MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 116937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_011071	CAG	2	6	60554	60559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363830
1502	NC_011071	GCT	2	6	60565	60570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363830
1503	NC_011071	TGGCG	2	10	60583	60592	0 %	20 %	60 %	20 %	194363830
1504	NC_011071	TCG	2	6	60597	60602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363830
1505	NC_011071	GCA	3	9	60667	60675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363830
1506	NC_011071	CAG	2	6	60683	60688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363830
1507	NC_011071	CTG	2	6	60695	60700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363830
1508	NC_011071	GC	3	6	60747	60752	0 %	0 %	50 %	50 %	194363830
1509	NC_011071	GAG	2	6	60753	60758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194363830
1510	NC_011071	AGCC	2	8	60770	60777	25 %	0 %	25 %	50 %	194363830
1511	NC_011071	GTGC	2	8	60799	60806	0 %	25 %	50 %	25 %	194363830
1512	NC_011071	CGC	2	6	60811	60816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363830
1513	NC_011071	TCA	2	6	60829	60834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363830
1514	NC_011071	TCT	2	6	60850	60855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363830
1515	NC_011071	GGC	2	6	60860	60865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363830
1516	NC_011071	GGC	2	6	60872	60877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363830
1517	NC_011071	CTTC	2	8	60913	60920	0 %	50 %	0 %	50 %	194363830
1518	NC_011071	CAG	2	6	60935	60940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363830
1519	NC_011071	GGC	2	6	60998	61003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_011071	CGT	2	6	61102	61107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1521	NC_011071	TCCCTG	2	12	61114	61125	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	194363831
1522	NC_011071	GCC	2	6	61183	61188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363831
1523	NC_011071	CGC	2	6	61191	61196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363831
1524	NC_011071	GCTGCC	2	12	61213	61224	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194363831
1525	NC_011071	GC	4	8	61287	61294	0 %	0 %	50 %	50 %	194363831
1526	NC_011071	TGC	2	6	61329	61334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1527	NC_011071	ACC	2	6	61340	61345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363831
1528	NC_011071	GAAG	2	8	61359	61366	50 %	0 %	50 %	0 %	194363831
1529	NC_011071	GAA	2	6	61390	61395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363831
1530	NC_011071	GGT	2	6	61428	61433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363831
1531	NC_011071	TGGACG	2	12	61436	61447	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194363831
1532	NC_011071	GC	3	6	61477	61482	0 %	0 %	50 %	50 %	194363831
1533	NC_011071	ACG	2	6	61505	61510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1534	NC_011071	GTGG	2	8	61527	61534	0 %	25 %	75 %	0 %	194363831
1535	NC_011071	AAG	2	6	61540	61545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363831
1536	NC_011071	GCC	2	6	61582	61587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363831
1537	NC_011071	CTG	2	6	61606	61611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1538	NC_011071	CGA	2	6	61686	61691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1539	NC_011071	GAA	2	6	61749	61754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363831
1540	NC_011071	GCC	4	12	61757	61768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363831
1541	NC_011071	TCG	2	6	61823	61828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1542	NC_011071	ACG	2	6	61847	61852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1543	NC_011071	CTG	2	6	61864	61869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1544	NC_011071	CAG	2	6	61870	61875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1545	NC_011071	TGG	2	6	61900	61905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363831
1546	NC_011071	TGC	2	6	61907	61912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363831
1547	NC_011071	CGG	2	6	61926	61931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363831
1548	NC_011071	CAA	2	6	61950	61955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363831
1549	NC_011071	ATG	2	6	61985	61990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363831
1550	NC_011071	GC	3	6	61995	62000	0 %	0 %	50 %	50 %	194363831
1551	NC_011071	CG	3	6	62025	62030	0 %	0 %	50 %	50 %	194363832
1552	NC_011071	CCGCTG	2	12	62031	62042	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194363832
1553	NC_011071	CTG	2	6	62154	62159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363832
1554	NC_011071	TCG	2	6	62218	62223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363832
1555	NC_011071	TTC	2	6	62232	62237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363832
1556	NC_011071	GCG	2	6	62256	62261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363832
1557	NC_011071	CCA	2	6	62299	62304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363832
1558	NC_011071	TGGC	2	8	62309	62316	0 %	25 %	50 %	25 %	194363832
1559	NC_011071	GAT	2	6	62324	62329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363832
1560	NC_011071	GCC	2	6	62343	62348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363832
1561	NC_011071	CAG	2	6	62351	62356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363832
1562	NC_011071	CGT	2	6	62444	62449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363832
1563	NC_011071	CG	3	6	62457	62462	0 %	0 %	50 %	50 %	194363832
1564	NC_011071	GCC	2	6	62466	62471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363832
1565	NC_011071	GCC	2	6	62475	62480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363832
1566	NC_011071	CGC	2	6	62528	62533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363832
1567	NC_011071	GCC	2	6	62659	62664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363832
