %	194363812
121	NC_011071	CACC	2	8	40026	40033	25 %	0 %	0 %	75 %	194363812
122	NC_011071	GCTG	2	8	40634	40641	0 %	25 %	50 %	25 %	194363813
123	NC_011071	GCCG	2	8	41547	41554	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011071	CGGC	2	8	41607	41614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011071	CGGC	2	8	41657	41664	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011071	CGGC	2	8	41707	41714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011071	CGGC	2	8	41829	41836	0 %	0 %	50 %	50 %	194363814
128	NC_011071	CGGC	2	8	42819	42826	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_011071	CCGG	2	8	43394	43401	0 %	0 %	50 %	50 %	194363815
130	NC_011071	ACCG	2	8	44219	44226	25 %	0 %	25 %	50 %	194363815
131	NC_011071	ACCA	2	8	45077	45084	50 %	0 %	0 %	50 %	194363815
132	NC_011071	CACC	2	8	45239	45246	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_011071	GCCG	2	8	45253	45260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011071	GGCC	2	8	45359	45366	0 %	0 %	50 %	50 %	194363816
135	NC_011071	TGCG	2	8	45389	45396	0 %	25 %	50 %	25 %	194363816
136	NC_011071	CGGG	2	8	45687	45694	0 %	0 %	75 %	25 %	194363816
137	NC_011071	CCAG	2	8	46066	46073	25 %	0 %	25 %	50 %	194363816
138	NC_011071	GGGC	2	8	46102	46109	0 %	0 %	75 %	25 %	194363816
139	NC_011071	ATGG	2	8	46129	46136	25 %	25 %	50 %	0 %	194363816
140	NC_011071	CGGC	2	8	46819	46826	0 %	0 %	50 %	50 %	194363817
141	NC_011071	CTCG	2	8	46871	46878	0 %	25 %	25 %	50 %	194363817
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143	NC_011071	CGGT	2	8	47763	47770	0 %	25 %	50 %	25 %	194363818
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