MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome

Total Repeats: 56123

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010475	ATTT	2	8	241458	241465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4502	NC_010475	T	7	7	241463	241469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_010475	GTT	2	6	241475	241480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_010475	TAAT	2	8	241619	241626	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4505	NC_010475	ACC	2	6	241636	241641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4506	NC_010475	GTTTT	2	10	241660	241669	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_010475	A	6	6	241697	241702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_010475	TGG	2	6	241774	241779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076864
4509	NC_010475	CGC	2	6	241820	241825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076864
4510	NC_010475	CAA	2	6	241857	241862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076864
4511	NC_010475	AGA	2	6	241874	241879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076864
4512	NC_010475	ACG	2	6	241970	241975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076864
4513	NC_010475	T	6	6	242007	242012	0 %	100 %	0 %	0 %	170076864
4514	NC_010475	TTG	2	6	242151	242156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076864
4515	NC_010475	CGG	2	6	242194	242199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076864
4516	NC_010475	TGGC	2	8	242200	242207	0 %	25 %	50 %	25 %	170076864
4517	NC_010475	CTC	2	6	242247	242252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	170076864
4518	NC_010475	GCG	2	6	242345	242350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076864
4519	NC_010475	CGT	2	6	242516	242521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076864
4520	NC_010475	GGA	2	6	242751	242756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076864
4521	NC_010475	GCG	2	6	242841	242846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076864
4522	NC_010475	A	6	6	242947	242952	100 %	0 %	0 %	0 %	170076864
4523	NC_010475	CCA	2	6	243011	243016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076864
4524	NC_010475	CAG	2	6	243030	243035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076864
4525	NC_010475	GCG	2	6	243040	243045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076864
4526	NC_010475	TCG	3	9	243055	243063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076864
4527	NC_010475	TAAGCT	2	12	243190	243201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	170076864
4528	NC_010475	GC	3	6	243207	243212	0 %	0 %	50 %	50 %	170076864
4529	NC_010475	GGA	2	6	243222	243227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076864
4530	NC_010475	GCT	2	6	243390	243395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076864
4531	NC_010475	T	6	6	243395	243400	0 %	100 %	0 %	0 %	170076864
4532	NC_010475	AACCC	2	10	243420	243429	40 %	0 %	0 %	60 %	170076864
4533	NC_010475	TGA	2	6	243478	243483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076864
4534	NC_010475	GAA	2	6	243553	243558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076864
4535	NC_010475	CAT	2	6	243690	243695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076865
4536	NC_010475	TTA	2	6	243728	243733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076865
4537	NC_010475	ATT	2	6	243757	243762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076865
4538	NC_010475	TCT	2	6	243801	243806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076865
4539	NC_010475	TCA	2	6	243935	243940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076865
4540	NC_010475	TGG	2	6	243984	243989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076865
4541	NC_010475	TTC	2	6	244022	244027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076865
4542	NC_010475	TGA	2	6	244164	244169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076865
4543	NC_010475	CGA	2	6	244227	244232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076865
4544	NC_010475	ATG	2	6	244268	244273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076865
4545	NC_010475	TATT	2	8	244280	244287	25 %	75 %	0 %	0 %	170076865
4546	NC_010475	CATT	2	8	244470	244477	25 %	50 %	0 %	25 %	170076865
4547	NC_010475	CGC	2	6	244500	244505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076865
4548	NC_010475	CTA	2	6	244560	244565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076865
4549	NC_010475	TGA	2	6	244674	244679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076865
4550	NC_010475	AGC	2	6	244787	244792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076865
4551	NC_010475	A	6	6	244867	244872	100 %	0 %	0 %	0 %	170076865
4552	NC_010475	A	6	6	244886	244891	100 %	0 %	0 %	0 %	170076865
4553	NC_010475	GAGCG	2	10	244896	244905	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4554	NC_010475	CGC	2	6	244922	244927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4555	NC_010475	GA	3	6	245013	245018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_010475	A	6	6	245021	245026	100 %	0 %	0 %	0 %	170076866
4557	NC_010475	AGATC	2	10	245031	245040	40 %	20 %	20 %	20 %	170076866
4558	NC_010475	T	6	6	245211	245216	0 %	100 %	0 %	0 %	170076866
4559	NC_010475	ATT	2	6	245236	245241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076866
4560	NC_010475	TAA	2	6	245244	245249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076866
4561	NC_010475	ATT	2	6	245292	245297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076866
4562	NC_010475	A	7	7	245329	245335	100 %	0 %	0 %	0 %	170076866
4563	NC_010475	ATC	2	6	245347	245352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076866
