MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010475	GCT	2	6	268036	268041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076882
5002	NC_010475	CGGT	2	8	268055	268062	0 %	25 %	50 %	25 %	170076882
5003	NC_010475	T	6	6	268204	268209	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_010475	TGA	2	6	268287	268292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076883
5005	NC_010475	GCG	3	9	268367	268375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076883
5006	NC_010475	TGA	2	6	268425	268430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076883
5007	NC_010475	A	6	6	268455	268460	100 %	0 %	0 %	0 %	170076883
5008	NC_010475	GAC	2	6	268480	268485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076883
5009	NC_010475	CGGA	2	8	268488	268495	25 %	0 %	50 %	25 %	170076883
5010	NC_010475	TTG	2	6	268573	268578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076883
5011	NC_010475	GCA	2	6	268648	268653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076883
5012	NC_010475	CCG	2	6	268725	268730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076883
5013	NC_010475	TCG	2	6	268782	268787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076883
5014	NC_010475	ATGG	2	8	268813	268820	25 %	25 %	50 %	0 %	170076883
5015	NC_010475	TGGGGG	2	12	268854	268865	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	170076883
5016	NC_010475	C	6	6	268902	268907	0 %	0 %	0 %	100 %	170076883
5017	NC_010475	TTGG	2	8	269013	269020	0 %	50 %	50 %	0 %	170076883
5018	NC_010475	CGG	2	6	269030	269035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076883
5019	NC_010475	CCCA	2	8	269147	269154	25 %	0 %	0 %	75 %	170076884
5020	NC_010475	CG	3	6	269162	269167	0 %	0 %	50 %	50 %	170076884
5021	NC_010475	TGG	2	6	269226	269231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076884
5022	NC_010475	TAA	2	6	269281	269286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076884
5023	NC_010475	TCTGG	2	10	269311	269320	0 %	40 %	40 %	20 %	170076884
5024	NC_010475	T	6	6	269377	269382	0 %	100 %	0 %	0 %	170076884
5025	NC_010475	ATC	2	6	269391	269396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076884
5026	NC_010475	CCTC	2	8	269404	269411	0 %	25 %	0 %	75 %	170076884
5027	NC_010475	CGC	2	6	269434	269439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076884
5028	NC_010475	TTA	2	6	269523	269528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076884
5029	NC_010475	TGT	2	6	269554	269559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076884
5030	NC_010475	CCG	2	6	269612	269617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076884
5031	NC_010475	TGG	2	6	269631	269636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076884
5032	NC_010475	A	6	6	269675	269680	100 %	0 %	0 %	0 %	170076884
5033	NC_010475	TTG	2	6	269697	269702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076884
5034	NC_010475	TGC	2	6	269704	269709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076884
5035	NC_010475	CCA	2	6	269736	269741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076884
5036	NC_010475	GTCA	2	8	269754	269761	25 %	25 %	25 %	25 %	170076884
5037	NC_010475	AGG	2	6	269769	269774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076884
5038	NC_010475	TCG	2	6	269884	269889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076884
5039	NC_010475	GTG	2	6	270035	270040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076884
5040	NC_010475	TTTC	2	8	270073	270080	0 %	75 %	0 %	25 %	170076884
5041	NC_010475	GTC	2	6	270140	270145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076884
5042	NC_010475	CCG	2	6	270253	270258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076884
5043	NC_010475	TGA	2	6	270268	270273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076884
5044	NC_010475	AATT	2	8	270282	270289	50 %	50 %	0 %	0 %	170076884
5045	NC_010475	TGG	2	6	270315	270320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076884
5046	NC_010475	ATG	2	6	270447	270452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076884
5047	NC_010475	CTCGAT	2	12	270497	270508	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	170076884
5048	NC_010475	T	6	6	270536	270541	0 %	100 %	0 %	0 %	170076884
5049	NC_010475	ATC	2	6	270595	270600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076885
5050	NC_010475	CTT	2	6	270630	270635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076885
5051	NC_010475	CCA	2	6	270768	270773	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076885
5052	NC_010475	C	6	6	270781	270786	0 %	0 %	0 %	100 %	170076885
5053	NC_010475	AAT	2	6	270799	270804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076885
5054	NC_010475	GC	3	6	270889	270894	0 %	0 %	50 %	50 %	170076885
5055	NC_010475	GCC	2	6	270922	270927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076885
5056	NC_010475	ATC	2	6	271003	271008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076885
5057	NC_010475	AGC	2	6	271024	271029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_010475	GAA	2	6	271107	271112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_010475	GTAAC	2	10	271227	271236	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5060	NC_010475	TG	3	6	271310	271315	0 %	50 %	50 %	0 %	170076886
5061	NC_010475	TTTAG	2	10	271358	271367	20 %	60 %	20 %	0 %	170076886
5062	NC_010475	TGCT	2	8	271486	271493	0 %	50 %	25 %	25 %	170076886
5063	NC_010475	GCG	2	6	271532	271537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076886
5064	NC_010475	CCA	2	6	271641	271646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076886
