MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010658	ACA	2	6	194377	194382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733784
4003	NC_010658	GGT	2	6	194390	194395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733784
4004	NC_010658	TGG	2	6	194401	194406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733784
4005	NC_010658	CCA	2	6	194439	194444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733784
4006	NC_010658	ACG	3	9	194479	194487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733784
4007	NC_010658	CAT	2	6	194546	194551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733784
4008	NC_010658	TAA	2	6	194561	194566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733784
4009	NC_010658	GGC	2	6	194568	194573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733784
4010	NC_010658	CGG	2	6	194628	194633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733784
4011	NC_010658	CG	3	6	194685	194690	0 %	0 %	50 %	50 %	187733784
4012	NC_010658	TGA	2	6	194695	194700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733784
4013	NC_010658	GGT	2	6	194843	194848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733784
4014	NC_010658	TCA	2	6	194980	194985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733784
4015	NC_010658	GTT	2	6	195000	195005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733784
4016	NC_010658	CG	3	6	195008	195013	0 %	0 %	50 %	50 %	187733784
4017	NC_010658	GGC	2	6	195073	195078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733784
4018	NC_010658	TGT	2	6	195088	195093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733784
4019	NC_010658	TGA	2	6	195170	195175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733784
4020	NC_010658	TGA	2	6	195281	195286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733784
4021	NC_010658	CTA	2	6	195353	195358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733784
4022	NC_010658	CG	4	8	195375	195382	0 %	0 %	50 %	50 %	187733784
4023	NC_010658	TC	3	6	195409	195414	0 %	50 %	0 %	50 %	187733784
4024	NC_010658	TTA	2	6	195426	195431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733784
4025	NC_010658	GAA	2	6	195609	195614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731373
4026	NC_010658	A	6	6	195631	195636	100 %	0 %	0 %	0 %	187731373
4027	NC_010658	TGA	2	6	195746	195751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731373
4028	NC_010658	CTGG	2	8	195762	195769	0 %	25 %	50 %	25 %	187731373
4029	NC_010658	CG	3	6	195774	195779	0 %	0 %	50 %	50 %	187731373
4030	NC_010658	TCG	2	6	195799	195804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731373
4031	NC_010658	GTC	2	6	195826	195831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731373
4032	NC_010658	TGA	2	6	195835	195840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731373
4033	NC_010658	TCA	2	6	195848	195853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731373
4034	NC_010658	A	6	6	195874	195879	100 %	0 %	0 %	0 %	187731373
4035	NC_010658	ATC	2	6	195966	195971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731373
4036	NC_010658	AGA	2	6	196013	196018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731373
4037	NC_010658	GGT	2	6	196104	196109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731373
4038	NC_010658	TGC	2	6	196153	196158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731373
4039	NC_010658	GGC	2	6	196235	196240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731373
4040	NC_010658	ATC	2	6	196254	196259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731373
4041	NC_010658	CAT	2	6	196295	196300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731373
4042	NC_010658	GCG	2	6	196315	196320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731373
4043	NC_010658	GGC	2	6	196343	196348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731373
4044	NC_010658	CTG	2	6	196365	196370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731373
4045	NC_010658	A	6	6	196412	196417	100 %	0 %	0 %	0 %	187731373
4046	NC_010658	TCG	2	6	196418	196423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731373
4047	NC_010658	TGA	2	6	196435	196440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731373
4048	NC_010658	T	6	6	196496	196501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_010658	AAGG	2	8	196530	196537	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_010658	AGG	2	6	196545	196550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_010658	CAT	2	6	196561	196566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730772
4052	NC_010658	TGG	2	6	196632	196637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730772
4053	NC_010658	GCG	2	6	196713	196718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730772
4054	NC_010658	ATCA	2	8	196763	196770	50 %	25 %	0 %	25 %	187730772
4055	NC_010658	TCA	2	6	196800	196805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730772
4056	NC_010658	CGA	2	6	196815	196820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730772
4057	NC_010658	T	6	6	196859	196864	0 %	100 %	0 %	0 %	187730772
4058	NC_010658	CGC	2	6	196941	196946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730772
4059	NC_010658	GGC	2	6	197015	197020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730772
4060	NC_010658	A	6	6	197031	197036	100 %	0 %	0 %	0 %	187730772
4061	NC_010658	T	6	6	197062	197067	0 %	100 %	0 %	0 %	187730772
4062	NC_010658	CGG	2	6	197068	197073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730772
4063	NC_010658	CG	3	6	197167	197172	0 %	0 %	50 %	50 %	187730772
4064	NC_010658	CGC	2	6	197245	197250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730772
4065	NC_010658	TGA	3	9	197310	197318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730772
4066	NC_010658	TGG	2	6	197371	197376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730772
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4068	NC_010658	ATG	2	6	197478	197483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730772
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4070	NC_010658	GCG	2	6	197604	197609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730772
4071	NC_010658	GGC	2	6	197662	197667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730772
4072	NC_010658	ATG	2	6	197735	197740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730772
4073	NC_010658	ACC	3	9	197744	197752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730772
4074	NC_010658	TTG	2	6	197769	197774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730772
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4076	NC_010658	TGC	2	6	197799	197804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730772
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4078	NC_010658	CCG	2	6	197921	197926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730772
4079	NC_010658	GAG	2	6	198071	198076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730772
4080	NC_010658	CGG	2	6	198084	198089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730772
4081	NC_010658	TGG	2	6	198093	198098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730772
4082	NC_010658	CGA	2	6	198109	198114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730772
4083	NC_010658	GTA	2	6	198125	198130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730772
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4088	NC_010658	AG	3	6	198556	198561	50 %	0 %	50 %	0 %	187730772
4089	NC_010658	ATT	2	6	198787	198792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730676
4090	NC_010658	GC	3	6	198871	198876	0 %	0 %	50 %	50 %	187730676
4091	NC_010658	CCG	2	6	198943	198948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730676
