MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010658	ATT	2	6	98285	98290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733661
2003	NC_010658	CTG	2	6	98336	98341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733661
2004	NC_010658	GAC	2	6	98390	98395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733661
2005	NC_010658	CT	3	6	98488	98493	0 %	50 %	0 %	50 %	187734219
2006	NC_010658	T	9	9	98514	98522	0 %	100 %	0 %	0 %	187734219
2007	NC_010658	A	6	6	98541	98546	100 %	0 %	0 %	0 %	187734219
2008	NC_010658	TTCA	2	8	98592	98599	25 %	50 %	0 %	25 %	187734219
2009	NC_010658	TTA	2	6	98734	98739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732984
2010	NC_010658	CGC	2	6	98781	98786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732984
2011	NC_010658	AC	3	6	98876	98881	50 %	0 %	0 %	50 %	187732984
2012	NC_010658	GCC	2	6	98882	98887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732984
2013	NC_010658	TCTT	2	8	98949	98956	0 %	75 %	0 %	25 %	187732984
2014	NC_010658	GAA	2	6	98989	98994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732984
2015	NC_010658	GC	3	6	99041	99046	0 %	0 %	50 %	50 %	187732984
2016	NC_010658	AAC	2	6	99185	99190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187732984
2017	NC_010658	TTA	2	6	99210	99215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_010658	TAT	2	6	99244	99249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731238
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2022	NC_010658	AACG	2	8	99530	99537	50 %	0 %	25 %	25 %	187731238
2023	NC_010658	CTGC	2	8	99587	99594	0 %	25 %	25 %	50 %	187731238
2024	NC_010658	AAC	2	6	99671	99676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731238
2025	NC_010658	AAC	2	6	99782	99787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731238
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2102	NC_010658	GTGC	2	8	103506	103513	0 %	25 %	50 %	25 %	187730773
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2108	NC_010658	GCA	2	6	103815	103820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730773
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2112	NC_010658	TA	3	6	104068	104073	50 %	50 %	0 %	0 %	187730773
2113	NC_010658	TCA	2	6	104099	104104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2114	NC_010658	TGA	2	6	104146	104151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2115	NC_010658	A	7	7	104198	104204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2116	NC_010658	GAA	2	6	104313	104318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734255
2117	NC_010658	TCAGA	2	10	104421	104430	40 %	20 %	20 %	20 %	187734255
2118	NC_010658	CGC	2	6	104453	104458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734255
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2123	NC_010658	A	6	6	104635	104640	100 %	0 %	0 %	0 %	187734255
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2369	NC_010658	AGAGC	2	10	116103	116112	40 %	0 %	40 %	20 %	187733027
2370	NC_010658	TCGT	2	8	116138	116145	0 %	50 %	25 %	25 %	187733027
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2372	NC_010658	ATC	2	6	116197	116202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733027
2373	NC_010658	CGA	2	6	116205	116210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733027
2374	NC_010658	CAG	2	6	116272	116277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733027
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2471	NC_010658	ACT	2	6	120556	120561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733045
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2473	NC_010658	AAG	2	6	120631	120636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733045
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2483	NC_010658	T	7	7	121015	121021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2484	NC_010658	AG	3	6	121063	121068	50 %	0 %	50 %	0 %	187731189
2485	NC_010658	CTG	2	6	121080	121085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
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2487	NC_010658	CT	3	6	121155	121160	0 %	50 %	0 %	50 %	187731189
2488	NC_010658	GTT	2	6	121176	121181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731189
2489	NC_010658	GGCG	2	8	121206	121213	0 %	0 %	75 %	25 %	187731189
2490	NC_010658	GCT	2	6	121242	121247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2491	NC_010658	GCT	2	6	121272	121277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2492	NC_010658	CTGA	2	8	121287	121294	25 %	25 %	25 %	25 %	187731189
2493	NC_010658	GCT	2	6	121320	121325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2494	NC_010658	GCT	2	6	121368	121373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2495	NC_010658	AGGCG	2	10	121375	121384	20 %	0 %	60 %	20 %	187731189
2496	NC_010658	CT	3	6	121408	121413	0 %	50 %	0 %	50 %	187731189
2497	NC_010658	GCT	2	6	121416	121421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2498	NC_010658	TC	3	6	121444	121449	0 %	50 %	0 %	50 %	187731189
2499	NC_010658	GCT	2	6	121464	121469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731189
2500	NC_010658	CTGA	2	8	121479	121486	25 %	25 %	25 %	25 %	187731189

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