MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 7026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010334	AT	3	6	3	8	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010334	CT	3	6	129	134	0 %	50 %	0 %	50 %	167621942
3	NC_010334	AG	3	6	995	1000	50 %	0 %	50 %	0 %	167621942
4	NC_010334	CT	3	6	2043	2048	0 %	50 %	0 %	50 %	167621943
5	NC_010334	AT	3	6	2887	2892	50 %	50 %	0 %	0 %	167621944
6	NC_010334	GC	3	6	3776	3781	0 %	0 %	50 %	50 %	167621944
7	NC_010334	GT	3	6	3867	3872	0 %	50 %	50 %	0 %	167621944
8	NC_010334	GA	3	6	3894	3899	50 %	0 %	50 %	0 %	167621944
9	NC_010334	TA	3	6	5844	5849	50 %	50 %	0 %	0 %	167621945
10	NC_010334	AC	3	6	5924	5929	50 %	0 %	0 %	50 %	167621945
11	NC_010334	AG	4	8	6800	6807	50 %	0 %	50 %	0 %	167621946
12	NC_010334	CG	4	8	8434	8441	0 %	0 %	50 %	50 %	167621947
13	NC_010334	GA	3	6	10085	10090	50 %	0 %	50 %	0 %	167621948
14	NC_010334	TC	3	6	12143	12148	0 %	50 %	0 %	50 %	167621951
15	NC_010334	TG	3	6	16180	16185	0 %	50 %	50 %	0 %	167621953
16	NC_010334	GC	4	8	18504	18511	0 %	0 %	50 %	50 %	167621956
17	NC_010334	AG	3	6	18722	18727	50 %	0 %	50 %	0 %	167621956
18	NC_010334	GC	3	6	21361	21366	0 %	0 %	50 %	50 %	167621958
19	NC_010334	TC	4	8	21414	21421	0 %	50 %	0 %	50 %	167621958
20	NC_010334	GT	3	6	22325	22330	0 %	50 %	50 %	0 %	167621958
21	NC_010334	GA	3	6	22728	22733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010334	GT	3	6	22850	22855	0 %	50 %	50 %	0 %	167621959
23	NC_010334	TG	3	6	23167	23172	0 %	50 %	50 %	0 %	167621959
24	NC_010334	CT	3	6	23759	23764	0 %	50 %	0 %	50 %	167621960
25	NC_010334	AC	3	6	25082	25087	50 %	0 %	0 %	50 %	167621961
26	NC_010334	TG	3	6	26482	26487	0 %	50 %	50 %	0 %	167621963
27	NC_010334	CT	3	6	27098	27103	0 %	50 %	0 %	50 %	167621964
28	NC_010334	CA	3	6	27435	27440	50 %	0 %	0 %	50 %	167621964
29	NC_010334	AG	3	6	28092	28097	50 %	0 %	50 %	0 %	167621964
30	NC_010334	TC	3	6	28804	28809	0 %	50 %	0 %	50 %	167621965
31	NC_010334	GC	3	6	28823	28828	0 %	0 %	50 %	50 %	167621965
32	NC_010334	TC	3	6	30400	30405	0 %	50 %	0 %	50 %	167621966
33	NC_010334	GC	3	6	31539	31544	0 %	0 %	50 %	50 %	167621967
34	NC_010334	TA	3	6	31816	31821	50 %	50 %	0 %	0 %	167621967
35	NC_010334	TA	4	8	32539	32546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010334	TC	3	6	32882	32887	0 %	50 %	0 %	50 %	167621969
37	NC_010334	CT	3	6	32917	32922	0 %	50 %	0 %	50 %	167621969
38	NC_010334	AT	3	6	33503	33508	50 %	50 %	0 %	0 %	167621969
39	NC_010334	GT	3	6	33973	33978	0 %	50 %	50 %	0 %	167621970
40	NC_010334	CT	3	6	33989	33994	0 %	50 %	0 %	50 %	167621970
41	NC_010334	AT	3	6	36481	36486	50 %	50 %	0 %	0 %	167621972
42	NC_010334	CA	3	6	36499	36504	50 %	0 %	0 %	50 %	167621972
43	NC_010334	AG	5	10	37307	37316	50 %	0 %	50 %	0 %	167621972
44	NC_010334	AT	3	6	37408	37413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010334	TA	3	6	37480	37485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010334	CG	3	6	38122	38127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_010334	AG	3	6	38144	38149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_010334	GT	3	6	38884	38889	0 %	50 %	50 %	0 %	167621975
