MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Stenotrophomonas maltophilia K279a chromosome

Total Repeats: 123609

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010943	GGA	2	6	46357	46362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572130
1002	NC_010943	TGT	2	6	46410	46415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572130
1003	NC_010943	CGC	2	6	46481	46486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572130
1004	NC_010943	TCTG	2	8	46498	46505	0 %	50 %	25 %	25 %	190572130
1005	NC_010943	AGA	2	6	46509	46514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572130
1006	NC_010943	ACG	2	6	46526	46531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572130
1007	NC_010943	ACG	2	6	46539	46544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572130
1008	NC_010943	TGAG	2	8	46557	46564	25 %	25 %	50 %	0 %	190572130
1009	NC_010943	TGG	2	6	46629	46634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572130
1010	NC_010943	GC	3	6	46694	46699	0 %	0 %	50 %	50 %	190572130
1011	NC_010943	TGGC	2	8	46703	46710	0 %	25 %	50 %	25 %	190572130
1012	NC_010943	CAG	2	6	46789	46794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572130
1013	NC_010943	GTG	2	6	46824	46829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572130
1014	NC_010943	TCG	2	6	46848	46853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572130
1015	NC_010943	CAA	2	6	46936	46941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572130
1016	NC_010943	ACG	2	6	46950	46955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572130
1017	NC_010943	CGG	2	6	46957	46962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572130
1018	NC_010943	GCC	2	6	47058	47063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572130
1019	NC_010943	ACG	2	6	47073	47078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572130
1020	NC_010943	GGA	2	6	47168	47173	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190572130
1021	NC_010943	CGAC	2	8	47178	47185	25 %	0 %	25 %	50 %	190572130
1022	NC_010943	CAA	2	6	47284	47289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572130
1023	NC_010943	GT	3	6	47292	47297	0 %	50 %	50 %	0 %	190572130
1024	NC_010943	TGG	2	6	47328	47333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572130
1025	NC_010943	GCA	2	6	47350	47355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572130
1026	NC_010943	CAG	2	6	47411	47416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572130
1027	NC_010943	TAC	2	6	47504	47509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572130
1028	NC_010943	GC	3	6	47736	47741	0 %	0 %	50 %	50 %	190572130
1029	NC_010943	TGA	2	6	47767	47772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572130
1030	NC_010943	GGGC	2	8	47841	47848	0 %	0 %	75 %	25 %	190572130
1031	NC_010943	GAA	2	6	47918	47923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572130
1032	NC_010943	ATC	2	6	47934	47939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190572130
1033	NC_010943	AACGA	2	10	47959	47968	60 %	0 %	20 %	20 %	190572130
1034	NC_010943	CA	3	6	48022	48027	50 %	0 %	0 %	50 %	190572130
1035	NC_010943	CACG	2	8	48091	48098	25 %	0 %	25 %	50 %	190572131
1036	NC_010943	TCG	2	6	48116	48121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572131
1037	NC_010943	AAGG	2	8	48210	48217	50 %	0 %	50 %	0 %	190572131
1038	NC_010943	CTC	2	6	48229	48234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572131
1039	NC_010943	CAG	2	6	48277	48282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572131
1040	NC_010943	GCG	2	6	48412	48417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572131
1041	NC_010943	CACAGC	2	12	48439	48450	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190572131
1042	NC_010943	GACC	2	8	48608	48615	25 %	0 %	25 %	50 %	190572131
1043	NC_010943	GCC	2	6	48636	48641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572132
1044	NC_010943	AAC	2	6	48646	48651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190572132
1045	NC_010943	TGG	2	6	48680	48685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572132
1046	NC_010943	CGC	2	6	48698	48703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572132
1047	NC_010943	CGGT	2	8	48708	48715	0 %	25 %	50 %	25 %	190572132
1048	NC_010943	ATGGGT	2	12	48723	48734	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	190572132
1049	NC_010943	CAG	2	6	48753	48758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572132
1050	NC_010943	GTG	2	6	48770	48775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572132
1051	NC_010943	TCG	2	6	48823	48828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572132
1052	NC_010943	ACC	2	6	48915	48920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572132
1053	NC_010943	CGCC	2	8	48923	48930	0 %	0 %	25 %	75 %	190572132
1054	NC_010943	GCAG	2	8	48962	48969	25 %	0 %	50 %	25 %	190572132
1055	NC_010943	GTT	2	6	48989	48994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572132
1056	NC_010943	GGC	2	6	48997	49002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572132
1057	NC_010943	GTG	2	6	49070	49075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572132
1058	NC_010943	CAAT	2	8	49076	49083	50 %	25 %	0 %	25 %	190572132
1059	NC_010943	CAG	2	6	49110	49115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572132
1060	NC_010943	TGC	2	6	49132	49137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572132
1061	NC_010943	GCCA	2	8	49157	49164	25 %	0 %	25 %	50 %	190572132
1062	NC_010943	AC	3	6	49211	49216	50 %	0 %	0 %	50 %	190572132
1063	NC_010943	GCA	2	6	49249	49254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572132
1064	NC_010943	CGA	2	6	49265	49270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572132
1065	NC_010943	CGC	2	6	49272	49277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572132
1066	NC_010943	GGC	2	6	49358	49363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_010943	GCC	2	6	49385	49390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_010943	GTCAT	2	10	49408	49417	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1069	NC_010943	GTG	2	6	49476	49481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572133
