MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 plasmid pBS512_211

Total Repeats: 4359

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010660	A	6	6	47925	47930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_010660	ACC	2	6	47991	47996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_010660	AT	3	6	48006	48011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010660	TCA	2	6	48052	48057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_010660	AC	3	6	48083	48088	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_010660	GTT	2	6	48125	48130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010660	TGC	2	6	48138	48143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_010660	CGA	2	6	48144	48149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_010660	TCA	2	6	48161	48166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_010660	CCG	2	6	48217	48222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_010660	AAC	2	6	48416	48421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_010660	ATT	2	6	48511	48516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734384
1013	NC_010660	GCA	2	6	48538	48543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734384
1014	NC_010660	TCC	2	6	48603	48608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734384
1015	NC_010660	CAG	2	6	48638	48643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734384
1016	NC_010660	GAT	2	6	48650	48655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734384
1017	NC_010660	CGC	2	6	48656	48661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734384
1018	NC_010660	TCC	2	6	48668	48673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734384
1019	NC_010660	T	6	6	48699	48704	0 %	100 %	0 %	0 %	187734384
1020	NC_010660	TGT	3	9	48742	48750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734384
1021	NC_010660	CGG	2	6	49041	49046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734384
1022	NC_010660	CTTC	2	8	49066	49073	0 %	50 %	0 %	50 %	187734384
1023	NC_010660	ATC	2	6	49229	49234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734384
1024	NC_010660	GAC	2	6	49252	49257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734384
1025	NC_010660	TA	3	6	49352	49357	50 %	50 %	0 %	0 %	187734384
1026	NC_010660	CG	3	6	49431	49436	0 %	0 %	50 %	50 %	187734384
1027	NC_010660	AT	3	6	49473	49478	50 %	50 %	0 %	0 %	187734384
1028	NC_010660	GTG	2	6	49546	49551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734384
1029	NC_010660	TTTC	2	8	49660	49667	0 %	75 %	0 %	25 %	187734384
1030	NC_010660	CAG	2	6	49699	49704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734384
1031	NC_010660	TGAC	2	8	49831	49838	25 %	25 %	25 %	25 %	187734384
1032	NC_010660	AGA	2	6	49851	49856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734384
1033	NC_010660	ACG	2	6	49967	49972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734384
1034	NC_010660	AGC	2	6	50079	50084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734384
1035	NC_010660	ATC	2	6	50090	50095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734384
1036	NC_010660	TTCCC	2	10	50227	50236	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
1037	NC_010660	GTTG	2	8	50366	50373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010660	CGG	2	6	50451	50456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010660	TCA	2	6	50513	50518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_010660	GCC	2	6	50524	50529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_010660	CAC	2	6	50812	50817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734289
1042	NC_010660	A	6	6	50936	50941	100 %	0 %	0 %	0 %	187734289
1043	NC_010660	CTG	2	6	50950	50955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_010660	CAT	2	6	51046	51051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010660	GAA	2	6	51093	51098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_010660	GTT	2	6	51158	51163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010660	TTAC	2	8	51346	51353	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1048	NC_010660	TCA	2	6	51388	51393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_010660	GAC	2	6	51446	51451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_010660	GTAT	2	8	51533	51540	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010660	AC	3	6	51550	51555	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_010660	GTGG	2	8	51713	51720	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_010660	CGA	2	6	51735	51740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_010660	CTC	2	6	51763	51768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_010660	GCAGAA	2	12	51771	51782	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1056	NC_010660	TTA	2	6	51788	51793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_010660	GAT	2	6	51810	51815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010660	CGA	2	6	51872	51877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_010660	GCC	2	6	51908	51913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_010660	TCA	2	6	51973	51978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_010660	TCTG	2	8	51987	51994	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1062	NC_010660	TAA	2	6	52018	52023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010660	TTG	2	6	52071	52076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010660	T	7	7	52136	52142	0 %	100 %	0 %	0 %	187734274
1065	NC_010660	AT	3	6	52144	52149	50 %	50 %	0 %	0 %	187734274
1066	NC_010660	GCG	2	6	52251	52256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734274
1067	NC_010660	CGGCTT	2	12	52345	52356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734274
1068	NC_010660	ATT	2	6	52392	52397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734274
1069	NC_010660	AGGA	2	8	52424	52431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_010660	TGG	2	6	52535	52540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_010660	CTT	2	6	52568	52573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_010660	T	6	6	52606	52611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_010660	TTC	2	6	52613	52618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_010660	TCT	2	6	52634	52639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_010660	TGA	2	6	52706	52711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_010660	ATG	2	6	52817	52822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_010660	CAT	2	6	52869	52874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_010660	ACT	2	6	52875	52880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_010660	TG	3	6	52892	52897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_010660	AAC	2	6	53002	53007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_010660	T	7	7	53151	53157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_010660	A	7	7	53189	53195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_010660	T	6	6	53200	53205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_010660	ATATA	2	10	53212	53221	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_010660	A	6	6	53265	53270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_010660	ATC	2	6	53280	53285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_010660	TCT	2	6	53313	53318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_010660	TAC	2	6	53324	53329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010660	GATG	2	8	53331	53338	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010660	