MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia R551-3 chromosome

Total Repeats: 116937

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_011071	CGC	2	6	229388	229393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363966
6002	NC_011071	GGCC	2	8	229430	229437	0 %	0 %	50 %	50 %	194363966
6003	NC_011071	CTG	2	6	229446	229451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6004	NC_011071	GCT	2	6	229460	229465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6005	NC_011071	CTG	2	6	229470	229475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6006	NC_011071	CG	3	6	229488	229493	0 %	0 %	50 %	50 %	194363966
6007	NC_011071	GGCA	2	8	229507	229514	25 %	0 %	50 %	25 %	194363966
6008	NC_011071	GC	3	6	229524	229529	0 %	0 %	50 %	50 %	194363966
6009	NC_011071	TTC	2	6	229545	229550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363966
6010	NC_011071	GGC	2	6	229557	229562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363966
6011	NC_011071	ACC	2	6	229584	229589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363966
6012	NC_011071	GCG	2	6	229600	229605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363966
6013	NC_011071	GCCG	2	8	229625	229632	0 %	0 %	50 %	50 %	194363966
6014	NC_011071	CCG	2	6	229643	229648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363966
6015	NC_011071	CGAC	2	8	229666	229673	25 %	0 %	25 %	50 %	194363966
6016	NC_011071	TCA	2	6	229684	229689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363966
6017	NC_011071	CTG	2	6	229761	229766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6018	NC_011071	GCA	2	6	229772	229777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6019	NC_011071	GCC	2	6	229785	229790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363966
6020	NC_011071	CGA	2	6	229868	229873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6021	NC_011071	CG	3	6	229897	229902	0 %	0 %	50 %	50 %	194363966
6022	NC_011071	TGG	2	6	229952	229957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363966
6023	NC_011071	CGG	2	6	229969	229974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363966
6024	NC_011071	GGC	2	6	230060	230065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363966
6025	NC_011071	CGG	2	6	230155	230160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363966
6026	NC_011071	TCG	2	6	230203	230208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6027	NC_011071	T	6	6	230236	230241	0 %	100 %	0 %	0 %	194363966
6028	NC_011071	CCG	2	6	230258	230263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363966
6029	NC_011071	TGC	2	6	230278	230283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6030	NC_011071	CGC	2	6	230358	230363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363966
6031	NC_011071	GGC	2	6	230379	230384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363966
6032	NC_011071	CAA	2	6	230405	230410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363966
6033	NC_011071	CGTG	2	8	230444	230451	0 %	25 %	50 %	25 %	194363966
6034	NC_011071	ACG	2	6	230482	230487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6035	NC_011071	TGGCGA	2	12	230521	230532	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	194363966
6036	NC_011071	CGA	2	6	230537	230542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6037	NC_011071	TGC	2	6	230572	230577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6038	NC_011071	CGA	2	6	230600	230605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6039	NC_011071	CG	3	6	230612	230617	0 %	0 %	50 %	50 %	194363966
6040	NC_011071	GCC	2	6	230618	230623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363966
6041	NC_011071	TG	3	6	230667	230672	0 %	50 %	50 %	0 %	194363966
6042	NC_011071	GGC	2	6	230681	230686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363966
6043	NC_011071	GGA	2	6	230729	230734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194363966
6044	NC_011071	CCG	2	6	230743	230748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363966
6045	NC_011071	CAGC	2	8	230759	230766	25 %	0 %	25 %	50 %	194363966
6046	NC_011071	CAG	2	6	230793	230798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6047	NC_011071	CGAT	2	8	230815	230822	25 %	25 %	25 %	25 %	194363966
6048	NC_011071	GCT	2	6	230828	230833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6049	NC_011071	CCG	2	6	230875	230880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363966
6050	NC_011071	CA	4	8	230894	230901	50 %	0 %	0 %	50 %	194363966
6051	NC_011071	GCT	2	6	230918	230923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6052	NC_011071	CGA	2	6	230942	230947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363966
6053	NC_011071	CG	3	6	230978	230983	0 %	0 %	50 %	50 %	194363966
6054	NC_011071	GACC	2	8	230992	230999	25 %	0 %	25 %	50 %	194363966
6055	NC_011071	TCCC	2	8	231018	231025	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6056	NC_011071	GCAC	2	8	231030	231037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_011071	GTG	2	6	231151	231156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363967
6058	NC_011071	GCA	2	6	231282	231287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363967
6059	NC_011071	GGC	2	6	231333	231338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363967
6060	NC_011071	CGG	2	6	231401	231406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363967
6061	NC_011071	CAA	2	6	231420	231425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363967
6062	NC_011071	CTG	2	6	231430	231435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363967
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6065	NC_011071	CGG	2	6	231519	231524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363967
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6069	NC_011071	CGC	2	6	231675	231680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363967
6070	NC_011071	GC	3	6	231679	231684	0 %	0 %	50 %	50 %	194363967
6071	NC_011071	GCC	2	6	231688	231693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363967
6072	NC_011071	CTG	2	6	231715	231720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363967
6073	NC_011071	CTG	2	6	231751	231756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363967
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6075	NC_011071	TGGTG	2	10	231887	231896	0 %	40 %	60 %	0 %	194363967
6076	NC_011071	CGCA	2	8	231924	231931	25 %	0 %	25 %	50 %	194363967
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6087	NC_011071	GCCG	2	8	232369	232376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6088	NC_011071	CAC	2	6	232405	232410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6089	NC_011071	CGGC	2	8	232426	232433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6090	NC_011071	GCCG	2	8	232486	232493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6091	NC_011071	GTT	2	6	232512	232517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6092	NC_011071	CAG	2	6	232606	232611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6093	NC_011071	CAG	2	6	232619	232624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6094	NC_011071	ATCGG	2	10	232675	232684	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6095	NC_011071	GGC	2	6	232762	232767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_011071	TGCA	2	8	232852	232859	25 %	25 %	25 %	25 %	194363968
6097	NC_011071	TGT	2	6	232861	232866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	194363968
