MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 11329

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010658	CAGA	2	8	156	163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_010658	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	187733611
3	NC_010658	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	187733611
4	NC_010658	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	187733611
5	NC_010658	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	187733611
6	NC_010658	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	187733611
7	NC_010658	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	187733611
8	NC_010658	TGCC	2	8	2594	2601	0 %	25 %	25 %	50 %	187733611
9	NC_010658	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	187733021
10	NC_010658	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	187733021
11	NC_010658	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	187733021
12	NC_010658	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	187733021
13	NC_010658	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	187733021
14	NC_010658	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	187733021
15	NC_010658	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	187732437
16	NC_010658	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	187731324
17	NC_010658	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	187731324
18	NC_010658	GCCA	2	8	7226	7233	25 %	0 %	25 %	50 %	187730478
19	NC_010658	GCAT	2	8	7955	7962	25 %	25 %	25 %	25 %	187730478
20	NC_010658	GGCG	2	8	8086	8093	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_010658	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	187730143
22	NC_010658	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	187730143
23	NC_010658	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	187730143
24	NC_010658	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	187730143
25	NC_010658	GCTG	2	8	8989	8996	0 %	25 %	50 %	25 %	187730143
26	NC_010658	CTGT	2	8	9239	9246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_010658	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	187732969
28	NC_010658	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	187732969
29	NC_010658	GAAT	2	8	10515	10522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_010658	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	187732486
31	NC_010658	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	187732486
32	NC_010658	CAGT	2	8	11496	11503	25 %	25 %	25 %	25 %	187731912
33	NC_010658	GCGA	2	8	11610	11617	25 %	0 %	50 %	25 %	187732886
34	NC_010658	CTTT	2	8	12077	12084	0 %	75 %	0 %	25 %	187732886
35	NC_010658	CCAT	2	8	12329	12336	25 %	25 %	0 %	50 %	187732886
36	NC_010658	CTTC	2	8	12604	12611	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_010658	CTGG	2	8	12639	12646	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010658	ATCA	2	8	12765	12772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010658	GCCA	2	8	13110	13117	25 %	0 %	25 %	50 %	187732290
40	NC_010658	CAGC	2	8	13243	13250	25 %	0 %	25 %	50 %	187732290
41	NC_010658	AGGA	2	8	13583	13590	50 %	0 %	50 %	0 %	187730035
42	NC_010658	ATTC	2	8	14024	14031	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010658	AGTG	2	8	14166	14173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010658	ATGG	2	8	14329	14336	25 %	25 %	50 %	0 %	187731544
