MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010660	ATA	2	6	99703	99708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734483
2002	NC_010660	CTT	2	6	99759	99764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734483
2003	NC_010660	GAA	2	6	99786	99791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734483
2004	NC_010660	T	6	6	99799	99804	0 %	100 %	0 %	0 %	187734483
2005	NC_010660	TTTA	2	8	99819	99826	25 %	75 %	0 %	0 %	187734483
2006	NC_010660	TTA	2	6	99843	99848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734483
2007	NC_010660	TCT	2	6	99891	99896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734483
2008	NC_010660	ATT	2	6	100009	100014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734483
2009	NC_010660	AAG	3	9	100043	100051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734483
2010	NC_010660	T	6	6	100126	100131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2011	NC_010660	G	6	6	100162	100167	0 %	0 %	100 %	0 %	187734447
2012	NC_010660	TG	3	6	100220	100225	0 %	50 %	50 %	0 %	187734447
2013	NC_010660	GAT	2	6	100352	100357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734385
2014	NC_010660	TTTTA	2	10	100360	100369	20 %	80 %	0 %	0 %	187734385
2015	NC_010660	TTTAT	2	10	100395	100404	20 %	80 %	0 %	0 %	187734385
2016	NC_010660	AAAT	2	8	100510	100517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_010660	TAA	2	6	100525	100530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_010660	TTATAA	2	12	100558	100569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_010660	AAT	2	6	100570	100575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_010660	AT	3	6	100642	100647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_010660	T	6	6	100657	100662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2022	NC_010660	T	6	6	100694	100699	0 %	100 %	0 %	0 %	187734294
2023	NC_010660	A	7	7	100714	100720	100 %	0 %	0 %	0 %	187734294
2024	NC_010660	AGT	2	6	100724	100729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734294
2025	NC_010660	CAT	2	6	100828	100833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2026	NC_010660	CAG	2	6	100910	100915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734469
2027	NC_010660	TAT	2	6	101025	101030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2028	NC_010660	TC	3	6	101116	101121	0 %	50 %	0 %	50 %	187734298
2029	NC_010660	TGTTT	2	10	101127	101136	0 %	80 %	20 %	0 %	187734298
2030	NC_010660	TGTT	2	8	101165	101172	0 %	75 %	25 %	0 %	187734298
2031	NC_010660	TCTTT	2	10	101179	101188	0 %	80 %	0 %	20 %	187734298
2032	NC_010660	AAAT	2	8	101213	101220	75 %	25 %	0 %	0 %	187734298
2033	NC_010660	ATG	2	6	101272	101277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734298
2034	NC_010660	T	6	6	101289	101294	0 %	100 %	0 %	0 %	187734298
2035	NC_010660	AT	3	6	101295	101300	50 %	50 %	0 %	0 %	187734298
2036	NC_010660	TTC	2	6	101334	101339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734298
2037	NC_010660	TAA	2	6	101395	101400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734298
2038	NC_010660	AAT	2	6	101404	101409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734298
2039	NC_010660	AAGTT	2	10	101425	101434	40 %	40 %	20 %	0 %	187734298
2040	NC_010660	ATT	2	6	101458	101463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734298
2041	NC_010660	TGC	2	6	101478	101483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734298
2042	NC_010660	CG	3	6	101505	101510	0 %	0 %	50 %	50 %	187734298
2043	NC_010660	T	6	6	101523	101528	0 %	100 %	0 %	0 %	187734298
2044	NC_010660	ATGCT	2	10	101593	101602	20 %	40 %	20 %	20 %	187734298
2045	NC_010660	AT	4	8	101651	101658	50 %	50 %	0 %	0 %	187734298
2046	NC_010660	AT	3	6	101694	101699	50 %	50 %	0 %	0 %	187734298
2047	NC_010660	GAA	2	6	101769	101774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734298
2048	NC_010660	TTG	2	6	101775	101780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734298
2049	NC_010660	TTC	2	6	101814	101819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734298
2050	NC_010660	T	6	6	101849	101854	0 %	100 %	0 %	0 %	187734298
2051	NC_010660	TTA	2	6	101917	101922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734298
2052	NC_010660	CTTT	2	8	101942	101949	0 %	75 %	0 %	25 %	187734298
