MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010475	A	8	8	135711	135718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2502	NC_010475	T	6	6	135743	135748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_010475	CG	3	6	135828	135833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2504	NC_010475	A	6	6	135859	135864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_010475	AATAA	2	10	135875	135884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_010475	TCA	2	6	135887	135892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2507	NC_010475	CAT	2	6	135984	135989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_010475	AGA	2	6	136069	136074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076770
2509	NC_010475	CAAT	2	8	136081	136088	50 %	25 %	0 %	25 %	170076770
2510	NC_010475	GAC	2	6	136230	136235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076770
2511	NC_010475	GGC	2	6	136239	136244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2512	NC_010475	AGC	2	6	136387	136392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076770
2513	NC_010475	GCC	2	6	136544	136549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076770
2514	NC_010475	GCAG	2	8	136565	136572	25 %	0 %	50 %	25 %	170076770
2515	NC_010475	GCA	2	6	136600	136605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076770
2516	NC_010475	CGA	2	6	136674	136679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076770
2517	NC_010475	AGA	2	6	136684	136689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076770
2518	NC_010475	AGA	2	6	136798	136803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076770
2519	NC_010475	GAT	2	6	136825	136830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076770
2520	NC_010475	GGC	2	6	136882	136887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2521	NC_010475	CGG	2	6	136895	136900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2522	NC_010475	GGAA	2	8	137152	137159	50 %	0 %	50 %	0 %	170076770
2523	NC_010475	GGC	2	6	137194	137199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2524	NC_010475	AAT	2	6	137264	137269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076770
2525	NC_010475	GCG	2	6	137336	137341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2526	NC_010475	GAA	2	6	137410	137415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076770
2527	NC_010475	CCG	2	6	137619	137624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076770
2528	NC_010475	TGG	2	6	137644	137649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076770
2529	NC_010475	GCC	2	6	137753	137758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076770
2530	NC_010475	TGC	2	6	137772	137777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076770
2531	NC_010475	GTC	2	6	137820	137825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076770
2532	NC_010475	ATA	2	6	137925	137930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076770
2533	NC_010475	AGT	2	6	137948	137953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076770
2534	NC_010475	GCG	2	6	137957	137962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2535	NC_010475	GCG	2	6	137993	137998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2536	NC_010475	AAT	2	6	138038	138043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076770
2537	NC_010475	AGG	2	6	138076	138081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076770
2538	NC_010475	A	7	7	138086	138092	100 %	0 %	0 %	0 %	170076770
2539	NC_010475	AGA	2	6	138115	138120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076770
2540	NC_010475	A	6	6	138120	138125	100 %	0 %	0 %	0 %	170076770
2541	NC_010475	CAC	2	6	138130	138135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076770
2542	NC_010475	TGA	2	6	138172	138177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076770
2543	NC_010475	GCG	2	6	138197	138202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2544	NC_010475	ACA	2	6	138203	138208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076770
2545	NC_010475	CGA	2	6	138210	138215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076770
2546	NC_010475	ATA	2	6	138222	138227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076770
2547	NC_010475	CGG	2	6	138285	138290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076770
2548	NC_010475	TAA	2	6	138322	138327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076770
2549	NC_010475	CATC	2	8	138336	138343	25 %	25 %	0 %	50 %	170076770
2550	NC_010475	CCG	2	6	138359	138364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076770
2551	NC_010475	AGA	2	6	138420	138425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076770
2552	NC_010475	CGT	2	6	138521	138526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076771
2553	NC_010475	GCC	2	6	138542	138547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076771
2554	NC_010475	TTGG	2	8	138703	138710	0 %	50 %	50 %	0 %	170076771
2555	NC_010475	GGT	2	6	138749	138754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076771
2556	NC_010475	TAA	2	6	138775	138780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076771
2557	NC_010475	CAG	2	6	138796	138801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076771
2558	NC_010475	ATC	2	6	138832	138837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076771
2559	NC_010475	CCAGA	2	10	138849	138858	40 %	0 %	20 %	40 %	170076771
2560	NC_010475	GTC	2	6	138865	138870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076771
2561	NC_010475	AAAAT	2	10	138891	138900	80 %	20 %	0 %	0 %	170076771
2562	NC_010475	ATCCA	2	10	138965	138974	40 %	20 %	0 %	40 %	170076771
2563	NC_010475	CTG	2	6	139018	139023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076771
2564	NC_010475	CAA	2	6	139108	139113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076771
