MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010475	C	6	6	26824	26829	0 %	0 %	0 %	100 %	170076665
502	NC_010475	GTT	2	6	26861	26866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076665
503	NC_010475	CAA	2	6	26886	26891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076665
504	NC_010475	AGCCA	2	10	26940	26949	40 %	0 %	20 %	40 %	170076665
505	NC_010475	CAA	2	6	26981	26986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076665
506	NC_010475	GCC	2	6	27010	27015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076665
507	NC_010475	TTG	2	6	27026	27031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076665
508	NC_010475	AAG	2	6	27034	27039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076665
509	NC_010475	ATA	2	6	27162	27167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_010475	TGT	2	6	27202	27207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076666
511	NC_010475	TG	3	6	27210	27215	0 %	50 %	50 %	0 %	170076666
512	NC_010475	GGC	2	6	27413	27418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076666
513	NC_010475	TGA	2	6	27471	27476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076666
514	NC_010475	CAG	2	6	27612	27617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076666
515	NC_010475	A	6	6	27625	27630	100 %	0 %	0 %	0 %	170076666
516	NC_010475	AGC	2	6	27676	27681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076666
517	NC_010475	A	6	6	27762	27767	100 %	0 %	0 %	0 %	170076666
518	NC_010475	GCA	2	6	27805	27810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076666
519	NC_010475	A	6	6	27840	27845	100 %	0 %	0 %	0 %	170076666
520	NC_010475	ACG	2	6	27876	27881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076666
521	NC_010475	ATT	2	6	27902	27907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076666
522	NC_010475	GCC	3	9	27992	28000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076666
523	NC_010475	CAA	2	6	28052	28057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076666
524	NC_010475	CCG	2	6	28140	28145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076666
525	NC_010475	CAG	2	6	28163	28168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076666
526	NC_010475	TCTT	2	8	28215	28222	0 %	75 %	0 %	25 %	170076666
527	NC_010475	A	6	6	28264	28269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_010475	TTG	2	6	28270	28275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_010475	GTA	2	6	28322	28327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_010475	CCAAAG	2	12	28343	28354	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_010475	AAG	3	9	28352	28360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_010475	CCT	2	6	28449	28454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076667
533	NC_010475	CCT	2	6	28533	28538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076667
534	NC_010475	TACC	2	8	28623	28630	25 %	25 %	0 %	50 %	170076667
535	NC_010475	GAA	2	6	28684	28689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076667
536	NC_010475	ACG	2	6	28769	28774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076667
537	NC_010475	CCG	2	6	28781	28786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076667
538	NC_010475	A	7	7	28817	28823	100 %	0 %	0 %	0 %	170076667
539	NC_010475	TTG	2	6	28843	28848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076667
540	NC_010475	CTT	2	6	28857	28862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_010475	A	6	6	28868	28873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_010475	C	8	8	28906	28913	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
543	NC_010475	CAAA	2	8	29038	29045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
544	NC_010475	AAC	2	6	29057	29062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_010475	TCGC	2	8	29073	29080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_010475	GCT	3	9	29084	29092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_010475	TAA	2	6	29099	29104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_010475	CT	3	6	29178	29183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
549	NC_010475	AGA	2	6	29272	29277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_010475	CAG	2	6	29320	29325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_010475	ACA	2	6	29362	29367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_010475	GTTTT	2	10	29394	29403	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
553	NC_010475	CAG	2	6	29451	29456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076668
554	NC_010475	CACTC	2	10	29516	29525	20 %	20 %	0 %	60 %	170076668
555	NC_010475	AGG	2	6	29557	29562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076668
556	NC_010475	TTTTC	2	10	29618	29627	0 %	80 %	0 %	20 %	170076668
557	NC_010475	CAA	2	6	29628	29633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076668
558	NC_010475	TCA	2	6	29644	29649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076668
559	NC_010475	AAT	2	6	29694	29699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076668
560	NC_010475	CTT	2	6	30020	30025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076668
