MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010658	TCT	2	6	23912	23917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731181
502	NC_010658	CTG	2	6	23922	23927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731181
503	NC_010658	TGGC	2	8	23960	23967	0 %	25 %	50 %	25 %	187731181
504	NC_010658	AATCTG	2	12	24042	24053	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187731181
505	NC_010658	ACA	2	6	24056	24061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731181
506	NC_010658	GT	3	6	24308	24313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
507	NC_010658	TC	3	6	24314	24319	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
508	NC_010658	CAT	2	6	24323	24328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_010658	AGC	2	6	24332	24337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_010658	A	7	7	24344	24350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_010658	TTG	2	6	24405	24410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731624
512	NC_010658	AGC	2	6	24470	24475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731624
513	NC_010658	GCA	2	6	24519	24524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731624
514	NC_010658	TGA	2	6	24562	24567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731624
515	NC_010658	CAT	2	6	24575	24580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731624
516	NC_010658	GC	3	6	24627	24632	0 %	0 %	50 %	50 %	187731624
517	NC_010658	CTT	2	6	24722	24727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_010658	GCA	2	6	24845	24850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730801
519	NC_010658	TTC	2	6	24861	24866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730801
520	NC_010658	CTT	2	6	24898	24903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730801
521	NC_010658	CATA	2	8	25004	25011	50 %	25 %	0 %	25 %	187730272
522	NC_010658	AAG	2	6	25030	25035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730272
523	NC_010658	GT	3	6	25037	25042	0 %	50 %	50 %	0 %	187730272
524	NC_010658	CG	3	6	25083	25088	0 %	0 %	50 %	50 %	187730272
525	NC_010658	GAA	2	6	25107	25112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730272
526	NC_010658	GCGCAA	2	12	25115	25126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730272
527	NC_010658	GGTGAT	2	12	25133	25144	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	187730272
528	NC_010658	TGCG	2	8	25260	25267	0 %	25 %	50 %	25 %	187730272
529	NC_010658	TCA	2	6	25306	25311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730272
530	NC_010658	TCT	2	6	25316	25321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730272
531	NC_010658	GAT	2	6	25359	25364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730272
532	NC_010658	TTA	2	6	25401	25406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730272
533	NC_010658	GCGT	2	8	25468	25475	0 %	25 %	50 %	25 %	187730272
534	NC_010658	AGC	2	6	25479	25484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730272
535	NC_010658	TCTGGC	2	12	25517	25528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730272
536	NC_010658	TGA	2	6	25580	25585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730272
537	NC_010658	CAG	2	6	25746	25751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730272
538	NC_010658	AGT	2	6	25805	25810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730272
539	NC_010658	A	7	7	25818	25824	100 %	0 %	0 %	0 %	187730272
540	NC_010658	AGC	2	6	25834	25839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730272
541	NC_010658	TGA	2	6	25880	25885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730272
542	NC_010658	CCGC	2	8	25891	25898	0 %	0 %	25 %	75 %	187730272
543	NC_010658	T	6	6	25902	25907	0 %	100 %	0 %	0 %	187730272
544	NC_010658	TGA	2	6	25969	25974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730740
545	NC_010658	TGA	3	9	26069	26077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730740
546	NC_010658	CAT	2	6	26087	26092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730740
547	NC_010658	A	6	6	26103	26108	100 %	0 %	0 %	0 %	187730740
548	NC_010658	A	7	7	26112	26118	100 %	0 %	0 %	0 %	187730740
549	NC_010658	ATG	2	6	26131	26136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730740
550	NC_010658	CCT	2	6	26139	26144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187730740
551	NC_010658	GCA	2	6	26155	26160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730740
552	NC_010658	CTGG	2	8	26248	26255	0 %	25 %	50 %	25 %	187730740
553	NC_010658	CCG	3	9	26323	26331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730740
554	NC_010658	CAT	2	6	26462	26467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730740
555	NC_010658	CG	3	6	26469	26474	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
556	NC_010658	ATC	2	6	26484	26489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730740
557	NC_010658	GCGGAA	2	12	26556	26567	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	187730740
558	NC_010658	CTGC	2	8	26709	26716	0 %	25 %	25 %	50 %	187730740
559	NC_010658	TGC	2	6	26878	26883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
560	NC_010658	GAC	2	6	26991	26996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730740
561	NC_010658	TCG	2	6	27115	27120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
562	NC_010658	GCT	2	6	27125	27130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
563	NC_010658	GC	3	6	27142	27147	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