49	NC_010334	TG	3	6	39196	39201	0 %	50 %	50 %	0 %	167621975
50	NC_010334	TG	3	6	40114	40119	0 %	50 %	50 %	0 %	167621976
51	NC_010334	GT	3	6	40165	40170	0 %	50 %	50 %	0 %	167621976
52	NC_010334	TA	3	6	40899	40904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_010334	GA	3	6	41094	41099	50 %	0 %	50 %	0 %	167621978
54	NC_010334	TA	3	6	41319	41324	50 %	50 %	0 %	0 %	167621978
55	NC_010334	TG	3	6	41984	41989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010334	GT	3	6	42545	42550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010334	AC	3	6	43367	43372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_010334	AC	3	6	43536	43541	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_010334	CA	3	6	43718	43723	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010334	AC	3	6	44798	44803	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_010334	AC	3	6	45005	45010	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010334	GA	3	6	45485	45490	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_010334	GA	3	6	45714	45719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_010334	GT	3	6	46908	46913	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_010334	CT	3	6	47668	47673	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_010334	GT	3	6	48635	48640	0 %	50 %	50 %	0 %	167621981
67	NC_010334	CT	3	6	49991	49996	0 %	50 %	0 %	50 %	167621982
68	NC_010334	GT	3	6	50345	50350	0 %	50 %	50 %	0 %	167621982
69	NC_010334	AT	3	6	50442	50447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_010334	GT	3	6	52033	52038	0 %	50 %	50 %	0 %	167621984
71	NC_010334	AG	3	6	52864	52869	50 %	0 %	50 %	0 %	167621984
72	NC_010334	GT	3	6	53318	53323	0 %	50 %	50 %	0 %	167621984
73	NC_010334	TG	3	6	53347	53352	0 %	50 %	50 %	0 %	167621984
74	NC_010334	AT	3	6	53661	53666	50 %	50 %	0 %	0 %	167621985
75	NC_010334	CT	3	6	54614	54619	0 %	50 %	0 %	50 %	167621986
76	NC_010334	GC	3	6	56444	56449	0 %	0 %	50 %	50 %	167621988
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78	NC_010334	AT	3	6	57886	57891	50 %	50 %	0 %	0 %	167621989
79	NC_010334	AG	3	6	58637	58642	50 %	0 %	50 %	0 %	167621990
80	NC_010334	TC	3	6	59496	59501	0 %	50 %	0 %	50 %	167621991
81	NC_010334	TG	3	6	59781	59786	0 %	50 %	50 %	0 %	167621991
82	NC_010334	TA	3	6	63246	63251	50 %	50 %	0 %	0 %	167621995
83	NC_010334	GT	3	6	63371	63376	0 %	50 %	50 %	0 %	167621995
84	NC_010334	TC	3	6	64874	64879	0 %	50 %	0 %	50 %	167621996
85	NC_010334	GC	3	6	65117	65122	0 %	0 %	50 %	50 %	167621996
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87	NC_010334	GC	3	6	69074	69079	0 %	0 %	50 %	50 %	167622001
88	NC_010334	GA	3	6	69250	69255	50 %	0 %	50 %	0 %	167622002
89	NC_010334	GA	3	6	69531	69536	50 %	0 %	50 %	0 %	167622002
90	NC_010334	AT	3	6	69650	69655	50 %	50 %	0 %	0 %	167622002
91	NC_010334	GC	3	6	71050	71055	0 %	0 %	50 %	50 %	167622003
92	NC_010334	AC	3	6	72675	72680	50 %	0 %	0 %	50 %	167622004
93	NC_010334	TG	3	6	73152	73157	0 %	50 %	50 %	0 %	167622004
