MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

Total Repeats: 28835

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010380	TAA	2	6	45	50	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010380	AAT	2	6	54	59	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010380	TTC	2	6	60	65	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_010380	ATT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010380	AGG	2	6	183	188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010380	TCA	2	6	291	296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832473
7	NC_010380	AAC	2	6	360	365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169832473
8	NC_010380	ATT	2	6	374	379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832473
9	NC_010380	GTA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832473
10	NC_010380	GAA	2	6	467	472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169832473
11	NC_010380	GGA	2	6	659	664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169832473
12	NC_010380	TTA	2	6	686	691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832473
13	NC_010380	TTA	2	6	762	767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832473
14	NC_010380	GAT	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832473
15	NC_010380	GAA	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169832473
16	NC_010380	GAG	2	6	983	988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169832473
17	NC_010380	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169832473
18	NC_010380	ATA	2	6	1413	1418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169832473
19	NC_010380	AAT	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169832473
20	NC_010380	TAT	2	6	1668	1673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_010380	TAT	2	6	1677	1682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010380	TAA	2	6	1734	1739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169834446
23	NC_010380	TAC	2	6	1764	1769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834446
24	NC_010380	CTT	2	6	1925	1930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834446
25	NC_010380	CTT	2	6	1942	1947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834446
26	NC_010380	CTT	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834446
27	NC_010380	GTA	2	6	1969	1974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834446
28	NC_010380	ATT	2	6	2149	2154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834446
29	NC_010380	TGC	2	6	2169	2174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834446
30	NC_010380	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834446
31	NC_010380	GAT	2	6	2365	2370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834446
32	NC_010380	ACT	2	6	2500	2505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169834446
33	NC_010380	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169834446
34	NC_010380	GAA	2	6	2653	2658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834446
35	NC_010380	CAG	2	6	2798	2803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834446
36	NC_010380	AGT	2	6	2912	2917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010380	TTG	2	6	2937	2942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832865
38	NC_010380	TGT	2	6	3055	3060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832865
39	NC_010380	ATG	2	6	3062	3067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832865
40	NC_010380	ATT	2	6	3101	3106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832865
41	NC_010380	CAG	2	6	3206	3211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
42	NC_010380	GCA	2	6	3280	3285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
43	NC_010380	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
44	NC_010380	TGG	2	6	3323	3328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169834529
45	NC_010380	TGA	3	9	3516	3524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834529
46	NC_010380	TTC	2	6	3701	3706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	169834529
47	NC_010380	AGA	2	6	3726	3731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
48	NC_010380	GAC	2	6	3801	3806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
49	NC_010380	AGT	2	6	3915	3920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834529
50	NC_010380	GAA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
51	NC_010380	GAT	2	6	3961	3966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169834529
52	NC_010380	AAG	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
53	NC_010380	CTC	2	6	4121	4126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	169834529
54	NC_010380	AGC	2	6	4128	4133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834529
55	NC_010380	TAT	2	6	4137	4142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169834529
56	NC_010380	AAG	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
57	NC_010380	GAA	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834529
58	NC_010380	TAA	2	6	4316	4321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_010380	GAA	2	6	4474	4479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833645
60	NC_010380	TTA	2	6	4610	4615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833645
61	NC_010380	GAT	2	6	4658	4663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833645
62	NC_010380	CAG	2	6	4707	4712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833645
63	NC_010380	TAT	2	6	4735	4740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833645
64	NC_010380	GTT	2	6	4811	4816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833645
65	NC_010380	CAT	2	6	4817	4822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833645
66	NC_010380	GAT	2	6	4844	4849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833645
67	NC_010380	ACT	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833645
68	NC_010380	TTA	2	6	4961	4966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
69	NC_010380	CTA	2	6	5055	5060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833013
70	NC_010380	AGA	2	6	5092	5097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
71	NC_010380	GAT	2	6	5198	5203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
72	NC_010380	TGG	2	6	5211	5216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	169833013
73	NC_010380	GCA	2	6	5315	5320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833013