45	NC_010658	TGGT	2	8	14420	14427	0 %	50 %	50 %	0 %	187731544
46	NC_010658	ACCG	2	8	14787	14794	25 %	0 %	25 %	50 %	187731544
47	NC_010658	AAGA	2	8	15007	15014	75 %	0 %	25 %	0 %	187731544
48	NC_010658	CCAT	2	8	15584	15591	25 %	25 %	0 %	50 %	187731544
49	NC_010658	ACTG	2	8	15978	15985	25 %	25 %	25 %	25 %	187731544
50	NC_010658	GACA	2	8	17796	17803	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_010658	ATTA	2	8	18011	18018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_010658	TAAT	2	8	18029	18036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010658	GGTT	2	8	18398	18405	0 %	50 %	50 %	0 %	187732952
54	NC_010658	GTGG	2	8	19022	19029	0 %	25 %	75 %	0 %	187732952
55	NC_010658	CGTT	2	8	19394	19401	0 %	50 %	25 %	25 %	187732952
56	NC_010658	TTTA	2	8	19566	19573	25 %	75 %	0 %	0 %	187732489
57	NC_010658	CCAC	2	8	19869	19876	25 %	0 %	0 %	75 %	187732489
58	NC_010658	AATA	2	8	20499	20506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010658	CTTC	2	8	20521	20528	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010658	TCCT	2	8	20973	20980	0 %	50 %	0 %	50 %	187733459
61	NC_010658	TTAT	2	8	21336	21343	25 %	75 %	0 %	0 %	187732477
62	NC_010658	TTTC	2	8	21528	21535	0 %	75 %	0 %	25 %	187732477
63	NC_010658	CTGC	2	8	21956	21963	0 %	25 %	25 %	50 %	187732477
64	NC_010658	ATTT	2	8	22554	22561	25 %	75 %	0 %	0 %	187732477
65	NC_010658	GCTG	2	8	23827	23834	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_010658	TGGC	2	8	23960	23967	0 %	25 %	50 %	25 %	187731181
67	NC_010658	CATA	2	8	25004	25011	50 %	25 %	0 %	25 %	187730272
68	NC_010658	TGCG	2	8	25260	25267	0 %	25 %	50 %	25 %	187730272
69	NC_010658	GCGT	2	8	25468	25475	0 %	25 %	50 %	25 %	187730272
70	NC_010658	CCGC	2	8	25891	25898	0 %	0 %	25 %	75 %	187730272
71	NC_010658	CTGG	2	8	26248	26255	0 %	25 %	50 %	25 %	187730740
72	NC_010658	CTGC	2	8	26709	26716	0 %	25 %	25 %	50 %	187730740
73	NC_010658	TGCG	2	8	27259	27266	0 %	25 %	50 %	25 %	187730740
74	NC_010658	TGGT	2	8	27671	27678	0 %	50 %	50 %	0 %	187730740
75	NC_010658	GTGG	2	8	28464	28471	0 %	25 %	75 %	0 %	187730740
76	NC_010658	GCTG	2	8	28818	28825	0 %	25 %	50 %	25 %	187733568
77	NC_010658	ATGG	2	8	29659	29666	25 %	25 %	50 %	0 %	187730844
78	NC_010658	TTGA	2	8	30530	30537	25 %	50 %	25 %	0 %	187731568
79	NC_010658	TGGC	2	8	31073	31080	0 %	25 %	50 %	25 %	187732027
80	NC_010658	TCAT	2	8	31757	31764	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_010658	TCCC	2	8	31787	31794	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
82	NC_010658	TGGC	2	8	31828	31835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_010658	GCTG	2	8	32050	32057	0 %	25 %	50 %	25 %	187732869
84	NC_010658	CGTG	2	8	32527	32534	0 %	25 %	50 %	25 %	187732869
85	NC_010658	CATG	2	8	32997	33004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_010658	AGTG	2	8	33147	33154	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_010658	TCCT	2	8	33309	33316	0 %	50 %	0 %	50 %	187733195
88	NC_010658	CTTA	2	8	33337	33344	25 %	50 %	0 %	25 %	187733195
89	NC_010658	AGCC	2	8	34239	34246	25 %	0 %	25 %	50 %	187733195
90	NC_010658	GACC	2	8	34505	34512	25 %	0 %	25 %	50 %	187733854
91	NC_010658	CGCA	2	8	35505	35512	25 %	0 %	25 %	50 %	187733854
92	NC_010658	CTGT	2	8	35679	35686	0 %	50 %	25 %	25 %	187733854
93	NC_010658	GGCG	2	8	35855	35862	0 %	0 %	75 %	25 %	187733854
