MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010475	GGGA	2	8	108708	108715	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_010475	TTG	2	6	108862	108867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076741
2003	NC_010475	CAT	2	6	108941	108946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076741
2004	NC_010475	GGA	2	6	108961	108966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076741
2005	NC_010475	CGA	2	6	108983	108988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076741
2006	NC_010475	CGAGGG	2	12	109097	109108	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	170076741
2007	NC_010475	ATG	2	6	109168	109173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076741
2008	NC_010475	TAG	2	6	109211	109216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076741
2009	NC_010475	A	6	6	109368	109373	100 %	0 %	0 %	0 %	170076741
2010	NC_010475	GA	3	6	109449	109454	50 %	0 %	50 %	0 %	170076741
2011	NC_010475	AAT	2	6	109473	109478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076741
2012	NC_010475	GAG	2	6	109539	109544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076741
2013	NC_010475	TGG	3	9	109546	109554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076741
2014	NC_010475	ACA	2	6	109576	109581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076741
2015	NC_010475	TGA	2	6	109604	109609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076741
2016	NC_010475	TTC	2	6	109650	109655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076741
2017	NC_010475	CCG	2	6	109693	109698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076741
2018	NC_010475	ATG	2	6	109699	109704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076741
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2020	NC_010475	T	6	6	109804	109809	0 %	100 %	0 %	0 %	170076742
2021	NC_010475	TGG	2	6	109829	109834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076742
2022	NC_010475	GGC	2	6	109863	109868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076742
2023	NC_010475	CAAC	2	8	109899	109906	50 %	0 %	0 %	50 %	170076742
2024	NC_010475	TC	3	6	109963	109968	0 %	50 %	0 %	50 %	170076742
2025	NC_010475	CCG	2	6	110043	110048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076742
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2029	NC_010475	GTT	2	6	110406	110411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2030	NC_010475	AGA	2	6	110417	110422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2031	NC_010475	TCC	2	6	110424	110429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2032	NC_010475	GCCC	2	8	110450	110457	0 %	0 %	25 %	75 %	170076743
2033	NC_010475	GTG	2	6	110541	110546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076743
2034	NC_010475	GCG	2	6	110598	110603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076743
2035	NC_010475	CAAA	2	8	110687	110694	75 %	0 %	0 %	25 %	170076743
2036	NC_010475	GTA	2	6	110716	110721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076743
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2040	NC_010475	CTA	2	6	110980	110985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076743
2041	NC_010475	CTG	2	6	110992	110997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076743
2042	NC_010475	GCC	2	6	111033	111038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076743
2043	NC_010475	AGT	2	6	111269	111274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076743
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2046	NC_010475	TGC	2	6	111370	111375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076743
2047	NC_010475	GC	3	6	111438	111443	0 %	0 %	50 %	50 %	170076743
2048	NC_010475	CT	3	6	111489	111494	0 %	50 %	0 %	50 %	170076743
2049	NC_010475	CAG	2	6	111515	111520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076743
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2052	NC_010475	ATT	2	6	111657	111662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076743
2053	NC_010475	GCA	2	6	111678	111683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076743
2054	NC_010475	TTGA	2	8	111705	111712	25 %	50 %	25 %	0 %	170076743
2055	NC_010475	T	6	6	111816	111821	0 %	100 %	0 %	0 %	170076744
2056	NC_010475	A	6	6	111858	111863	100 %	0 %	0 %	0 %	170076744
2057	NC_010475	TAAA	2	8	111926	111933	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_010475	ACC	3	9	111965	111973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076745
2059	NC_010475	ACGG	2	8	112073	112080	25 %	0 %	50 %	25 %	170076745
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2062	NC_010475	CGG	2	6	112167	112172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076745
2063	NC_010475	TGT	2	6	112237	112242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076745
2064	NC_010475	CTG	2	6	112289	112294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076745
2065	NC_010475	GAC	2	6	112304	112309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076745