1070	NC_010943	CG	3	6	49508	49513	0 %	0 %	50 %	50 %	190572133
1071	NC_010943	GGC	2	6	49587	49592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572133
1072	NC_010943	GCC	2	6	49593	49598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572133
1073	NC_010943	CAG	2	6	49611	49616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572133
1074	NC_010943	CTT	2	6	49671	49676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572133
1075	NC_010943	GCC	2	6	49698	49703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572133
1076	NC_010943	CG	3	6	49769	49774	0 %	0 %	50 %	50 %	190572133
1077	NC_010943	CCTT	2	8	49777	49784	0 %	50 %	0 %	50 %	190572133
1078	NC_010943	CAG	2	6	49791	49796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572133
1079	NC_010943	GCC	2	6	49870	49875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572133
1080	NC_010943	GGT	2	6	49893	49898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572133
1081	NC_010943	CGG	2	6	49997	50002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572133
1082	NC_010943	TGCT	2	8	50008	50015	0 %	50 %	25 %	25 %	190572133
1083	NC_010943	CGT	2	6	50033	50038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572133
1084	NC_010943	GCAGC	2	10	50064	50073	20 %	0 %	40 %	40 %	190572133
1085	NC_010943	CAG	3	9	50139	50147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572133
1086	NC_010943	CG	3	6	50156	50161	0 %	0 %	50 %	50 %	190572133
1087	NC_010943	GGCT	2	8	50179	50186	0 %	25 %	50 %	25 %	190572133
1088	NC_010943	TCC	2	6	50197	50202	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190572133
1089	NC_010943	TGA	2	6	50261	50266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572133
1090	NC_010943	CTT	2	6	50274	50279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572133
1091	NC_010943	TACCGG	2	12	50300	50311	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190572133
1092	NC_010943	CGA	2	6	50378	50383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572133
1093	NC_010943	CGGC	2	8	50416	50423	0 %	0 %	50 %	50 %	190572133
1094	NC_010943	CGTG	2	8	50524	50531	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_010943	CCTCCC	2	12	50578	50589	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1096	NC_010943	CGC	2	6	50605	50610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_010943	AGCAAA	2	12	50638	50649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1098	NC_010943	A	7	7	50647	50653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_010943	GTT	2	6	50696	50701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010943	GTT	2	6	50747	50752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190572134
1101	NC_010943	CGC	2	6	50762	50767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572134
1102	NC_010943	TCG	2	6	50808	50813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572134
1103	NC_010943	TGA	2	6	50875	50880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572134
1104	NC_010943	GCG	2	6	50890	50895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572134
1105	NC_010943	CAGC	2	8	50905	50912	25 %	0 %	25 %	50 %	190572134
1106	NC_010943	CGCA	2	8	50981	50988	25 %	0 %	25 %	50 %	190572134
1107	NC_010943	CCA	2	6	51013	51018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572134
1108	NC_010943	GCA	2	6	51021	51026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572134
1109	NC_010943	GTGG	2	8	51029	51036	0 %	25 %	75 %	0 %	190572134
1110	NC_010943	GCG	2	6	51099	51104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572134
1111	NC_010943	CCA	2	6	51112	51117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572134
1112	NC_010943	CGA	2	6	51175	51180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572134
1113	NC_010943	GAT	2	6	51206	51211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190572134
1114	NC_010943	CGG	2	6	51217	51222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572134
1115	NC_010943	GCT	2	6	51283	51288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190572134
1116	NC_010943	CAG	2	6	51296	51301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572134
1117	NC_010943	GCA	2	6	51356	51361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572134
1118	NC_010943	GCA	3	9	51367	51375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572134
1119	NC_010943	GCG	2	6	51480	51485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190572134
1120	NC_010943	GGT	2	6	51499	51504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572134
1121	NC_010943	GCA	2	6	51544	51549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572134
1122	NC_010943	CTT	2	6	51551	51556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190572134
1123	NC_010943	GCC	2	6	51590	51595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190572134
1124	NC_010943	GGT	2	6	51608	51613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572134
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1126	NC_010943	CAG	2	6	51629	51634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190572134
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1254	NC_010943	CAC	2	6	55995	56000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190572138
1255	NC_010943	CG	3	6	56024	56029	0 %	0 %	50 %	50 %	190572138
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1261	NC_010943	GAA	2	6	56172	56177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572138
1262	NC_010943	AGA	2	6	56186	56191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190572138
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1282	NC_010943	CG	4	8	57430	57437	0 %	0 %	50 %	50 %	190572139
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1337	NC_010943	CGGC	2	8	59296	59303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1356	NC_010943	TTG	2	6	59796	59801	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1366	NC_010943	TGG	3	9	60531	60539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190572141
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