74	NC_010380	GAA	2	6	5384	5389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
75	NC_010380	GAG	2	6	5478	5483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169833013
76	NC_010380	TGA	2	6	5542	5547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
77	NC_010380	AGA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
78	NC_010380	TGA	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
79	NC_010380	TGA	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
80	NC_010380	AGA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
81	NC_010380	AGA	2	6	6112	6117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
82	NC_010380	ATT	2	6	6149	6154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
83	NC_010380	GGA	2	6	6190	6195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	169833013
84	NC_010380	CGT	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169833013
85	NC_010380	ACA	2	6	6373	6378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169833013
86	NC_010380	TGT	2	6	6433	6438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833013
87	NC_010380	CAT	2	6	6440	6445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833013
88	NC_010380	TGA	2	6	6682	6687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
89	NC_010380	TGA	4	12	6742	6753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
90	NC_010380	TGA	2	6	6766	6771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
91	NC_010380	GAT	2	6	6794	6799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
92	NC_010380	GTA	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
93	NC_010380	CGA	2	6	6957	6962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169833013
94	NC_010380	TGT	2	6	7138	7143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169833013
95	NC_010380	TGA	2	6	7161	7166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
96	NC_010380	TGA	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
97	NC_010380	GAA	2	6	7222	7227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
98	NC_010380	CCG	2	6	7322	7327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	169833013
99	NC_010380	ACA	2	6	7434	7439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	169833013
100	NC_010380	ACT	3	9	7586	7594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169833013
101	NC_010380	ATT	2	6	7595	7600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
102	NC_010380	TTA	2	6	7919	7924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
103	NC_010380	GTA	2	6	8147	8152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833013
104	NC_010380	ATA	2	6	8226	8231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169833013
105	NC_010380	ATT	2	6	8283	8288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
106	NC_010380	TTA	2	6	8420	8425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833013
107	NC_010380	GAA	2	6	8444	8449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833013
108	NC_010380	TCT	2	6	8468	8473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_010380	AAT	2	6	8496	8501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010380	TAA	2	6	8511	8516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_010380	CGT	2	6	8561	8566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834126
112	NC_010380	TGC	2	6	8682	8687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169834126
113	NC_010380	GCA	2	6	8732	8737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	169834126
114	NC_010380	AGA	2	6	8770	8775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169834126
115	NC_010380	AAT	2	6	8802	8807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	169833356
116	NC_010380	CGT	2	6	8832	8837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169833356
117	NC_010380	TGA	2	6	8845	8850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833356
118	NC_010380	TAT	2	6	8905	8910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833356
119	NC_010380	TGA	2	6	9008	9013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169833356
120	NC_010380	TGC	2	6	9062	9067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169833356
121	NC_010380	TAT	2	6	9090	9095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833356
122	NC_010380	TTA	2	6	9160	9165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833167
123	NC_010380	GAA	2	6	9208	9213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833167
124	NC_010380	ATT	2	6	9231	9236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169833167
125	NC_010380	AAG	2	6	9245	9250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	169833167
126	NC_010380	ATT	2	6	9281	9286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832420
127	NC_010380	TTG	2	6	9287	9292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	169832420
128	NC_010380	GTC	2	6	9341	9346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	169832420
129	NC_010380	TTA	2	6	9364	9369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	169832420
130	NC_010380	TAG	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	169832420
131	NC_010380	ATC	2	6	9558	9563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	169832420
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261	NC_010380	CCT	2	6	19402	19407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
262	NC_010380	GGT	2	6	19538	19543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
263	NC_010380	TCG	2	6	19653	19658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_010380	CGT	2	6	19733	19738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_010380	AGT	2	6	20191	20196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
266	NC_010380	GTA	2	6	20258	20263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
267	NC_010380	ATG	2	6	20281	20286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_010380	TAA	3	9	20352	20360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_010380	GAA	2	6	20423	20428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
270	NC_010380	TGA	2	6	20518	20523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
271	NC_010380	ATT	2	6	20525	20530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_010380	GTG	2	6	20691	20696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
273	NC_010380	TTA	2	6	20739	20744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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