MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010658	ATCGGT	2	12	168547	168558	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187732326
3502	NC_010658	TGG	2	6	168602	168607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732326
3503	NC_010658	TAT	2	6	168639	168644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732326
3504	NC_010658	TCC	2	6	168730	168735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187732326
3505	NC_010658	GTGAT	2	10	168761	168770	20 %	40 %	40 %	0 %	187732326
3506	NC_010658	CAG	2	6	168795	168800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
3507	NC_010658	GCA	2	6	168842	168847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
3508	NC_010658	GCA	2	6	168903	168908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
3509	NC_010658	AGC	2	6	168910	168915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
3510	NC_010658	CAA	2	6	168972	168977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732326
3511	NC_010658	AAC	2	6	169003	169008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732326
3512	NC_010658	GAA	2	6	169044	169049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732326
3513	NC_010658	GTGAT	2	10	169052	169061	20 %	40 %	40 %	0 %	187732326
3514	NC_010658	CAG	2	6	169075	169080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732326
3515	NC_010658	GCG	2	6	169154	169159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732326
3516	NC_010658	CAC	2	6	169246	169251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_010658	TCA	2	6	169266	169271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_010658	TACGT	2	10	169297	169306	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3519	NC_010658	GGA	2	6	169334	169339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_010658	TGGC	2	8	169344	169351	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3521	NC_010658	CAT	2	6	169398	169403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_010658	GCG	2	6	169451	169456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_010658	GTC	2	6	169516	169521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_010658	ATG	2	6	169678	169683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_010658	TTG	2	6	169708	169713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_010658	GGA	2	6	169734	169739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_010658	TGA	2	6	169745	169750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_010658	GATC	2	8	169809	169816	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3529	NC_010658	TCAA	2	8	169817	169824	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3530	NC_010658	GTG	2	6	169831	169836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_010658	TTG	2	6	169841	169846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_010658	ACA	2	6	169893	169898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_010658	TAA	2	6	169929	169934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_010658	TGG	2	6	169937	169942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_010658	TGG	2	6	169964	169969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3536	NC_010658	AGA	2	6	170010	170015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3537	NC_010658	AAC	2	6	170033	170038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_010658	ACG	2	6	170143	170148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_010658	TGG	3	9	170150	170158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_010658	GCT	2	6	170183	170188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_010658	TGC	2	6	170303	170308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_010658	GGC	2	6	170319	170324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_010658	GTT	2	6	170367	170372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_010658	TGA	2	6	170445	170450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010658	TGC	2	6	170456	170461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_010658	GGC	2	6	170515	170520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_010658	ATT	2	6	170584	170589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730763
3548	NC_010658	GACT	2	8	170642	170649	25 %	25 %	25 %	25 %	187730763
3549	NC_010658	GTC	2	6	170663	170668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730763
3550	NC_010658	TCA	2	6	170727	170732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730763
3551	NC_010658	CTT	2	6	170767	170772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730763
3552	NC_010658	CGA	2	6	170797	170802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730763
3553	NC_010658	GTT	2	6	170891	170896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730763
3554	NC_010658	TTC	2	6	170927	170932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730763
3555	NC_010658	TGGCC	2	10	171018	171027	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3556	NC_010658	TTC	2	6	171061	171066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_010658	A	6	6	171093	171098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3558	NC_010658	GGC	2	6	171162	171167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730533
3559	NC_010658	CCACG	2	10	171195	171204	20 %	0 %	20 %	60 %	187730533
3560	NC_010658	ACCA	2	8	171283	171290	50 %	0 %	0 %	50 %	187730533
3561	NC_010658	CCG	2	6	171308	171313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730533
3562	NC_010658	TCA	2	6	171347	171352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730533
3563	NC_010658	CTT	2	6	171360	171365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730533
3564	NC_010658	GGT	2	6	171422	171427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730533
3565	NC_010658	ACA	2	6	171510	171515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730533
3566	NC_010658	T	7	7	171557	171563	0 %	100 %	0 %	0 %	187730533