4092	NC_010658	TGA	2	6	199002	199007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730676
4093	NC_010658	CTT	2	6	199095	199100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730676
4094	NC_010658	CGC	2	6	199154	199159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_010658	CAT	2	6	199204	199209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730131
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4099	NC_010658	GC	3	6	199339	199344	0 %	0 %	50 %	50 %	187730131
4100	NC_010658	TGG	2	6	199431	199436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730131
4101	NC_010658	CGA	2	6	199558	199563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730131
4102	NC_010658	CTG	2	6	199580	199585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
4103	NC_010658	TTGC	2	8	199670	199677	0 %	50 %	25 %	25 %	187730131
4104	NC_010658	G	6	6	199686	199691	0 %	0 %	100 %	0 %	187730131
4105	NC_010658	GAC	2	6	199751	199756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730131
4106	NC_010658	CTGCGC	2	12	199775	199786	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187730131
4107	NC_010658	GCA	2	6	199801	199806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730131
4108	NC_010658	AG	3	6	199864	199869	50 %	0 %	50 %	0 %	187730131
4109	NC_010658	CTG	2	6	199883	199888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
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4113	NC_010658	GCTG	2	8	199986	199993	0 %	25 %	50 %	25 %	187730131
4114	NC_010658	TGGCGC	2	12	200052	200063	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187730131
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4116	NC_010658	TGG	2	6	200129	200134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730131
4117	NC_010658	CGG	2	6	200205	200210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730131
4118	NC_010658	GCGT	2	8	200277	200284	0 %	25 %	50 %	25 %	187730131
4119	NC_010658	TGC	2	6	200301	200306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
4120	NC_010658	CGG	2	6	200323	200328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730131
4121	NC_010658	GAA	2	6	200338	200343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730131
4122	NC_010658	GCC	2	6	200365	200370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730131
4123	NC_010658	CTG	2	6	200393	200398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730131
4124	NC_010658	GCG	2	6	200420	200425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730131
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4131	NC_010658	TCAT	2	8	200802	200809	25 %	50 %	0 %	25 %	187731844
4132	NC_010658	TGC	2	6	200847	200852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731251
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4136	NC_010658	CCT	2	6	201142	201147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4137	NC_010658	CT	3	6	201242	201247	0 %	50 %	0 %	50 %	187732986
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4223	NC_010658	TA	3	6	205531	205536	50 %	50 %	0 %	0 %	187730943
4224	NC_010658	ATC	2	6	205557	205562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730943
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4227	NC_010658	A	7	7	205704	205710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4228	NC_010658	CTGGCA	2	12	206018	206029	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	187730764
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4232	NC_010658	TGA	2	6	206276	206281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730764
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4234	NC_010658	GCGA	2	8	206427	206434	25 %	0 %	50 %	25 %	187730764
4235	NC_010658	ATAC	2	8	206497	206504	50 %	25 %	0 %	25 %	187730797
4236	NC_010658	AGC	2	6	206516	206521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730797
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4238	NC_010658	CGG	2	6	206622	206627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730797
4239	NC_010658	TTC	2	6	206700	206705	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730797
4240	NC_010658	GC	3	6	206734	206739	0 %	0 %	50 %	50 %	187730797
4241	NC_010658	CTA	2	6	206843	206848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730797
4242	NC_010658	GCC	2	6	207006	207011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733230
4243	NC_010658	TTTG	2	8	207021	207028	0 %	75 %	25 %	0 %	187733230
4244	NC_010658	TCA	2	6	207043	207048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733230
4245	NC_010658	TTC	2	6	207070	207075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733230
4246	NC_010658	TACG	2	8	207120	207127	25 %	25 %	25 %	25 %	187733230
4247	NC_010658	CTGG	2	8	207180	207187	0 %	25 %	50 %	25 %	187733230
4248	NC_010658	GGT	2	6	207192	207197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733230
4249	NC_010658	CGT	2	6	207224	207229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733230
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4252	NC_010658	CAA	2	6	207290	207295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733230
4253	NC_010658	GCA	2	6	207311	207316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733230
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4261	NC_010658	ATT	2	6	207821	207826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4262	NC_010658	TGT	2	6	207829	207834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4263	NC_010658	TAAA	2	8	207891	207898	75 %	25 %	0 %	0 %	187730291
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4348	NC_010658	CGT	2	6	211937	211942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4350	NC_010658	GTAG	2	8	212079	212086	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4351	NC_010658	CCT	2	6	212179	212184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4352	NC_010658	AAG	2	6	212192	212197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4353	NC_010658	CA	3	6	212214	212219	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4354	NC_010658	TGA	2	6	212227	212232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4356	NC_010658	GGT	2	6	212304	212309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4357	NC_010658	AGG	2	6	212414	212419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4358	NC_010658	CCA	2	6	212444	212449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4359	NC_010658	TAAA	2	8	212463	212470	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4360	NC_010658	A	6	6	212468	212473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4361	NC_010658	AAC	2	6	212555	212560	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4362	NC_010658	GTT	2	6	212565	212570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4363	NC_010658	TC	3	6	212577	212582	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4364	NC_010658	GAT	2	6	212598	212603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4365	NC_010658	GCG	2	6	212877	212882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4366	NC_010658	AGC	2	6	212894	212899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4367	NC_010658	GT	5	10	212915	212924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4368	NC_010658	G	6	6	213038	213043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4369	NC_010658	TCC	2	6	213048	213053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4370	NC_010658	CTGA	2	8	213068	213075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4371	NC_010658	GTAC	2	8	213152	213159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4372	NC_010658	GGA	2	6	213357	213362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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