MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

< Previous12...176177178179180181182183184185186187188Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93501	NC_010658	CAC	2	6	4607824	4607829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730734
93502	NC_010658	CGG	2	6	4607900	4607905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730734
93503	NC_010658	GC	3	6	4607933	4607938	0 %	0 %	50 %	50 %	187730734
93504	NC_010658	TTC	2	6	4608007	4608012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730734
93505	NC_010658	TGG	2	6	4608063	4608068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730734
93506	NC_010658	CAG	2	6	4608120	4608125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93507	NC_010658	A	7	7	4608133	4608139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93508	NC_010658	CGG	2	6	4608326	4608331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732378
93509	NC_010658	ATC	2	6	4608334	4608339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732378
93510	NC_010658	CAT	2	6	4608360	4608365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732378
93511	NC_010658	A	6	6	4608407	4608412	100 %	0 %	0 %	0 %	187732378
93512	NC_010658	GAA	3	9	4608433	4608441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732378
93513	NC_010658	GCT	2	6	4608576	4608581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732378
93514	NC_010658	GC	3	6	4608646	4608651	0 %	0 %	50 %	50 %	187732378
93515	NC_010658	CG	3	6	4608680	4608685	0 %	0 %	50 %	50 %	187732378
93516	NC_010658	TGGC	2	8	4608706	4608713	0 %	25 %	50 %	25 %	187732378
93517	NC_010658	CTGG	2	8	4608716	4608723	0 %	25 %	50 %	25 %	187732378
93518	NC_010658	CGG	2	6	4608790	4608795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732808
93519	NC_010658	CAG	2	6	4608804	4608809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732808
93520	NC_010658	TCT	2	6	4608850	4608855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732808
93521	NC_010658	GTA	2	6	4608861	4608866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732808
93522	NC_010658	CGC	2	6	4608989	4608994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732808
93523	NC_010658	GCA	2	6	4608998	4609003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732808
93524	NC_010658	GGT	2	6	4609056	4609061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732808
93525	NC_010658	TCG	2	6	4609078	4609083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732808
93526	NC_010658	TTCA	2	8	4609107	4609114	25 %	50 %	0 %	25 %	187732808
93527	NC_010658	GCG	2	6	4609244	4609249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732808
93528	NC_010658	GCG	2	6	4609304	4609309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732808
93529	NC_010658	CGG	2	6	4609342	4609347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187732808
93530	NC_010658	CTT	2	6	4609374	4609379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187732808
93531	NC_010658	CCG	2	6	4609466	4609471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732808
93532	NC_010658	ACG	2	6	4609482	4609487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732808
93533	NC_010658	CGC	2	6	4609569	4609574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732808
93534	NC_010658	CCAG	2	8	4609613	4609620	25 %	0 %	25 %	50 %	187732808
93535	NC_010658	AAT	2	6	4609635	4609640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732808
93536	NC_010658	CAA	2	6	4609674	4609679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93537	NC_010658	ATA	2	6	4609705	4609710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93538	NC_010658	T	6	6	4609714	4609719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93539	NC_010658	T	7	7	4609739	4609745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93540	NC_010658	TAG	2	6	4609748	4609753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93541	NC_010658	AGA	2	6	4609928	4609933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731952
93542	NC_010658	TTG	2	6	4609984	4609989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731952
93543	NC_010658	GGT	2	6	4610052	4610057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731952
93544	NC_010658	GTA	2	6	4610172	4610177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731952
93545	NC_010658	A	6	6	4610181	4610186	100 %	0 %	0 %	0 %	187731952
93546	NC_010658	CGCT	2	8	4610248	4610255	0 %	25 %	25 %	50 %	187731952
93547	NC_010658	GGC	2	6	4610329	4610334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731952
93548	NC_010658	GCA	2	6	4610420	4610425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731475
93549	NC_010658	GAC	2	6	4610646	4610651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731475