2565	NC_010475	ATT	2	6	139150	139155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_010475	GAA	2	6	139159	139164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_010475	A	6	6	139205	139210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_010475	AGC	2	6	139214	139219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_010475	TCCA	2	8	139221	139228	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_010475	ATT	2	6	139245	139250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_010475	ACT	2	6	139263	139268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_010475	AAATCA	2	12	139312	139323	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2573	NC_010475	GCA	2	6	139360	139365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076772
2574	NC_010475	GTT	2	6	139375	139380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076772
2575	NC_010475	CCG	2	6	139409	139414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076772
2576	NC_010475	AG	3	6	139475	139480	50 %	0 %	50 %	0 %	170076772
2577	NC_010475	CTGTTG	2	12	139520	139531	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	170076772
2578	NC_010475	GGA	2	6	139585	139590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076772
2579	NC_010475	CGC	2	6	139638	139643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076772
2580	NC_010475	A	6	6	139811	139816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_010475	AACCA	2	10	139853	139862	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
2582	NC_010475	A	6	6	139864	139869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_010475	CTC	2	6	139882	139887	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2584	NC_010475	TTAA	2	8	139903	139910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_010475	CTT	2	6	140006	140011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076773
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2587	NC_010475	AGAA	2	8	140055	140062	75 %	0 %	25 %	0 %	170076773
2588	NC_010475	CG	3	6	140100	140105	0 %	0 %	50 %	50 %	170076773
2589	NC_010475	ACGG	2	8	140111	140118	25 %	0 %	50 %	25 %	170076773
2590	NC_010475	CTT	2	6	140141	140146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076773
2591	NC_010475	TCAG	2	8	140197	140204	25 %	25 %	25 %	25 %	170076773
2592	NC_010475	AGG	2	6	140224	140229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076773
2593	NC_010475	CTT	2	6	140252	140257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076773
2594	NC_010475	AAT	2	6	140277	140282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076773
2595	NC_010475	TTC	2	6	140328	140333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076773
2596	NC_010475	GCCACC	2	12	140400	140411	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	170076773
2597	NC_010475	GCA	3	9	140519	140527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076773
2598	NC_010475	GAC	3	9	140585	140593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076773
2599	NC_010475	ATC	2	6	140704	140709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076773
2600	NC_010475	GAA	2	6	140724	140729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076773
2601	NC_010475	AGA	2	6	140783	140788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076773
2602	NC_010475	CGA	2	6	140836	140841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076773
2603	NC_010475	TGG	2	6	140921	140926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076773
2604	NC_010475	TTG	2	6	140944	140949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076773
2605	NC_010475	CGA	2	6	140972	140977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076773
2606	NC_010475	TTC	2	6	140988	140993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076773
2607	NC_010475	TGGC	2	8	141034	141041	0 %	25 %	50 %	25 %	170076773
2608	NC_010475	CTTCG	2	10	141171	141180	0 %	40 %	20 %	40 %	170076773
2609	NC_010475	G	6	6	141180	141185	0 %	0 %	100 %	0 %	170076773
2610	NC_010475	AAG	2	6	141253	141258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076773
2611	NC_010475	TTC	2	6	141375	141380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076773
2612	NC_010475	CGC	2	6	141415	141420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076773
2613	NC_010475	TCA	2	6	141457	141462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076773
2614	NC_010475	GTG	2	6	141466	141471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076773
2615	NC_010475	CAC	2	6	141491	141496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076773
2616	NC_010475	GGC	2	6	141522	141527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076773
2617	NC_010475	ATCG	2	8	141528	141535	25 %	25 %	25 %	25 %	170076773
2618	NC_010475	GCA	2	6	141544	141549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076773
2619	NC_010475	T	7	7	141623	141629	0 %	100 %	0 %	0 %	170076773
2620	NC_010475	TTC	2	6	141636	141641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076773
2621	NC_010475	TTC	2	6	141705	141710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076773
2622	NC_010475	ATT	2	6	141804	141809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076773
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2624	NC_010475	GAC	2	6	141857	141862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076773
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2995	NC_010475	GA	3	6	162230	162235	50 %	0 %	50 %	0 %	228861783
2996	NC_010475	CCG	2	6	162261	162266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	228861783
2997	NC_010475	TGT	2	6	162310	162315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	228861783
2998	NC_010475	TGC	3	9	162422	162430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228861783
2999	NC_010475	GCT	2	6	162585	162590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	228861783
3000	NC_010475	AGA	2	6	162626	162631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	228861783

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