MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010475	CAG	2	6	54143	54148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076683
1002	NC_010475	GAA	2	6	54182	54187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1003	NC_010475	TGAA	2	8	54207	54214	50 %	25 %	25 %	0 %	170076683
1004	NC_010475	GCC	2	6	54233	54238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076683
1005	NC_010475	GAA	2	6	54272	54277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1006	NC_010475	A	6	6	54427	54432	100 %	0 %	0 %	0 %	170076683
1007	NC_010475	TCG	2	6	54450	54455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076683
1008	NC_010475	TTG	2	6	54483	54488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076683
1009	NC_010475	TCC	2	6	54630	54635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076683
1010	NC_010475	CTC	2	6	54677	54682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076683
1011	NC_010475	TCA	2	6	54729	54734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076683
1012	NC_010475	GAA	2	6	54788	54793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1013	NC_010475	TGA	2	6	54838	54843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076683
1014	NC_010475	ATG	2	6	54908	54913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076683
1015	NC_010475	GAA	2	6	55022	55027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1016	NC_010475	GTG	2	6	55058	55063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076683
1017	NC_010475	CTC	3	9	55202	55210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076683
1018	NC_010475	GAA	2	6	55253	55258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1019	NC_010475	GAA	2	6	55307	55312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1020	NC_010475	GAA	2	6	55316	55321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1021	NC_010475	CTG	2	6	55418	55423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076683
1022	NC_010475	ATCC	2	8	55567	55574	25 %	25 %	0 %	50 %	170076683
1023	NC_010475	CAA	2	6	55624	55629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076683
1024	NC_010475	TTC	2	6	55735	55740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076683
1025	NC_010475	AGA	2	6	55743	55748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1026	NC_010475	CCAA	2	8	55782	55789	50 %	0 %	0 %	50 %	170076683
1027	NC_010475	GAA	3	9	55838	55846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1028	NC_010475	CCA	2	6	55902	55907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076683
1029	NC_010475	ATC	2	6	55922	55927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076683
1030	NC_010475	GAA	2	6	55928	55933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076683
1031	NC_010475	A	6	6	56076	56081	100 %	0 %	0 %	0 %	170076683
1032	NC_010475	GT	3	6	56238	56243	0 %	50 %	50 %	0 %	170076683
1033	NC_010475	AGT	2	6	56259	56264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076683
1034	NC_010475	CATCG	2	10	56316	56325	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1035	NC_010475	ATT	2	6	56330	56335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_010475	T	6	6	56334	56339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_010475	ATC	2	6	56340	56345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_010475	ATC	3	9	56364	56372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_010475	GCA	2	6	56449	56454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076684
1040	NC_010475	TGA	2	6	56469	56474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076684
1041	NC_010475	GCC	2	6	56522	56527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076684
1042	NC_010475	TG	3	6	56552	56557	0 %	50 %	50 %	0 %	170076684
1043	NC_010475	AGA	2	6	56620	56625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076684
1044	NC_010475	ATCA	2	8	56690	56697	50 %	25 %	0 %	25 %	170076684
1045	NC_010475	AGA	2	6	56767	56772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076684
1046	NC_010475	ATTT	2	8	56842	56849	25 %	75 %	0 %	0 %	170076684
1047	NC_010475	AGA	2	6	56854	56859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076684
1048	NC_010475	CAA	2	6	56896	56901	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076684
1049	NC_010475	CCG	2	6	56903	56908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076684
1050	NC_010475	GCG	2	6	56990	56995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076684
1051	NC_010475	GCT	2	6	57089	57094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076684
1052	NC_010475	GAG	2	6	57120	57125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076684
1053	NC_010475	GCC	2	6	57134	57139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076684
1054	NC_010475	CCA	2	6	57142	57147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076684
1055	NC_010475	CTCC	2	8	57165	57172	0 %	25 %	0 %	75 %	170076684
1056	NC_010475	GCC	2	6	57281	57286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076684
1057	NC_010475	C	6	6	57491	57496	0 %	0 %	0 %	100 %	170076684
1058	NC_010475	CTC	2	6	57501	57506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076684
1059	NC_010475	GCA	3	9	57545	57553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076684
1060	NC_010475	C	7	7	57597	57603	0 %	0 %	0 %	100 %	170076684
1061	NC_010475	GCC	2	6	57663	57668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076684
1062	NC_010475	ACA	2	6	57711	57716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076684
1063	NC_010475	AGC	2	6	57740	57745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076684
