MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 123609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010943	CAT	2	6	87063	87068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572169
2003	NC_010943	GC	3	6	87084	87089	0 %	0 %	50 %	50 %	190572169
2004	NC_010943	GCG	2	6	87098	87103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572169
2005	NC_010943	CTG	2	6	87138	87143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572169
2006	NC_010943	GCT	2	6	87236	87241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572169
2007	NC_010943	GCC	2	6	87309	87314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572169
2008	NC_010943	GCG	2	6	87332	87337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572169
2009	NC_010943	CTG	2	6	87339	87344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572169
2010	NC_010943	GCTG	2	8	87382	87389	0 %	25 %	50 %	25 %	190572169
2011	NC_010943	CG	4	8	87462	87469	0 %	0 %	50 %	50 %	190572169
2012	NC_010943	GGC	2	6	87473	87478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572169
2013	NC_010943	GCT	2	6	87479	87484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572169
2014	NC_010943	GCC	2	6	87504	87509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572169
2015	NC_010943	TGG	2	6	87607	87612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572169
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2019	NC_010943	ATGGCG	2	12	87789	87800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190572170
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2052	NC_010943	CG	3	6	88716	88721	0 %	0 %	50 %	50 %	190572171
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2054	NC_010943	GC	3	6	88745	88750	0 %	0 %	50 %	50 %	190572171
2055	NC_010943	GGGCA	2	10	88807	88816	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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2058	NC_010943	ACG	2	6	88893	88898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572172
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2063	NC_010943	TGC	2	6	89087	89092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572172
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2096	NC_010943	ACCC	2	8	90675	90682	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2097	NC_010943	TGC	2	6	90733	90738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2098	NC_010943	CACC	2	8	90813	90820	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2099	NC_010943	CCGCC	2	10	90936	90945	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
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2101	NC_010943	CGGC	2	8	90995	91002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2102	NC_010943	GATC	2	8	91073	91080	25 %	25 %	25 %	25 %	190572173
2103	NC_010943	TCT	2	6	91100	91105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572173
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2106	NC_010943	TCG	2	6	91255	91260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572173
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2110	NC_010943	ACC	2	6	91354	91359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572173
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2377	NC_010943	ACGCCT	2	12	100787	100798	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190572182
2378	NC_010943	CGC	2	6	100806	100811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572182
2379	NC_010943	GGT	2	6	100827	100832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572182
2380	NC_010943	GCC	2	6	100915	100920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572182
2381	NC_010943	CTG	3	9	100975	100983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2382	NC_010943	CTG	2	6	100990	100995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2383	NC_010943	GCC	2	6	101013	101018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572182
2384	NC_010943	AACCTG	2	12	101038	101049	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190572182
2385	NC_010943	GGT	2	6	101052	101057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572182
2386	NC_010943	CTG	2	6	101065	101070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2387	NC_010943	TTC	2	6	101086	101091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572182
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2390	NC_010943	CGG	2	6	101163	101168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572182
2391	NC_010943	TCG	2	6	101186	101191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2392	NC_010943	GGC	2	6	101194	101199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572182
2393	NC_010943	CTG	2	6	101218	101223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2394	NC_010943	GGC	2	6	101233	101238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572182
2395	NC_010943	TGCG	2	8	101255	101262	0 %	25 %	50 %	25 %	190572182
2396	NC_010943	GGC	2	6	101332	101337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572182
2397	NC_010943	CCGG	2	8	101357	101364	0 %	0 %	50 %	50 %	190572182
2398	NC_010943	AAGGAA	2	12	101368	101379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572182
2399	NC_010943	GCT	2	6	101391	101396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2400	NC_010943	GGT	3	9	101436	101444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572182
2401	NC_010943	ACG	2	6	101471	101476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2402	NC_010943	AGCC	2	8	101531	101538	25 %	0 %	25 %	50 %	190572182
