MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010475	TTC	2	6	190004	190009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_010475	ATCA	2	8	190041	190048	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_010475	GTT	2	6	190100	190105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_010475	CGT	2	6	190185	190190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3505	NC_010475	AG	4	8	190226	190233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_010475	GCG	2	6	190244	190249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_010475	CGT	2	6	190257	190262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_010475	T	6	6	190262	190267	0 %	100 %	0 %	0 %	170076812
3509	NC_010475	GTT	2	6	190316	190321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076812
3510	NC_010475	TGG	2	6	190346	190351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076812
3511	NC_010475	AGG	2	6	190378	190383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076812
3512	NC_010475	GCG	2	6	190462	190467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076812
3513	NC_010475	GGC	2	6	190617	190622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076812
3514	NC_010475	TGC	2	6	190667	190672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076812
3515	NC_010475	GCT	2	6	190692	190697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076812
3516	NC_010475	CAT	2	6	190737	190742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076812
3517	NC_010475	TGT	2	6	190847	190852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_010475	G	6	6	190910	190915	0 %	0 %	100 %	0 %	170076813
3519	NC_010475	CAA	2	6	190925	190930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076813
3520	NC_010475	TCA	2	6	190969	190974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076813
3521	NC_010475	CCT	2	6	190987	190992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076813
3522	NC_010475	TCT	2	6	191020	191025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076813
3523	NC_010475	GAA	2	6	191087	191092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076813
3524	NC_010475	CCT	2	6	191121	191126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076813
3525	NC_010475	CAG	2	6	191253	191258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076813
3526	NC_010475	CCA	2	6	191281	191286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076813
3527	NC_010475	A	7	7	191291	191297	100 %	0 %	0 %	0 %	170076813
3528	NC_010475	TTTA	2	8	191327	191334	25 %	75 %	0 %	0 %	170076813
3529	NC_010475	ACTG	2	8	191351	191358	25 %	25 %	25 %	25 %	170076813
3530	NC_010475	TCC	2	6	191382	191387	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076813
3531	NC_010475	GCC	2	6	191475	191480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076813
3532	NC_010475	AAC	2	6	191542	191547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076813
3533	NC_010475	CGAT	2	8	191679	191686	25 %	25 %	25 %	25 %	170076813
3534	NC_010475	GAT	2	6	191735	191740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076813
3535	NC_010475	CTC	2	6	191744	191749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076813
3536	NC_010475	GCG	2	6	191765	191770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076813
3537	NC_010475	TTGGC	2	10	191798	191807	0 %	40 %	40 %	20 %	170076813
3538	NC_010475	GAT	2	6	191815	191820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076813
3539	NC_010475	CT	3	6	191829	191834	0 %	50 %	0 %	50 %	170076813
3540	NC_010475	ATC	2	6	192012	192017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076813
3541	NC_010475	A	6	6	192056	192061	100 %	0 %	0 %	0 %	170076813
3542	NC_010475	ACC	2	6	192160	192165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076813
3543	NC_010475	TGA	2	6	192175	192180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076813
3544	NC_010475	CAG	2	6	192218	192223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076813
3545	NC_010475	TTGGT	2	10	192269	192278	0 %	60 %	40 %	0 %	170076813
3546	NC_010475	A	6	6	192336	192341	100 %	0 %	0 %	0 %	170076813
3547	NC_010475	GCG	2	6	192354	192359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076813
3548	NC_010475	ACG	2	6	192390	192395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076813
3549	NC_010475	TGGTT	2	10	192413	192422	0 %	60 %	40 %	0 %	170076813
3550	NC_010475	GCA	2	6	192443	192448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076813
3551	NC_010475	AAC	2	6	192485	192490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_010475	CAA	2	6	192529	192534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_010475	TAC	2	6	192619	192624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_010475	GCG	2	6	192633	192638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_010475	T	6	6	192650	192655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_010475	GTA	2	6	192905	192910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076814
3557	NC_010475	CGC	2	6	192962	192967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076814
3558	NC_010475	GC	3	6	192994	192999	0 %	0 %	50 %	50 %	170076814
3559	NC_010475	GCT	2	6	193042	193047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076814
3560	NC_010475	GGT	2	6	193114	193119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076814
3561	NC_010475	TTCG	2	8	193148	193155	0 %	50 %	25 %	25 %	170076814
3562	NC_010475	C	6	6	193224	193229	0 %	0 %	0 %	100 %	170076814
3563	NC_010475	CA	3	6	193239	193244	50 %	0 %	0 %	50 %	170076814
3564	NC_010475	CCGT	2	8	193324	193331	0 %	25 %	25 %	50 %	170076814
3565	NC_010475	CAA	2	6	193397	193402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076814
3566	NC_010475	ATC	2	6	193422	193427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076814
3567	NC_010475	ACC	2	6	193533	193538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076814