5065	NC_010475	GCC	2	6	271713	271718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076886
5066	NC_010475	GGC	2	6	271741	271746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076886
5067	NC_010475	CAC	2	6	271788	271793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076886
5068	NC_010475	CTCA	2	8	271804	271811	25 %	25 %	0 %	50 %	170076886
5069	NC_010475	A	6	6	271913	271918	100 %	0 %	0 %	0 %	170076886
5070	NC_010475	A	6	6	272066	272071	100 %	0 %	0 %	0 %	170076886
5071	NC_010475	GAGG	2	8	272125	272132	25 %	0 %	75 %	0 %	170076886
5072	NC_010475	TCC	2	6	272146	272151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076886
5073	NC_010475	AGC	2	6	272300	272305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5074	NC_010475	CTG	2	6	272324	272329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_010475	CCT	2	6	272337	272342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5076	NC_010475	TTA	2	6	272346	272351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_010475	GAA	2	6	272377	272382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_010475	TCT	2	6	272409	272414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_010475	ACA	2	6	272434	272439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076887
5080	NC_010475	TCA	2	6	272445	272450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076887
5081	NC_010475	ATC	2	6	272518	272523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076887
5082	NC_010475	GCCA	2	8	272590	272597	25 %	0 %	25 %	50 %	170076887
5083	NC_010475	T	6	6	272599	272604	0 %	100 %	0 %	0 %	170076887
5084	NC_010475	AGT	2	6	272655	272660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076887
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5087	NC_010475	AAGTG	2	10	272760	272769	40 %	20 %	40 %	0 %	170076887
5088	NC_010475	CGG	2	6	272805	272810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076887
5089	NC_010475	ACCC	2	8	272845	272852	25 %	0 %	0 %	75 %	170076887
5090	NC_010475	CGG	2	6	272890	272895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076887
5091	NC_010475	GCCA	2	8	272930	272937	25 %	0 %	25 %	50 %	170076887
5092	NC_010475	ACCG	2	8	273064	273071	25 %	0 %	25 %	50 %	170076887
5093	NC_010475	CAC	2	6	273073	273078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076887
5094	NC_010475	TTCT	2	8	273138	273145	0 %	75 %	0 %	25 %	170076887
5095	NC_010475	ACG	2	6	273176	273181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076887
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5099	NC_010475	GGAC	2	8	273294	273301	25 %	0 %	50 %	25 %	170076887
5100	NC_010475	GTC	2	6	273403	273408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076887
5101	NC_010475	G	6	6	273439	273444	0 %	0 %	100 %	0 %	170076887
5102	NC_010475	CTG	2	6	273445	273450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076887
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5104	NC_010475	TTTCGA	2	12	273546	273557	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	170076887
5105	NC_010475	TCG	2	6	273605	273610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076887
5106	NC_010475	GGGC	2	8	273732	273739	0 %	0 %	75 %	25 %	170076887
5107	NC_010475	TGG	2	6	273744	273749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076887
5108	NC_010475	GCA	2	6	273768	273773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076888
5109	NC_010475	GAT	2	6	273787	273792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076888
5110	NC_010475	GAA	2	6	273890	273895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076888
5111	NC_010475	GGC	2	6	273920	273925	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076888
5112	NC_010475	GTT	2	6	273929	273934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076888
5113	NC_010475	CACT	2	8	273942	273949	25 %	25 %	0 %	50 %	170076888
5114	NC_010475	CCA	2	6	273963	273968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076888
5115	NC_010475	CGC	2	6	274015	274020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076888
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5117	NC_010475	TCG	2	6	274059	274064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076888
5118	NC_010475	CAG	3	9	274273	274281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076888
5119	NC_010475	CA	3	6	274310	274315	50 %	0 %	0 %	50 %	170076888
5120	NC_010475	TTG	2	6	274357	274362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076888
5121	NC_010475	CCA	2	6	274379	274384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076888
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5123	NC_010475	CGG	2	6	274449	274454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076888
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5162	NC_010475	TA	3	6	276717	276722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5233	NC_010475	AAG	2	6	280325	280330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5241	NC_010475	A	7	7	280877	280883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_010475	GTC	2	6	280894	280899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_010475	TTG	2	6	281509	281514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076896
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5497	NC_010475	TCCC	2	8	294650	294657	0 %	25 %	0 %	75 %	170076907
5498	NC_010475	GGT	2	6	294698	294703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076907
5499	NC_010475	GGCA	2	8	294752	294759	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5500	NC_010475	AGT	2	6	294835	294840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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