MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010660	GGA	2	6	119828	119833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734437
2502	NC_010660	TGT	2	6	119858	119863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734437
2503	NC_010660	TTA	2	6	119871	119876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734437
2504	NC_010660	AAT	2	6	119877	119882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734437
2505	NC_010660	ATT	2	6	120078	120083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734437
2506	NC_010660	CAT	2	6	120223	120228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734437
2507	NC_010660	TCA	2	6	120240	120245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734437
2508	NC_010660	AAAG	2	8	120308	120315	75 %	0 %	25 %	0 %	187734437
2509	NC_010660	ATA	2	6	120373	120378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734437
2510	NC_010660	TTC	2	6	120416	120421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734437
2511	NC_010660	AGTC	2	8	120525	120532	25 %	25 %	25 %	25 %	187734437
2512	NC_010660	TAA	2	6	120545	120550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734437
2513	NC_010660	TTG	2	6	120627	120632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734437
2514	NC_010660	GGT	2	6	120636	120641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734437
2515	NC_010660	TC	3	6	120686	120691	0 %	50 %	0 %	50 %	187734437
2516	NC_010660	TTA	2	6	120794	120799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734437
2517	NC_010660	AAT	2	6	120857	120862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734437
2518	NC_010660	ACT	2	6	120873	120878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734437
2519	NC_010660	ACTA	2	8	120919	120926	50 %	25 %	0 %	25 %	187734437
2520	NC_010660	CATT	2	8	120979	120986	25 %	50 %	0 %	25 %	187734344
2521	NC_010660	GAT	2	6	121014	121019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734344
2522	NC_010660	CTG	2	6	121030	121035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734344
2523	NC_010660	TGGCT	2	10	121052	121061	0 %	40 %	40 %	20 %	187734344
2524	NC_010660	TGA	2	6	121085	121090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734344
2525	NC_010660	AGA	2	6	121122	121127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734344
2526	NC_010660	GAA	2	6	121185	121190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734344
2527	NC_010660	AGAC	2	8	121265	121272	50 %	0 %	25 %	25 %	187734344
2528	NC_010660	TGAA	2	8	121327	121334	50 %	25 %	25 %	0 %	187734344
2529	NC_010660	CTG	2	6	121345	121350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734344
2530	NC_010660	ATT	2	6	121374	121379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734344
2531	NC_010660	ATA	2	6	121386	121391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734344
2532	NC_010660	A	6	6	121402	121407	100 %	0 %	0 %	0 %	187734344
2533	NC_010660	ATT	2	6	121445	121450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734344
2534	NC_010660	CAA	2	6	121454	121459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734344
2535	NC_010660	CAA	2	6	121522	121527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734344
2536	NC_010660	TA	3	6	121536	121541	50 %	50 %	0 %	0 %	187734344
2537	NC_010660	AATT	2	8	121672	121679	50 %	50 %	0 %	0 %	187734344
2538	NC_010660	GAT	2	6	121688	121693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734344
2539	NC_010660	GAA	2	6	121718	121723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734344
2540	NC_010660	AGC	2	6	121768	121773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734344
2541	NC_010660	TAT	2	6	121786	121791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734344
2542	NC_010660	AT	3	6	121790	121795	50 %	50 %	0 %	0 %	187734344
2543	NC_010660	AAGTGA	2	12	121808	121819	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187734344
2544	NC_010660	ATCT	2	8	121888	121895	25 %	50 %	0 %	25 %	187734344
2545	NC_010660	AT	3	6	121918	121923	50 %	50 %	0 %	0 %	187734344
2546	NC_010660	AGTGAA	2	12	121929	121940	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	187734344
2547	NC_010660	AAGA	2	8	121989	121996	75 %	0 %	25 %	0 %	187734344
2548	NC_010660	AAGT	2	8	122044	122051	50 %	25 %	25 %	0 %	187734504
2549	NC_010660	AATT	2	8	122062	122069	50 %	50 %	0 %	0 %	187734504
2550	NC_010660	TTG	2	6	122128	122133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734504
2551	NC_010660	T	6	6	122135	122140	0 %	100 %	0 %	0 %	187734504
2552	NC_010660	TTG	2	6	122232	122237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734504
2553	NC_010660	ATT	2	6	122246	122251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734504
2554	NC_010660	GATGCG	2	12	122295	122306	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187734504
2555	NC_010660	ATT	2	6	122313	122318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734504
2556	NC_010660	T	6	6	122371	122376	0 %	100 %	0 %	0 %	187734504
2557	NC_010660	TGT	2	6	122387	122392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734504
2558	NC_010660	GCT	2	6	122439	122444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734504
2559	NC_010660	ATT	2	6	122508	122513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734504
2560	NC_010660	AAAG	2	8	122529	122536	75 %	0 %	25 %	0 %	187734504
2561	NC_010660	CAT	2	6	122621	122626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734504