93550	NC_010658	GAA	2	6	4610717	4610722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731475
93551	NC_010658	TCG	2	6	4610727	4610732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731475
93552	NC_010658	TGAAT	2	10	4610762	4610771	40 %	40 %	20 %	0 %	187731475
93553	NC_010658	TGC	2	6	4611060	4611065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730397
93554	NC_010658	T	6	6	4611073	4611078	0 %	100 %	0 %	0 %	187730397
93555	NC_010658	TGG	2	6	4611081	4611086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730397
93556	NC_010658	GGC	2	6	4611091	4611096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730397
93557	NC_010658	AAG	2	6	4611123	4611128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187730397
93558	NC_010658	CT	3	6	4611212	4611217	0 %	50 %	0 %	50 %	187730397
93559	NC_010658	ACA	2	6	4611262	4611267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730397
93560	NC_010658	ATT	2	6	4611387	4611392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730397
93561	NC_010658	GC	3	6	4611437	4611442	0 %	0 %	50 %	50 %	187730397
93562	NC_010658	ATGT	2	8	4611482	4611489	25 %	50 %	25 %	0 %	187730397
93563	NC_010658	AGCG	2	8	4611578	4611585	25 %	0 %	50 %	25 %	187730397
93564	NC_010658	TGG	2	6	4611650	4611655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730397
93565	NC_010658	GGC	2	6	4611853	4611858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730397
93566	NC_010658	GCG	2	6	4611869	4611874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730397
93567	NC_010658	GTG	2	6	4611905	4611910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730397
93568	NC_010658	ACA	2	6	4611924	4611929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187730397
93569	NC_010658	TAC	2	6	4611972	4611977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730397
93570	NC_010658	TGT	2	6	4612018	4612023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730397
93571	NC_010658	GGC	2	6	4612030	4612035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187730397
93572	NC_010658	ATT	2	6	4612036	4612041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187730397
93573	NC_010658	CGC	2	6	4612043	4612048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730397
93574	NC_010658	A	7	7	4612080	4612086	100 %	0 %	0 %	0 %	187730397
93575	NC_010658	TGC	2	6	4612123	4612128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730397
93576	NC_010658	A	6	6	4612335	4612340	100 %	0 %	0 %	0 %	187730397
93577	NC_010658	GTTT	2	8	4612380	4612387	0 %	75 %	25 %	0 %	187730397
93578	NC_010658	TTC	2	6	4612473	4612478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93579	NC_010658	CTG	2	6	4612497	4612502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93580	NC_010658	C	6	6	4612533	4612538	0 %	0 %	0 %	100 %	187732050
93581	NC_010658	ACC	2	6	4612553	4612558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187732050
93582	NC_010658	TGT	2	6	4612578	4612583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732050
93583	NC_010658	GAA	2	6	4612823	4612828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732050
93584	NC_010658	ATC	2	6	4612928	4612933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732050
93585	NC_010658	TGGTG	2	10	4612981	4612990	0 %	40 %	60 %	0 %	187732050
93586	NC_010658	AACGG	2	10	4613006	4613015	40 %	0 %	40 %	20 %	187732050
93587	NC_010658	TGCC	2	8	4613157	4613164	0 %	25 %	25 %	50 %	187732050
93588	NC_010658	T	6	6	4613212	4613217	0 %	100 %	0 %	0 %	187732050
93589	NC_010658	AGC	2	6	4613279	4613284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732050
93590	NC_010658	TAA	2	6	4613293	4613298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732050
93591	NC_010658	GAC	2	6	4613368	4613373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732050
93592	NC_010658	CTG	2	6	4613423	4613428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732050
93593	NC_010658	TGG	2	6	4613505	4613510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732050
93594	NC_010658	TGT	2	6	4613658	4613663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732050
93595	NC_010658	TGT	2	6	4613676	4613681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732050
93596	NC_010658	GC	3	6	4613724	4613729	0 %	0 %	50 %	50 %	187732050
93597	NC_010658	TGT	2	6	4613730	4613735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732050
93598	NC_010658	TGG	3	9	4613751	4613759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732050
93599	NC_010658	ATG	2	6	4613771	4613776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732050
93600	NC_010658	AAG	2	6	4613835	4613840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732050
