MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_010475	TGT	2	6	215189	215194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076835
4002	NC_010475	GAATTG	2	12	215263	215274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076835
4003	NC_010475	A	7	7	215289	215295	100 %	0 %	0 %	0 %	170076835
4004	NC_010475	CT	3	6	215349	215354	0 %	50 %	0 %	50 %	170076835
4005	NC_010475	A	6	6	215460	215465	100 %	0 %	0 %	0 %	170076835
4006	NC_010475	TAT	2	6	215508	215513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076835
4007	NC_010475	TGG	2	6	215573	215578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076835
4008	NC_010475	ATT	2	6	215581	215586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076835
4009	NC_010475	A	6	6	215631	215636	100 %	0 %	0 %	0 %	170076835
4010	NC_010475	G	6	6	215649	215654	0 %	0 %	100 %	0 %	170076835
4011	NC_010475	AATA	2	8	215665	215672	75 %	25 %	0 %	0 %	170076835
4012	NC_010475	TTA	2	6	215674	215679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076835
4013	NC_010475	TAT	2	6	215722	215727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076835
4014	NC_010475	ATG	2	6	215747	215752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076835
4015	NC_010475	TGG	2	6	215777	215782	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076835
4016	NC_010475	T	6	6	215803	215808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_010475	ATC	2	6	215820	215825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_010475	AGA	2	6	215827	215832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_010475	CAA	2	6	215837	215842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_010475	TAA	2	6	215849	215854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_010475	A	7	7	215853	215859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_010475	TAA	2	6	215868	215873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_010475	A	6	6	215883	215888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_010475	CCAAT	2	10	215909	215918	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4025	NC_010475	GTG	2	6	216020	216025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076836
4026	NC_010475	GGC	2	6	216118	216123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076836
4027	NC_010475	G	6	6	216166	216171	0 %	0 %	100 %	0 %	170076836
4028	NC_010475	TGAA	2	8	216176	216183	50 %	25 %	25 %	0 %	170076837
4029	NC_010475	CGC	2	6	216238	216243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076837
4030	NC_010475	GCG	2	6	216279	216284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076837
4031	NC_010475	CTG	2	6	216323	216328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076837
4032	NC_010475	CTG	2	6	216381	216386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076837
4033	NC_010475	GTGTT	2	10	216431	216440	0 %	60 %	40 %	0 %	170076837
4034	NC_010475	GGC	2	6	216505	216510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076837
4035	NC_010475	T	8	8	216579	216586	0 %	100 %	0 %	0 %	170076837
4036	NC_010475	GCC	2	6	216638	216643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076837
4037	NC_010475	GCC	2	6	216691	216696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076837
4038	NC_010475	T	6	6	216742	216747	0 %	100 %	0 %	0 %	170076837
4039	NC_010475	GGA	2	6	216886	216891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076837
4040	NC_010475	CGTCG	2	10	216920	216929	0 %	20 %	40 %	40 %	170076837
4041	NC_010475	TCT	3	9	217112	217120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076837
4042	NC_010475	A	7	7	217150	217156	100 %	0 %	0 %	0 %	170076837
4043	NC_010475	TCC	2	6	217223	217228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076837
4044	NC_010475	TGC	2	6	217240	217245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076837
4045	NC_010475	ACG	2	6	217304	217309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076838
4046	NC_010475	T	6	6	217319	217324	0 %	100 %	0 %	0 %	170076838
4047	NC_010475	TAC	2	6	217375	217380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076838
4048	NC_010475	TCTG	2	8	217434	217441	0 %	50 %	25 %	25 %	170076838
4049	NC_010475	C	6	6	217506	217511	0 %	0 %	0 %	100 %	170076838
4050	NC_010475	GAG	2	6	217562	217567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076838
4051	NC_010475	GCC	2	6	217584	217589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076838
4052	NC_010475	AGC	2	6	217616	217621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076838
4053	NC_010475	CAA	2	6	217648	217653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076838
4054	NC_010475	A	6	6	217656	217661	100 %	0 %	0 %	0 %	170076838
4055	NC_010475	A	6	6	217675	217680	100 %	0 %	0 %	0 %	170076838
4056	NC_010475	GAG	2	6	217742	217747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076839
4057	NC_010475	CTT	2	6	217753	217758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076839
4058	NC_010475	GCG	2	6	217803	217808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076839
4059	NC_010475	CCT	2	6	217813	217818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076839
4060	NC_010475	GA	3	6	217896	217901	50 %	0 %	50 %	0 %	170076839
4061	NC_010475	TCC	2	6	217902	217907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076839
4062	NC_010475	T	6	6	217934	217939	0 %	100 %	0 %	0 %	170076839
4063	NC_010475	AAT	2	6	217977	217982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076839