2562	NC_010660	TAT	2	6	122627	122632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734504
2563	NC_010660	AGG	2	6	122648	122653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734504
2564	NC_010660	ACTA	2	8	122717	122724	50 %	25 %	0 %	25 %	187734504
2565	NC_010660	TC	3	6	122740	122745	0 %	50 %	0 %	50 %	187734504
2566	NC_010660	ATA	2	6	122812	122817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734504
2567	NC_010660	T	6	6	122916	122921	0 %	100 %	0 %	0 %	187734504
2568	NC_010660	T	7	7	122923	122929	0 %	100 %	0 %	0 %	187734504
2569	NC_010660	TAT	2	6	122961	122966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734504
2570	NC_010660	AGAAAA	2	12	122978	122989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	187734504
2571	NC_010660	A	6	6	122986	122991	100 %	0 %	0 %	0 %	187734504
2572	NC_010660	GTCT	2	8	122992	122999	0 %	50 %	25 %	25 %	187734504
2573	NC_010660	ATA	2	6	123040	123045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734504
2574	NC_010660	TAT	2	6	123115	123120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734504
2575	NC_010660	ATAAG	2	10	123130	123139	60 %	20 %	20 %	0 %	187734504
2576	NC_010660	AAG	2	6	123173	123178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734504
2577	NC_010660	TA	3	6	123220	123225	50 %	50 %	0 %	0 %	187734504
2578	NC_010660	GAT	2	6	123249	123254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734504
2579	NC_010660	TTGTT	2	10	123256	123265	0 %	80 %	20 %	0 %	187734504
2580	NC_010660	GTGC	2	8	123276	123283	0 %	25 %	50 %	25 %	187734504
2581	NC_010660	AT	3	6	123295	123300	50 %	50 %	0 %	0 %	187734504
2582	NC_010660	GT	3	6	123312	123317	0 %	50 %	50 %	0 %	187734504
2583	NC_010660	TGT	2	6	123359	123364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734504
2584	NC_010660	CTAA	2	8	123423	123430	50 %	25 %	0 %	25 %	187734504
2585	NC_010660	ACA	2	6	123496	123501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734504
2586	NC_010660	A	6	6	123530	123535	100 %	0 %	0 %	0 %	187734504
2587	NC_010660	TTA	2	6	123667	123672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734504
2588	NC_010660	GTA	2	6	123760	123765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734504
2589	NC_010660	AT	3	6	123809	123814	50 %	50 %	0 %	0 %	187734504
2590	NC_010660	TGG	2	6	123851	123856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734504
2591	NC_010660	GA	3	6	123920	123925	50 %	0 %	50 %	0 %	187734504
2592	NC_010660	A	9	9	123938	123946	100 %	0 %	0 %	0 %	187734504
2593	NC_010660	TGA	2	6	124043	124048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734504
2594	NC_010660	TTAG	2	8	124119	124126	25 %	50 %	25 %	0 %	187734430
2595	NC_010660	TCC	2	6	124151	124156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734430
2596	NC_010660	ATT	2	6	124161	124166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734430
2597	NC_010660	GTTAT	2	10	124248	124257	20 %	60 %	20 %	0 %	187734430
2598	NC_010660	TTAATG	2	12	124320	124331	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	187734430
2599	NC_010660	TGA	2	6	124376	124381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734430
2600	NC_010660	GTT	2	6	124398	124403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734430
2601	NC_010660	TA	3	6	124506	124511	50 %	50 %	0 %	0 %	187734342
2602	NC_010660	CTCA	2	8	124518	124525	25 %	25 %	0 %	50 %	187734342
2603	NC_010660	ATT	2	6	124632	124637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734342
2604	NC_010660	ATG	2	6	124663	124668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734342
2605	NC_010660	A	6	6	124669	124674	100 %	0 %	0 %	0 %	187734342
2606	NC_010660	TTC	2	6	124744	124749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734342
2607	NC_010660	ATT	2	6	124769	124774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734342
2608	NC_010660	AGT	2	6	124781	124786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734342
2609	NC_010660	CTC	2	6	124864	124869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734342
2610	NC_010660	TA	3	6	124873	124878	50 %	50 %	0 %	0 %	187734342
2611	NC_010660	T	6	6	124904	124909	0 %	100 %	0 %	0 %	187734342
2612	NC_010660	GTG	2	6	124945	124950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734342
2613	NC_010660	TAG	2	6	125024	125029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734342
2614	NC_010660	AT	4	8	125035	125042	50 %	50 %	0 %	0 %	187734342
2615	NC_010660	ATT	2	6	125092	125097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734342
2616	NC_010660	A	7	7	125112	125118	100 %	0 %	0 %	0 %	187734342
2617	NC_010660	GT	3	6	125123	125128	0 %	50 %	50 %	0 %	187734342
2618	NC_010660	TGC	2	6	125174	125179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734342
2619	NC_010660	AT	3	6	125180	125185	50 %	50 %	0 %	0 %	187734342
2620	NC_010660	T	6	6	125205	125210	0 %	100 %	0 %	0 %	187734342
2621	NC_010660	AGA	2	6	125310	125315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734342
2622	NC_010660	CGGTTT	2	12	125323	125334	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	187734342
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2871	NC_010660	GTT	2	6	136440	136445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2872	NC_010660	TGC	2	6	136460	136465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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