MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 123609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010943	CTT	2	6	139565	139570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572210
3502	NC_010943	AGC	3	9	139633	139641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572210
3503	NC_010943	CCA	2	6	139696	139701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572210
3504	NC_010943	TCG	2	6	139749	139754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572210
3505	NC_010943	TCCAGC	2	12	139899	139910	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572210
3506	NC_010943	GCCT	2	8	140013	140020	0 %	25 %	25 %	50 %	190572210
3507	NC_010943	GCG	2	6	140025	140030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572210
3508	NC_010943	CTTC	2	8	140038	140045	0 %	50 %	0 %	50 %	190572210
3509	NC_010943	GAA	2	6	140055	140060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572210
3510	NC_010943	ACC	2	6	140088	140093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572210
3511	NC_010943	GCG	3	9	140100	140108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572210
3512	NC_010943	GCG	3	9	140322	140330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572210
3513	NC_010943	CAG	3	9	140339	140347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572210
3514	NC_010943	CGC	3	9	140480	140488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572210
3515	NC_010943	CTG	2	6	140489	140494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572210
3516	NC_010943	TGG	2	6	140530	140535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572210
3517	NC_010943	CAC	2	6	140597	140602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572210
3518	NC_010943	GGCG	2	8	140686	140693	0 %	0 %	75 %	25 %	190572210
3519	NC_010943	CTT	2	6	140720	140725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572210
3520	NC_010943	CGG	2	6	140758	140763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572210
3521	NC_010943	GAA	2	6	140777	140782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572210
3522	NC_010943	GCCC	2	8	140797	140804	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3523	NC_010943	GCT	2	6	140847	140852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_010943	GC	3	6	140891	140896	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3525	NC_010943	TGA	2	6	140902	140907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572211
3526	NC_010943	GTG	2	6	140928	140933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572211
3527	NC_010943	CCG	2	6	140950	140955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572211
3528	NC_010943	GAA	2	6	140984	140989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572211
3529	NC_010943	GTA	2	6	141113	141118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572211
3530	NC_010943	GCC	2	6	141125	141130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572211
3531	NC_010943	GCT	2	6	141148	141153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3532	NC_010943	TCGA	2	8	141156	141163	25 %	25 %	25 %	25 %	190572211
3533	NC_010943	GCT	2	6	141232	141237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3534	NC_010943	TCG	2	6	141342	141347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3535	NC_010943	TCG	2	6	141417	141422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3536	NC_010943	GAA	2	6	141464	141469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572211
3537	NC_010943	TCCAGC	2	12	141567	141578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572211
3538	NC_010943	CG	4	8	141676	141683	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3539	NC_010943	GGCG	2	8	141685	141692	0 %	0 %	75 %	25 %	190572211
3540	NC_010943	GCC	2	6	141743	141748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572211
3541	NC_010943	CG	3	6	141766	141771	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3542	NC_010943	GCCCAT	2	12	141794	141805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572211
3543	NC_010943	TGGCGG	2	12	141856	141867	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	190572211
3544	NC_010943	GATG	2	8	141886	141893	25 %	25 %	50 %	0 %	190572211
3545	NC_010943	CAGCG	2	10	141986	141995	20 %	0 %	40 %	40 %	190572211
3546	NC_010943	CAG	3	9	142007	142015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3547	NC_010943	CCGA	2	8	142083	142090	25 %	0 %	25 %	50 %	190572211
3548	NC_010943	CCGG	2	8	142111	142118	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3549	NC_010943	CGC	3	9	142148	142156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572211
3550	NC_010943	GC	3	6	142170	142175	0 %	0 %	50 %	50 %	190572211
3551	NC_010943	CGG	2	6	142177	142182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572211
3552	NC_010943	CTG	2	6	142190	142195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3553	NC_010943	CACGCC	2	12	142238	142249	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	190572211
3554	NC_010943	TGA	2	6	142294	142299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572211
3555	NC_010943	GTGC	2	8	142353	142360	0 %	25 %	50 %	25 %	190572211
3556	NC_010943	GGC	2	6	142361	142366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572211
3557	NC_010943	AGC	2	6	142416	142421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3558	NC_010943	CGG	2	6	142426	142431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572211
3559	NC_010943	GCA	3	9	142450	142458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3560	NC_010943	CGT	2	6	142497	142502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572211
3561	NC_010943	TC	5	10	142514	142523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3562	NC_010943	TGCG	2	8	142527	142534	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3563	NC_010943	CTC	2	6	142565	142570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_010943	GCAACG	2	12	142659	142670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_010943	AGCCAG	2	12	142676	142687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_010943	GGCGG	2	10	142706	142715	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3567	NC_010943	TGGG	2	8	142718	142725	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_010943	CCAT	2	8	142766	142773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_010943	CCCA	2	8	142790	142797	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3570	NC_010943	TGG	2	6	142833	142838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010943	GGGT	2	8	142965	142972	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010943	GCG	2	6	143002	143007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_010943	ACCC	2	8	143051	143058	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3574	NC_010943	CCG	2	6	143281	143286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572212
3575	NC_010943	CTT	2	6	143329	143334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572212
