MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_010658	GC	3	6	512475	512480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10502	NC_010658	GCC	2	6	512535	512540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10503	NC_010658	AGCC	2	8	512601	512608	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10504	NC_010658	ATT	2	6	512640	512645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10505	NC_010658	GAT	2	6	512662	512667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10506	NC_010658	GTG	2	6	512668	512673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10507	NC_010658	GCG	2	6	512696	512701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10508	NC_010658	GGT	2	6	512815	512820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10509	NC_010658	CGC	2	6	512931	512936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730217
10510	NC_010658	ATGC	2	8	512945	512952	25 %	25 %	25 %	25 %	187730217
10511	NC_010658	AT	3	6	512956	512961	50 %	50 %	0 %	0 %	187730217
10512	NC_010658	TCAG	2	8	512979	512986	25 %	25 %	25 %	25 %	187730217
10513	NC_010658	ATG	2	6	513020	513025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730217
10514	NC_010658	GTG	2	6	513131	513136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730217
10515	NC_010658	CAGC	2	8	513147	513154	25 %	0 %	25 %	50 %	187730217
10516	NC_010658	GCCA	2	8	513290	513297	25 %	0 %	25 %	50 %	187730217
10517	NC_010658	TGA	2	6	513307	513312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730217
10518	NC_010658	CAC	2	6	513463	513468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730217
10519	NC_010658	GCC	2	6	513498	513503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730217
10520	NC_010658	ATT	2	6	513509	513514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730217
10521	NC_010658	GGA	2	6	513584	513589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10522	NC_010658	GCT	2	6	513628	513633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733524
10523	NC_010658	ACCAA	2	10	513676	513685	60 %	0 %	0 %	40 %	187733524
10524	NC_010658	GCA	2	6	513803	513808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733524
10525	NC_010658	ATC	2	6	513862	513867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733524
10526	NC_010658	CAA	2	6	513869	513874	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733524
10527	NC_010658	GCC	2	6	513913	513918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733524
10528	NC_010658	GAT	2	6	513951	513956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733524
10529	NC_010658	CAG	2	6	514047	514052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733524
10530	NC_010658	CAC	2	6	514056	514061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733524
10531	NC_010658	CCAGA	2	10	514100	514109	40 %	0 %	20 %	40 %	187733524
10532	NC_010658	GGA	2	6	514136	514141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733524
10533	NC_010658	TGA	2	6	514184	514189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733524
10534	NC_010658	GAT	2	6	514233	514238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733524
10535	NC_010658	GTG	3	9	514276	514284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733524
10536	NC_010658	GA	3	6	514310	514315	50 %	0 %	50 %	0 %	187733524
10537	NC_010658	T	6	6	514323	514328	0 %	100 %	0 %	0 %	187733524
10538	NC_010658	AGA	2	6	514346	514351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733524
10539	NC_010658	GCA	2	6	514378	514383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733524
10540	NC_010658	CGT	2	6	514398	514403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733524
10541	NC_010658	GCC	2	6	514444	514449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733524
10542	NC_010658	CAC	2	6	514452	514457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733524
10543	NC_010658	AAT	2	6	514479	514484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733524
10544	NC_010658	CGC	2	6	514485	514490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733524
10545	NC_010658	GCA	2	6	514507	514512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733524
10546	NC_010658	GGC	2	6	514629	514634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733524
10547	NC_010658	ATC	2	6	514636	514641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733524
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10549	NC_010658	CA	3	6	514736	514741	50 %	0 %	0 %	50 %	187733524
10550	NC_010658	CAT	2	6	514743	514748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733524
10551	NC_010658	ATC	2	6	514750	514755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733524
10552	NC_010658	CGC	3	9	514766	514774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733524
10553	NC_010658	CTGG	2	8	514836	514843	0 %	25 %	50 %	25 %	187733524
10554	NC_010658	AC	3	6	514907	514912	50 %	0 %	0 %	50 %	187733524
10555	NC_010658	ATG	2	6	514933	514938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733524
10556	NC_010658	AATG	2	8	514983	514990	50 %	25 %	25 %	0 %	187733524