4564	NC_010475	AAAAT	2	10	245360	245369	80 %	20 %	0 %	0 %	170076866
4565	NC_010475	AGAA	2	8	245444	245451	75 %	0 %	25 %	0 %	170076866
4566	NC_010475	ATT	2	6	245467	245472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	170076866
4567	NC_010475	TTC	2	6	245477	245482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	170076866
4568	NC_010475	GAA	2	6	245497	245502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4569	NC_010475	CAC	2	6	245533	245538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076866
4570	NC_010475	GTC	2	6	245563	245568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076866
4571	NC_010475	AGAA	2	8	245576	245583	75 %	0 %	25 %	0 %	170076866
4572	NC_010475	TAC	2	6	245617	245622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076866
4573	NC_010475	GCAA	2	8	245675	245682	50 %	0 %	25 %	25 %	170076866
4574	NC_010475	AAG	2	6	245699	245704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4575	NC_010475	ATTTA	2	10	245711	245720	40 %	60 %	0 %	0 %	170076866
4576	NC_010475	AGA	2	6	245730	245735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4577	NC_010475	ATTC	2	8	245763	245770	25 %	50 %	0 %	25 %	170076866
4578	NC_010475	GAA	2	6	245785	245790	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4579	NC_010475	A	6	6	245827	245832	100 %	0 %	0 %	0 %	170076866
4580	NC_010475	GAA	2	6	245872	245877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	170076866
4581	NC_010475	TAA	2	6	245886	245891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076866
4582	NC_010475	ATC	2	6	245938	245943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076866
4583	NC_010475	A	7	7	246019	246025	100 %	0 %	0 %	0 %	170076866
4584	NC_010475	GATC	2	8	246049	246056	25 %	25 %	25 %	25 %	170076866
4585	NC_010475	T	6	6	246086	246091	0 %	100 %	0 %	0 %	170076866
4586	NC_010475	GAG	2	6	246109	246114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076866
4587	NC_010475	ATA	2	6	246119	246124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	170076866
4588	NC_010475	AAAGT	2	10	246161	246170	60 %	20 %	20 %	0 %	170076866
4589	NC_010475	GT	3	6	246172	246177	0 %	50 %	50 %	0 %	170076866
4590	NC_010475	AGC	2	6	246180	246185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076866
4591	NC_010475	GTT	2	6	246356	246361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076867
4592	NC_010475	T	6	6	246360	246365	0 %	100 %	0 %	0 %	170076867
4593	NC_010475	GGT	2	6	246368	246373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076867
4594	NC_010475	CTG	2	6	246409	246414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076867
4595	NC_010475	CGG	2	6	246475	246480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076867
4596	NC_010475	GGATT	2	10	246520	246529	20 %	40 %	40 %	0 %	170076867
4597	NC_010475	TAGA	2	8	246537	246544	50 %	25 %	25 %	0 %	170076867
4598	NC_010475	T	6	6	246555	246560	0 %	100 %	0 %	0 %	170076867
4599	NC_010475	ATTTA	2	10	246576	246585	40 %	60 %	0 %	0 %	170076867
4600	NC_010475	ATCA	2	8	246645	246652	50 %	25 %	0 %	25 %	170076867
4601	NC_010475	T	6	6	246684	246689	0 %	100 %	0 %	0 %	170076867
4602	NC_010475	ACC	2	6	246811	246816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	170076867
4603	NC_010475	TGG	2	6	246932	246937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	170076867
4604	NC_010475	GCGTT	2	10	246970	246979	0 %	40 %	40 %	20 %	170076867
4605	NC_010475	CCG	2	6	247109	247114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076867
4606	NC_010475	GGA	2	6	247163	247168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	170076867
4607	NC_010475	A	6	6	247221	247226	100 %	0 %	0 %	0 %	170076867
4608	NC_010475	CGCCC	2	10	247246	247255	0 %	0 %	20 %	80 %	170076867
4609	NC_010475	ATC	2	6	247326	247331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076867
4610	NC_010475	GCC	2	6	247396	247401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076867
4611	NC_010475	GCC	2	6	247423	247428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	170076867
4612	NC_010475	TCAA	2	8	247453	247460	50 %	25 %	0 %	25 %	170076867
4613	NC_010475	G	6	6	247520	247525	0 %	0 %	100 %	0 %	170076867
4614	NC_010475	CTG	2	6	247533	247538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076867
4615	NC_010475	TAG	2	6	247681	247686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	170076867
4616	NC_010475	TGC	2	6	247697	247702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076867
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4618	NC_010475	A	7	7	247725	247731	100 %	0 %	0 %	0 %	170076867
4619	NC_010475	CA	3	6	247759	247764	50 %	0 %	0 %	50 %	170076867
4620	NC_010475	AGC	2	6	247789	247794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	170076867
4621	NC_010475	TGC	2	6	247813	247818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	170076867
4622	NC_010475	GCTTCC	2	12	247846	247857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	170076867
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4624	NC_010475	CAT	2	6	247899	247904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	170076867
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4996	NC_010475	CGG	2	6	267747	267752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076882
4997	NC_010475	TCGGCA	2	12	267803	267814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	170076882
4998	NC_010475	AAC	2	6	267877	267882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	170076882
4999	NC_010475	TTG	2	6	267943	267948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	170076882
5000	NC_010475	GCG	2	6	268015	268020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	170076882

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