94	NC_010658	ACCG	2	8	36009	36016	25 %	0 %	25 %	50 %	187733854
95	NC_010658	CGTC	2	8	36483	36490	0 %	25 %	25 %	50 %	187733854
96	NC_010658	GGCG	2	8	36692	36699	0 %	0 %	75 %	25 %	187733854
97	NC_010658	TGGC	2	8	36946	36953	0 %	25 %	50 %	25 %	187733854
98	NC_010658	GCTG	2	8	36959	36966	0 %	25 %	50 %	25 %	187733854
99	NC_010658	GCCA	2	8	37877	37884	25 %	0 %	25 %	50 %	187730467
100	NC_010658	CAGC	2	8	38010	38017	25 %	0 %	25 %	50 %	187730467
101	NC_010658	AGGA	2	8	38350	38357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010658	TGTT	2	8	38658	38665	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_010658	TGTT	2	8	38903	38910	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_010658	TGTT	2	8	39093	39100	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010658	CTGG	2	8	39358	39365	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_010658	TGCG	2	8	40554	40561	0 %	25 %	50 %	25 %	187732301
107	NC_010658	ATGA	2	8	40709	40716	50 %	25 %	25 %	0 %	187732301
108	NC_010658	GGCG	2	8	41050	41057	0 %	0 %	75 %	25 %	187732301
109	NC_010658	GGAT	2	8	41664	41671	25 %	25 %	50 %	0 %	187732301
110	NC_010658	AACC	2	8	41734	41741	50 %	0 %	0 %	50 %	187732301
111	NC_010658	CAGG	2	8	41831	41838	25 %	0 %	50 %	25 %	187732301
112	NC_010658	TGGC	2	8	42097	42104	0 %	25 %	50 %	25 %	187732301
113	NC_010658	TGTT	2	8	42207	42214	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_010658	CCTG	2	8	42432	42439	0 %	25 %	25 %	50 %	187730428
115	NC_010658	TAAA	2	8	42470	42477	75 %	25 %	0 %	0 %	187730428
116	NC_010658	AATC	2	8	42506	42513	50 %	25 %	0 %	25 %	187730428
117	NC_010658	GCAG	2	8	42995	43002	25 %	0 %	50 %	25 %	187731973
118	NC_010658	AATG	2	8	43772	43779	50 %	25 %	25 %	0 %	187731366
119	NC_010658	GGCA	2	8	45220	45227	25 %	0 %	50 %	25 %	187734080
120	NC_010658	CGGT	2	8	45821	45828	0 %	25 %	50 %	25 %	187734080
121	NC_010658	GTCA	2	8	46344	46351	25 %	25 %	25 %	25 %	187733861
122	NC_010658	GCTT	2	8	47513	47520	0 %	50 %	25 %	25 %	187733413
123	NC_010658	ACCT	2	8	47593	47600	25 %	25 %	0 %	50 %	187733413
124	NC_010658	AGTA	2	8	47811	47818	50 %	25 %	25 %	0 %	187733413
125	NC_010658	CACC	2	8	48987	48994	25 %	0 %	0 %	75 %	187733413
126	NC_010658	CTAC	2	8	49097	49104	25 %	25 %	0 %	50 %	187733413
127	NC_010658	CTTA	2	8	49943	49950	25 %	50 %	0 %	25 %	187730491
128	NC_010658	GCCA	2	8	50142	50149	25 %	0 %	25 %	50 %	187730491
129	NC_010658	CGGT	2	8	50355	50362	0 %	25 %	50 %	25 %	187730491
130	NC_010658	CTGC	2	8	51325	51332	0 %	25 %	25 %	50 %	187731746
131	NC_010658	AACC	2	8	51452	51459	50 %	0 %	0 %	50 %	187731746
132	NC_010658	CCTG	2	8	51554	51561	0 %	25 %	25 %	50 %	187731450
133	NC_010658	ATCA	2	8	51703	51710	50 %	25 %	0 %	25 %	187731450
134	NC_010658	TACC	2	8	51978	51985	25 %	25 %	0 %	50 %	187731450
135	NC_010658	TGAT	2	8	52226	52233	25 %	50 %	25 %	0 %	187731450
136	NC_010658	TGGC	2	8	52685	52692	0 %	25 %	50 %	25 %	187731450
137	NC_010658	CAGC	2	8	53886	53893	25 %	0 %	25 %	50 %	187731450
138	NC_010658	TGCG	2	8	54279	54286	0 %	25 %	50 %	25 %	187731450
139	NC_010658	TGGT	2	8	55114	55121	0 %	50 %	50 %	0 %	187730247
140	NC_010658	TCAA	2	8	55326	55333	50 %	25 %	0 %	25 %	187730247
141	NC_010658	GGCA	2	8	55530	55537	25 %	0 %	50 %	25 %	187730247
142	NC_010658	ATCA	2	8	55628	55635	50 %	25 %	0 %	25 %	187730247
143	NC_010658	GCGG	2	8	56323	56330	0 %	0 %	75 %	25 %	187730247
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