MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 plasmid pAQ6

Total Repeats: 2326

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010480	CTG	2	6	54798	54803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_010480	CAA	2	6	54967	54972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_010480	GTT	2	6	54973	54978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_010480	AGG	2	6	55044	55049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_010480	ACT	2	6	55083	55088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_010480	TGA	2	6	55257	55262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_010480	T	6	6	55390	55395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_010480	GA	3	6	55469	55474	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_010480	GAAAC	2	10	55539	55548	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_010480	ACC	2	6	55573	55578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_010480	TTG	2	6	55930	55935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_010480	C	7	7	55940	55946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1013	NC_010480	TTA	2	6	55949	55954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_010480	GCG	2	6	55955	55960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010480	TA	3	6	56015	56020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010480	GTT	2	6	56157	56162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010480	GTT	2	6	56232	56237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010480	GTT	2	6	56332	56337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_010480	GTT	2	6	56406	56411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_010480	TGCG	2	8	56783	56790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_010480	ACT	2	6	57017	57022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_010480	GGA	2	6	57163	57168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_010480	GTT	2	6	57176	57181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_010480	ACCT	2	8	57399	57406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1025	NC_010480	TGT	2	6	57438	57443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_010480	TGC	2	6	57506	57511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_010480	CTA	2	6	57624	57629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_010480	TGA	2	6	57654	57659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_010480	GGA	2	6	57800	57805	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_010480	GTT	2	6	57813	57818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_010480	ACCT	2	8	58036	58043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_010480	TGT	2	6	58074	58079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_010480	TGC	2	6	58142	58147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_010480	CTT	2	6	58421	58426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_010480	AAG	2	6	58429	58434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010480	TG	3	6	58448	58453	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010480	A	6	6	58570	58575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_010480	GAG	3	9	58658	58666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_010480	TAC	2	6	58898	58903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_010480	AGAT	2	8	58978	58985	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010480	AAC	2	6	59092	59097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_010480	AAGGT	2	10	59125	59134	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010480	G	6	6	59275	59280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010480	CAG	2	6	59409	59414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_010480	CTA	2	6	59517	59522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_010480	AGA	2	6	59592	59597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_010480	AGC	2	6	59654	59659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_010480	ATTG	2	8	59793	59800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_010480	ATT	2	6	59819	59824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_010480	AAG	2	6	59955	59960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_010480	GA	3	6	60043	60048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_010480	CAA	2	6	60119	60124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_010480	AG	3	6	60260	60265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_010480	TTC	2	6	60330	60335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_010480	TGC	3	9	60412	60420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_010480	CTAA	2	8	60859	60866	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_010480	AAG	2	6	61005	61010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_010480	GA	3	6	61325	61330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_010480	A	7	7	61392	61398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_010480	AAT	2	6	61481	61486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_010480	GA	4	8	61537	61544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_010480	TAA	2	6	61596	61601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_010480	T	6	6	61613	61618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010480	ATC	2	6	61721	61726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_010480	CCA	2	6	61741	61746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_010480	TCT	2	6	61859	61864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079607
1067	NC_010480	CTG	2	6	61885	61890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079607
1068	NC_010480	GATA	2	8	61950	61957	50 %	25 %	25 %	0 %	170079607
1069	NC_010480	ATG	2	6	61973	61978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079607