2403	NC_010943	CTG	2	6	101620	101625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2404	NC_010943	CTG	2	6	101635	101640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2405	NC_010943	GCT	2	6	101703	101708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
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2407	NC_010943	ATC	2	6	101764	101769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572182
2408	NC_010943	TCAGCG	2	12	101828	101839	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2409	NC_010943	TGC	2	6	101852	101857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2410	NC_010943	CAA	2	6	101871	101876	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572182
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2412	NC_010943	TCG	2	6	101899	101904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2413	NC_010943	CTG	2	6	101913	101918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
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2418	NC_010943	CTG	2	6	102073	102078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
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2422	NC_010943	CGA	2	6	102132	102137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572182
2423	NC_010943	TGCG	2	8	102149	102156	0 %	25 %	50 %	25 %	190572182
2424	NC_010943	GCA	2	6	102171	102176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572182
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2429	NC_010943	TTC	2	6	102316	102321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572182
2430	NC_010943	GCT	2	6	102396	102401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572182
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2433	NC_010943	GC	3	6	102496	102501	0 %	0 %	50 %	50 %	190572182
2434	NC_010943	GGTG	2	8	102548	102555	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2435	NC_010943	CACC	2	8	102599	102606	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2436	NC_010943	TCG	2	6	102627	102632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2437	NC_010943	GGC	2	6	102725	102730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2438	NC_010943	CAG	2	6	102752	102757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2440	NC_010943	GCG	2	6	102777	102782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2441	NC_010943	CGG	2	6	102799	102804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2442	NC_010943	GAT	2	6	102840	102845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2443	NC_010943	CCG	2	6	102848	102853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2444	NC_010943	TCCC	2	8	102926	102933	0 %	25 %	0 %	75 %	190572183
2445	NC_010943	CGC	2	6	102949	102954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572183
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2449	NC_010943	GGCGA	2	10	103019	103028	20 %	0 %	60 %	20 %	190572183
2450	NC_010943	CGG	2	6	103081	103086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572183
2451	NC_010943	CTG	2	6	103103	103108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572183
2452	NC_010943	TGC	3	9	103113	103121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572183
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2471	NC_010943	ACC	2	6	103709	103714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572183
2472	NC_010943	CGA	2	6	103744	103749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572183
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2474	NC_010943	CTGG	2	8	103774	103781	0 %	25 %	50 %	25 %	190572183
2475	NC_010943	GCCGAC	2	12	103793	103804	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190572183
2476	NC_010943	GGTC	2	8	103832	103839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2477	NC_010943	TTC	2	6	103889	103894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572184
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2479	NC_010943	GCT	2	6	103933	103938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572184
2480	NC_010943	CTG	2	6	103949	103954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572184
2481	NC_010943	CG	3	6	103983	103988	0 %	0 %	50 %	50 %	190572184
2482	NC_010943	GAG	2	6	104012	104017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572184
2483	NC_010943	GCG	2	6	104067	104072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572184
2484	NC_010943	CGG	3	9	104088	104096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572184
2485	NC_010943	GGA	2	6	104125	104130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572184
2486	NC_010943	GAG	2	6	104135	104140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572184
2487	NC_010943	AAGG	2	8	104141	104148	50 %	0 %	50 %	0 %	190572184
2488	NC_010943	CCG	2	6	104149	104154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572184
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2492	NC_010943	CG	3	6	104211	104216	0 %	0 %	50 %	50 %	190572184
2493	NC_010943	ACG	2	6	104238	104243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572184
2494	NC_010943	GCA	2	6	104257	104262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572184
2495	NC_010943	CGC	2	6	104373	104378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572184
2496	NC_010943	GGC	2	6	104468	104473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572184
2497	NC_010943	GGT	2	6	104476	104481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572184
2498	NC_010943	CTGCG	2	10	104501	104510	0 %	20 %	40 %	40 %	190572184
2499	NC_010943	CGA	2	6	104596	104601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572184
2500	NC_010943	CGA	2	6	104659	104664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572184

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