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2067	NC_010475	TAAA	2	8	112488	112495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2068	NC_010475	GTAA	2	8	112554	112561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2069	NC_010475	TTTA	2	8	112577	112584	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2070	NC_010475	CATA	2	8	112627	112634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2071	NC_010475	TGC	2	6	112690	112695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2073	NC_010475	CGC	2	6	112739	112744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076746
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2087	NC_010475	GAA	2	6	113520	113525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2088	NC_010475	TCCC	2	8	113713	113720	0 %	25 %	0 %	75 %	170076747
2089	NC_010475	AGC	2	6	113754	113759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076747
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2092	NC_010475	AT	3	6	113913	113918	50 %	50 %	0 %	0 %	170076747
2093	NC_010475	CCG	2	6	113924	113929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076747
2094	NC_010475	GCA	2	6	113934	113939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076747
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2096	NC_010475	AGC	2	6	114042	114047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076747
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2099	NC_010475	GCATCA	2	12	114308	114319	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	170076748
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2102	NC_010475	TGC	2	6	114403	114408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076748
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2105	NC_010475	GAT	2	6	114458	114463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076748
2106	NC_010475	AAGGC	2	10	114484	114493	40 %	0 %	40 %	20 %	170076748
2107	NC_010475	ACC	2	6	114586	114591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076748
2108	NC_010475	ATCCCC	2	12	114604	114615	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	170076748
2109	NC_010475	CTTGG	2	10	114701	114710	0 %	40 %	40 %	20 %	170076748
2110	NC_010475	CTTTA	2	10	114785	114794	20 %	60 %	0 %	20 %	170076748
2111	NC_010475	AAC	2	6	114820	114825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076748
2112	NC_010475	ATT	2	6	114831	114836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076748
2113	NC_010475	CAAACA	2	12	114851	114862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076748
2114	NC_010475	ACC	3	9	114891	114899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076748
2115	NC_010475	ACCC	2	8	114906	114913	25 %	0 %	0 %	75 %	170076748
2116	NC_010475	CGC	3	9	115118	115126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076748
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2118	NC_010475	GTTGG	2	10	115160	115169	0 %	40 %	60 %	0 %	170076748
2119	NC_010475	TTC	2	6	115182	115187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076748
2120	NC_010475	A	6	6	115222	115227	100 %	0 %	0 %	0 %	170076748
2121	NC_010475	TCG	2	6	115303	115308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076748
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2123	NC_010475	GGTC	2	8	115355	115362	0 %	25 %	50 %	25 %	170076748
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2245	NC_010475	T	7	7	122242	122248	0 %	100 %	0 %	0 %	170076754
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2248	NC_010475	GGC	2	6	122518	122523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076754
2249	NC_010475	GGCGA	2	10	122621	122630	20 %	0 %	60 %	20 %	170076754
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2256	NC_010475	GCT	2	6	122965	122970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076754
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2360	NC_010475	AATTT	2	10	127956	127965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2363	NC_010475	TAAA	2	8	128085	128092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2364	NC_010475	A	6	6	128138	128143	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2365	NC_010475	AGA	2	6	128165	128170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2366	NC_010475	ATA	2	6	128201	128206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2367	NC_010475	TGAAT	2	10	128348	128357	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
2368	NC_010475	GT	3	6	128406	128411	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2369	NC_010475	ATT	2	6	128421	128426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_010475	TGGT	2	8	128570	128577	0 %	50 %	50 %	0 %	170076759
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2495	NC_010475	CTC	2	6	135299	135304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076769
2496	NC_010475	CGT	2	6	135326	135331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076769
2497	NC_010475	A	6	6	135413	135418	100 %	0 %	0 %	0 %	170076769
2498	NC_010475	CAT	2	6	135445	135450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076769
2499	NC_010475	GCG	4	12	135524	135535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076769
2500	NC_010475	GCA	2	6	135586	135591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076769

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