4064	NC_010475	CCA	2	6	218037	218042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076839
4065	NC_010475	GTA	2	6	218092	218097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_010475	CTA	2	6	218111	218116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4067	NC_010475	CAA	2	6	218147	218152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076840
4068	NC_010475	CACCGA	2	12	218227	218238	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	170076840
4069	NC_010475	CGA	2	6	218390	218395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076840
4070	NC_010475	ATG	2	6	218507	218512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076840
4071	NC_010475	CTC	2	6	218546	218551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076840
4072	NC_010475	C	6	6	218785	218790	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4073	NC_010475	CAA	2	6	218837	218842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_010475	TGA	2	6	218853	218858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_010475	CAA	2	6	218890	218895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076841
4076	NC_010475	A	6	6	218894	218899	100 %	0 %	0 %	0 %	170076841
4077	NC_010475	A	6	6	218999	219004	100 %	0 %	0 %	0 %	170076841
4078	NC_010475	CGAG	2	8	219006	219013	25 %	0 %	50 %	25 %	170076841
4079	NC_010475	AAG	2	6	219020	219025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076841
4080	NC_010475	TCG	2	6	219095	219100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076841
4081	NC_010475	GCG	2	6	219148	219153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076841
4082	NC_010475	CAA	2	6	219186	219191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076841
4083	NC_010475	CCA	2	6	219215	219220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076841
4084	NC_010475	AAG	2	6	219329	219334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076841
4085	NC_010475	C	6	6	219361	219366	0 %	0 %	0 %	100 %	170076841
4086	NC_010475	TTCT	2	8	219537	219544	0 %	75 %	0 %	25 %	170076841
4087	NC_010475	GTTGC	2	10	219551	219560	0 %	40 %	40 %	20 %	170076841
4088	NC_010475	A	7	7	219620	219626	100 %	0 %	0 %	0 %	170076841
4089	NC_010475	GAA	2	6	219649	219654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076841
4090	NC_010475	GTT	2	6	219679	219684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076841
4091	NC_010475	AAG	2	6	219764	219769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076841
4092	NC_010475	TGA	2	6	219774	219779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076841
4093	NC_010475	ACA	2	6	219791	219796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076841
4094	NC_010475	AG	3	6	219876	219881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_010475	T	8	8	219916	219923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_010475	TAGGTT	2	12	219953	219964	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_010475	CTG	2	6	219993	219998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_010475	T	6	6	220013	220018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_010475	ATC	2	6	220050	220055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_010475	AAT	2	6	220058	220063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_010475	T	7	7	220125	220131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_010475	GCA	2	6	220147	220152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_010475	ATG	2	6	220171	220176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_010475	AT	3	6	220193	220198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_010475	GTCAA	2	10	220206	220215	40 %	20 %	20 %	20 %	170076842
4106	NC_010475	TGG	2	6	220231	220236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076842
4107	NC_010475	GTTGG	2	10	220247	220256	0 %	40 %	60 %	0 %	170076842
4108	NC_010475	TC	3	6	220288	220293	0 %	50 %	0 %	50 %	170076842
4109	NC_010475	TAA	2	6	220377	220382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076842
4110	NC_010475	T	6	6	220426	220431	0 %	100 %	0 %	0 %	170076842
4111	NC_010475	ATT	2	6	220557	220562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076842
4112	NC_010475	T	6	6	220599	220604	0 %	100 %	0 %	0 %	170076842
4113	NC_010475	A	6	6	220623	220628	100 %	0 %	0 %	0 %	170076842
4114	NC_010475	T	6	6	220655	220660	0 %	100 %	0 %	0 %	170076842
4115	NC_010475	AAG	2	6	220675	220680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076842
4116	NC_010475	TCA	2	6	220779	220784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_010475	T	6	6	220878	220883	0 %	100 %	0 %	0 %	170076843
4118	NC_010475	GCG	2	6	220963	220968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076843
4119	NC_010475	CGC	2	6	220986	220991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076843
4120	NC_010475	GAA	2	6	221011	221016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076843
4121	NC_010475	GTC	2	6	221026	221031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076843
4122	NC_010475	AATT	2	8	221081	221088	50 %	50 %	0 %	0 %	170076843
4123	NC_010475	GTC	2	6	221125	221130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076843
4124	NC_010475	ATCA	2	8	221148	221155	50 %	25 %	0 %	25 %	170076843
4125	NC_010475	CTG	3	9	221164	221172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076843
4126	NC_010475	CCG	2	6	221294	221299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076843
4127	NC_010475	ATG	2	6	221426	221431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076843