3576	NC_010943	ATC	2	6	143373	143378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572212
3577	NC_010943	GCT	2	6	143422	143427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572212
3578	NC_010943	CTG	2	6	143432	143437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572212
3579	NC_010943	CCG	2	6	143438	143443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572212
3580	NC_010943	GCG	2	6	143444	143449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572212
3581	NC_010943	GCA	2	6	143496	143501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572212
3582	NC_010943	GCG	2	6	143510	143515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572212
3583	NC_010943	CAT	2	6	143536	143541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572212
3584	NC_010943	GTT	2	6	143563	143568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572212
3585	NC_010943	GCT	2	6	143584	143589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572212
3586	NC_010943	GCT	2	6	143602	143607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572212
3587	NC_010943	CGG	2	6	143632	143637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572212
3588	NC_010943	CAA	2	6	143782	143787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572212
3589	NC_010943	CCT	2	6	143791	143796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572212
3590	NC_010943	TGC	2	6	143846	143851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572213
3591	NC_010943	GCA	2	6	143853	143858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572213
3592	NC_010943	CTG	2	6	143924	143929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572213
3593	NC_010943	CGC	2	6	143989	143994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572213
3594	NC_010943	GC	4	8	143997	144004	0 %	0 %	50 %	50 %	190572213
3595	NC_010943	GCC	2	6	144019	144024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572213
3596	NC_010943	CGT	2	6	144142	144147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572213
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3598	NC_010943	CG	3	6	144260	144265	0 %	0 %	50 %	50 %	190572213
3599	NC_010943	GCC	2	6	144320	144325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572213
3600	NC_010943	CCA	2	6	144395	144400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572213
3601	NC_010943	CGG	2	6	144402	144407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572213
3602	NC_010943	ATGC	2	8	144512	144519	25 %	25 %	25 %	25 %	190572213
3603	NC_010943	CATT	2	8	144525	144532	25 %	50 %	0 %	25 %	190572213
3604	NC_010943	CAA	2	6	144568	144573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572213
3605	NC_010943	GT	3	6	144607	144612	0 %	50 %	50 %	0 %	190572213
3606	NC_010943	GCA	2	6	144643	144648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572213
3607	NC_010943	CAT	2	6	144694	144699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572213
3608	NC_010943	CAGG	2	8	144715	144722	25 %	0 %	50 %	25 %	190572213
3609	NC_010943	GTC	2	6	144729	144734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572213
3610	NC_010943	CTG	2	6	144788	144793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572213
3611	NC_010943	GGC	2	6	144816	144821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572213
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3613	NC_010943	CG	3	6	144886	144891	0 %	0 %	50 %	50 %	190572213
3614	NC_010943	GAA	2	6	144937	144942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572213
3615	NC_010943	AGT	2	6	144952	144957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572213
3616	NC_010943	GAC	2	6	144962	144967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572213
3617	NC_010943	AG	4	8	145005	145012	50 %	0 %	50 %	0 %	190572213
3618	NC_010943	CAT	2	6	145084	145089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572213
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3620	NC_010943	GAC	2	6	145155	145160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572214
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3622	NC_010943	GGC	2	6	145279	145284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572214
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3747	NC_010943	CTG	2	6	149764	149769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572216
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3761	NC_010943	TCA	2	6	150276	150281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572217
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3857	NC_010943	GGT	2	6	153290	153295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572220
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3859	NC_010943	CGT	2	6	153440	153445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572220
3860	NC_010943	TGCG	2	8	153526	153533	0 %	25 %	50 %	25 %	190572220
3861	NC_010943	CTG	2	6	153566	153571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572221
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3865	NC_010943	CTG	2	6	153830	153835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572221
3866	NC_010943	GCA	2	6	153849	153854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572221
3867	NC_010943	GAC	2	6	153884	153889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572221
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3985	NC_010943	ATC	2	6	158072	158077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572225
3986	NC_010943	GGCCA	2	10	158147	158156	20 %	0 %	40 %	40 %	190572225
3987	NC_010943	GCTG	2	8	158166	158173	0 %	25 %	50 %	25 %	190572225
3988	NC_010943	GCA	3	9	158185	158193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572225
3989	NC_010943	GAG	2	6	158204	158209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572225
3990	NC_010943	GCA	2	6	158224	158229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572225
3991	NC_010943	GAC	2	6	158249	158254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572225
3992	NC_010943	GCA	2	6	158269	158274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572225
3993	NC_010943	CTG	3	9	158282	158290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572225
3994	NC_010943	CGA	2	6	158314	158319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572225
3995	NC_010943	CAC	2	6	158332	158337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572225
3996	NC_010943	CGA	2	6	158407	158412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572225
3997	NC_010943	AGCGC	2	10	158413	158422	20 %	0 %	40 %	40 %	190572225
3998	NC_010943	CG	4	8	158437	158444	0 %	0 %	50 %	50 %	190572225
3999	NC_010943	ATC	2	6	158454	158459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572225
4000	NC_010943	CTG	2	6	158465	158470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572225

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