MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010658	GTC	2	6	48382	48387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733413
1002	NC_010658	CAT	2	6	48444	48449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733413
1003	NC_010658	GTA	2	6	48454	48459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733413
1004	NC_010658	TGCGT	2	10	48581	48590	0 %	40 %	40 %	20 %	187733413
1005	NC_010658	AAC	2	6	48713	48718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733413
1006	NC_010658	ACG	2	6	48721	48726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733413
1007	NC_010658	ATG	2	6	48839	48844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733413
1008	NC_010658	ACG	2	6	48850	48855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733413
1009	NC_010658	GCG	2	6	48867	48872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733413
1010	NC_010658	TGG	2	6	48876	48881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733413
1011	NC_010658	AGT	2	6	48930	48935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733413
1012	NC_010658	TGG	3	9	48936	48944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733413
1013	NC_010658	CACC	2	8	48987	48994	25 %	0 %	0 %	75 %	187733413
1014	NC_010658	TTC	2	6	49072	49077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733413
1015	NC_010658	AAT	2	6	49087	49092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733413
1016	NC_010658	CTAC	2	8	49097	49104	25 %	25 %	0 %	50 %	187733413
1017	NC_010658	AGG	2	6	49134	49139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733413
1018	NC_010658	CAC	2	6	49176	49181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733413
1019	NC_010658	GTT	2	6	49182	49187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187733413
1020	NC_010658	TCA	2	6	49188	49193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733413
1021	NC_010658	CCA	2	6	49221	49226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733413
1022	NC_010658	TCG	2	6	49310	49315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733413
1023	NC_010658	TCG	2	6	49394	49399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733413
1024	NC_010658	TGG	2	6	49617	49622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733413
1025	NC_010658	T	6	6	49642	49647	0 %	100 %	0 %	0 %	187733413
1026	NC_010658	CAT	2	6	49669	49674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010658	GTG	2	6	49759	49764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_010658	GT	3	6	49884	49889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010658	AT	3	6	49901	49906	50 %	50 %	0 %	0 %	187730491
1030	NC_010658	CGTGGC	2	12	49931	49942	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187730491
1031	NC_010658	CTTA	2	8	49943	49950	25 %	50 %	0 %	25 %	187730491
1032	NC_010658	GCG	2	6	49954	49959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730491
1033	NC_010658	T	6	6	50064	50069	0 %	100 %	0 %	0 %	187730491
1034	NC_010658	CCA	2	6	50071	50076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730491
1035	NC_010658	GCCA	2	8	50142	50149	25 %	0 %	25 %	50 %	187730491
1036	NC_010658	GCG	2	6	50190	50195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730491
1037	NC_010658	GGC	2	6	50318	50323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730491
1038	NC_010658	CGGT	2	8	50355	50362	0 %	25 %	50 %	25 %	187730491
1039	NC_010658	AGA	2	6	50378	50383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730491
1040	NC_010658	ATG	2	6	50424	50429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730491
1041	NC_010658	GGC	2	6	50448	50453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730491
1042	NC_010658	CAG	2	6	50460	50465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730491
1043	NC_010658	GGT	2	6	50475	50480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730491
1044	NC_010658	GCA	2	6	50486	50491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730491
1045	NC_010658	GAT	2	6	50550	50555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730491
1046	NC_010658	ACC	2	6	50559	50564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730491
1047	NC_010658	TGA	2	6	50587	50592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730491
1048	NC_010658	TGG	2	6	50614	50619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730491
1049	NC_010658	GCC	2	6	50630	50635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730491
1050	NC_010658	GAT	2	6	50639	50644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730491
1051	NC_010658	CAG	2	6	50676	50681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730491
1052	NC_010658	AGC	2	6	50698	50703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730491
1053	NC_010658	CAA	2	6	50915	50920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731746
1054	NC_010658	CCG	2	6	51058	51063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731746
1055	NC_010658	CCA	2	6	51070	51075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731746
1056	NC_010658	CCA	2	6	51163	51168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731746
1057	NC_010658	GCTCGC	2	12	51223	51234	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	187731746
1058	NC_010658	CGC	2	6	51289	51294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731746
1059	NC_010658	CTGC	2	8	51325	51332	0 %	25 %	25 %	50 %	187731746
