MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 116937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011071	CTG	2	6	421657	421662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11002	NC_011071	TGC	2	6	421670	421675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11003	NC_011071	GC	3	6	421715	421720	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11004	NC_011071	TGG	2	6	421730	421735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364129
11005	NC_011071	GC	3	6	421744	421749	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11006	NC_011071	GCT	3	9	421785	421793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11007	NC_011071	CTG	2	6	421801	421806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11008	NC_011071	CAG	2	6	421861	421866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11009	NC_011071	GCC	2	6	421961	421966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194364129
11010	NC_011071	GTG	2	6	422014	422019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364129
11011	NC_011071	CATG	2	8	422049	422056	25 %	25 %	25 %	25 %	194364129
11012	NC_011071	CGG	2	6	422076	422081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364129
11013	NC_011071	ATC	2	6	422092	422097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194364129
11014	NC_011071	GGT	2	6	422113	422118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364129
11015	NC_011071	CGGC	2	8	422171	422178	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11016	NC_011071	GC	3	6	422195	422200	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11017	NC_011071	GC	3	6	422227	422232	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11018	NC_011071	GCT	2	6	422253	422258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11019	NC_011071	CGGTG	2	10	422259	422268	0 %	20 %	60 %	20 %	194364129
11020	NC_011071	CCG	3	9	422270	422278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194364129
11021	NC_011071	TGCGCC	2	12	422300	422311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	194364129
11022	NC_011071	TGG	2	6	422316	422321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364129
11023	NC_011071	CG	3	6	422374	422379	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11024	NC_011071	GC	4	8	422406	422413	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11025	NC_011071	GTGGC	2	10	422414	422423	0 %	20 %	60 %	20 %	194364129
11026	NC_011071	CTG	2	6	422437	422442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11027	NC_011071	GTGC	2	8	422458	422465	0 %	25 %	50 %	25 %	194364129
11028	NC_011071	CG	3	6	422562	422567	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11029	NC_011071	GTG	2	6	422596	422601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364129
11030	NC_011071	CTG	2	6	422614	422619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11031	NC_011071	GCT	2	6	422658	422663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11032	NC_011071	CG	3	6	422669	422674	0 %	0 %	50 %	50 %	194364129
11033	NC_011071	CGT	2	6	422681	422686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364129
11034	NC_011071	GCCTG	2	10	422774	422783	0 %	20 %	40 %	40 %	194364129
11035	NC_011071	GCG	2	6	422842	422847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364129
11036	NC_011071	CGC	2	6	422865	422870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194364129
11037	NC_011071	TGC	2	6	422901	422906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_011071	AAC	2	6	422907	422912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_011071	CACC	2	8	422992	422999	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11040	NC_011071	CAG	2	6	423092	423097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_011071	CACC	2	8	423135	423142	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11042	NC_011071	GT	3	6	423152	423157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_011071	CCAA	2	8	423159	423166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11044	NC_011071	CGG	2	6	423188	423193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_011071	TGG	2	6	423199	423204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364130
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11047	NC_011071	GC	3	6	423232	423237	0 %	0 %	50 %	50 %	194364130
11048	NC_011071	CAG	2	6	423248	423253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364130
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11052	NC_011071	GC	3	6	423390	423395	0 %	0 %	50 %	50 %	194364130
11053	NC_011071	CAG	2	6	423437	423442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364130
11054	NC_011071	CAG	2	6	423506	423511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364130
11055	NC_011071	CCACG	2	10	423533	423542	20 %	0 %	20 %	60 %	194364130
11056	NC_011071	CGG	2	6	423543	423548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364130
11057	NC_011071	GCG	2	6	423566	423571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364130
11058	NC_011071	CAG	2	6	423665	423670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364130
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11060	NC_011071	GCGG	2	8	423710	423717	0 %	0 %	75 %	25 %	194364130
11061	NC_011071	GCCCG	2	10	423792	423801	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11062	NC_011071	TCA	2	6	423844	423849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194364131
11063	NC_011071	CGG	2	6	423856	423861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364131
11064	NC_011071	CGGT	2	8	423868	423875	0 %	25 %	50 %	25 %	194364131
11065	NC_011071	GC	3	6	423898	423903	0 %	0 %	50 %	50 %	194364131
11066	NC_011071	GTCG	2	8	423929	423936	0 %	25 %	50 %	25 %	194364131
11067	NC_011071	CTG	2	6	423950	423955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364131
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11072	NC_011071	GCGT	2	8	424117	424124	0 %	25 %	50 %	25 %	194364131
11073	NC_011071	GCG	2	6	424125	424130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364131
