MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_010475	A	6	6	3001728	3001733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56002	NC_010475	AAC	2	6	3001776	3001781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079454
56003	NC_010475	ATG	2	6	3001795	3001800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
56004	NC_010475	ACG	2	6	3001833	3001838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
56005	NC_010475	GAC	2	6	3001854	3001859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
56006	NC_010475	ATG	2	6	3001924	3001929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
56007	NC_010475	AGC	2	6	3001946	3001951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
56008	NC_010475	ATC	2	6	3001974	3001979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079454
56009	NC_010475	TGA	2	6	3001987	3001992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
56010	NC_010475	T	7	7	3002065	3002071	0 %	100 %	0 %	0 %	170079454
56011	NC_010475	GAT	2	6	3002124	3002129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
56012	NC_010475	TGA	2	6	3002134	3002139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
56013	NC_010475	AATA	2	8	3002187	3002194	75 %	25 %	0 %	0 %	170079454
56014	NC_010475	TGAG	2	8	3002236	3002243	25 %	25 %	50 %	0 %	170079454
56015	NC_010475	GGT	2	6	3002300	3002305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079454
56016	NC_010475	AAG	2	6	3002326	3002331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
56017	NC_010475	TC	3	6	3002360	3002365	0 %	50 %	0 %	50 %	170079454
56018	NC_010475	CTC	2	6	3002388	3002393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079454
56019	NC_010475	ACA	2	6	3002453	3002458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079454
56020	NC_010475	TTC	2	6	3002515	3002520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079454
56021	NC_010475	GAA	2	6	3002559	3002564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
56022	NC_010475	AGA	2	6	3002597	3002602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
56023	NC_010475	GCATCG	2	12	3002629	3002640	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170079454
56024	NC_010475	TGA	2	6	3002669	3002674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
56025	NC_010475	CA	3	6	3002691	3002696	50 %	0 %	0 %	50 %	170079454
56026	NC_010475	GTT	2	6	3002829	3002834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079454
56027	NC_010475	GGT	2	6	3002867	3002872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079454
56028	NC_010475	TGGTT	2	10	3002912	3002921	0 %	60 %	40 %	0 %	170079454
56029	NC_010475	CAAT	2	8	3002927	3002934	50 %	25 %	0 %	25 %	170079454
56030	NC_010475	GAA	2	6	3002949	3002954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
56031	NC_010475	ATC	2	6	3002964	3002969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079454
56032	NC_010475	GAA	2	6	3002991	3002996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079454
56033	NC_010475	CGT	2	6	3003012	3003017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079454
56034	NC_010475	ACG	2	6	3003197	3003202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
56035	NC_010475	GAT	2	6	3003243	3003248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
56036	NC_010475	TTC	2	6	3003263	3003268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079454
56037	NC_010475	GCA	2	6	3003281	3003286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079454
56038	NC_010475	ATC	2	6	3003360	3003365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079454
56039	NC_010475	ATT	2	6	3003372	3003377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170079454
56040	NC_010475	TGA	2	6	3003464	3003469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079454
56041	NC_010475	GTC	2	6	3003490	3003495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079454
56042	NC_010475	AAATC	2	10	3003623	3003632	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
56043	NC_010475	T	7	7	3003689	3003695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56044	NC_010475	TCT	2	6	3003704	3003709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079455
56045	NC_010475	T	6	6	3003727	3003732	0 %	100 %	0 %	0 %	170079455
56046	NC_010475	AGGA	2	8	3003740	3003747	50 %	0 %	50 %	0 %	170079455
56047	NC_010475	TTGGGC	2	12	3003869	3003880	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	170079455
56048	NC_010475	CGGT	2	8	3003922	3003929	0 %	25 %	50 %	25 %	170079455
56049	NC_010475	GTT	2	6	3003930	3003935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079455
56050	NC_010475	GTG	2	6	3003947	3003952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079455
56051	NC_010475	G	6	6	3004006	3004011	0 %	0 %	100 %	0 %	170079455
56052	NC_010475	GT	3	6	3004077	3004082	0 %	50 %	50 %	0 %	170079455
56053	NC_010475	GTG	2	6	3004129	3004134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56054	NC_010475	CTT	2	6	3004219	3004224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56055	NC_010475	TGC	2	6	3004301	3004306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079457
56056	NC_010475	CCG	3	9	3004388	3004396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
56057	NC_010475	G	6	6	3004482	3004487	0 %	0 %	100 %	0 %	170079457
56058	NC_010475	GCA	2	6	3004508	3004513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170079457
56059	NC_010475	ATC	2	6	3004563	3004568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079457
56060	NC_010475	AG	3	6	3004619	3004624	50 %	0 %	50 %	0 %	170079457
56061	NC_010475	GTC	2	6	3004668	3004673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079457
56062	NC_010475	CAA	2	6	3004713	3004718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170079457
56063	NC_010475	GCC	2	6	3004791	3004796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
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56065	NC_010475	GCT	2	6	3004874	3004879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079457
56066	NC_010475	GTT	2	6	3005028	3005033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170079457
56067	NC_010475	CCG	2	6	3005054	3005059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
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56071	NC_010475	GCC	2	6	3005128	3005133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079457
56072	NC_010475	TCC	2	6	3005215	3005220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170079457
56073	NC_010475	ATTC	2	8	3005228	3005235	25 %	50 %	0 %	25 %	170079457
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56075	NC_010475	TCAT	2	8	3005281	3005288	25 %	50 %	0 %	25 %	170079457
56076	NC_010475	G	6	6	3005325	3005330	0 %	0 %	100 %	0 %	170079457
56077	NC_010475	GGA	2	6	3005372	3005377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170079457
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56080	NC_010475	CAT	2	6	3005516	3005521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170079457
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56082	NC_010475	TCT	2	6	3005632	3005637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170079457
56083	NC_010475	GA	3	6	3005641	3005646	50 %	0 %	50 %	0 %	170079457
56084	NC_010475	G	6	6	3005717	3005722	0 %	0 %	100 %	0 %	170079457
56085	NC_010475	CATC	2	8	3005729	3005736	25 %	25 %	0 %	50 %	170079457
56086	NC_010475	AACA	2	8	3005794	3005801	75 %	0 %	0 %	25 %	170079457
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56088	NC_010475	GAT	2	6	3005848	3005853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079457
56089	NC_010475	GAA	2	6	3005881	3005886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170079456
56090	NC_010475	A	6	6	3005932	3005937	100 %	0 %	0 %	0 %	170079456
56091	NC_010475	CTG	2	6	3006101	3006106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079458
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56098	NC_010475	A	6	6	3006555	3006560	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
56099	NC_010475	GCC	2	6	3006591	3006596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170079458
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56103	NC_010475	A	6	6	3006829	3006834	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
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56115	NC_010475	CCTC	2	8	3007204	3007211	0 %	25 %	0 %	75 %	170079458
56116	NC_010475	TGG	2	6	3007396	3007401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170079458
56117	NC_010475	A	7	7	3007438	3007444	100 %	0 %	0 %	0 %	170079458
56118	NC_010475	CGCTG	2	10	3007559	3007568	0 %	20 %	40 %	40 %	170079459
56119	NC_010475	GAT	2	6	3007575	3007580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170079459
56120	NC_010475	A	6	6	3007652	3007657	100 %	0 %	0 %	0 %	170079459
56121	NC_010475	CTG	2	6	3007688	3007693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079459
56122	NC_010475	GTC	2	6	3007907	3007912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170079459
56123	NC_010475	ATCA	2	8	3008038	3008045	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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