4128	NC_010475	GAA	3	9	221449	221457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076843
4129	NC_010475	AGA	3	9	221466	221474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076843
4130	NC_010475	AGC	2	6	221574	221579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076843
4131	NC_010475	CT	3	6	221603	221608	0 %	50 %	0 %	50 %	170076843
4132	NC_010475	TCC	2	6	221621	221626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076843
4133	NC_010475	CAT	2	6	221631	221636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076843
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4135	NC_010475	CCGTTG	2	12	221705	221716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076843
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4137	NC_010475	CCGTGG	2	12	221822	221833	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	170076843
4138	NC_010475	GAAG	2	8	221884	221891	50 %	0 %	50 %	0 %	170076843
4139	NC_010475	TTG	2	6	221893	221898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076843
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4141	NC_010475	GCT	2	6	221988	221993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4142	NC_010475	T	7	7	221996	222002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_010475	CCA	2	6	222033	222038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4144	NC_010475	AAT	2	6	222041	222046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_010475	TGC	2	6	222093	222098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4146	NC_010475	ATT	2	6	222129	222134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_010475	ACT	2	6	222255	222260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076844
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4165	NC_010475	T	7	7	223625	223631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4166	NC_010475	GCA	2	6	223727	223732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076845
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4219	NC_010475	TCAG	2	8	226564	226571	25 %	25 %	25 %	25 %	170076845
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4221	NC_010475	A	7	7	226773	226779	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4222	NC_010475	ACC	2	6	226876	226881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076846
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4228	NC_010475	A	6	6	227136	227141	100 %	0 %	0 %	0 %	170076846
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4231	NC_010475	C	6	6	227316	227321	0 %	0 %	0 %	100 %	170076846
4232	NC_010475	G	6	6	227368	227373	0 %	0 %	100 %	0 %	170076846
4233	NC_010475	CCT	2	6	227442	227447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076846
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4235	NC_010475	GGC	2	6	227555	227560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4236	NC_010475	G	6	6	227575	227580	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_010475	A	7	7	227620	227626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_010475	TGG	2	6	227658	227663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076847
4239	NC_010475	AGGC	2	8	227683	227690	25 %	0 %	50 %	25 %	170076847
4240	NC_010475	CG	3	6	227695	227700	0 %	0 %	50 %	50 %	170076847
4241	NC_010475	CGG	2	6	227791	227796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076847
4242	NC_010475	TGC	2	6	227857	227862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076847
4243	NC_010475	GCC	2	6	227933	227938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076847
4244	NC_010475	ATTT	2	8	227959	227966	25 %	75 %	0 %	0 %	170076847
4245	NC_010475	AGC	2	6	227988	227993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076847
4246	NC_010475	GATG	2	8	228010	228017	25 %	25 %	50 %	0 %	170076847
4247	NC_010475	AAAC	2	8	228236	228243	75 %	0 %	0 %	25 %	170076847
4248	NC_010475	GTG	2	6	228251	228256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076847
4249	NC_010475	GAA	2	6	228278	228283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076847
4250	NC_010475	AAC	2	6	228499	228504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076847
4251	NC_010475	GAA	2	6	228601	228606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076847
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4254	NC_010475	GAA	2	6	228688	228693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4255	NC_010475	TGCC	2	8	228848	228855	0 %	25 %	25 %	50 %	170076848
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4319	NC_010475	ACCGC	2	10	232489	232498	20 %	0 %	20 %	60 %	170076852
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4332	NC_010475	A	7	7	233112	233118	100 %	0 %	0 %	0 %	170076852
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4360	NC_010475	GCAG	2	8	235039	235046	25 %	0 %	50 %	25 %	170076853
4361	NC_010475	AATC	2	8	235145	235152	50 %	25 %	0 %	25 %	170076853
4362	NC_010475	GCA	2	6	235206	235211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076853
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4371	NC_010475	TGG	2	6	235780	235785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076854
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4495	NC_010475	CCGT	2	8	241211	241218	0 %	25 %	25 %	50 %	170076861
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4499	NC_010475	ACAG	2	8	241331	241338	50 %	0 %	25 %	25 %	170076862
4500	NC_010475	CTT	2	6	241416	241421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076862

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