94	NC_010334	TA	3	6	76202	76207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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97	NC_010334	CT	3	6	77081	77086	0 %	50 %	0 %	50 %	167622009
98	NC_010334	AG	3	6	79359	79364	50 %	0 %	50 %	0 %	167622011
99	NC_010334	GA	3	6	79641	79646	50 %	0 %	50 %	0 %	167622011
100	NC_010334	AG	3	6	79894	79899	50 %	0 %	50 %	0 %	167622011
101	NC_010334	GA	3	6	80103	80108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010334	CA	3	6	80468	80473	50 %	0 %	0 %	50 %	167622012
103	NC_010334	AG	3	6	80915	80920	50 %	0 %	50 %	0 %	167622012
104	NC_010334	TA	3	6	81755	81760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_010334	AT	3	6	81866	81871	50 %	50 %	0 %	0 %	167622013
106	NC_010334	GC	3	6	83887	83892	0 %	0 %	50 %	50 %	167622014
107	NC_010334	TC	3	6	86844	86849	0 %	50 %	0 %	50 %	167622017
108	NC_010334	AC	3	6	86915	86920	50 %	0 %	0 %	50 %	167622017
109	NC_010334	GA	3	6	87430	87435	50 %	0 %	50 %	0 %	167622017
110	NC_010334	AC	3	6	88440	88445	50 %	0 %	0 %	50 %	167622019
111	NC_010334	AG	3	6	88905	88910	50 %	0 %	50 %	0 %	167622019
112	NC_010334	TG	3	6	89074	89079	0 %	50 %	50 %	0 %	167622019
113	NC_010334	CG	3	6	92429	92434	0 %	0 %	50 %	50 %	167622022
114	NC_010334	GA	3	6	92787	92792	50 %	0 %	50 %	0 %	167622023
115	NC_010334	GT	3	6	93734	93739	0 %	50 %	50 %	0 %	167622024
116	NC_010334	TG	3	6	93953	93958	0 %	50 %	50 %	0 %	167622024
117	NC_010334	TG	3	6	94156	94161	0 %	50 %	50 %	0 %	167622024
118	NC_010334	TG	3	6	94513	94518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010334	AG	3	6	94969	94974	50 %	0 %	50 %	0 %	167622025
120	NC_010334	GC	3	6	96247	96252	0 %	0 %	50 %	50 %	167622026
121	NC_010334	CG	3	6	97892	97897	0 %	0 %	50 %	50 %	167622028
122	NC_010334	GT	3	6	98605	98610	0 %	50 %	50 %	0 %	167622029
123	NC_010334	CA	3	6	102181	102186	50 %	0 %	0 %	50 %	167622032
124	NC_010334	TC	3	6	102214	102219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_010334	TG	3	6	102391	102396	0 %	50 %	50 %	0 %	167622033
126	NC_010334	CT	3	6	102405	102410	0 %	50 %	0 %	50 %	167622033
127	NC_010334	TA	3	6	102511	102516	50 %	50 %	0 %	0 %	167622033
128	NC_010334	GT	3	6	103363	103368	0 %	50 %	50 %	0 %	167622033
129	NC_010334	AT	3	6	104609	104614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010334	TC	3	6	104690	104695	0 %	50 %	0 %	50 %	167622034
131	NC_010334	CA	3	6	104784	104789	50 %	0 %	0 %	50 %	167622034
132	NC_010334	AT	3	6	104929	104934	50 %	50 %	0 %	0 %	167622034
133	NC_010334	TC	3	6	105043	105048	0 %	50 %	0 %	50 %	167622035
134	NC_010334	CG	3	6	105576	105581	0 %	0 %	50 %	50 %	167622035
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136	NC_010334	GA	3	6	106982	106987	50 %	0 %	50 %	0 %	167622035
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139	NC_010334	CT	3	6	109585	109590	0 %	50 %	0 %	50 %	167622038
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141	NC_010334	CG	3	6	111896	111901	0 %	0 %	50 %	50 %	167622040
142	NC_010334	TC	3	6	114154	114159	0 %	50 %	0 %	50 %	167622043
143	NC_010334	TG	3	6	115030	115035	0 %	50 %	50 %	0 %	167622043
144	NC_010334	TG	3	6	115262	115267	0 %	50 %	50 %	0 %	167622043
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