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6101	NC_011071	CG	3	6	233094	233099	0 %	0 %	50 %	50 %	194363968
6102	NC_011071	ATCCG	2	10	233156	233165	20 %	20 %	20 %	40 %	194363968
6103	NC_011071	CAGC	2	8	233231	233238	25 %	0 %	25 %	50 %	194363968
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6106	NC_011071	GCCGA	2	10	233386	233395	20 %	0 %	40 %	40 %	194363968
6107	NC_011071	GCT	3	9	233417	233425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363968
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6110	NC_011071	CGA	2	6	233558	233563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363968
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6112	NC_011071	CGC	2	6	233609	233614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363968
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6117	NC_011071	CTGC	2	8	233783	233790	0 %	25 %	25 %	50 %	194363968
6118	NC_011071	GA	3	6	233824	233829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_011071	CGC	2	6	233861	233866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363969
6120	NC_011071	TGCG	2	8	233879	233886	0 %	25 %	50 %	25 %	194363969
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6123	NC_011071	GCT	3	9	233913	233921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363969
6124	NC_011071	GCC	2	6	233947	233952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363969
6125	NC_011071	GCA	2	6	233991	233996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363969
6126	NC_011071	AAC	2	6	234175	234180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	194363969
6127	NC_011071	ATCG	2	8	234189	234196	25 %	25 %	25 %	25 %	194363969
6128	NC_011071	TGGAGG	2	12	234215	234226	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	194363969
6129	NC_011071	GC	3	6	234247	234252	0 %	0 %	50 %	50 %	194363969
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6131	NC_011071	CTG	2	6	234280	234285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363969
6132	NC_011071	CGG	2	6	234290	234295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363969
6133	NC_011071	CTG	2	6	234296	234301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363969
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6135	NC_011071	GTGGCG	2	12	234418	234429	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	194363969
6136	NC_011071	GGC	2	6	234491	234496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363969
6137	NC_011071	GGC	2	6	234519	234524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363969
6138	NC_011071	GCT	2	6	234555	234560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363969
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6140	NC_011071	GC	3	6	234619	234624	0 %	0 %	50 %	50 %	194363969
6141	NC_011071	GAC	2	6	234649	234654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363969
6142	NC_011071	GC	3	6	234724	234729	0 %	0 %	50 %	50 %	194363969
6143	NC_011071	GC	3	6	234739	234744	0 %	0 %	50 %	50 %	194363969
6144	NC_011071	GATC	2	8	234768	234775	25 %	25 %	25 %	25 %	194363969
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6147	NC_011071	GTC	2	6	234874	234879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363969
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6149	NC_011071	GTG	3	9	234961	234969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363969
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6151	NC_011071	GTC	2	6	235110	235115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363969
6152	NC_011071	CGAT	2	8	235183	235190	25 %	25 %	25 %	25 %	194363969
6153	NC_011071	GGA	2	6	235209	235214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	194363969
6154	NC_011071	CG	4	8	235215	235222	0 %	0 %	50 %	50 %	194363969
6155	NC_011071	CCG	2	6	235322	235327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363969
6156	NC_011071	ATC	2	6	235367	235372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	194363969
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6188	NC_011071	GCA	2	6	236772	236777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6227	NC_011071	GTG	2	6	238437	238442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	194363973
6228	NC_011071	GCG	2	6	238492	238497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363973
6229	NC_011071	GCG	2	6	238513	238518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363973
6230	NC_011071	CTG	2	6	238521	238526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363973
6231	NC_011071	CGT	2	6	238658	238663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363973
6232	NC_011071	CAG	2	6	238671	238676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363973
6233	NC_011071	AGC	2	6	238681	238686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363973
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6235	NC_011071	CGCAG	2	10	238791	238800	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6236	NC_011071	CAAG	2	8	238804	238811	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6237	NC_011071	GC	3	6	238812	238817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6238	NC_011071	CTG	2	6	238841	238846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6239	NC_011071	CGT	2	6	238946	238951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6240	NC_011071	TGGC	2	8	239025	239032	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6241	NC_011071	GC	3	6	239031	239036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6242	NC_011071	CG	3	6	239095	239100	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6243	NC_011071	CG	3	6	239110	239115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6244	NC_011071	CGC	2	6	239131	239136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363974
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6246	NC_011071	GCACC	2	10	239151	239160	20 %	0 %	20 %	60 %	194363974
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6361	NC_011071	ACG	2	6	243934	243939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6363	NC_011071	GCGG	2	8	243972	243979	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6364	NC_011071	AAG	2	6	244039	244044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6365	NC_011071	CAA	2	6	244057	244062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6366	NC_011071	GAA	2	6	244109	244114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	194363977
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6490	NC_011071	GCG	2	6	248878	248883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363982
6491	NC_011071	ACG	2	6	248920	248925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363982
6492	NC_011071	GCA	2	6	249046	249051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	194363982
6493	NC_011071	GTGCTG	2	12	249060	249071	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	194363982
6494	NC_011071	TTC	2	6	249078	249083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	194363982
6495	NC_011071	GCT	2	6	249119	249124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363982
6496	NC_011071	CAC	2	6	249158	249163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	194363982
6497	NC_011071	CGG	2	6	249172	249177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	194363982
6498	NC_011071	CTG	2	6	249234	249239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	194363982
6499	NC_011071	GC	4	8	249290	249297	0 %	0 %	50 %	50 %	194363982
6500	NC_011071	CCG	2	6	249331	249336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	194363982

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