MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella boydii CDC 3083-94 chromosome

Total Repeats: 93651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010658	TGAT	2	8	221214	221221	25 %	50 %	25 %	0 %	187731163
4502	NC_010658	AAC	2	6	221245	221250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187731163
4503	NC_010658	CACC	2	8	221257	221264	25 %	0 %	0 %	75 %	187731163
4504	NC_010658	CGC	2	6	221279	221284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731163
4505	NC_010658	TGT	2	6	221400	221405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187731163
4506	NC_010658	CCA	2	6	221459	221464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187731163
4507	NC_010658	CGC	2	6	221474	221479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187731163
4508	NC_010658	CGTGAT	2	12	221483	221494	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	187731163
4509	NC_010658	TGG	2	6	221497	221502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187731163
4510	NC_010658	GGC	2	6	221535	221540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187731163
4511	NC_010658	TCA	2	6	221599	221604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731163
4512	NC_010658	TCA	2	6	221626	221631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187731163
4513	NC_010658	TGA	2	6	221689	221694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730232
4514	NC_010658	TCA	2	6	221879	221884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730232
4515	NC_010658	GTG	2	6	221993	221998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730232
4516	NC_010658	ATTG	2	8	222038	222045	25 %	50 %	25 %	0 %	187730232
4517	NC_010658	ATG	2	6	222046	222051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187730232
4518	NC_010658	GCTG	2	8	222052	222059	0 %	25 %	50 %	25 %	187730232
4519	NC_010658	ACTGG	2	10	222167	222176	20 %	20 %	40 %	20 %	187730232
4520	NC_010658	CT	3	6	222177	222182	0 %	50 %	0 %	50 %	187730232
4521	NC_010658	TTG	2	6	222183	222188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730232
4522	NC_010658	TGC	2	6	222199	222204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187730232
4523	NC_010658	AACA	2	8	222234	222241	75 %	0 %	0 %	25 %	187730232
4524	NC_010658	GGA	2	6	222243	222248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187730232
4525	NC_010658	TTG	2	6	222295	222300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730232
4526	NC_010658	GCA	2	6	222459	222464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730560
4527	NC_010658	TCA	2	6	222474	222479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187730560
4528	NC_010658	CGTT	2	8	222483	222490	0 %	50 %	25 %	25 %	187730560
4529	NC_010658	CCCATT	2	12	222517	222528	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	187730560
4530	NC_010658	GCA	2	6	222549	222554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187730560
4531	NC_010658	T	6	6	222579	222584	0 %	100 %	0 %	0 %	187730560
4532	NC_010658	T	6	6	222590	222595	0 %	100 %	0 %	0 %	187730560
4533	NC_010658	T	6	6	222617	222622	0 %	100 %	0 %	0 %	187730560
4534	NC_010658	GTT	2	6	222743	222748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187730560
4535	NC_010658	GGT	2	6	222749	222754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187730560
4536	NC_010658	ACC	2	6	222984	222989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734104
4537	NC_010658	GTG	2	6	223053	223058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734104
4538	NC_010658	TGG	2	6	223111	223116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734104
4539	NC_010658	CGCGG	2	10	223212	223221	0 %	0 %	60 %	40 %	187734104
4540	NC_010658	AACG	2	8	223414	223421	50 %	0 %	25 %	25 %	187734104
4541	NC_010658	GGT	2	6	223479	223484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734104
4542	NC_010658	GA	3	6	223513	223518	50 %	0 %	50 %	0 %	187734104
4543	NC_010658	CAG	2	6	223521	223526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734104
4544	NC_010658	CAA	2	6	223527	223532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734104
4545	NC_010658	CAA	2	6	223540	223545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734104
4546	NC_010658	AAGT	2	8	223568	223575	50 %	25 %	25 %	0 %	187734104
4547	NC_010658	GTT	2	6	223581	223586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734104
4548	NC_010658	TGG	2	6	223633	223638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187734104
4549	NC_010658	AGA	2	6	223639	223644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	187734104
4550	NC_010658	GCA	2	6	223717	223722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_010658	CCTG	2	8	223833	223840	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_010658	G	6	6	223848	223853	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_010658	CCGT	2	8	223868	223875	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4554	NC_010658	T	8	8	223935	223942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_010658	TTC	2	6	223961	223966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4556	NC_010658	TGC	2	6	224027	224032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733505
4557	NC_010658	ATG	2	6	224052	224057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733505
4558	NC_010658	TTCCAT	2	12	224082	224093	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	187733505
4559	NC_010658	TCCT	2	8	224100	224107	0 %	50 %	0 %	50 %	187733505
4560	NC_010658	GTG	2	6	224125	224130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	187733505
4561	NC_010658	A	6	6	224328	224333	100 %	0 %	0 %	0 %	187733298
4562	NC_010658	GTGAT	2	10	224374	224383	20 %	40 %	40 %	0 %	187733298
4563	NC_010658	GCTG	2	8	224440	224447	0 %	25 %	50 %	25 %	187733298
4564	NC_010658	GGA	2	6	224470	224475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	187733298
4565	NC_010658	TCT	2	6	224525	224530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187733298
