MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 116937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011071	TGA	2	6	20572	20577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363794
502	NC_011071	GGT	2	6	20658	20663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011071	GTCG	2	8	20696	20703	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
504	NC_011071	AAC	2	6	20706	20711	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_011071	CCAT	2	8	20761	20768	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
506	NC_011071	TGT	2	6	20807	20812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194363795
507	NC_011071	ACG	2	6	20833	20838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
508	NC_011071	TCG	2	6	20854	20859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363795
509	NC_011071	ATCAA	2	10	20979	20988	60 %	20 %	0 %	20 %	194363795
510	NC_011071	ACC	2	6	21072	21077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363795
511	NC_011071	TGC	2	6	21152	21157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363795
512	NC_011071	CGA	2	6	21172	21177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
513	NC_011071	ACG	2	6	21211	21216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
514	NC_011071	TCTG	2	8	21386	21393	0 %	50 %	25 %	25 %	194363795
515	NC_011071	AGA	2	6	21397	21402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363795
516	NC_011071	CAC	2	6	21413	21418	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363795
517	NC_011071	ACG	2	6	21427	21432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
518	NC_011071	ATC	2	6	21453	21458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363795
519	NC_011071	TGGC	2	8	21591	21598	0 %	25 %	50 %	25 %	194363795
520	NC_011071	AGG	2	6	21637	21642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194363795
521	NC_011071	GGC	2	6	21643	21648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363795
522	NC_011071	GCA	2	6	21679	21684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
523	NC_011071	ACG	2	6	21778	21783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
524	NC_011071	TCA	2	6	21820	21825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363795
525	NC_011071	CGG	2	6	21845	21850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363795
526	NC_011071	CAGG	2	8	21867	21874	25 %	0 %	50 %	25 %	194363795
527	NC_011071	ACCA	2	8	21930	21937	50 %	0 %	0 %	50 %	194363795
528	NC_011071	CAGTAC	2	12	21951	21962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	194363795
529	NC_011071	GCAG	2	8	21993	22000	25 %	0 %	50 %	25 %	194363795
530	NC_011071	ACG	2	6	22021	22026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
531	NC_011071	GCA	2	6	22045	22050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
532	NC_011071	GACT	2	8	22067	22074	25 %	25 %	25 %	25 %	194363795
533	NC_011071	CAA	2	6	22112	22117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363795
534	NC_011071	TGG	2	6	22216	22221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363795
535	NC_011071	GCA	2	6	22238	22243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
536	NC_011071	ATC	2	6	22261	22266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363795
537	NC_011071	CAG	2	6	22299	22304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
538	NC_011071	TAC	2	6	22392	22397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363795
539	NC_011071	AGC	2	6	22586	22591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363795
540	NC_011071	GGC	2	6	22598	22603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363795
541	NC_011071	CAT	2	6	22640	22645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363795
542	NC_011071	GGC	2	6	22694	22699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363795
543	NC_011071	CAA	2	6	22730	22735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363795
544	NC_011071	AG	3	6	22760	22765	50 %	0 %	50 %	0 %	194363795
545	NC_011071	GGC	2	6	22944	22949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363795
546	NC_011071	TGG	2	6	22973	22978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363795
547	NC_011071	ATGAA	2	10	22986	22995	60 %	20 %	20 %	0 %	194363796
548	NC_011071	CGGC	2	8	23058	23065	0 %	0 %	50 %	50 %	194363796
549	NC_011071	GAA	2	6	23093	23098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363796
550	NC_011071	GCG	2	6	23135	23140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363796
551	NC_011071	TCG	2	6	23216	23221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_011071	AGC	2	6	23222	23227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_011071	C	6	6	23237	23242	0 %	0 %	0 %	100 %	194363797
554	NC_011071	AAC	2	6	23244	23249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363797
555	NC_011071	TGGGTG	2	12	23322	23333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363797
556	NC_011071	GTC	2	6	23420	23425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363797
557	NC_011071	GCC	2	6	23513	23518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363797
558	NC_011071	CGCC	2	8	23521	23528	0 %	0 %	25 %	75 %	194363797
559	NC_011071	GCAG	2	8	23560	23567	25 %	0 %	50 %	25 %	194363797
560	NC_011071	GCT	3	9	23587	23595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363797
561	NC_011071	GCG	2	6	23668	23673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363797
562	NC_011071	CAG	2	6	23708	23713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363797
563	NC_011071	GCT	2	6	23737	23742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363797
564	NC_011071	GCC	2	6	23759	23764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363797