3567	NC_010658	G	6	6	171624	171629	0 %	0 %	100 %	0 %	187730533
3568	NC_010658	ATA	2	6	171672	171677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730533
3569	NC_010658	CGC	2	6	171684	171689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730533
3570	NC_010658	TGC	2	6	171805	171810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730533
3571	NC_010658	A	6	6	171820	171825	100 %	0 %	0 %	0 %	187730533
3572	NC_010658	TCG	2	6	171903	171908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_010658	CAA	2	6	171922	171927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_010658	CGG	2	6	171929	171934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_010658	ATC	2	6	171941	171946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3576	NC_010658	A	8	8	171959	171966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_010658	CGT	2	6	171975	171980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3578	NC_010658	GCA	2	6	172014	172019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730436
3579	NC_010658	AAC	2	6	172123	172128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730436
3580	NC_010658	CCG	2	6	172137	172142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730436
3581	NC_010658	CTT	2	6	172230	172235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730436
3582	NC_010658	ACT	2	6	172253	172258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730436
3583	NC_010658	ATG	2	6	172292	172297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730436
3584	NC_010658	CGC	2	6	172326	172331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730436
3585	NC_010658	TCA	2	6	172418	172423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730436
3586	NC_010658	CCG	2	6	172494	172499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730436
3587	NC_010658	TGG	2	6	172501	172506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730436
3588	NC_010658	CTT	2	6	172521	172526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730436
3589	NC_010658	TCG	2	6	172541	172546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730436
3590	NC_010658	AG	3	6	172627	172632	50 %	0 %	50 %	0 %	187730436
3591	NC_010658	T	6	6	172642	172647	0 %	100 %	0 %	0 %	187730436
3592	NC_010658	T	6	6	172680	172685	0 %	100 %	0 %	0 %	187730436
3593	NC_010658	CAG	2	6	172711	172716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730436
3594	NC_010658	TGGC	2	8	172761	172768	0 %	25 %	50 %	25 %	187730436
3595	NC_010658	AAT	2	6	172801	172806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187730436
3596	NC_010658	CTG	2	6	172816	172821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730436
3597	NC_010658	CTG	2	6	172906	172911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3598	NC_010658	TTA	2	6	172919	172924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731963
3599	NC_010658	TCT	2	6	172961	172966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731963
3600	NC_010658	CTCG	2	8	172968	172975	0 %	25 %	25 %	50 %	187731963
3601	NC_010658	CAG	2	6	173044	173049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3602	NC_010658	CTGG	2	8	173052	173059	0 %	25 %	50 %	25 %	187731963
3603	NC_010658	CGGT	2	8	173090	173097	0 %	25 %	50 %	25 %	187731963
3604	NC_010658	GTG	2	6	173300	173305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731963
3605	NC_010658	CGT	2	6	173316	173321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3606	NC_010658	GCG	2	6	173335	173340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731963
3607	NC_010658	CGG	2	6	173358	173363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731963
3608	NC_010658	TAA	2	6	173464	173469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731963
3609	NC_010658	GCCAG	2	10	173481	173490	20 %	0 %	40 %	40 %	187731963
3610	NC_010658	TCG	2	6	173558	173563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3611	NC_010658	AGT	2	6	173579	173584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731963
3612	NC_010658	CGT	2	6	173648	173653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3613	NC_010658	GCT	2	6	173655	173660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3614	NC_010658	TGG	2	6	173724	173729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731963
3615	NC_010658	CTT	2	6	173787	173792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731963
3616	NC_010658	TGA	2	6	173805	173810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731963
3617	NC_010658	CCAG	2	8	173871	173878	25 %	0 %	25 %	50 %	187731963
3618	NC_010658	CGC	3	9	173961	173969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731963
3619	NC_010658	GCG	2	6	173996	174001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731963
3620	NC_010658	CA	4	8	174043	174050	50 %	0 %	0 %	50 %	187731963
3621	NC_010658	TGGCGC	2	12	174056	174067	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187731963
3622	NC_010658	TTC	2	6	174070	174075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731963
3623	NC_010658	CGA	2	6	174162	174167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731963
3624	NC_010658	CGC	2	6	174230	174235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731963
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3626	NC_010658	GTG	2	6	174341	174346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731963
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3733	NC_010658	GTCTG	2	10	179710	179719	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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3741	NC_010658	CGT	2	6	180142	180147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731916
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3991	NC_010658	TGG	2	6	193903	193908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733784
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