MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010334	CTA	2	6	196609	196614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622111
3502	NC_010334	GAA	3	9	196749	196757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622111
3503	NC_010334	ATC	2	6	196819	196824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622111
3504	NC_010334	TG	3	6	196973	196978	0 %	50 %	50 %	0 %	167622111
3505	NC_010334	GCA	2	6	197074	197079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622111
3506	NC_010334	CAA	2	6	197087	197092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622111
3507	NC_010334	CGA	2	6	197138	197143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622111
3508	NC_010334	CCA	2	6	197148	197153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622111
3509	NC_010334	GTT	2	6	197194	197199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622111
3510	NC_010334	TCAGC	2	10	197210	197219	20 %	20 %	20 %	40 %	167622111
3511	NC_010334	CAC	2	6	197237	197242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622111
3512	NC_010334	GTAT	2	8	197272	197279	25 %	50 %	25 %	0 %	167622111
3513	NC_010334	TTCA	2	8	197370	197377	25 %	50 %	0 %	25 %	167622111
3514	NC_010334	GAT	2	6	197451	197456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622111
3515	NC_010334	AACAAG	2	12	197476	197487	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	167622111
3516	NC_010334	AGA	2	6	197496	197501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622111
3517	NC_010334	AGCT	2	8	197513	197520	25 %	25 %	25 %	25 %	167622111
3518	NC_010334	TCAG	2	8	197560	197567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3519	NC_010334	TGT	2	6	197611	197616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_010334	TCA	2	6	197665	197670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622112
3521	NC_010334	GCA	2	6	197714	197719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622112
3522	NC_010334	AGCA	2	8	197725	197732	50 %	0 %	25 %	25 %	167622112
3523	NC_010334	CGG	2	6	197770	197775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622112
3524	NC_010334	GTG	2	6	197802	197807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622112
3525	NC_010334	GAA	2	6	197861	197866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622112
3526	NC_010334	GCT	3	9	197945	197953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622112
3527	NC_010334	GAT	2	6	198040	198045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622112
3528	NC_010334	AGC	2	6	198161	198166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622112
3529	NC_010334	GGC	2	6	198191	198196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622112
3530	NC_010334	CA	3	6	198210	198215	50 %	0 %	0 %	50 %	167622112
3531	NC_010334	GTT	2	6	198233	198238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622112
3532	NC_010334	CTA	2	6	198330	198335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622112
3533	NC_010334	ACGGT	2	10	198336	198345	20 %	20 %	40 %	20 %	167622112
3534	NC_010334	TGCAC	2	10	198403	198412	20 %	20 %	20 %	40 %	167622112
3535	NC_010334	CAG	2	6	198459	198464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622112
3536	NC_010334	CAA	2	6	198487	198492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622112
3537	NC_010334	CGA	2	6	198504	198509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622112
3538	NC_010334	GCA	2	6	198545	198550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622112
3539	NC_010334	TGT	2	6	198556	198561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622112
3540	NC_010334	GTT	2	6	198642	198647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622112
3541	NC_010334	TAG	2	6	198654	198659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622112
3542	NC_010334	GGTTGT	2	12	198671	198682	0 %	50 %	50 %	0 %	167622112
3543	NC_010334	TTG	2	6	198762	198767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622112
3544	NC_010334	T	6	6	198855	198860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010334	AAC	2	6	198986	198991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_010334	ACA	2	6	199097	199102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_010334	C	6	6	199107	199112	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3548	NC_010334	TTTC	2	8	199122	199129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3549	NC_010334	GCC	2	6	199143	199148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_010334	CGA	2	6	199150	199155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_010334	G	6	6	199297	199302	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3552	NC_010334	CAG	2	6	199468	199473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_010334	AACT	2	8	199592	199599	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3554	NC_010334	CCA	2	6	199667	199672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3555	NC_010334	AAC	2	6	199735	199740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622113
3556	NC_010334	TGA	2	6	199921	199926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622113
3557	NC_010334	TCA	2	6	199933	199938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622113
3558	NC_010334	CTG	2	6	200039	200044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622113
3559	NC_010334	GCG	2	6	200145	200150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622113
3560	NC_010334	TTC	2	6	200163	200168	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622113
3561	NC_010334	AGCT	2	8	200297	200304	25 %	25 %	25 %	25 %	167622113
3562	NC_010334	CTG	2	6	200343	200348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622113
3563	NC_010334	GCT	2	6	200403	200408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622113
3564	NC_010334	TCT	2	6	200605	200610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622113
3565	NC_010334	TAA	2	6	200665	200670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622113
3566	NC_010334	GGC	2	6	200751	200756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622113
3567	NC_010334	GATA	2	8	200875	200882	50 %	25 %	25 %	0 %	167622113
3568	NC_010334	GT	3	6	200973	200978	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_010334	AGT	2	6	200990	200995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_010334	TTTA	2	8	201004	201011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_010334	TTG	2	6	201023	201028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_010334	TGA	2	6	201070	201075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_010334	CCA	2	6	201095	201100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622114
3574	NC_010334	TGC	2	6	201146	201151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622114
3575	NC_010334	T	6	6	201287	201292	0 %	100 %	0 %	0 %	167622114
3576	NC_010334	GTT	2	6	201342	201347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622114
3577	NC_010334	T	6	6	201355	201360	0 %	100 %	0 %	0 %	167622114
3578	NC_010334	CCTT	2	8	201362	201369	0 %	50 %	0 %	50 %	167622114