565	NC_011071	AC	3	6	23809	23814	50 %	0 %	0 %	50 %	194363797
566	NC_011071	CACCG	2	10	23822	23831	20 %	0 %	20 %	60 %	194363797
567	NC_011071	GC	3	6	23850	23855	0 %	0 %	50 %	50 %	194363797
568	NC_011071	GGC	2	6	23956	23961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_011071	GCC	2	6	23983	23988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_011071	GTCAT	2	10	24006	24015	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
571	NC_011071	CG	3	6	24056	24061	0 %	0 %	50 %	50 %	194363798
572	NC_011071	TCG	2	6	24062	24067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363798
573	NC_011071	GTG	2	6	24073	24078	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363798
574	NC_011071	CG	3	6	24105	24110	0 %	0 %	50 %	50 %	194363798
575	NC_011071	CAG	2	6	24208	24213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363798
576	NC_011071	GCC	2	6	24295	24300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363798
577	NC_011071	GATGC	2	10	24310	24319	20 %	20 %	40 %	20 %	194363798
578	NC_011071	CG	4	8	24366	24373	0 %	0 %	50 %	50 %	194363798
579	NC_011071	CCTT	2	8	24374	24381	0 %	50 %	0 %	50 %	194363798
580	NC_011071	CAG	2	6	24388	24393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363798
581	NC_011071	GCC	2	6	24467	24472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363798
582	NC_011071	GGT	2	6	24490	24495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363798
583	NC_011071	CGG	2	6	24594	24599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363798
584	NC_011071	TGCT	2	8	24605	24612	0 %	50 %	25 %	25 %	194363798
585	NC_011071	GCAGC	2	10	24661	24670	20 %	0 %	40 %	40 %	194363798
586	NC_011071	CAG	3	9	24736	24744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363798
587	NC_011071	CAC	2	6	24750	24755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363798
588	NC_011071	GGCT	2	8	24776	24783	0 %	25 %	50 %	25 %	194363798
589	NC_011071	TTC	2	6	24793	24798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363798
590	NC_011071	GCG	2	6	24809	24814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363798
591	NC_011071	GCC	2	6	24820	24825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363798
592	NC_011071	CTT	2	6	24871	24876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363798
593	NC_011071	CGGC	2	8	25013	25020	0 %	0 %	50 %	50 %	194363798
594	NC_011071	CGTG	2	8	25121	25128	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
595	NC_011071	CCTT	2	8	25175	25182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
596	NC_011071	GGGAGG	2	12	25197	25208	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_011071	CCAT	2	8	25254	25261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
598	NC_011071	CCTCCC	2	12	25283	25294	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
599	NC_011071	GC	3	6	25295	25300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_011071	CGC	2	6	25310	25315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_011071	GCAAGA	2	12	25331	25342	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
602	NC_011071	GTT	2	6	25392	25397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
603	NC_011071	GTT	2	6	25443	25448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194363799
604	NC_011071	TCG	2	6	25504	25509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363799
605	NC_011071	TGA	2	6	25571	25576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363799
606	NC_011071	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	194363799
607	NC_011071	CCA	2	6	25709	25714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363799
608	NC_011071	CAG	2	6	25793	25798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363799
609	NC_011071	CCA	2	6	25808	25813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363799
610	NC_011071	CGA	2	6	25871	25876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363799
611	NC_011071	GAT	2	6	25902	25907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	194363799
612	NC_011071	CAG	2	6	25992	25997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363799
613	NC_011071	GCA	2	6	26052	26057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363799
614	NC_011071	GCA	3	9	26063	26071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363799
615	NC_011071	CAG	2	6	26106	26111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363799
616	NC_011071	GGTCG	2	10	26136	26145	0 %	20 %	60 %	20 %	194363799
617	NC_011071	CCA	2	6	26159	26164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363799
618	NC_011071	CGG	2	6	26174	26179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363799
619	NC_011071	GCA	2	6	26240	26245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363799
620	NC_011071	CTT	2	6	26247	26252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363799
621	NC_011071	GGT	2	6	26304	26309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363799
622	NC_011071	CGGC	2	8	26314	26321	0 %	0 %	50 %	50 %	194363799
623	NC_011071	CAG	2	6	26325	26330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363799
624	NC_011071	ATCG	2	8	26388	26395	25 %	25 %	25 %	25 %	194363799
625	NC_011071	CG	3	6	26405	26410	0 %	0 %	50 %	50 %	194363799
626	NC_011071	GCT	3	9	26429	26437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363799
627	NC_011071	GC	3	6	26452	26457	0 %	0 %	50 %	50 %	194363799
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759	NC_011071	ACC	2	6	31021	31026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363803
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763	NC_011071	GGC	2	6	31416	31421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363804
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