MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 1526

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010480	CCG	2	6	53	58	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079554
2	NC_010480	GCA	2	6	117	122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079554
3	NC_010480	CGC	2	6	168	173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079554
4	NC_010480	ATG	2	6	227	232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079554
5	NC_010480	TTG	2	6	239	244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079554
6	NC_010480	AGT	4	12	337	348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079554
7	NC_010480	GTG	2	6	386	391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079554
8	NC_010480	TTA	2	6	442	447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079554
9	NC_010480	CAG	2	6	457	462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079554
10	NC_010480	AGC	2	6	582	587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079554
11	NC_010480	CAA	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079554
12	NC_010480	ATT	2	6	654	659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079555
13	NC_010480	CGC	2	6	766	771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079555
14	NC_010480	GAT	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079555
15	NC_010480	CAG	2	6	929	934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079555
16	NC_010480	GAA	2	6	989	994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079555
17	NC_010480	AGG	2	6	1044	1049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079555
18	NC_010480	GTC	2	6	1171	1176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079555
19	NC_010480	TGA	2	6	1501	1506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079555
20	NC_010480	CCA	2	6	1753	1758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_010480	CTG	2	6	1768	1773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_010480	ATC	2	6	1888	1893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079556
23	NC_010480	AGT	2	6	1908	1913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079556
24	NC_010480	TTA	2	6	1929	1934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079556
25	NC_010480	CAG	2	6	1996	2001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079556
26	NC_010480	CGC	2	6	2020	2025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079556
27	NC_010480	AAG	2	6	2031	2036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079556
28	NC_010480	ATC	2	6	2056	2061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079556
29	NC_010480	CAG	2	6	2109	2114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079556
30	NC_010480	GTT	2	6	2331	2336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079556
31	NC_010480	TCA	2	6	2342	2347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079556
32	NC_010480	ACC	2	6	2521	2526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079556
33	NC_010480	CTG	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079556
34	NC_010480	GTT	2	6	2617	2622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079556
35	NC_010480	TTC	2	6	2636	2641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079556
36	NC_010480	ACG	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079556
37	NC_010480	GAG	2	6	2725	2730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079556
38	NC_010480	ACC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079556
39	NC_010480	CGG	3	9	2946	2954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079556
40	NC_010480	ATT	2	6	2974	2979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079556
41	NC_010480	GCT	2	6	3032	3037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079556
42	NC_010480	AGT	2	6	3050	3055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079556
43	NC_010480	TTC	2	6	3211	3216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079556
44	NC_010480	TCC	2	6	3247	3252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079556
45	NC_010480	TCG	2	6	3389	3394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079556
46	NC_010480	GAT	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079556
47	NC_010480	AGC	2	6	3516	3521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_010480	ATG	2	6	3768	3773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010480	AAG	2	6	3839	3844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010480	GTG	2	6	4029	4034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010480	ATC	2	6	4124	4129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079557
52	NC_010480	ATT	2	6	4147	4152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079557
53	NC_010480	GAT	2	6	4322	4327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079557
54	NC_010480	GCG	2	6	4358	4363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079557
55	NC_010480	CAA	2	6	4510	4515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079558
56	NC_010480	AAG	2	6	4535	4540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079558
57	NC_010480	AGA	2	6	4772	4777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079558
58	NC_010480	TTC	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079559
59	NC_010480	GGA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079559
60	NC_010480	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079559
61	NC_010480	AGT	2	6	5365	5370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_010480	GAT	2	6	5487	5492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010480	GGC	2	6	5510	5515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_010480	TGA	2	6	5539	5544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010480	TCA	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079560
66	NC_010480	AAC	2	6	5671	5676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079560
67	NC_010480	CGC	2	6	5777	5782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
68	NC_010480	CTG	2	6	5844	5849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079560
69	NC_010480	GAA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
70	NC_010480	CAG	2	6	5901	5906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079560
71	NC_010480	TGT	2	6	5954	5959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079560