1064	NC_010475	TGG	2	6	57825	57830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076684
1065	NC_010475	ACC	2	6	57929	57934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076684
1066	NC_010475	CAG	2	6	57944	57949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076684
1067	NC_010475	CAG	2	6	57953	57958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076684
1068	NC_010475	ACA	2	6	57973	57978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076684
1069	NC_010475	AAC	2	6	57987	57992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076684
1070	NC_010475	TAATC	2	10	58000	58009	40 %	40 %	0 %	20 %	170076684
1071	NC_010475	TGT	2	6	58020	58025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076684
1072	NC_010475	TAA	2	6	58084	58089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076684
1073	NC_010475	GAA	2	6	58211	58216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076684
1074	NC_010475	GAT	2	6	58301	58306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076684
1075	NC_010475	CATTGA	2	12	58315	58326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170076684
1076	NC_010475	CAG	2	6	58434	58439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076684
1077	NC_010475	AGTC	2	8	58444	58451	25 %	25 %	25 %	25 %	170076684
1078	NC_010475	TCGGG	2	10	58457	58466	0 %	20 %	60 %	20 %	170076684
1079	NC_010475	G	6	6	58464	58469	0 %	0 %	100 %	0 %	170076684
1080	NC_010475	TTG	2	6	58592	58597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076684
1081	NC_010475	CGC	2	6	58654	58659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076684
1082	NC_010475	CCT	2	6	58741	58746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076684
1083	NC_010475	CAA	2	6	58787	58792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076684
1084	NC_010475	GCC	2	6	59021	59026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076684
1085	NC_010475	CACAA	2	10	59057	59066	60 %	0 %	0 %	40 %	170076684
1086	NC_010475	ATT	2	6	59069	59074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076684
1087	NC_010475	GCCA	2	8	59094	59101	25 %	0 %	25 %	50 %	170076684
1088	NC_010475	TGA	2	6	59131	59136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076684
1089	NC_010475	CCA	2	6	59163	59168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076684
1090	NC_010475	CAAC	2	8	59224	59231	50 %	0 %	0 %	50 %	170076684
1091	NC_010475	ATT	2	6	59258	59263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076684
1092	NC_010475	A	6	6	59318	59323	100 %	0 %	0 %	0 %	170076684
1093	NC_010475	CAG	2	6	59393	59398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076684
1094	NC_010475	GCG	2	6	59492	59497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076684
1095	NC_010475	TAC	2	6	59514	59519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_010475	GGC	2	6	59579	59584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076685
1097	NC_010475	GCG	2	6	59630	59635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076685
1098	NC_010475	GGGTA	2	10	59693	59702	20 %	20 %	60 %	0 %	170076685
1099	NC_010475	TCG	2	6	59736	59741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076685
1100	NC_010475	T	7	7	59778	59784	0 %	100 %	0 %	0 %	170076685
1101	NC_010475	C	6	6	59871	59876	0 %	0 %	0 %	100 %	170076685
1102	NC_010475	TTC	2	6	60035	60040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076685
1103	NC_010475	G	7	7	60052	60058	0 %	0 %	100 %	0 %	170076685
1104	NC_010475	CTCA	2	8	60134	60141	25 %	25 %	0 %	50 %	170076685
1105	NC_010475	CAA	2	6	60280	60285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_010475	CTT	2	6	60323	60328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076686
1107	NC_010475	TTC	2	6	60335	60340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076686
1108	NC_010475	TCA	2	6	60393	60398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076686
1109	NC_010475	ATA	2	6	60407	60412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076686
1110	NC_010475	CCTG	2	8	60447	60454	0 %	25 %	25 %	50 %	170076686
1111	NC_010475	GCTTG	2	10	60486	60495	0 %	40 %	40 %	20 %	170076686
1112	NC_010475	GTC	2	6	60632	60637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076686
1113	NC_010475	ATAG	2	8	60664	60671	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_010475	ATT	2	6	60694	60699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_010475	GGTTG	2	10	60710	60719	0 %	40 %	60 %	0 %	170076687
1116	NC_010475	AAC	2	6	60776	60781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076687
1117	NC_010475	TCAT	2	8	60807	60814	25 %	50 %	0 %	25 %	170076687
1118	NC_010475	GAT	2	6	60830	60835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076687
1119	NC_010475	GC	3	6	60901	60906	0 %	0 %	50 %	50 %	170076687
1120	NC_010475	CCA	2	6	60919	60924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076687
1121	NC_010475	ATC	2	6	60950	60955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076687
1122	NC_010475	AAC	2	6	61019	61024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076687
1123	NC_010475	AGC	2	6	61079	61084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076687
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1125	NC_010475	TGG	2	6	61162	61167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076687
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1127	NC_010475	A	6	6	61273	61278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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