1568	NC_011071	CGCGG	2	10	62693	62702	0 %	0 %	60 %	40 %	194363832
1569	NC_011071	CAG	2	6	62709	62714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363832
1570	NC_011071	GC	3	6	62736	62741	0 %	0 %	50 %	50 %	194363832
1571	NC_011071	CAT	2	6	62870	62875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_011071	CGC	2	6	62908	62913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_011071	CGGAC	2	10	62925	62934	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
1574	NC_011071	T	8	8	63004	63011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_011071	CG	3	6	63012	63017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1576	NC_011071	GGC	2	6	63039	63044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_011071	GGC	2	6	63080	63085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_011071	TGC	3	9	63195	63203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1579	NC_011071	TGGCCG	2	12	63204	63215	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	194363833
1580	NC_011071	CGA	2	6	63232	63237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1581	NC_011071	CGG	2	6	63249	63254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363833
1582	NC_011071	GGC	2	6	63265	63270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363833
1583	NC_011071	CCAG	2	8	63339	63346	25 %	0 %	25 %	50 %	194363833
1584	NC_011071	GCA	2	6	63358	63363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1585	NC_011071	GCT	2	6	63421	63426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1586	NC_011071	CAGGC	2	10	63498	63507	20 %	0 %	40 %	40 %	194363833
1587	NC_011071	GGC	2	6	63523	63528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363833
1588	NC_011071	CCA	2	6	63565	63570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363833
1589	NC_011071	CAG	2	6	63590	63595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1590	NC_011071	GC	3	6	63668	63673	0 %	0 %	50 %	50 %	194363833
1591	NC_011071	CGC	2	6	63682	63687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363833
1592	NC_011071	CGGCG	2	10	63694	63703	0 %	0 %	60 %	40 %	194363833
1593	NC_011071	CGA	2	6	63718	63723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1594	NC_011071	GGCC	2	8	63727	63734	0 %	0 %	50 %	50 %	194363833
1595	NC_011071	GCA	2	6	63763	63768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1596	NC_011071	CTG	2	6	63857	63862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1597	NC_011071	GGCC	2	8	63907	63914	0 %	0 %	50 %	50 %	194363833
1598	NC_011071	CTG	2	6	63995	64000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363833
1599	NC_011071	GCC	2	6	64013	64018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363833
1600	NC_011071	GCG	2	6	64022	64027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363833
1601	NC_011071	CGC	3	9	64077	64085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363833
1602	NC_011071	GAA	2	6	64138	64143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363834
1603	NC_011071	CGCC	2	8	64154	64161	0 %	0 %	25 %	75 %	194363834
1604	NC_011071	CCG	3	9	64210	64218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363834
1605	NC_011071	CGGC	3	12	64228	64239	0 %	0 %	50 %	50 %	194363834
1606	NC_011071	GC	3	6	64255	64260	0 %	0 %	50 %	50 %	194363834
1607	NC_011071	GCC	2	6	64268	64273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363834
1608	NC_011071	GGA	2	6	64308	64313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194363834
1609	NC_011071	GCC	2	6	64334	64339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363834
1610	NC_011071	GCC	2	6	64400	64405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363834
1611	NC_011071	CGC	2	6	64421	64426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363834
1612	NC_011071	GC	3	6	64461	64466	0 %	0 %	50 %	50 %	194363834
1613	NC_011071	AGC	2	6	64514	64519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363834
1614	NC_011071	GCG	2	6	64520	64525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363834
1615	NC_011071	TCG	2	6	64616	64621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363834
1616	NC_011071	CG	3	6	64624	64629	0 %	0 %	50 %	50 %	194363834
1617	NC_011071	TGG	2	6	64682	64687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363834
1618	NC_011071	CCG	2	6	64695	64700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363834
1619	NC_011071	CTG	2	6	64702	64707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363834
1620	NC_011071	TGC	2	6	64712	64717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363834
1621	NC_011071	GCA	2	6	64727	64732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363834
1622	NC_011071	CCG	2	6	64750	64755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363834
1623	NC_011071	GCA	2	6	64766	64771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363834
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1625	NC_011071	CCG	2	6	64839	64844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363834
1626	NC_011071	CTG	2	6	64888	64893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363834
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1686	NC_011071	CA	3	6	66772	66777	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1687	NC_011071	CACC	2	8	66805	66812	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1688	NC_011071	TCG	2	6	66833	66838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363835
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1702	NC_011071	CTG	2	6	67309	67314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363836
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1734	NC_011071	AGCGCA	2	12	68351	68362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363837
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1998	NC_011071	ATC	2	6	78293	78298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363842
1999	NC_011071	CAC	2	6	78325	78330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363842
2000	NC_011071	TCGG	2	8	78335	78342	0 %	25 %	50 %	25 %	194363842

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