MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_010658	T	6	6	298452	298457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_010658	CGC	2	6	298519	298524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6003	NC_010658	AAC	2	6	298596	298601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731295
6004	NC_010658	TCG	2	6	298694	298699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731295
6005	NC_010658	CGG	2	6	298736	298741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731295
6006	NC_010658	GGC	3	9	298783	298791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731295
6007	NC_010658	ATT	2	6	298792	298797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187731295
6008	NC_010658	TG	3	6	298850	298855	0 %	50 %	50 %	0 %	187731295
6009	NC_010658	GAA	2	6	298897	298902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731295
6010	NC_010658	GAA	2	6	298939	298944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731295
6011	NC_010658	GAA	2	6	298960	298965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187731295
6012	NC_010658	ATC	2	6	298999	299004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731295
6013	NC_010658	CAA	2	6	299009	299014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731295
6014	NC_010658	CCAG	2	8	299021	299028	25 %	0 %	25 %	50 %	187731295
6015	NC_010658	TTG	2	6	299070	299075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731295
6016	NC_010658	GAA	2	6	299118	299123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_010658	AT	3	6	299158	299163	50 %	50 %	0 %	0 %	187731807
6018	NC_010658	ATC	2	6	299223	299228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731807
6019	NC_010658	GATG	2	8	299275	299282	25 %	25 %	50 %	0 %	187731807
6020	NC_010658	A	6	6	299285	299290	100 %	0 %	0 %	0 %	187731807
6021	NC_010658	TAA	2	6	299397	299402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_010658	AACAAT	2	12	299414	299425	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6023	NC_010658	CTG	2	6	299471	299476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_010658	AAGT	2	8	299502	299509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_010658	CAG	2	6	299512	299517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_010658	ACG	2	6	299545	299550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_010658	CGT	2	6	299582	299587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732256
6028	NC_010658	AGG	2	6	299621	299626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187732256
6029	NC_010658	ATA	2	6	299660	299665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187732256
6030	NC_010658	CAT	2	6	299671	299676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732256
6031	NC_010658	CTG	2	6	299680	299685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732256
6032	NC_010658	GAA	2	6	299701	299706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187732256
6033	NC_010658	ATT	2	6	299754	299759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732256
6034	NC_010658	CGT	2	6	299788	299793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732256
6035	NC_010658	TTA	2	6	299857	299862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187732256
6036	NC_010658	TAG	2	6	299880	299885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187732256
6037	NC_010658	TCTT	2	8	299906	299913	0 %	75 %	0 %	25 %	187732256
6038	NC_010658	TTG	2	6	299951	299956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187732256
6039	NC_010658	ATC	2	6	299960	299965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732256
6040	NC_010658	GAG	2	6	299989	299994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187732256
6041	NC_010658	TGC	2	6	299996	300001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732256
6042	NC_010658	A	6	6	300080	300085	100 %	0 %	0 %	0 %	187732256
6043	NC_010658	TCA	2	6	300128	300133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732256
6044	NC_010658	ATTG	2	8	300216	300223	25 %	50 %	25 %	0 %	187732256
6045	NC_010658	GGCT	2	8	300227	300234	0 %	25 %	50 %	25 %	187732256
6046	NC_010658	CAGC	2	8	300263	300270	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6047	NC_010658	AATC	2	8	300361	300368	50 %	25 %	0 %	25 %	187733270
6048	NC_010658	CAG	3	9	300377	300385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733270
6049	NC_010658	GC	3	6	300472	300477	0 %	0 %	50 %	50 %	187733270
6050	NC_010658	CGAC	2	8	300499	300506	25 %	0 %	25 %	50 %	187733270
6051	NC_010658	CT	3	6	300654	300659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6052	NC_010658	ATA	3	9	300667	300675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_010658	TGC	2	6	300683	300688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_010658	T	6	6	300691	300696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_010658	AT	3	6	300706	300711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_010658	TCA	2	6	300719	300724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_010658	TTG	2	6	300760	300765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_010658	ATAA	2	8	300787	300794	75 %	25 %	0 %	0 %	187733700
6059	NC_010658	GAT	2	6	300795	300800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733700
6060	NC_010658	TGG	2	6	300804	300809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733700
6061	NC_010658	TGC	2	6	300817	300822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733700
6062	NC_010658	ACGCA	2	10	300857	300866	40 %	0 %	20 %	40 %	187733700
6063	NC_010658	CGT	2	6	300877	300882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733700
6064	NC_010658	GCTA	2	8	300917	300924	25 %	25 %	25 %	25 %	187734168
6065	NC_010658	AAT	2	6	300927	300932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734168
6066	NC_010658	ACG	2	6	300957	300962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734168
6067	NC_010658	CAT	2	6	300979	300984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734168
6068	NC_010658	AAC	2	6	301000	301005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734168
6069	NC_010658	ATA	2	6	301134	301139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_010658	TGC	2	6	301141	301146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_010658	ATT	2	6	301154	301159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6072	NC_010658	CCG	2	6	301162	301167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6073	NC_010658	AAT	2	6	301173	301178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6074	NC_010658	TCA	2	6	301320	301325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730361
6075	NC_010658	TCG	2	6	301394	301399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730361