3579	NC_010334	GTG	2	6	201421	201426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622114
3580	NC_010334	GCG	2	6	201522	201527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622114
3581	NC_010334	AGC	2	6	201667	201672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622114
3582	NC_010334	AGC	2	6	201709	201714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622114
3583	NC_010334	TGC	2	6	201772	201777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622114
3584	NC_010334	GTCT	2	8	201811	201818	0 %	50 %	25 %	25 %	167622114
3585	NC_010334	CTG	2	6	201843	201848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622114
3586	NC_010334	TGCG	2	8	201871	201878	0 %	25 %	50 %	25 %	167622114
3587	NC_010334	G	6	6	201881	201886	0 %	0 %	100 %	0 %	167622114
3588	NC_010334	GT	3	6	201948	201953	0 %	50 %	50 %	0 %	167622114
3589	NC_010334	CAA	2	6	201976	201981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622114
3590	NC_010334	CTG	2	6	202050	202055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622114
3591	NC_010334	ATC	2	6	202062	202067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622114
3592	NC_010334	AT	3	6	202110	202115	50 %	50 %	0 %	0 %	167622114
3593	NC_010334	TAT	2	6	202119	202124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622114
3594	NC_010334	CGT	2	6	202151	202156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622114
3595	NC_010334	GTCT	2	8	202204	202211	0 %	50 %	25 %	25 %	167622114
3596	NC_010334	TA	3	6	202228	202233	50 %	50 %	0 %	0 %	167622114
3597	NC_010334	TGC	2	6	202246	202251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622114
3598	NC_010334	TGG	2	6	202276	202281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622114
3599	NC_010334	GTC	2	6	202397	202402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_010334	CTA	2	6	202426	202431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_010334	GAG	2	6	202432	202437	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_010334	TAG	2	6	202443	202448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_010334	AG	3	6	202447	202452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3604	NC_010334	CGA	2	6	202453	202458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_010334	T	6	6	202469	202474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_010334	G	6	6	202495	202500	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_010334	CAC	2	6	202563	202568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622115
3608	NC_010334	CAG	2	6	202599	202604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622115
3609	NC_010334	TTG	2	6	202648	202653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622115
3610	NC_010334	TTA	2	6	202663	202668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622115
3611	NC_010334	T	6	6	202737	202742	0 %	100 %	0 %	0 %	167622115
3612	NC_010334	GCC	2	6	202743	202748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622115
3613	NC_010334	CTT	2	6	202750	202755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622115
3614	NC_010334	TTC	2	6	202836	202841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622115
3615	NC_010334	AAT	2	6	202926	202931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622115
3616	NC_010334	TGAG	2	8	202958	202965	25 %	25 %	50 %	0 %	167622115
3617	NC_010334	CAG	2	6	203007	203012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622115
3618	NC_010334	CTT	2	6	203051	203056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622115
3619	NC_010334	CGA	2	6	203075	203080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622115
3620	NC_010334	CT	3	6	203089	203094	0 %	50 %	0 %	50 %	167622115
3621	NC_010334	TCA	2	6	203140	203145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622115
3622	NC_010334	AGT	2	6	203149	203154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622115
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3748	NC_010334	GTC	2	6	210188	210193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622118
3749	NC_010334	CGAT	2	8	210275	210282	25 %	25 %	25 %	25 %	167622118
3750	NC_010334	GTT	2	6	210283	210288	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622118
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3752	NC_010334	CGC	2	6	210338	210343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622118
3753	NC_010334	TACT	2	8	210366	210373	25 %	50 %	0 %	25 %	167622118
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3756	NC_010334	CAT	2	6	210414	210419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622118
3757	NC_010334	ATG	2	6	210547	210552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622118
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3759	NC_010334	TGA	2	6	210641	210646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622118
3760	NC_010334	TGG	2	6	210663	210668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622118
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3762	NC_010334	TGA	2	6	210723	210728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622118
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3854	NC_010334	TGAT	2	8	215270	215277	25 %	50 %	25 %	0 %	167622123
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3856	NC_010334	GGC	2	6	215317	215322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3857	NC_010334	TAA	2	6	215344	215349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3858	NC_010334	TAAT	2	8	215375	215382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3859	NC_010334	TAG	2	6	215415	215420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3861	NC_010334	GATA	2	8	215478	215485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3862	NC_010334	GAGG	2	8	215509	215516	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3863	NC_010334	TCACT	2	10	215554	215563	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
3864	NC_010334	CTTT	2	8	215614	215621	0 %	75 %	0 %	25 %	167622124
3865	NC_010334	TAC	2	6	215631	215636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622124
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3867	NC_010334	CAC	2	6	215729	215734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622124
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3992	NC_010334	TG	3	6	222159	222164	0 %	50 %	50 %	0 %	167622129
3993	NC_010334	CGC	2	6	222182	222187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622129
3994	NC_010334	TAA	2	6	222400	222405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3995	NC_010334	GATT	2	8	222456	222463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_010334	GA	3	6	222465	222470	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3997	NC_010334	GACA	2	8	222481	222488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3998	NC_010334	ATT	2	6	222500	222505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_010334	ATCTTA	2	12	222519	222530	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4000	NC_010334	TTA	2	6	222551	222556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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