TAA	2	6	53348	53353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_010660	CGAA	2	8	53396	53403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1092	NC_010660	TGA	2	6	53464	53469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_010660	A	8	8	53534	53541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_010660	TAA	2	6	53560	53565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_010660	A	7	7	53579	53585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010660	AG	3	6	53606	53611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010660	AT	3	6	53655	53660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010660	TCA	2	6	53661	53666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_010660	TTC	2	6	53671	53676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_010660	ATT	2	6	53680	53685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010660	GA	3	6	53696	53701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010660	CAG	2	6	53754	53759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_010660	TAA	2	6	53832	53837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_010660	TAT	2	6	53929	53934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734415
1105	NC_010660	AT	3	6	53949	53954	50 %	50 %	0 %	0 %	187734415
1106	NC_010660	TTTA	2	8	54009	54016	25 %	75 %	0 %	0 %	187734415
1107	NC_010660	AAC	2	6	54169	54174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734415
1108	NC_010660	A	6	6	54187	54192	100 %	0 %	0 %	0 %	187734415
1109	NC_010660	ACC	2	6	54217	54222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734415
1110	NC_010660	AGA	2	6	54289	54294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734415
1111	NC_010660	TTC	2	6	54333	54338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734415
1112	NC_010660	ATA	2	6	54366	54371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734415
1113	NC_010660	C	6	6	54449	54454	0 %	0 %	0 %	100 %	187734415
1114	NC_010660	CTGGCT	2	12	54476	54487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734415
1115	NC_010660	AAT	2	6	54488	54493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734415
1116	NC_010660	AAC	2	6	54501	54506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734415
1117	NC_010660	AAT	3	9	54548	54556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734415
1118	NC_010660	ACA	2	6	54560	54565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734415
1119	NC_010660	ACA	2	6	54652	54657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734415
1120	NC_010660	ACC	2	6	54662	54667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734415
1121	NC_010660	ATT	2	6	54675	54680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187734415
1122	NC_010660	ACAA	2	8	54777	54784	75 %	0 %	0 %	25 %	187734415
1123	NC_010660	CAG	2	6	54953	54958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734415
1124	NC_010660	TGC	2	6	54970	54975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734415
1125	NC_010660	CCT	2	6	55036	55041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187734415
1126	NC_010660	GCTCT	2	10	55085	55094	0 %	40 %	20 %	40 %	187734415
1127	NC_010660	GGA	2	6	55129	55134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187734415
1128	NC_010660	GAAT	2	8	55324	55331	50 %	25 %	25 %	0 %	187734415
1129	NC_010660	GCAG	2	8	55402	55409	25 %	0 %	50 %	25 %	187734415
1130	NC_010660	CAG	2	6	55541	55546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734415
1131	NC_010660	TGAC	2	8	55560	55567	25 %	25 %	25 %	25 %	187734415
1132	NC_010660	TAC	2	6	55634	55639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734353
1133	NC_010660	T	6	6	55650	55655	0 %	100 %	0 %	0 %	187734353
1134	NC_010660	AGTT	2	8	55672	55679	25 %	50 %	25 %	0 %	187734353
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1264	NC_010660	T	6	6	62020	62025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1268	NC_010660	CTT	2	6	62276	62281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734321
1269	NC_010660	CCG	2	6	62289	62294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734321
1270	NC_010660	GTA	2	6	62316	62321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734321
1271	NC_010660	TCA	2	6	62387	62392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734321
1272	NC_010660	TTC	2	6	62400	62405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734321
1273	NC_010660	TGT	2	6	62423	62428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734321
1274	NC_010660	GAC	2	6	62468	62473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734321
1275	NC_010660	CACCGG	2	12	62475	62486	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	187734321
1276	NC_010660	CGG	2	6	62569	62574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734321
1277	NC_010660	ATTCC	2	10	62595	62604	20 %	40 %	0 %	40 %	187734321
1278	NC_010660	CTTC	2	8	62614	62621	0 %	50 %	0 %	50 %	187734321
1279	NC_010660	TGC	2	6	62622	62627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734321
1280	NC_010660	TCA	2	6	62699	62704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734321
1281	NC_010660	CAC	2	6	62753	62758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734321
1282	NC_010660	CTG	2	6	62793	62798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734321
1283	NC_010660	TG	3	6	62811	62816	0 %	50 %	50 %	0 %	187734321
1284	NC_010660	ACC	2	6	62906	62911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734321
1285	NC_010660	TGC	2	6	62962	62967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734321
1286	NC_010660	CAG	2	6	62991	62996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734321
1287	NC_010660	T	6	6	63070	63075	0 %	100 %	0 %	0 %	187734321
1288	NC_010660	TGA	2	6	63093	63098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734321
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1290	NC_010660	CAC	2	6	63165	63170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734321
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1293	NC_010660	CTG	2	6	63225	63230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734321
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1296	NC_010660	CCG	2	6	63318	63323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734465
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1302	NC_010660	CTT	2	6	63573	63578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734465
1303	NC_010660	GTTTAC	2	12	63589	63600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187734465
1304	NC_010660	ACC	2	6	63626	63631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734465
1305	NC_010660	T	6	6	63761	63766	0 %	100 %	0 %	0 %	187734398
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1310	NC_010660	TTG	2	6	63984	63989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734398
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1313	NC_010660	T	6	6	64375	64380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1322	NC_010660	A	6	6	64687	64692	100 %	0 %	0 %	0 %	187734346
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1351	NC_010660	ATT	2	6	66194	66199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1352	NC_010660	GGA	2	6	66211	66216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1353	NC_010660	CAGAC	2	10	66219	66228	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1354	NC_010660	CAC	2	6	66265	66270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1387	NC_010660	TCATT	2	10	67585	67594	20 %	60 %	0 %	20 %	187734505
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