3568	NC_010475	CGC	2	6	193559	193564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076814
3569	NC_010475	GCC	2	6	193659	193664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076814
3570	NC_010475	GGC	2	6	193856	193861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_010475	ACA	2	6	193887	193892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_010475	CT	3	6	193923	193928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3573	NC_010475	A	7	7	193945	193951	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3574	NC_010475	ATT	2	6	193985	193990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_010475	TAGT	2	8	194001	194008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_010475	GTC	2	6	194129	194134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076815
3577	NC_010475	ATT	2	6	194184	194189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076815
3578	NC_010475	ACTG	2	8	194205	194212	25 %	25 %	25 %	25 %	170076815
3579	NC_010475	TGC	2	6	194292	194297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076815
3580	NC_010475	CTG	2	6	194303	194308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076815
3581	NC_010475	CAC	2	6	194321	194326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076815
3582	NC_010475	CAT	2	6	194502	194507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3583	NC_010475	CAAT	2	8	194532	194539	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3584	NC_010475	TAT	2	6	194546	194551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_010475	T	6	6	194557	194562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3586	NC_010475	AAG	2	6	194570	194575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3587	NC_010475	T	7	7	194587	194593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_010475	AAT	2	6	194595	194600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_010475	CGT	2	6	194663	194668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076816
3590	NC_010475	ACAA	2	8	194680	194687	75 %	0 %	0 %	25 %	170076816
3591	NC_010475	TCG	2	6	194692	194697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076816
3592	NC_010475	T	7	7	194748	194754	0 %	100 %	0 %	0 %	170076816
3593	NC_010475	AAT	2	6	194787	194792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076816
3594	NC_010475	CAAA	2	8	194818	194825	75 %	0 %	0 %	25 %	170076816
3595	NC_010475	TGT	2	6	194828	194833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076816
3596	NC_010475	TGC	2	6	194869	194874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076816
3597	NC_010475	CCA	2	6	194875	194880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076816
3598	NC_010475	A	8	8	194935	194942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_010475	GAA	2	6	195025	195030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076817
3600	NC_010475	CAG	2	6	195114	195119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076817
3601	NC_010475	GTC	2	6	195142	195147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076817
3602	NC_010475	ATG	2	6	195149	195154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076817
3603	NC_010475	GAA	2	6	195166	195171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_010475	TTGC	2	8	195179	195186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3605	NC_010475	A	6	6	195323	195328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_010475	TGG	2	6	195380	195385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_010475	TAG	2	6	195387	195392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076818
3608	NC_010475	TTCGTA	2	12	195404	195415	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170076818
3609	NC_010475	TTCT	2	8	195416	195423	0 %	75 %	0 %	25 %	170076818
3610	NC_010475	CCG	2	6	195442	195447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076818
3611	NC_010475	GTC	3	9	195476	195484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076818
3612	NC_010475	TTC	2	6	195527	195532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076818
3613	NC_010475	GTC	2	6	195548	195553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076818
3614	NC_010475	TCG	2	6	195570	195575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076818
3615	NC_010475	GTC	2	6	195578	195583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076818
3616	NC_010475	CTG	2	6	195602	195607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076818
3617	NC_010475	TGGGG	2	10	195612	195621	0 %	20 %	80 %	0 %	170076818
3618	NC_010475	CTT	2	6	195637	195642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076818
3619	NC_010475	GCT	2	6	195700	195705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076818
3620	NC_010475	CGGG	2	8	195737	195744	0 %	0 %	75 %	25 %	170076818
3621	NC_010475	GTA	2	6	195755	195760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076818
3622	NC_010475	TCT	2	6	195765	195770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076818
3623	NC_010475	AGGG	2	8	195784	195791	25 %	0 %	75 %	0 %	170076818
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3625	NC_010475	GCT	2	6	195881	195886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076818
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3870	NC_010475	A	6	6	209212	209217	100 %	0 %	0 %	0 %	170076829
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3996	NC_010475	GCA	2	6	214959	214964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076835
3997	NC_010475	AT	4	8	214976	214983	50 %	50 %	0 %	0 %	170076835
3998	NC_010475	CGC	2	6	215012	215017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076835
3999	NC_010475	TGGGA	2	10	215032	215041	20 %	20 %	60 %	0 %	170076835
4000	NC_010475	CGAG	2	8	215152	215159	25 %	0 %	50 %	25 %	170076835

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