MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010660	CTGAA	2	10	73551	73560	40 %	20 %	20 %	20 %	187734496
1502	NC_010660	GT	3	6	73661	73666	0 %	50 %	50 %	0 %	187734496
1503	NC_010660	CG	3	6	73697	73702	0 %	0 %	50 %	50 %	187734496
1504	NC_010660	CTG	2	6	73737	73742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734496
1505	NC_010660	TCGA	2	8	73768	73775	25 %	25 %	25 %	25 %	187734496
1506	NC_010660	CGCC	2	8	73796	73803	0 %	0 %	25 %	75 %	187734496
1507	NC_010660	TGC	2	6	73844	73849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734496
1508	NC_010660	TTG	2	6	73897	73902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734496
1509	NC_010660	CGTTA	2	10	73998	74007	20 %	40 %	20 %	20 %	187734496
1510	NC_010660	AATT	2	8	74013	74020	50 %	50 %	0 %	0 %	187734496
1511	NC_010660	GTC	2	6	74055	74060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734496
1512	NC_010660	ACG	2	6	74073	74078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734496
1513	NC_010660	ATTT	2	8	74084	74091	25 %	75 %	0 %	0 %	187734496
1514	NC_010660	GTCTG	2	10	74130	74139	0 %	40 %	40 %	20 %	187734496
1515	NC_010660	AT	3	6	74179	74184	50 %	50 %	0 %	0 %	187734496
1516	NC_010660	CAG	2	6	74258	74263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734496
1517	NC_010660	CCA	2	6	74308	74313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734496
1518	NC_010660	TAC	2	6	74345	74350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734496
1519	NC_010660	CTG	2	6	74464	74469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734496
1520	NC_010660	GCCA	2	8	74520	74527	25 %	0 %	25 %	50 %	187734496
1521	NC_010660	GTT	2	6	74551	74556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734496
1522	NC_010660	TAC	2	6	74693	74698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734496
1523	NC_010660	GTC	2	6	74785	74790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734496
1524	NC_010660	T	6	6	74832	74837	0 %	100 %	0 %	0 %	187734496
1525	NC_010660	T	6	6	74849	74854	0 %	100 %	0 %	0 %	187734496
1526	NC_010660	AAT	2	6	74890	74895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734496
1527	NC_010660	ATA	2	6	74945	74950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_010660	TAA	2	6	74952	74957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_010660	ATTA	2	8	74980	74987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_010660	T	6	6	75007	75012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_010660	AAATT	2	10	75055	75064	60 %	40 %	0 %	0 %	187734371
1532	NC_010660	TCC	2	6	75144	75149	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734371
1533	NC_010660	GGT	2	6	75166	75171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734332
1534	NC_010660	ACT	2	6	75252	75257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734332
1535	NC_010660	TTG	2	6	75404	75409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734332
1536	NC_010660	GCA	2	6	75427	75432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734332
1537	NC_010660	GCA	2	6	75463	75468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734332
1538	NC_010660	TCTTTT	2	12	75533	75544	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	187734332
1539	NC_010660	TTC	2	6	75562	75567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734332
1540	NC_010660	GTT	2	6	75611	75616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734332
1541	NC_010660	TTG	2	6	75630	75635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734332
1542	NC_010660	TCT	2	6	75640	75645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734332
1543	NC_010660	GAA	2	6	75694	75699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734332
1544	NC_010660	GCA	2	6	75725	75730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734332
1545	NC_010660	GCT	2	6	75831	75836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734332
1546	NC_010660	TCA	2	6	75869	75874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734332
1547	NC_010660	TGT	2	6	75892	75897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734417
1548	NC_010660	ACC	2	6	76042	76047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734417
1549	NC_010660	CAA	2	6	76054	76059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734417
1550	NC_010660	GCT	3	9	76107	76115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734417
1551	NC_010660	AG	3	6	76120	76125	50 %	0 %	50 %	0 %	187734417
1552	NC_010660	ATG	2	6	76172	76177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734417
1553	NC_010660	CTT	2	6	76191	76196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734417
1554	NC_010660	T	7	7	76216	76222	0 %	100 %	0 %	0 %	187734417
1555	NC_010660	T	8	8	76238	76245	0 %	100 %	0 %	0 %	187734417
1556	NC_010660	AGC	2	6	76286	76291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734417
1557	NC_010660	ACC	2	6	76344	76349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734417
1558	NC_010660	AGT	2	6	76364	76369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734417
1559	NC_010660	AC	3	6	76467	76472	50 %	0 %	0 %	50 %	187734417
1560	NC_010660	TGA	2	6	76523	76528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734417
1561	NC_010660	AAT	2	6	76555	76560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734417
1562	NC_010660	GCT	2	6	76597	76602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734417