1060	NC_010658	TCA	2	6	51355	51360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731746
1061	NC_010658	ACA	2	6	51397	51402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731746
1062	NC_010658	ACC	2	6	51420	51425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731746
1063	NC_010658	AACC	2	8	51452	51459	50 %	0 %	0 %	50 %	187731746
1064	NC_010658	CCTG	2	8	51554	51561	0 %	25 %	25 %	50 %	187731450
1065	NC_010658	CTG	2	6	51580	51585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1066	NC_010658	TCG	2	6	51611	51616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1067	NC_010658	TCG	2	6	51680	51685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1068	NC_010658	ATCA	2	8	51703	51710	50 %	25 %	0 %	25 %	187731450
1069	NC_010658	CTG	2	6	51769	51774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1070	NC_010658	TGC	2	6	51792	51797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1071	NC_010658	GCC	2	6	51854	51859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731450
1072	NC_010658	GTT	2	6	51862	51867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731450
1073	NC_010658	CAG	2	6	51880	51885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1074	NC_010658	CCA	2	6	51966	51971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731450
1075	NC_010658	TACC	2	8	51978	51985	25 %	25 %	0 %	50 %	187731450
1076	NC_010658	T	6	6	51998	52003	0 %	100 %	0 %	0 %	187731450
1077	NC_010658	TGC	2	6	52017	52022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1078	NC_010658	TAA	2	6	52083	52088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731450
1079	NC_010658	GGTGAT	2	12	52129	52140	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187731450
1080	NC_010658	TGT	2	6	52206	52211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731450
1081	NC_010658	CGC	2	6	52212	52217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731450
1082	NC_010658	TGAT	2	8	52226	52233	25 %	50 %	25 %	0 %	187731450
1083	NC_010658	ATA	2	6	52238	52243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187731450
1084	NC_010658	CAG	2	6	52348	52353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1085	NC_010658	GAC	2	6	52626	52631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1086	NC_010658	GCT	2	6	52638	52643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1087	NC_010658	TGGC	2	8	52685	52692	0 %	25 %	50 %	25 %	187731450
1088	NC_010658	CAG	2	6	52732	52737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1089	NC_010658	TCT	2	6	52754	52759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731450
1090	NC_010658	GGC	2	6	52771	52776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731450
1091	NC_010658	CG	3	6	52944	52949	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
1092	NC_010658	CCA	2	6	52960	52965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731450
1093	NC_010658	TCGCTG	2	12	53234	53245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1094	NC_010658	TGC	2	6	53248	53253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1095	NC_010658	ATC	2	6	53285	53290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731450
1096	NC_010658	CAG	2	6	53335	53340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1097	NC_010658	CAG	2	6	53422	53427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1098	NC_010658	CAG	3	9	53479	53487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1099	NC_010658	GTT	2	6	53511	53516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731450
1100	NC_010658	ACC	2	6	53579	53584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731450
1101	NC_010658	ACG	2	6	53632	53637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1102	NC_010658	TCA	3	9	53717	53725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731450
1103	NC_010658	GCA	2	6	53754	53759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1104	NC_010658	CAG	2	6	53814	53819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731450
1105	NC_010658	AG	3	6	53824	53829	50 %	0 %	50 %	0 %	187731450
1106	NC_010658	ATC	2	6	53846	53851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731450
1107	NC_010658	CAGC	2	8	53886	53893	25 %	0 %	25 %	50 %	187731450
1108	NC_010658	CG	3	6	53898	53903	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
1109	NC_010658	GGC	3	9	53910	53918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731450
1110	NC_010658	CAT	2	6	53922	53927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731450
1111	NC_010658	CG	4	8	54017	54024	0 %	0 %	50 %	50 %	187731450
1112	NC_010658	TCT	2	6	54185	54190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731450
1113	NC_010658	CTT	2	6	54195	54200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731450
1114	NC_010658	TGCG	2	8	54279	54286	0 %	25 %	50 %	25 %	187731450
1115	NC_010658	AAAGT	2	10	54315	54324	60 %	20 %	20 %	0 %	187731450
1116	NC_010658	ACC	2	6	54451	54456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_010658	GTG	2	6	54478	54483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_010658	T	7	7	54569	54575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_010658	GTG	2	6	54691	54696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730247
1120	NC_010658	TGG	2	6	54727	54732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730247
1121	NC_010658	TTC	2	6	54794	54799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730247