72	NC_010480	CTG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079560
73	NC_010480	CGC	2	6	6074	6079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
74	NC_010480	TCA	2	6	6145	6150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079560
75	NC_010480	GAT	2	6	6180	6185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079560
76	NC_010480	TTC	2	6	6231	6236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079560
77	NC_010480	AAC	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079560
78	NC_010480	ACA	2	6	6341	6346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079560
79	NC_010480	GCA	2	6	6354	6359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079560
80	NC_010480	ATT	2	6	6523	6528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079560
81	NC_010480	GGC	2	6	6596	6601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079560
82	NC_010480	CAA	2	6	6690	6695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079560
83	NC_010480	CGC	2	6	6756	6761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
84	NC_010480	GTG	2	6	6919	6924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079560
85	NC_010480	GCG	2	6	7100	7105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079560
86	NC_010480	AAG	2	6	7245	7250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
87	NC_010480	CGC	2	6	7355	7360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
88	NC_010480	CCA	2	6	7361	7366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079560
89	NC_010480	ACG	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079560
90	NC_010480	ACC	2	6	7545	7550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079560
91	NC_010480	AGC	2	6	7648	7653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079560
92	NC_010480	AGA	2	6	7676	7681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
93	NC_010480	CGC	2	6	7757	7762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079560
94	NC_010480	AGA	2	6	7802	7807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
95	NC_010480	TTA	2	6	8033	8038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079560
96	NC_010480	GAA	2	6	8127	8132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079560
97	NC_010480	AGG	2	6	8212	8217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079560
98	NC_010480	AAT	2	6	8224	8229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079560
99	NC_010480	ACA	2	6	8242	8247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
100	NC_010480	CCG	2	6	8286	8291	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
101	NC_010480	GCC	2	6	8321	8326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
102	NC_010480	ATG	2	6	8349	8354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079561
103	NC_010480	AGT	2	6	8371	8376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079561
104	NC_010480	AGC	2	6	8398	8403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
105	NC_010480	CGC	2	6	8686	8691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
106	NC_010480	CAG	3	9	8771	8779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
107	NC_010480	GAC	2	6	9139	9144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
108	NC_010480	AAC	2	6	9171	9176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
109	NC_010480	ATT	2	6	9270	9275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079561
110	NC_010480	GAT	2	6	9398	9403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079561
111	NC_010480	CCG	2	6	9424	9429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
112	NC_010480	AAT	2	6	9470	9475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079561
113	NC_010480	AAG	2	6	9588	9593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079561
114	NC_010480	CAA	2	6	9680	9685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
115	NC_010480	CAA	2	6	9741	9746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
116	NC_010480	TCC	2	6	9849	9854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079561
117	NC_010480	GGC	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079561
118	NC_010480	ATG	2	6	9933	9938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079561
119	NC_010480	TCC	2	6	9957	9962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079561
120	NC_010480	AGA	2	6	10014	10019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079561
121	NC_010480	TGG	2	6	10031	10036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079561
122	NC_010480	CAG	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
123	NC_010480	CAA	2	6	10070	10075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
124	NC_010480	CTC	2	6	10133	10138	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079561
125	NC_010480	CTG	2	6	10167	10172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079561
126	NC_010480	CGT	2	6	10199	10204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079561
127	NC_010480	CGT	2	6	10280	10285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079561
128	NC_010480	CGC	2	6	10369	10374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079561
129	NC_010480	GGT	2	6	10393	10398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079561
130	NC_010480	AAC	2	6	10479	10484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079561
131	NC_010480	TCA	2	6	10537	10542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079561
132	NC_010480	CAG	2	6	10713	10718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
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134	NC_010480	GAC	2	6	10822	10827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079561
135	NC_010480	ATC	2	6	10865	10870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079561
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148	NC_010480	TTG	2	6	12442	12447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_010480	TGG	2	6	13013	13018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
160	NC_010480	TTA	2	6	13140	13145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_010480	GTA	2	6	13325	13330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079567
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382	NC_010480	TGC	3	9	31868	31876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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