1563	NC_010660	AAT	2	6	76606	76611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734417
1564	NC_010660	TCTG	2	8	76692	76699	0 %	50 %	25 %	25 %	187734417
1565	NC_010660	AT	3	6	76775	76780	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
1566	NC_010660	AT	3	6	76785	76790	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
1567	NC_010660	ATTA	2	8	76804	76811	50 %	50 %	0 %	0 %	187734311
1568	NC_010660	AAT	2	6	76838	76843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734311
1569	NC_010660	CAA	2	6	76853	76858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734311
1570	NC_010660	GCTT	2	8	76968	76975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1571	NC_010660	GAA	2	6	77046	77051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_010660	CGGC	2	8	77054	77061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1573	NC_010660	GGA	2	6	77063	77068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010660	GC	3	6	77074	77079	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_010660	GAA	2	6	77097	77102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_010660	GCC	2	6	77103	77108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1577	NC_010660	T	7	7	77328	77334	0 %	100 %	0 %	0 %	187734416
1578	NC_010660	TC	3	6	77429	77434	0 %	50 %	0 %	50 %	187734416
1579	NC_010660	TTGCC	2	10	77436	77445	0 %	40 %	20 %	40 %	187734416
1580	NC_010660	ATG	2	6	77491	77496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1581	NC_010660	TTG	2	6	77507	77512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734416
1582	NC_010660	CAT	2	6	77565	77570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734416
1583	NC_010660	CCG	2	6	77646	77651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734416
1584	NC_010660	ACGCC	2	10	77684	77693	20 %	0 %	20 %	60 %	187734416
1585	NC_010660	CTG	2	6	77719	77724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1586	NC_010660	GT	3	6	77735	77740	0 %	50 %	50 %	0 %	187734416
1587	NC_010660	CTG	2	6	77860	77865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1588	NC_010660	GAA	2	6	77889	77894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734416
1589	NC_010660	TTA	2	6	77967	77972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734416
1590	NC_010660	GAT	2	6	78024	78029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1591	NC_010660	ATC	2	6	78083	78088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734416
1592	NC_010660	A	6	6	78120	78125	100 %	0 %	0 %	0 %	187734416
1593	NC_010660	CTG	2	6	78160	78165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1594	NC_010660	CTG	2	6	78196	78201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1595	NC_010660	GACG	2	8	78210	78217	25 %	0 %	50 %	25 %	187734416
1596	NC_010660	GGA	2	6	78232	78237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734416
1597	NC_010660	GAT	2	6	78402	78407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1598	NC_010660	TGA	2	6	78476	78481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1599	NC_010660	TGA	2	6	78488	78493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734416
1600	NC_010660	CGA	2	6	78572	78577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734416
1601	NC_010660	GAAGGG	2	12	78578	78589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734416
1602	NC_010660	CAGT	2	8	78649	78656	25 %	25 %	25 %	25 %	187734416
1603	NC_010660	ACTG	2	8	78663	78670	25 %	25 %	25 %	25 %	187734416
1604	NC_010660	T	6	6	78692	78697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_010660	GT	3	6	78734	78739	0 %	50 %	50 %	0 %	187734376
1606	NC_010660	GA	3	6	78741	78746	50 %	0 %	50 %	0 %	187734376
1607	NC_010660	GGAT	2	8	78774	78781	25 %	25 %	50 %	0 %	187734376
1608	NC_010660	TG	3	6	78861	78866	0 %	50 %	50 %	0 %	187734376
1609	NC_010660	CCG	2	6	78883	78888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734376
1610	NC_010660	GAA	2	6	78919	78924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734376
1611	NC_010660	CG	3	6	78928	78933	0 %	0 %	50 %	50 %	187734376
1612	NC_010660	CTG	2	6	78944	78949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734376
1613	NC_010660	A	6	6	79004	79009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_010660	AG	4	8	79041	79048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_010660	CAT	2	6	79179	79184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_010660	CCT	2	6	79198	79203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_010660	CAC	2	6	79214	79219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1618	NC_010660	ATC	2	6	79252	79257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_010660	GAT	2	6	79352	79357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_010660	ATT	2	6	79378	79383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_010660	GCC	2	6	79477	79482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734317
1622	NC_010660	A	7	7	79490	79496	100 %	0 %	0 %	0 %	187734317
1623	NC_010660	CGG	2	6	79538	79543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734317
1624	NC_010660	GCA	2	6	79678	79683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734317
1625	NC_010660	GC	3	6	79730	79735	0 %	0 %	50 %	50 %	187734317
1626	NC_010660	GGC	2	6	79873	79878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734317
1627	NC_010660	CGC	2	6	79890	79895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734317
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