6076	NC_010658	TCG	2	6	301427	301432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730361
6077	NC_010658	GCT	2	6	301452	301457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730361
6078	NC_010658	CAC	2	6	301480	301485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730361
6079	NC_010658	CG	3	6	301540	301545	0 %	0 %	50 %	50 %	187730361
6080	NC_010658	CGC	2	6	301551	301556	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187730361
6081	NC_010658	TCA	2	6	301586	301591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730361
6082	NC_010658	AGC	2	6	301592	301597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730361
6083	NC_010658	GCA	2	6	301704	301709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730361
6084	NC_010658	T	6	6	301729	301734	0 %	100 %	0 %	0 %	187730361
6085	NC_010658	CCA	2	6	301749	301754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187730361
6086	NC_010658	CAT	2	6	301783	301788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730361
6087	NC_010658	AG	3	6	301823	301828	50 %	0 %	50 %	0 %	187730361
6088	NC_010658	GCA	2	6	301830	301835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730361
6089	NC_010658	TTC	2	6	301865	301870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730361
6090	NC_010658	T	6	6	301947	301952	0 %	100 %	0 %	0 %	187730361
6091	NC_010658	CTT	2	6	301953	301958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730361
6092	NC_010658	GC	4	8	301960	301967	0 %	0 %	50 %	50 %	187730361
6093	NC_010658	GGA	2	6	302024	302029	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730361
6094	NC_010658	TCT	2	6	302102	302107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187730361
6095	NC_010658	TTG	2	6	302183	302188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6096	NC_010658	CGG	2	6	302219	302224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6097	NC_010658	TATTGA	2	12	302260	302271	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_010658	A	7	7	302271	302277	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_010658	GGC	2	6	302312	302317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731576
6100	NC_010658	CGC	2	6	302382	302387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731576
6101	NC_010658	TGA	2	6	302389	302394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731576
6102	NC_010658	GTTG	2	8	302425	302432	0 %	50 %	50 %	0 %	187731576
6103	NC_010658	GGTA	2	8	302467	302474	25 %	25 %	50 %	0 %	187731576
6104	NC_010658	GTG	2	6	302510	302515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731576
6105	NC_010658	GCG	2	6	302691	302696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731576
6106	NC_010658	GGGC	2	8	302714	302721	0 %	0 %	75 %	25 %	187731576
6107	NC_010658	TGGA	2	8	302774	302781	25 %	25 %	50 %	0 %	187731576
6108	NC_010658	TCG	2	6	302881	302886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731576
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6110	NC_010658	CAT	2	6	303107	303112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731463
6111	NC_010658	CGT	2	6	303132	303137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731463
6112	NC_010658	GTA	2	6	303194	303199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731463
6113	NC_010658	GCG	2	6	303225	303230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731463
6114	NC_010658	AAC	2	6	303243	303248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731463
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6116	NC_010658	AGC	2	6	303341	303346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731463
6117	NC_010658	GAG	2	6	303389	303394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187731463
6118	NC_010658	TGA	2	6	303511	303516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731463
6119	NC_010658	TAC	2	6	303539	303544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731463
6120	NC_010658	ACG	3	9	303567	303575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187731463
6121	NC_010658	CTG	2	6	303604	303609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731463
6122	NC_010658	CTT	2	6	303659	303664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187731463
6123	NC_010658	AGCGA	2	10	303672	303681	40 %	0 %	40 %	20 %	187731463
6124	NC_010658	CCG	2	6	303721	303726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731463
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6127	NC_010658	ATG	2	6	303927	303932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187731463
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6129	NC_010658	GCTG	2	8	304065	304072	0 %	25 %	50 %	25 %	187731463
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6134	NC_010658	TCG	2	6	304137	304142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731463
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6136	NC_010658	CCA	2	6	304387	304392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6138	NC_010658	GAC	2	6	304422	304427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6139	NC_010658	CTGG	2	8	304451	304458	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6140	NC_010658	G	6	6	304495	304500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6141	NC_010658	CGG	2	6	304560	304565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731565
6142	NC_010658	GCG	2	6	304610	304615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731565
6143	NC_010658	A	6	6	304649	304654	100 %	0 %	0 %	0 %	187731565
6144	NC_010658	CAT	2	6	304670	304675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6146	NC_010658	CCG	2	6	304825	304830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732035
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6151	NC_010658	CAT	2	6	304937	304942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732035
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6180	NC_010658	T	6	6	305969	305974	0 %	100 %	0 %	0 %	187732035
6181	NC_010658	CAT	2	6	305980	305985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732035
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6494	NC_010658	CAG	2	6	320808	320813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733401
6495	NC_010658	TGA	2	6	320861	320866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733401
6496	NC_010658	TGGT	2	8	320887	320894	0 %	50 %	50 %	0 %	187733401
6497	NC_010658	AGT	2	6	320954	320959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733401
6498	NC_010658	GTG	2	6	321087	321092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731876
6499	NC_010658	CTG	2	6	321105	321110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187731876
6500	NC_010658	GC	3	6	321162	321167	0 %	0 %	50 %	50 %	187731876

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