2053	NC_010660	CCTT	2	8	101953	101960	0 %	50 %	0 %	50 %	187734298
2054	NC_010660	CCA	2	6	101987	101992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734298
2055	NC_010660	TGTA	2	8	102057	102064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_010660	TGA	2	6	102070	102075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_010660	AAT	2	6	102148	102153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_010660	A	6	6	102191	102196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_010660	TAA	2	6	102260	102265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734434
2060	NC_010660	AGAGAA	2	12	102334	102345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734434
2061	NC_010660	TTC	2	6	102375	102380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734434
2062	NC_010660	ATA	2	6	102425	102430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734434
2063	NC_010660	T	6	6	102431	102436	0 %	100 %	0 %	0 %	187734434
2064	NC_010660	TGC	2	6	102504	102509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734423
2065	NC_010660	TA	4	8	102512	102519	50 %	50 %	0 %	0 %	187734423
2066	NC_010660	T	6	6	102550	102555	0 %	100 %	0 %	0 %	187734423
2067	NC_010660	AT	3	6	102563	102568	50 %	50 %	0 %	0 %	187734423
2068	NC_010660	GTAA	2	8	102574	102581	50 %	25 %	25 %	0 %	187734423
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2072	NC_010660	GA	3	6	102825	102830	50 %	0 %	50 %	0 %	187734423
2073	NC_010660	T	7	7	102858	102864	0 %	100 %	0 %	0 %	187734423
2074	NC_010660	A	6	6	102916	102921	100 %	0 %	0 %	0 %	187734423
2075	NC_010660	TGA	2	6	103017	103022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734423
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2077	NC_010660	AG	3	6	103111	103116	50 %	0 %	50 %	0 %	187734423
2078	NC_010660	TCTT	2	8	103128	103135	0 %	75 %	0 %	25 %	187734423
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2082	NC_010660	CAT	2	6	103358	103363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734423
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2094	NC_010660	TTG	2	6	103860	103865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734423
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2096	NC_010660	CATT	2	8	104099	104106	25 %	50 %	0 %	25 %	187734423
2097	NC_010660	CTT	2	6	104122	104127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734423
2098	NC_010660	TCT	2	6	104134	104139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734423
2099	NC_010660	GAA	2	6	104149	104154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734423
2100	NC_010660	A	6	6	104158	104163	100 %	0 %	0 %	0 %	187734423
2101	NC_010660	TGA	2	6	104289	104294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734423
2102	NC_010660	TA	3	6	104309	104314	50 %	50 %	0 %	0 %	187734423
2103	NC_010660	TAT	2	6	104333	104338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734423
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2105	NC_010660	TAC	2	6	104407	104412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734361
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2108	NC_010660	T	7	7	104637	104643	0 %	100 %	0 %	0 %	187734361
2109	NC_010660	ATTT	2	8	104683	104690	25 %	75 %	0 %	0 %	187734361
2110	NC_010660	TAT	2	6	104710	104715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734361
2111	NC_010660	CGT	2	6	104806	104811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734361
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2113	NC_010660	ATT	2	6	104927	104932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734361
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2118	NC_010660	TCT	2	6	105129	105134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734361
2119	NC_010660	T	6	6	105154	105159	0 %	100 %	0 %	0 %	187734361
2120	NC_010660	GA	3	6	105162	105167	50 %	0 %	50 %	0 %	187734361
2121	NC_010660	TCTT	2	8	105168	105175	0 %	75 %	0 %	25 %	187734361
2122	NC_010660	TGT	2	6	105188	105193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734361
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2126	NC_010660	GTT	2	6	105345	105350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734361
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2500	NC_010660	A	6	6	119786	119791	100 %	0 %	0 %	0 %	187734437

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