MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010658	GCG	2	6	121499	121504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731189
2502	NC_010658	TTG	2	6	121510	121515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731189
2503	NC_010658	GTC	2	6	121552	121557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2504	NC_010658	GCG	2	6	121634	121639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731189
2505	NC_010658	TGC	2	6	121663	121668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2506	NC_010658	GCTG	2	8	121677	121684	0 %	25 %	50 %	25 %	187731189
2507	NC_010658	CCG	2	6	121721	121726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731189
2508	NC_010658	TGA	2	6	121739	121744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731189
2509	NC_010658	GCC	2	6	121803	121808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731189
2510	NC_010658	TTG	2	6	121856	121861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731189
2511	NC_010658	TGT	2	6	121875	121880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731189
2512	NC_010658	GCCA	2	8	121893	121900	25 %	0 %	25 %	50 %	187731189
2513	NC_010658	GTG	2	6	121924	121929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731189
2514	NC_010658	ATC	3	9	121936	121944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731189
2515	NC_010658	ATG	4	12	121948	121959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731189
2516	NC_010658	TCG	2	6	121967	121972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2517	NC_010658	TGC	2	6	121986	121991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2518	NC_010658	TGG	3	9	122071	122079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731189
2519	NC_010658	CGG	2	6	122089	122094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731189
2520	NC_010658	GGTTG	2	10	122128	122137	0 %	40 %	60 %	0 %	187731189
2521	NC_010658	GTT	2	6	122189	122194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731189
2522	NC_010658	CTGT	2	8	122259	122266	0 %	50 %	25 %	25 %	187731189
2523	NC_010658	TTC	2	6	122282	122287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731189
2524	NC_010658	TAA	2	6	122295	122300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731189
2525	NC_010658	TGA	2	6	122314	122319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731189
2526	NC_010658	TTG	2	6	122335	122340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731189
2527	NC_010658	CCA	2	6	122463	122468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731189
2528	NC_010658	AGC	2	6	122515	122520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2529	NC_010658	ACG	2	6	122681	122686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2530	NC_010658	TA	4	8	122800	122807	50 %	50 %	0 %	0 %	187731189
2531	NC_010658	GGC	2	6	122818	122823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731189
2532	NC_010658	T	6	6	123082	123087	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_010658	T	6	6	123095	123100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2534	NC_010658	CGT	2	6	123116	123121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2535	NC_010658	CTG	2	6	123172	123177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2536	NC_010658	GAG	2	6	123228	123233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731650
2537	NC_010658	CGT	2	6	123237	123242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2538	NC_010658	AGA	2	6	123246	123251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731650
2539	NC_010658	GCT	2	6	123336	123341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2540	NC_010658	CCCG	2	8	123348	123355	0 %	0 %	25 %	75 %	187731650
2541	NC_010658	GAA	3	9	123361	123369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731650
2542	NC_010658	AACC	2	8	123387	123394	50 %	0 %	0 %	50 %	187731650
2543	NC_010658	GCC	2	6	123418	123423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731650
2544	NC_010658	GCT	2	6	123445	123450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2545	NC_010658	CTG	2	6	123478	123483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2546	NC_010658	CTG	2	6	123505	123510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2547	NC_010658	ACA	2	6	123530	123535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731650
2548	NC_010658	GAT	2	6	123559	123564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731650
2549	NC_010658	CA	3	6	123601	123606	50 %	0 %	0 %	50 %	187731650
2550	NC_010658	CTG	2	6	123607	123612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2551	NC_010658	AGA	2	6	123636	123641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731650
2552	NC_010658	GAAAGC	2	12	123642	123653	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	187731650
2553	NC_010658	GCTG	2	8	123723	123730	0 %	25 %	50 %	25 %	187731650
2554	NC_010658	CCAG	2	8	123876	123883	25 %	0 %	25 %	50 %	187731650
2555	NC_010658	GTT	2	6	123886	123891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731650
2556	NC_010658	GAT	2	6	124015	124020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731650
2557	NC_010658	CGG	2	6	124044	124049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731650
2558	NC_010658	CGG	2	6	124062	124067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731650
2559	NC_010658	TCT	2	6	124082	124087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731650
2560	NC_010658	CTG	2	6	124210	124215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2561	NC_010658	TGAT	2	8	124244	124251	25 %	50 %	25 %	0 %	187731650
2562	NC_010658	GTGC	2	8	124255	124262	0 %	25 %	50 %	25 %	187731650
2563	NC_010658	GGC	2	6	124264	124269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731650
2564	NC_010658	ACC	2	6	124300	124305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731650
2565	NC_010658	TGA	2	6	124506	124511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731650
2566	NC_010658	CAC	2	6	124609	124614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731650
2567	NC_010658	GT	3	6	124646	124651	0 %	50 %	50 %	0 %	187731650
2568	NC_010658	TGC	3	9	124697	124705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2569	NC_010658	CGG	2	6	124766	124771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731650
2570	NC_010658	TCTGG	2	10	124774	124783	0 %	40 %	40 %	20 %	187731650
2571	NC_010658	CTG	2	6	124924	124929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2572	NC_010658	GAA	2	6	124938	124943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731650
2573	NC_010658	TCT	2	6	124958	124963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731650