4566	NC_010658	CTG	2	6	224535	224540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187733298
4567	NC_010658	TGGC	2	8	224573	224580	0 %	25 %	50 %	25 %	187733298
4568	NC_010658	AATCTG	2	12	224655	224666	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	187733298
4569	NC_010658	ACA	2	6	224669	224674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187733298
4570	NC_010658	AGC	2	6	224795	224800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_010658	CAT	2	6	224960	224965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187732917
4572	NC_010658	CG	3	6	225122	225127	0 %	0 %	50 %	50 %	187732917
4573	NC_010658	TGCC	2	8	225140	225147	0 %	25 %	25 %	50 %	187732917
4574	NC_010658	AG	3	6	225153	225158	50 %	0 %	50 %	0 %	187732917
4575	NC_010658	GCC	2	6	225365	225370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187732917
4576	NC_010658	CTGC	2	8	225426	225433	0 %	25 %	25 %	50 %	187732917
4577	NC_010658	CTG	2	6	225449	225454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732917
4578	NC_010658	CGA	2	6	225497	225502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187732917
4579	NC_010658	CCAT	2	8	225612	225619	25 %	25 %	0 %	50 %	187732917
4580	NC_010658	TGC	2	6	225633	225638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187732917
4581	NC_010658	TAA	2	6	225811	225816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_010658	ATG	2	6	225842	225847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733243
4583	NC_010658	CGC	2	6	225868	225873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187733243
4584	NC_010658	CCA	2	6	225885	225890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733243
4585	NC_010658	GAT	2	6	225905	225910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733243
4586	NC_010658	AGC	2	6	225920	225925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733243
4587	NC_010658	ACC	2	6	225941	225946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187733243
4588	NC_010658	CTGC	2	8	225983	225990	0 %	25 %	25 %	50 %	187733243
4589	NC_010658	TGA	2	6	225996	226001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733243
4590	NC_010658	TGA	2	6	226059	226064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733243
4591	NC_010658	TGA	2	6	226156	226161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187733243
4592	NC_010658	AAT	2	6	226287	226292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187733243
4593	NC_010658	TCG	2	6	226381	226386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734086
4594	NC_010658	TCA	2	6	226407	226412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734086
4595	NC_010658	TTC	2	6	226436	226441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734086
4596	NC_010658	ATCA	2	8	226472	226479	50 %	25 %	0 %	25 %	187734086
4597	NC_010658	TGA	2	6	226560	226565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734086
4598	NC_010658	CGG	2	6	226573	226578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187734086
4599	NC_010658	CCA	2	6	226588	226593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734086
4600	NC_010658	GCTC	2	8	226624	226631	0 %	25 %	25 %	50 %	187734086
4601	NC_010658	CAC	2	6	226754	226759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734086
4602	NC_010658	CAG	2	6	226763	226768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734086
4603	NC_010658	ATC	2	6	226805	226810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734086
4604	NC_010658	TCG	2	6	226887	226892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734086
4605	NC_010658	GCC	2	6	226982	226987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734086
4606	NC_010658	TAG	2	6	227052	227057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734086
4607	NC_010658	TGC	2	6	227083	227088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734086
4608	NC_010658	CG	3	6	227098	227103	0 %	0 %	50 %	50 %	187734086
4609	NC_010658	CCAG	2	8	227110	227117	25 %	0 %	25 %	50 %	187734086
4610	NC_010658	TTG	2	6	227130	227135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	187734086
4611	NC_010658	AAC	2	6	227160	227165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	187734086
4612	NC_010658	TTC	2	6	227193	227198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	187734086
4613	NC_010658	ATC	2	6	227256	227261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	187734086
4614	NC_010658	TGC	2	6	227263	227268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734086
4615	NC_010658	CCA	2	6	227364	227369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734086
4616	NC_010658	AAT	2	6	227387	227392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	187734086
4617	NC_010658	CTG	2	6	227396	227401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	187734086
4618	NC_010658	GCA	2	6	227490	227495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734086
4619	NC_010658	CGC	2	6	227623	227628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	187734086
4620	NC_010658	CCA	2	6	227677	227682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	187734086
4621	NC_010658	GAT	2	6	227720	227725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	187734086
4622	NC_010658	ATCG	2	8	227729	227736	25 %	25 %	25 %	25 %	187734086
4623	NC_010658	CG	3	6	227755	227760	0 %	0 %	50 %	50 %	187734086
4624	NC_010658	CGA	2	6	227799	227804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187734086
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4742	NC_010658	GCT	2	6	234004	234009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4995	NC_010658	GGC	2	6	247135	247140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	187733347
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4997	NC_010658	GCA	2	6	247208	247213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	187733347
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