1122	NC_010658	GCG	2	6	54813	54818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730247
1123	NC_010658	GGC	2	6	54828	54833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730247
1124	NC_010658	CTG	2	6	54980	54985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730247
1125	NC_010658	CTG	2	6	54989	54994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730247
1126	NC_010658	GCG	2	6	55000	55005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730247
1127	NC_010658	CCT	2	6	55060	55065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730247
1128	NC_010658	TGGT	2	8	55114	55121	0 %	50 %	50 %	0 %	187730247
1129	NC_010658	GTT	2	6	55177	55182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730247
1130	NC_010658	CCA	2	6	55199	55204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730247
1131	NC_010658	TGC	2	6	55215	55220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730247
1132	NC_010658	CGC	2	6	55241	55246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730247
1133	NC_010658	TTC	3	9	55247	55255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730247
1134	NC_010658	CGT	2	6	55309	55314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730247
1135	NC_010658	TCAA	2	8	55326	55333	50 %	25 %	0 %	25 %	187730247
1136	NC_010658	TGA	2	6	55356	55361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730247
1137	NC_010658	CGA	2	6	55376	55381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730247
1138	NC_010658	GAA	2	6	55397	55402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730247
1139	NC_010658	GGT	2	6	55412	55417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730247
1140	NC_010658	ATG	2	6	55443	55448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730247
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1142	NC_010658	CCA	2	6	55612	55617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730247
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1144	NC_010658	GAT	2	6	55646	55651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730247
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1149	NC_010658	CCG	2	6	55827	55832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730247
1150	NC_010658	CGG	2	6	55971	55976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730247
1151	NC_010658	A	6	6	56132	56137	100 %	0 %	0 %	0 %	187730247
1152	NC_010658	TAT	2	6	56179	56184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730247
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1156	NC_010658	GCGG	2	8	56323	56330	0 %	0 %	75 %	25 %	187730247
1157	NC_010658	GAG	2	6	56361	56366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730247
1158	NC_010658	GGT	2	6	56450	56455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730247
1159	NC_010658	GCG	2	6	56482	56487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730247
1160	NC_010658	GGTGA	2	10	56562	56571	20 %	20 %	60 %	0 %	187730247
1161	NC_010658	GGCG	2	8	56598	56605	0 %	0 %	75 %	25 %	187730247
1162	NC_010658	TCA	2	6	56659	56664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730247
1163	NC_010658	CGG	2	6	56788	56793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730247
1164	NC_010658	GCCA	2	8	56853	56860	25 %	0 %	25 %	50 %	187730247
1165	NC_010658	CCTG	2	8	56916	56923	0 %	25 %	25 %	50 %	187730247
1166	NC_010658	A	6	6	56944	56949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1167	NC_010658	CAG	2	6	57055	57060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730282
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1170	NC_010658	GTGG	2	8	57346	57353	0 %	25 %	75 %	0 %	187730282
1171	NC_010658	TGG	2	6	57393	57398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730282
1172	NC_010658	GCC	2	6	57424	57429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730282
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1183	NC_010658	ACC	2	6	58277	58282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734070
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1200	NC_010658	CAC	2	6	59168	59173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734070
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1231	NC_010658	AATA	2	8	60659	60666	75 %	25 %	0 %	0 %	187733621
1232	NC_010658	CCA	2	6	60667	60672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733621
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1238	NC_010658	TCCA	2	8	61121	61128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1239	NC_010658	A	7	7	61128	61134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1240	NC_010658	AG	3	6	61153	61158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1241	NC_010658	AAT	2	6	61239	61244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1242	NC_010658	TAA	2	6	61332	61337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1243	NC_010658	TCT	2	6	61421	61426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1244	NC_010658	CTG	2	6	61475	61480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733147
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1247	NC_010658	CGAC	2	8	61558	61565	25 %	0 %	25 %	50 %	187733147
1248	NC_010658	GTG	2	6	61616	61621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733147
1249	NC_010658	TTTG	2	8	61640	61647	0 %	75 %	25 %	0 %	187733147
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