2574	NC_010658	ATC	2	6	125086	125091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731650
2575	NC_010658	CTG	2	6	125116	125121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2576	NC_010658	GAT	2	6	125127	125132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731650
2577	NC_010658	TCG	2	6	125151	125156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2578	NC_010658	CGT	2	6	125167	125172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2579	NC_010658	TGGC	2	8	125191	125198	0 %	25 %	50 %	25 %	187731650
2580	NC_010658	GCT	2	6	125208	125213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2581	NC_010658	TG	3	6	125285	125290	0 %	50 %	50 %	0 %	187731650
2582	NC_010658	CG	3	6	125310	125315	0 %	0 %	50 %	50 %	187731650
2583	NC_010658	CGA	2	6	125346	125351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2584	NC_010658	TGC	2	6	125394	125399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2585	NC_010658	CTG	2	6	125407	125412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731650
2586	NC_010658	CGC	2	6	125472	125477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731650
2587	NC_010658	GAA	2	6	125488	125493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731650
2588	NC_010658	CTA	2	6	125496	125501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731650
2589	NC_010658	GGT	2	6	125592	125597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731650
2590	NC_010658	GGC	2	6	125670	125675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731650
2591	NC_010658	GCG	2	6	125680	125685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731650
2592	NC_010658	CAAC	2	8	125778	125785	50 %	0 %	0 %	50 %	187731650
2593	NC_010658	TAA	2	6	125836	125841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731650
2594	NC_010658	T	6	6	125900	125905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_010658	AC	3	6	126006	126011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2596	NC_010658	GAAA	2	8	126108	126115	75 %	0 %	25 %	0 %	187732786
2597	NC_010658	CTTG	2	8	126123	126130	0 %	50 %	25 %	25 %	187732786
2598	NC_010658	AGC	2	6	126144	126149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732786
2599	NC_010658	GCAC	2	8	126150	126157	25 %	0 %	25 %	50 %	187732786
2600	NC_010658	GGGCA	2	10	126185	126194	20 %	0 %	60 %	20 %	187732786
2601	NC_010658	TGGA	2	8	126208	126215	25 %	25 %	50 %	0 %	187732786
2602	NC_010658	ACT	2	6	126284	126289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732786
2603	NC_010658	ACG	2	6	126290	126295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732786
2604	NC_010658	GCG	2	6	126314	126319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732786
2605	NC_010658	GGC	2	6	126342	126347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732786
2606	NC_010658	GCA	2	6	126363	126368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732786
2607	NC_010658	TAAA	2	8	126373	126380	75 %	25 %	0 %	0 %	187732786
2608	NC_010658	TAA	2	6	126437	126442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732458
2609	NC_010658	TTTC	2	8	126453	126460	0 %	75 %	0 %	25 %	187732458
2610	NC_010658	CAGCG	2	10	126463	126472	20 %	0 %	40 %	40 %	187732458
2611	NC_010658	CCA	2	6	126597	126602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732458
2612	NC_010658	TGG	2	6	126743	126748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732458
2613	NC_010658	CGC	2	6	126783	126788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732458
2614	NC_010658	ACC	2	6	126826	126831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732458
2615	NC_010658	GGTA	2	8	126849	126856	25 %	25 %	50 %	0 %	187732458
2616	NC_010658	TTC	2	6	126952	126957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732458
2617	NC_010658	GGCG	2	8	127002	127009	0 %	0 %	75 %	25 %	187732458
2618	NC_010658	ATT	2	6	127174	127179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732458
2619	NC_010658	CAGTTT	2	12	127189	127200	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	187732458
2620	NC_010658	T	6	6	127198	127203	0 %	100 %	0 %	0 %	187732458
2621	NC_010658	TCT	2	6	127214	127219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2622	NC_010658	TAA	2	6	127298	127303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731639
2623	NC_010658	AAT	2	6	127339	127344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731639
2624	NC_010658	GA	3	6	127352	127357	50 %	0 %	50 %	0 %	187731639
2625	NC_010658	CGT	2	6	127368	127373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731639
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2631	NC_010658	TCG	2	6	127670	127675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731639
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2639	NC_010658	TCG	2	6	127910	127915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731639
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2643	NC_010658	CCT	2	6	128098	128103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2644	NC_010658	A	7	7	128118	128124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2645	NC_010658	ATA	2	6	128134	128139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2650	NC_010658	AGA	2	6	128562	128567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2651	NC_010658	GCGA	2	8	128584	128591	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2652	NC_010658	CGA	2	6	128594	128599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2653	NC_010658	ATT	2	6	128602	128607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2654	NC_010658	CGT	2	6	128713	128718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730447
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2705	NC_010658	CGGA	2	8	131036	131043	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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2726	NC_010658	GTA	2	6	132524	132529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2735	NC_010658	TTG	2	6	132795	132800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2994	NC_010658	TTC	2	6	145450	145455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731223
2995	NC_010658	CAG	2	6	145483	145488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731223
2996	NC_010658	GCGAG	2	10	145493	145502	20 %	0 %	60 %	20 %	187731223
2997	NC_010658	GGC	2	6	145546	145551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731223
2998	NC_010658	CG	3	6	145561	145566	0 %	0 %	50 %	50 %	187731223
2999	NC_010658	GCC	2	6	145648	145653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731223
3000	NC_010658	ACGG	2	8	145663	145670	25 %	0 %	50 %	25 %	187731223

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