MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010480	GGTCGA	2	12	3285	3296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170079556
2	NC_010480	ATTGCT	2	12	7257	7268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170079560
3	NC_010480	CCCGCG	2	12	10593	10604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
4	NC_010480	GGTTGA	2	12	11772	11783	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170079562
5	NC_010480	AAGCCC	2	12	14853	14864	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	170079568
6	NC_010480	TGAGCC	2	12	15256	15267	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170079568
7	NC_010480	AGAGCA	2	12	18609	18620	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	170079570
8	NC_010480	GGTGAT	2	12	20182	20193	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	170079572
9	NC_010480	AGTTTT	2	12	20835	20846	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170079573
10	NC_010480	CGGTGG	2	12	22130	22141	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	170079575
11	NC_010480	CCTAGG	2	12	25927	25938	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170079578
12	NC_010480	AATCAA	2	12	33921	33932	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	170079588
13	NC_010480	GGACGA	2	12	46445	46456	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	170079597
14	NC_010480	TCTGTG	2	12	47035	47046	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	170079599
15	NC_010480	ATTGCC	2	12	49274	49285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170079601
16	NC_010480	TCCCAT	2	12	49587	49598	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	170079601
17	NC_010480	CGCTGC	2	12	62260	62271	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170079607
18	NC_010480	GGCCCT	2	12	65942	65953	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170079610
19	NC_010480	CGATAG	2	12	66764	66775	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	170079611
20	NC_010480	CTTGAT	2	12	69861	69872	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170079615
21	NC_010480	GAAGAG	2	12	81549	81560	50 %	0 %	50 %	0 %	170079625
22	NC_010480	GGCTCA	2	12	81808	81819	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170079625
23	NC_010480	AAGAAA	2	12	85665	85676	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	170079626
24	NC_010480	AGAGAA	2	12	85834	85845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079626
25	NC_010480	GAAAAT	2	12	86578	86589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	170079627
26	NC_010480	GGCTGT	2	12	95769	95780	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170079639
27	NC_010480	GTTTCG	2	12	98286	98297	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	170079639
28	NC_010480	AGTGGC	2	12	99713	99724	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	170079639
29	NC_010480	TCTCTA	2	12	103533	103544	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	170079642
30	NC_010480	CCGTTT	2	12	105141	105152	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	170079642
31	NC_010480	CCTGAT	2	12	113240	113251	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170079650
32	NC_010480	ATCTCA	2	12	116127	116138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079653
33	NC_010480	GATTTT	2	12	117684	117695	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	170079656
34	NC_010480	GTCCTT	2	12	117755	117766	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	170079656
35	NC_010480	TGCCTT	2	12	117902	117913	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	170079656
36	NC_010480	CTTGGG	2	12	119993	120004	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170079656
37	NC_010480	TTGAGT	2	12	120138	120149	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	170079656
38	NC_010480	ATCTTG	2	12	120990	121001	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170079656
39	NC_010480	CCATCT	2	12	123772	123783	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	170079661

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.