561	NC_010475	TCT	2	6	30034	30039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076668
562	NC_010475	CA	3	6	30061	30066	50 %	0 %	0 %	50 %	170076668
563	NC_010475	G	6	6	30077	30082	0 %	0 %	100 %	0 %	170076668
564	NC_010475	TCA	2	6	30083	30088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076668
565	NC_010475	GCC	2	6	30145	30150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076668
566	NC_010475	TCT	3	9	30196	30204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076668
567	NC_010475	GTT	2	6	30289	30294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076668
568	NC_010475	CAGC	2	8	30303	30310	25 %	0 %	25 %	50 %	170076668
569	NC_010475	T	6	6	30338	30343	0 %	100 %	0 %	0 %	170076668
570	NC_010475	GATA	2	8	30394	30401	50 %	25 %	25 %	0 %	170076668
571	NC_010475	CAC	2	6	30414	30419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076668
572	NC_010475	CAC	2	6	30423	30428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076668
573	NC_010475	CAC	2	6	30503	30508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076668
574	NC_010475	GA	3	6	30559	30564	50 %	0 %	50 %	0 %	170076668
575	NC_010475	ATTC	2	8	30566	30573	25 %	50 %	0 %	25 %	170076668
576	NC_010475	ATT	2	6	30576	30581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076668
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579	NC_010475	TGG	2	6	30743	30748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076668
580	NC_010475	CGT	2	6	30827	30832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_010475	TTGA	2	8	30852	30859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_010475	CTG	2	6	30921	30926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076669
583	NC_010475	GCC	2	6	30966	30971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076669
584	NC_010475	CAC	2	6	30978	30983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076669
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587	NC_010475	GAC	2	6	31362	31367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076669
588	NC_010475	AAT	2	6	31467	31472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076669
589	NC_010475	CGT	2	6	31502	31507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076669
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591	NC_010475	TGC	2	6	31581	31586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076669
592	NC_010475	T	6	6	31614	31619	0 %	100 %	0 %	0 %	170076669
593	NC_010475	TAA	2	6	31648	31653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076669
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595	NC_010475	A	6	6	31784	31789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
596	NC_010475	AG	3	6	31858	31863	50 %	0 %	50 %	0 %	170076670
597	NC_010475	CAA	2	6	31966	31971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076670
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599	NC_010475	TTC	2	6	32098	32103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076670
600	NC_010475	CCGTTG	2	12	32107	32118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076670
601	NC_010475	TTCA	2	8	32302	32309	25 %	50 %	0 %	25 %	170076670
602	NC_010475	GCTT	2	8	32366	32373	0 %	50 %	25 %	25 %	170076670
603	NC_010475	GCG	2	6	32375	32380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
604	NC_010475	TCA	2	6	32387	32392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076670
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606	NC_010475	CGA	2	6	32505	32510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076670
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608	NC_010475	CAT	2	6	32551	32556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076670
609	NC_010475	CGA	2	6	32676	32681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076670
610	NC_010475	TGG	2	6	32744	32749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076670
611	NC_010475	GCC	2	6	32773	32778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076670
612	NC_010475	GGA	2	6	32790	32795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076670
613	NC_010475	TTTCAA	2	12	32802	32813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	170076670
614	NC_010475	CGG	2	6	32837	32842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
615	NC_010475	GGC	2	6	32845	32850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
616	NC_010475	CGG	2	6	32867	32872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
617	NC_010475	TAA	2	6	32895	32900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076670
618	NC_010475	GCCAT	2	10	32947	32956	20 %	20 %	20 %	40 %	170076670
619	NC_010475	GCA	2	6	32970	32975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076670
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624	NC_010475	ATTA	2	8	33127	33134	50 %	50 %	0 %	0 %	170076670
625	NC_010475	A	6	6	33184	33189	100 %	0 %	0 %	0 %	170076670
626	NC_010475	ACG	2	6	33208	33213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076670
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628	NC_010475	CGG	2	6	33294	33299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076670
629	NC_010475	TGG	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076670
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