MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010658	CGC	2	6	321173	321178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731876
6502	NC_010658	AAG	2	6	321217	321222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731876
6503	NC_010658	A	6	6	321223	321228	100 %	0 %	0 %	0 %	187731876
6504	NC_010658	GC	3	6	321270	321275	0 %	0 %	50 %	50 %	187731876
6505	NC_010658	GC	3	6	321299	321304	0 %	0 %	50 %	50 %	187731876
6506	NC_010658	CGT	2	6	321341	321346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731876
6507	NC_010658	CGC	2	6	321370	321375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731876
6508	NC_010658	GCTG	2	8	321376	321383	0 %	25 %	50 %	25 %	187731876
6509	NC_010658	GGC	2	6	321429	321434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731876
6510	NC_010658	ACC	2	6	321540	321545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731876
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6512	NC_010658	TGA	2	6	321602	321607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731876
6513	NC_010658	TAG	2	6	321650	321655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731876
6514	NC_010658	GCA	2	6	321661	321666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731876
6515	NC_010658	TGCG	2	8	321673	321680	0 %	25 %	50 %	25 %	187731876
6516	NC_010658	GCA	2	6	321725	321730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731876
6517	NC_010658	GGT	2	6	321782	321787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731876
6518	NC_010658	GTT	2	6	321813	321818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731876
6519	NC_010658	CCAG	2	8	322036	322043	25 %	0 %	25 %	50 %	187731876
6520	NC_010658	CAAC	2	8	322052	322059	50 %	0 %	0 %	50 %	187731876
6521	NC_010658	TGG	2	6	322088	322093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731876
6522	NC_010658	CAT	2	6	322097	322102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731876
6523	NC_010658	ACA	2	6	322120	322125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731876
6524	NC_010658	AAGA	2	8	322173	322180	75 %	0 %	25 %	0 %	187731876
6525	NC_010658	CAA	2	6	322277	322282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731876
6526	NC_010658	CGAA	2	8	322285	322292	50 %	0 %	25 %	25 %	187731876
6527	NC_010658	CTG	3	9	322308	322316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731876
6528	NC_010658	TTG	2	6	322348	322353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731876
6529	NC_010658	CTTGC	2	10	322411	322420	0 %	40 %	20 %	40 %	187731876
6530	NC_010658	CTG	2	6	322425	322430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731876
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6533	NC_010658	TCG	2	6	322513	322518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731876
6534	NC_010658	AACG	2	8	322617	322624	50 %	0 %	25 %	25 %	187731876
6535	NC_010658	AGA	2	6	322631	322636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731876
6536	NC_010658	TGA	2	6	322670	322675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731876
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6539	NC_010658	TAC	2	6	322784	322789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731876
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6541	NC_010658	AAG	2	6	322875	322880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731876
6542	NC_010658	GAG	2	6	322891	322896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731876
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6544	NC_010658	ACT	2	6	322970	322975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730856
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6568	NC_010658	T	8	8	323919	323926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6589	NC_010658	CGC	2	6	325227	325232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733609
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6604	NC_010658	AGGT	2	8	326012	326019	25 %	25 %	50 %	0 %	187733170
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6607	NC_010658	T	7	7	326178	326184	0 %	100 %	0 %	0 %	187733170
6608	NC_010658	TAT	2	6	326271	326276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_010658	GTTTC	2	10	326301	326310	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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6616	NC_010658	CACTT	2	10	326948	326957	20 %	40 %	0 %	40 %	187732956
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6988	NC_010658	CAT	2	6	344454	344459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734130
6989	NC_010658	GCA	2	6	344480	344485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734130
6990	NC_010658	GAT	2	6	344502	344507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734130
6991	NC_010658	AGGT	2	8	344560	344567	25 %	25 %	50 %	0 %	187734130
6992	NC_010658	AAGT	2	8	344578	344585	50 %	25 %	25 %	0 %	187734130
6993	NC_010658	AAT	2	6	344616	344621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734130
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6995	NC_010658	CTGG	2	8	344780	344787	0 %	25 %	50 %	25 %	187733485
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7000	NC_010658	TCG	2	6	345289	345294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733485

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