11074	NC_011071	GCG	2	6	424261	424266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364131
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11078	NC_011071	CGG	2	6	424371	424376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11079	NC_011071	CG	3	6	424401	424406	0 %	0 %	50 %	50 %	194364132
11080	NC_011071	CGGT	2	8	424479	424486	0 %	25 %	50 %	25 %	194364132
11081	NC_011071	CGG	2	6	424521	424526	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364132
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11087	NC_011071	CGGG	2	8	424663	424670	0 %	0 %	75 %	25 %	194364132
11088	NC_011071	CGGC	2	8	424675	424682	0 %	0 %	50 %	50 %	194364132
11089	NC_011071	CGG	2	6	424689	424694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364132
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11093	NC_011071	GAT	2	6	424786	424791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194364132
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11102	NC_011071	GCCG	2	8	425036	425043	0 %	0 %	50 %	50 %	194364133
11103	NC_011071	GTG	3	9	425052	425060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364133
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11105	NC_011071	GCA	2	6	425110	425115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364133
11106	NC_011071	CTG	2	6	425132	425137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364133
11107	NC_011071	CTG	2	6	425147	425152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364133
11108	NC_011071	GC	3	6	425179	425184	0 %	0 %	50 %	50 %	194364133
11109	NC_011071	CGC	2	6	425201	425206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194364133
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11113	NC_011071	CG	4	8	425551	425558	0 %	0 %	50 %	50 %	194364133
11114	NC_011071	CCA	3	9	425560	425568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194364133
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11120	NC_011071	CGG	2	6	425767	425772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11122	NC_011071	GCG	2	6	425875	425880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364134
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11245	NC_011071	CGG	2	6	430327	430332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364139
11246	NC_011071	CGA	2	6	430360	430365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364139
11247	NC_011071	CAG	2	6	430384	430389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364139
11248	NC_011071	TAC	2	6	430448	430453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194364139
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11250	NC_011071	CGC	2	6	430575	430580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194364139
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11252	NC_011071	CGG	2	6	430726	430731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364139
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11254	NC_011071	CTGG	2	8	430800	430807	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11255	NC_011071	GGAA	2	8	430832	430839	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11256	NC_011071	CTG	2	6	430902	430907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364140
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11264	NC_011071	CTG	2	6	431037	431042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364140
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11281	NC_011071	GCT	2	6	431543	431548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364140
11282	NC_011071	ATC	2	6	431550	431555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194364140
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11284	NC_011071	GCCG	2	8	431633	431640	0 %	0 %	50 %	50 %	194364140
11285	NC_011071	CGGC	2	8	431692	431699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11286	NC_011071	CACC	2	8	431735	431742	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
11287	NC_011071	CG	3	6	431812	431817	0 %	0 %	50 %	50 %	194364141
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11315	NC_011071	GC	3	6	432580	432585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11316	NC_011071	CTGG	2	8	432600	432607	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11317	NC_011071	AGTC	2	8	432608	432615	25 %	25 %	25 %	25 %	194364142
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11332	NC_011071	AT	3	6	433202	433207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11333	NC_011071	AT	3	6	433210	433215	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11334	NC_011071	ATC	2	6	433227	433232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11337	NC_011071	CCA	2	6	433565	433570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11338	NC_011071	CGC	2	6	433576	433581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11341	NC_011071	TGCG	2	8	433716	433723	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11342	NC_011071	AAC	2	6	433763	433768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194364143
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11356	NC_011071	TTCC	2	8	434197	434204	0 %	50 %	0 %	50 %	194364143
11357	NC_011071	AGC	2	6	434226	434231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364143
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11362	NC_011071	CGA	2	6	434446	434451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364143
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11364	NC_011071	GTG	2	6	434513	434518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364143
11365	NC_011071	CGGCAA	2	12	434554	434565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364143
11366	NC_011071	ATC	2	6	434567	434572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194364143
11367	NC_011071	GGC	3	9	434597	434605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364143
11368	NC_011071	GCT	2	6	434620	434625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364143
11369	NC_011071	CTG	2	6	434648	434653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364143
