MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010658	ATT	2	6	273510	273515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	187733995
5502	NC_010658	AAC	2	6	273620	273625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733995
5503	NC_010658	TCA	2	6	273639	273644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733995
5504	NC_010658	CCA	2	6	273749	273754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733995
5505	NC_010658	GGGT	2	8	273767	273774	0 %	25 %	75 %	0 %	187733995
5506	NC_010658	A	6	6	273801	273806	100 %	0 %	0 %	0 %	187733995
5507	NC_010658	ATAA	2	8	273819	273826	75 %	25 %	0 %	0 %	187733995
5508	NC_010658	TAA	2	6	273843	273848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_010658	TACA	2	8	273849	273856	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5510	NC_010658	GCG	2	6	273866	273871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_010658	CAA	2	6	273882	273887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_010658	ACACC	2	10	273965	273974	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
5513	NC_010658	GGT	2	6	273984	273989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_010658	CAAC	2	8	274040	274047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_010658	TAAA	2	8	274082	274089	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_010658	CGC	2	6	274135	274140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_010658	CTC	2	6	274152	274157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_010658	ATA	2	6	274327	274332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_010658	GCC	2	6	274341	274346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_010658	GCT	2	6	274352	274357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_010658	ATC	2	6	274378	274383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_010658	CG	3	6	274398	274403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_010658	A	7	7	274493	274499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5524	NC_010658	TCA	2	6	274530	274535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_010658	CAC	2	6	274539	274544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_010658	T	7	7	274556	274562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_010658	CAA	2	6	274572	274577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_010658	CGT	2	6	274638	274643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5529	NC_010658	CTTT	2	8	274749	274756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5530	NC_010658	CGT	2	6	274952	274957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733115
5531	NC_010658	T	7	7	274972	274978	0 %	100 %	0 %	0 %	187733115
5532	NC_010658	GCA	2	6	274982	274987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733115
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5534	NC_010658	GGCA	2	8	275091	275098	25 %	0 %	50 %	25 %	187733115
5535	NC_010658	GAT	2	6	275124	275129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733115
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5537	NC_010658	TA	3	6	275157	275162	50 %	50 %	0 %	0 %	187733115
5538	NC_010658	ATG	2	6	275201	275206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733115
5539	NC_010658	ATCAT	2	10	275222	275231	40 %	40 %	0 %	20 %	187733115
5540	NC_010658	TGG	2	6	275279	275284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733115
5541	NC_010658	TTC	2	6	275314	275319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733115
5542	NC_010658	CGAT	2	8	275324	275331	25 %	25 %	25 %	25 %	187733115
5543	NC_010658	TCA	2	6	275361	275366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733115
5544	NC_010658	CTG	2	6	275370	275375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733115
5545	NC_010658	CTTT	2	8	275467	275474	0 %	75 %	0 %	25 %	187733115
5546	NC_010658	GAA	2	6	275483	275488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187733115
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5548	NC_010658	TATT	2	8	275535	275542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_010658	TAC	2	6	275544	275549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5550	NC_010658	TAA	2	6	275622	275627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_010658	AT	3	6	275687	275692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_010658	GTAT	2	8	275711	275718	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_010658	AATT	2	8	275765	275772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_010658	A	6	6	275779	275784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_010658	TA	3	6	275809	275814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_010658	AT	3	6	275859	275864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_010658	TAT	2	6	275886	275891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_010658	TATTGA	2	12	275895	275906	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_010658	TAA	2	6	275921	275926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_010658	GTT	2	6	275940	275945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_010658	GTA	2	6	275967	275972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_010658	T	7	7	276026	276032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_010658	ATC	2	6	276045	276050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_010658	AATG	2	8	276075	276082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_010658	AC	3	6	276152	276157	50 %	0 %	0 %	50 %	187733683
5566	NC_010658	ACA	2	6	276257	276262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733683
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5568	NC_010658	CCAA	2	8	276392	276399	50 %	0 %	0 %	50 %	187733683
5569	NC_010658	TCT	2	6	276416	276421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733683
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5581	NC_010658	GACCG	2	10	276978	276987	20 %	0 %	40 %	40 %	187733683
5582	NC_010658	ATC	2	6	277000	277005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187733683
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5593	NC_010658	GGT	2	6	277498	277503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187732597
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5627	NC_010658	CGG	2	6	279061	279066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_010658	CT	3	6	279107	279112	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5629	NC_010658	GCT	2	6	279127	279132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5631	NC_010658	GAG	2	6	279197	279202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5633	NC_010658	GGT	2	6	279256	279261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5635	NC_010658	TAC	2	6	279313	279318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5752	NC_010658	AAT	2	6	285125	285130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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