10557	NC_010658	ATA	2	6	515028	515033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_010658	A	6	6	515033	515038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10559	NC_010658	A	6	6	515055	515060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10560	NC_010658	ATA	2	6	515183	515188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10561	NC_010658	TG	3	6	515190	515195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10562	NC_010658	TGG	2	6	515204	515209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10563	NC_010658	A	7	7	515260	515266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10564	NC_010658	AT	4	8	515293	515300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10565	NC_010658	TA	3	6	515301	515306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10566	NC_010658	GAT	2	6	515316	515321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10567	NC_010658	TGT	2	6	515322	515327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10568	NC_010658	A	6	6	515336	515341	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10569	NC_010658	AAT	2	6	515345	515350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10570	NC_010658	ATC	2	6	515370	515375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10571	NC_010658	A	6	6	515376	515381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10572	NC_010658	T	6	6	515395	515400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10573	NC_010658	ACG	2	6	515421	515426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10574	NC_010658	CAT	2	6	515427	515432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10575	NC_010658	AAAT	2	8	515473	515480	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10576	NC_010658	AGC	2	6	515483	515488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10577	NC_010658	ATT	2	6	515496	515501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10578	NC_010658	TGCTA	2	10	515542	515551	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10579	NC_010658	GTA	2	6	515552	515557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10580	NC_010658	TA	3	6	515735	515740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10581	NC_010658	A	6	6	515783	515788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10582	NC_010658	ACA	2	6	516101	516106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10583	NC_010658	CTT	2	6	516168	516173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10584	NC_010658	GCA	2	6	516395	516400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731707
10585	NC_010658	CTG	2	6	516506	516511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731707
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10587	NC_010658	GTT	2	6	516734	516739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731095
10588	NC_010658	GGT	2	6	516757	516762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731095
10589	NC_010658	CTG	2	6	516800	516805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731095
10590	NC_010658	ATG	2	6	516827	516832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731095
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10592	NC_010658	AAG	2	6	516955	516960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731095
10593	NC_010658	ATTTG	2	10	516984	516993	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
10594	NC_010658	AAT	2	6	517017	517022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10595	NC_010658	CGT	2	6	517023	517028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10596	NC_010658	AGG	2	6	517051	517056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_010658	TGC	2	6	517070	517075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733191
10598	NC_010658	TG	3	6	517097	517102	0 %	50 %	50 %	0 %	187733191
10599	NC_010658	GGC	2	6	517142	517147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733191
10600	NC_010658	ACG	2	6	517153	517158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733191
10601	NC_010658	GAT	2	6	517197	517202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733191
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10603	NC_010658	GCT	2	6	517235	517240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733191
10604	NC_010658	ATG	2	6	517287	517292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733191
10605	NC_010658	GC	3	6	517331	517336	0 %	0 %	50 %	50 %	187733191
10606	NC_010658	TGG	2	6	517348	517353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733191
10607	NC_010658	CAGG	2	8	517359	517366	25 %	0 %	50 %	25 %	187733191
10608	NC_010658	TCG	2	6	517372	517377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733191
10609	NC_010658	ATG	2	6	517402	517407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733191
10610	NC_010658	GGTC	2	8	517484	517491	0 %	25 %	50 %	25 %	187733191
10611	NC_010658	TGA	2	6	517492	517497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733191
10612	NC_010658	GCTGGC	2	12	517523	517534	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	187733191
10613	NC_010658	GCC	2	6	517572	517577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733191
10614	NC_010658	TTGC	2	8	517617	517624	0 %	50 %	25 %	25 %	187733191
10615	NC_010658	ACC	2	6	517641	517646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733191
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10617	NC_010658	CGG	2	6	517660	517665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733191
10618	NC_010658	GC	4	8	517793	517800	0 %	0 %	50 %	50 %	187733191
10619	NC_010658	AAC	2	6	517815	517820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733191
10620	NC_010658	GCC	2	6	517832	517837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733191
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10622	NC_010658	ATG	2	6	517847	517852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733191
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10993	NC_010658	CGCA	2	8	534873	534880	25 %	0 %	25 %	50 %	187730233
10994	NC_010658	AG	3	6	534885	534890	50 %	0 %	50 %	0 %	187730233
10995	NC_010658	CGC	2	6	534900	534905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730233
10996	NC_010658	GAT	2	6	534922	534927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730233
10997	NC_010658	CGC	2	6	534985	534990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730233
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11000	NC_010658	CTG	2	6	535111	535116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730233

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