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11371	NC_011071	TGA	2	6	434685	434690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194364143
11372	NC_011071	CGG	2	6	434731	434736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364143
11373	NC_011071	TTC	2	6	434756	434761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194364143
11374	NC_011071	CGA	3	9	434803	434811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364143
11375	NC_011071	GTG	2	6	434829	434834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364143
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11382	NC_011071	GCC	2	6	435147	435152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194364143
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11386	NC_011071	CGA	2	6	435316	435321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364143
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11397	NC_011071	CGACC	2	10	435730	435739	20 %	0 %	20 %	60 %	194364143
11398	NC_011071	GCA	2	6	435766	435771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364143
11399	NC_011071	ATG	2	6	435785	435790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194364143
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11403	NC_011071	CTG	2	6	435896	435901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364143
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11418	NC_011071	TAA	2	6	436443	436448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11419	NC_011071	ATC	2	6	436456	436461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11420	NC_011071	T	6	6	436471	436476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11421	NC_011071	CAC	2	6	436506	436511	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194364144
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11430	NC_011071	CGCTC	2	10	436938	436947	0 %	20 %	20 %	60 %	194364144
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11432	NC_011071	CCGTA	2	10	437002	437011	20 %	20 %	20 %	40 %	194364144
11433	NC_011071	AAG	2	6	437065	437070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194364144
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11435	NC_011071	GCG	2	6	437231	437236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364144
11436	NC_011071	AGT	2	6	437337	437342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194364144
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11438	NC_011071	TG	3	6	437393	437398	0 %	50 %	50 %	0 %	194364144
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11445	NC_011071	A	6	6	437928	437933	100 %	0 %	0 %	0 %	194364144
11446	NC_011071	ACT	2	6	437942	437947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194364144
11447	NC_011071	TCAA	2	8	437968	437975	50 %	25 %	0 %	25 %	194364144
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11450	NC_011071	ACGC	2	8	438073	438080	25 %	0 %	25 %	50 %	194364144
11451	NC_011071	CGAT	2	8	438082	438089	25 %	25 %	25 %	25 %	194364144
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11453	NC_011071	AGCT	2	8	438168	438175	25 %	25 %	25 %	25 %	194364144
11454	NC_011071	AG	3	6	438225	438230	50 %	0 %	50 %	0 %	194364144
11455	NC_011071	CTA	2	6	438234	438239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194364144
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11457	NC_011071	CGATG	2	10	438390	438399	20 %	20 %	40 %	20 %	194364144
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11466	NC_011071	GCTTT	2	10	439044	439053	0 %	60 %	20 %	20 %	194364144
11467	NC_011071	GTG	2	6	439067	439072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194364144
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11470	NC_011071	GGA	2	6	439343	439348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194364144
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11472	NC_011071	TCG	2	6	439379	439384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364144
11473	NC_011071	AAGA	2	8	439414	439421	75 %	0 %	25 %	0 %	194364144
11474	NC_011071	GCT	3	9	439435	439443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364144
11475	NC_011071	TGGC	2	8	439483	439490	0 %	25 %	50 %	25 %	194364144
11476	NC_011071	GATGGC	2	12	439540	439551	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
11477	NC_011071	C	6	6	439641	439646	0 %	0 %	0 %	100 %	194364145
11478	NC_011071	CA	3	6	439683	439688	50 %	0 %	0 %	50 %	194364145
11479	NC_011071	CTC	2	6	439728	439733	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	194364145
11480	NC_011071	TCCGC	2	10	439754	439763	0 %	20 %	20 %	60 %	194364145
11481	NC_011071	CCA	2	6	439781	439786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194364145
11482	NC_011071	GC	3	6	439802	439807	0 %	0 %	50 %	50 %	194364145
11483	NC_011071	ATCCGC	2	12	439809	439820	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	194364145
11484	NC_011071	CGA	2	6	439910	439915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194364145
11485	NC_011071	GACG	2	8	439929	439936	25 %	0 %	50 %	25 %	194364145
11486	NC_011071	AGC	2	6	440031	440036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11487	NC_011071	CCA	2	6	440038	440043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11488	NC_011071	CGG	2	6	440091	440096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11489	NC_011071	CCGC	2	8	440116	440123	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11490	NC_011071	GCCG	2	8	440170	440177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11491	NC_011071	GCA	2	6	440259	440264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11492	NC_011071	TGA	2	6	440290	440295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11493	NC_011071	GCG	2	6	440467	440472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194364146
11494	NC_011071	ACCCGC	2	12	440502	440513	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	194364146
11495	NC_011071	TGC	2	6	440517	440522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194364146
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11498	NC_011071	TGCC	2	8	440735	440742	0 %	25 %	25 %	50 %	194364146
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