564	NC_010658	TGC	2	6	27148	27153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
565	NC_010658	GCA	2	6	27167	27172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730740
566	NC_010658	TGC	2	6	27183	27188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
567	NC_010658	ATC	2	6	27207	27212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730740
568	NC_010658	CG	3	6	27216	27221	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
569	NC_010658	CGC	2	6	27223	27228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730740
570	NC_010658	TGCG	2	8	27259	27266	0 %	25 %	50 %	25 %	187730740
571	NC_010658	GAA	2	6	27450	27455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730740
572	NC_010658	GTG	2	6	27491	27496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730740
573	NC_010658	TGT	2	6	27599	27604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730740
574	NC_010658	TGGT	2	8	27671	27678	0 %	50 %	50 %	0 %	187730740
575	NC_010658	CGC	2	6	27805	27810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730740
576	NC_010658	TGA	2	6	27817	27822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730740
577	NC_010658	TGC	2	6	27911	27916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
578	NC_010658	TCG	2	6	27926	27931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
579	NC_010658	CG	3	6	27944	27949	0 %	0 %	50 %	50 %	187730740
580	NC_010658	CTG	2	6	27954	27959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
581	NC_010658	TGG	2	6	28012	28017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730740
582	NC_010658	CAT	2	6	28157	28162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730740
583	NC_010658	CGT	2	6	28203	28208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
584	NC_010658	TGA	2	6	28283	28288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730740
585	NC_010658	AGCGA	2	10	28371	28380	40 %	0 %	40 %	20 %	187730740
586	NC_010658	GTGG	2	8	28464	28471	0 %	25 %	75 %	0 %	187730740
587	NC_010658	GGC	2	6	28514	28519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730740
588	NC_010658	ACG	2	6	28591	28596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730740
589	NC_010658	CTG	2	6	28600	28605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
590	NC_010658	CAG	2	6	28611	28616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730740
591	NC_010658	GCT	2	6	28678	28683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730740
592	NC_010658	CGGTGA	2	12	28757	28768	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187730740
593	NC_010658	TGA	2	6	28785	28790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730740
594	NC_010658	GCTG	2	8	28818	28825	0 %	25 %	50 %	25 %	187733568
595	NC_010658	TGG	2	6	28830	28835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733568
596	NC_010658	GCA	2	6	28860	28865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733568
597	NC_010658	TCC	2	6	28875	28880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187733568
598	NC_010658	GCG	2	6	28952	28957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733568
599	NC_010658	GCG	2	6	28977	28982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733568
600	NC_010658	TGA	2	6	29040	29045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733568
601	NC_010658	ATT	2	6	29096	29101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733568
602	NC_010658	GGC	2	6	29102	29107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733568
603	NC_010658	GC	3	6	29106	29111	0 %	0 %	50 %	50 %	187733568
604	NC_010658	T	6	6	29251	29256	0 %	100 %	0 %	0 %	187733568
605	NC_010658	A	6	6	29270	29275	100 %	0 %	0 %	0 %	187733568
606	NC_010658	AAT	2	6	29277	29282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733568
607	NC_010658	CGC	2	6	29307	29312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_010658	CGA	2	6	29406	29411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730844
609	NC_010658	CAC	2	6	29415	29420	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730844
610	NC_010658	CAA	2	6	29436	29441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730844
611	NC_010658	ACC	2	6	29530	29535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730844
612	NC_010658	GCG	2	6	29554	29559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730844
613	NC_010658	CCG	2	6	29598	29603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730844
614	NC_010658	ATGG	2	8	29659	29666	25 %	25 %	50 %	0 %	187730844
615	NC_010658	TTG	2	6	29862	29867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731568
616	NC_010658	AT	3	6	29897	29902	50 %	50 %	0 %	0 %	187731568
617	NC_010658	GAA	2	6	30140	30145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731568
618	NC_010658	CAGTA	2	10	30197	30206	40 %	20 %	20 %	20 %	187731568
619	NC_010658	TG	3	6	30247	30252	0 %	50 %	50 %	0 %	187731568
620	NC_010658	TGG	2	6	30453	30458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731568
621	NC_010658	CTC	2	6	30472	30477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	187731568
622	NC_010658	CG	3	6	30521	30526	0 %	0 %	50 %	50 %	187731568
623	NC_010658	TTGA	2	8	30530	30537	25 %	50 %	25 %	0 %	187731568
624	NC_010658	TGG	2	6	30633	30638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731568
625	NC_010658	GCA	2	6	30646	30651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731568
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627	NC_010658	GAA	2	6	30689	30694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731568
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