1070	NC_010480	GTG	2	6	62184	62189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079607
1071	NC_010480	GCC	2	6	62190	62195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079607
1072	NC_010480	CGCTGC	2	12	62260	62271	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	170079607
1073	NC_010480	GGA	2	6	62391	62396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079607
1074	NC_010480	ATG	2	6	62513	62518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079607
1075	NC_010480	AAG	2	6	62546	62551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079607
1076	NC_010480	CA	3	6	62675	62680	50 %	0 %	0 %	50 %	170079607
1077	NC_010480	AAC	2	6	62709	62714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079607
1078	NC_010480	GTG	2	6	62831	62836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079608
1079	NC_010480	AGAC	2	8	62895	62902	50 %	0 %	25 %	25 %	170079608
1080	NC_010480	CCA	2	6	62903	62908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170079608
1081	NC_010480	A	6	6	62908	62913	100 %	0 %	0 %	0 %	170079608
1082	NC_010480	TAA	2	6	62981	62986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079608
1083	NC_010480	GCC	3	9	62989	62997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079608
1084	NC_010480	AAC	2	6	63006	63011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079608
1085	NC_010480	GAA	2	6	63022	63027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079608
1086	NC_010480	TGAT	2	8	63060	63067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_010480	C	6	6	63072	63077	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1088	NC_010480	TCA	2	6	63105	63110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_010480	GAG	2	6	63138	63143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_010480	AGTCG	2	10	63177	63186	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1091	NC_010480	ATTT	3	12	63220	63231	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_010480	CGC	2	6	63334	63339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1093	NC_010480	TCG	2	6	63388	63393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_010480	TCC	2	6	63407	63412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_010480	AAT	2	6	63416	63421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_010480	GAT	2	6	63422	63427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_010480	ATT	2	6	63455	63460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_010480	AGCA	2	8	63508	63515	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_010480	TAG	2	6	63599	63604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_010480	AGA	2	6	63610	63615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_010480	AGA	2	6	63627	63632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_010480	C	6	6	63644	63649	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1103	NC_010480	C	6	6	63653	63658	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1104	NC_010480	G	6	6	63664	63669	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_010480	G	6	6	63708	63713	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_010480	TAG	2	6	63717	63722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_010480	TTA	2	6	63728	63733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_010480	A	6	6	63820	63825	100 %	0 %	0 %	0 %	170079609
1109	NC_010480	TAA	2	6	63847	63852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170079609
1110	NC_010480	GGGGT	2	10	63873	63882	0 %	20 %	80 %	0 %	170079609
1111	NC_010480	GGGCA	2	10	63910	63919	20 %	0 %	60 %	20 %	170079609
1112	NC_010480	GCT	2	6	63933	63938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079609
1113	NC_010480	CTA	2	6	64079	64084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079609
1114	NC_010480	GCG	2	6	64107	64112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170079609
1115	NC_010480	ATC	2	6	64264	64269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079609
1116	NC_010480	GACC	2	8	64280	64287	25 %	0 %	25 %	50 %	170079609
1117	NC_010480	TGA	2	6	64294	64299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079609
1118	NC_010480	AC	3	6	64319	64324	50 %	0 %	0 %	50 %	170079609
1119	NC_010480	TCA	2	6	64331	64336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079609
1120	NC_010480	A	6	6	64372	64377	100 %	0 %	0 %	0 %	170079609
1121	NC_010480	GCA	2	6	64427	64432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079609
1122	NC_010480	T	6	6	64453	64458	0 %	100 %	0 %	0 %	170079609
1123	NC_010480	TGG	2	6	64507	64512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079609
1124	NC_010480	ATT	2	6	64548	64553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079609
1125	NC_010480	TAAA	2	8	64573	64580	75 %	25 %	0 %	0 %	170079609
1126	NC_010480	CAG	2	6	64645	64650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079609
1127	NC_010480	T	6	6	64707	64712	0 %	100 %	0 %	0 %	170079609
1128	NC_010480	TGC	2	6	64718	64723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079609
1129	NC_010480	AT	3	6	64808	64813	50 %	50 %	0 %	0 %	170079609
1130	NC_010480	ACT	2	6	64816	64821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079609
1131	NC_010480	ATCC	2	8	64841	64848	25 %	25 %	0 %	50 %	170079609
1132	NC_010480	GAG	2	6	64868	64873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079609
1133	NC_010480	ACA	2	6	64919	64924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079609
1134	NC_010480	A	6	6	64980	64985	100 %	0 %	0 %	0 %	170079609
1135	NC_010480	ACG	2	6	64987	64992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079609
1136	NC_010480	C	6	6	65012	65017	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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