93601	NC_010658	T	8	8	4613910	4613917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93602	NC_010658	GGT	2	6	4613921	4613926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93603	NC_010658	CAC	2	6	4613949	4613954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733961
93604	NC_010658	TGG	2	6	4613979	4613984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733961
93605	NC_010658	GAT	2	6	4613986	4613991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733961
93606	NC_010658	CGG	2	6	4614032	4614037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733961
93607	NC_010658	CAG	2	6	4614094	4614099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733961
93608	NC_010658	AACG	2	8	4614200	4614207	50 %	0 %	25 %	25 %	187733961
93609	NC_010658	ACG	2	6	4614256	4614261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733961
93610	NC_010658	TTC	2	6	4614262	4614267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733961
93611	NC_010658	CAG	2	6	4614298	4614303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733961
93612	NC_010658	AGA	2	6	4614461	4614466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733961
93613	NC_010658	AG	3	6	4614520	4614525	50 %	0 %	50 %	0 %	187733961
93614	NC_010658	CAT	2	6	4614564	4614569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733961
93615	NC_010658	CCTG	2	8	4614706	4614713	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93616	NC_010658	ATGC	2	8	4614714	4614721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93617	NC_010658	CAA	2	6	4614794	4614799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733066
93618	NC_010658	CAT	2	6	4614800	4614805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733066
93619	NC_010658	AT	3	6	4614934	4614939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93620	NC_010658	TGA	2	6	4614968	4614973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93621	NC_010658	ATC	2	6	4614975	4614980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93622	NC_010658	ATT	2	6	4615006	4615011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93623	NC_010658	TAA	2	6	4615013	4615018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93624	NC_010658	CAT	2	6	4615031	4615036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93625	NC_010658	TAA	2	6	4615042	4615047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93626	NC_010658	GTG	2	6	4615050	4615055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93627	NC_010658	ATTT	2	8	4615071	4615078	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93628	NC_010658	T	6	6	4615076	4615081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93629	NC_010658	T	6	6	4615119	4615124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93630	NC_010658	T	6	6	4615165	4615170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93631	NC_010658	TAA	2	6	4615230	4615235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93632	NC_010658	AAG	2	6	4615272	4615277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93633	NC_010658	ATT	2	6	4615299	4615304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733363
93634	NC_010658	GCG	2	6	4615341	4615346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733363
93635	NC_010658	AGCC	2	8	4615408	4615415	25 %	0 %	25 %	50 %	187733363
93636	NC_010658	ATT	2	6	4615446	4615451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733363
93637	NC_010658	ATA	2	6	4615453	4615458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733363
93638	NC_010658	CCA	2	6	4615513	4615518	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733363
93639	NC_010658	GC	3	6	4615521	4615526	0 %	0 %	50 %	50 %	187733363
93640	NC_010658	TAC	2	6	4615545	4615550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733363
93641	NC_010658	TGC	2	6	4615570	4615575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733363
93642	NC_010658	TGG	2	6	4615690	4615695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733363
93643	NC_010658	ACA	2	6	4615763	4615768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733363
93644	NC_010658	CGA	2	6	4615771	4615776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733363
93645	NC_010658	GAC	2	6	4615841	4615846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733363
93646	NC_010658	TGGCAG	2	12	4615849	4615860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	187733363
93647	NC_010658	ACA	2	6	4615886	4615891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733363
93648	NC_010658	TGC	2	6	4615939	4615944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733363
93649	NC_010658	A	7	7	4615954	4615960	100 %	0 %	0 %	0 %	187733363
93650	NC_010658	A	6	6	4615972	4615977	100 %	0 %	0 %	0 %	187733363
93651	NC_010658	AGTA	2	8	4615984	4615991	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...176177178179180181182183184185186187188Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.