MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010334	A	6	6	109447	109452	100 %	0 %	0 %	0 %	167622038
2003	NC_010334	GCT	2	6	109530	109535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622038
2004	NC_010334	GTAG	2	8	109564	109571	25 %	25 %	50 %	0 %	167622038
2005	NC_010334	CT	3	6	109585	109590	0 %	50 %	0 %	50 %	167622038
2006	NC_010334	CAG	2	6	109603	109608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622038
2007	NC_010334	AACG	2	8	109699	109706	50 %	0 %	25 %	25 %	167622038
2008	NC_010334	CCA	2	6	109729	109734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622038
2009	NC_010334	ATC	2	6	109809	109814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622038
2010	NC_010334	GTA	2	6	109832	109837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622038
2011	NC_010334	TGT	2	6	109845	109850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622038
2012	NC_010334	GAGG	2	8	109906	109913	25 %	0 %	75 %	0 %	167622038
2013	NC_010334	CAC	2	6	109980	109985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622038
2014	NC_010334	TAA	2	6	110079	110084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622038
2015	NC_010334	CCTT	2	8	110108	110115	0 %	50 %	0 %	50 %	167622038
2016	NC_010334	TGA	2	6	110172	110177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_010334	TCA	2	6	110183	110188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2018	NC_010334	TTA	2	6	110279	110284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2019	NC_010334	GTT	2	6	110363	110368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622039
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2021	NC_010334	TTG	2	6	110527	110532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622039
2022	NC_010334	GTT	2	6	110633	110638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622039
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2030	NC_010334	CAT	2	6	110946	110951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622039
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2051	NC_010334	CAT	2	6	112088	112093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622040
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2053	NC_010334	TAG	3	9	112161	112169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2055	NC_010334	TATT	2	8	112321	112328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2056	NC_010334	AAG	2	6	112419	112424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622041
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2112	NC_010334	A	6	6	115980	115985	100 %	0 %	0 %	0 %	167622044
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2115	NC_010334	CTGAG	2	10	116077	116086	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2116	NC_010334	A	6	6	116093	116098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2118	NC_010334	CAA	2	6	116111	116116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2119	NC_010334	CAA	2	6	116122	116127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2120	NC_010334	GAA	2	6	116194	116199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622045
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2122	NC_010334	CGG	2	6	116248	116253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622045
2123	NC_010334	CGC	2	6	116308	116313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622045
2124	NC_010334	A	6	6	116324	116329	100 %	0 %	0 %	0 %	167622045
2125	NC_010334	TAC	2	6	116366	116371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622045
2126	NC_010334	TAA	2	6	116387	116392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622045
2127	NC_010334	GGT	2	6	116508	116513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622046
2128	NC_010334	ATG	2	6	116544	116549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622046
2129	NC_010334	ACG	2	6	116578	116583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622046
2130	NC_010334	CATGGT	2	12	116742	116753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	167622046
2131	NC_010334	GAA	2	6	116826	116831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622046
2132	NC_010334	CAA	2	6	116838	116843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622046
2133	NC_010334	TTC	2	6	116883	116888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622046
2134	NC_010334	GAT	2	6	117074	117079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622046
2135	NC_010334	GCG	2	6	117148	117153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622046
2136	NC_010334	ATT	2	6	117159	117164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622046
2137	NC_010334	TGA	2	6	117203	117208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622046
2138	NC_010334	GAA	2	6	117336	117341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622046
2139	NC_010334	GAA	2	6	117344	117349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622046
2140	NC_010334	ATC	2	6	117352	117357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622046
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2142	NC_010334	TTG	2	6	117376	117381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622046
2143	NC_010334	GGT	2	6	117459	117464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622046
2144	NC_010334	AC	3	6	117490	117495	50 %	0 %	0 %	50 %	167622046
2145	NC_010334	TGG	2	6	117542	117547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622046
2146	NC_010334	TTA	2	6	117626	117631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622046
2147	NC_010334	TCT	2	6	117832	117837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622046
2148	NC_010334	GTCA	2	8	117841	117848	25 %	25 %	25 %	25 %	167622046
2149	NC_010334	TGT	2	6	117905	117910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622046
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2151	NC_010334	AAG	2	6	118107	118112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622046
2152	NC_010334	TTC	2	6	118131	118136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622046
2153	NC_010334	TTGA	2	8	118167	118174	25 %	50 %	25 %	0 %	167622046
2154	NC_010334	GGT	2	6	118299	118304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622046
2155	NC_010334	TGA	2	6	118405	118410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622046
2156	NC_010334	TGG	2	6	118412	118417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622046
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2159	NC_010334	CTG	2	6	118567	118572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622046
2160	NC_010334	TGG	2	6	118619	118624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622046
2161	NC_010334	TGA	2	6	118703	118708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622046
2162	NC_010334	TA	3	6	118732	118737	50 %	50 %	0 %	0 %	167622046
2163	NC_010334	TCG	2	6	118742	118747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622046
2164	NC_010334	CTAC	2	8	118797	118804	25 %	25 %	0 %	50 %	167622046
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2169	NC_010334	CTG	2	6	118960	118965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622046
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2172	NC_010334	GCT	2	6	119169	119174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622046
2173	NC_010334	ATG	2	6	119197	119202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622046
2174	NC_010334	GTCAG	2	10	119239	119248	20 %	20 %	40 %	20 %	167622046
2175	NC_010334	TGA	2	6	119265	119270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2177	NC_010334	TTGG	2	8	119376	119383	0 %	50 %	50 %	0 %	167622047
2178	NC_010334	CGT	2	6	119393	119398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622047
2179	NC_010334	TGA	2	6	119515	119520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622047
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2189	NC_010334	TTTA	2	8	120663	120670	25 %	75 %	0 %	0 %	167622048
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2193	NC_010334	ATTTTT	2	12	120981	120992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2196	NC_010334	TTG	2	6	121155	121160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2197	NC_010334	T	6	6	121161	121166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2198	NC_010334	GTG	2	6	121207	121212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2199	NC_010334	A	6	6	121237	121242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2200	NC_010334	TAA	2	6	121266	121271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2201	NC_010334	TA	3	6	121280	121285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2202	NC_010334	TTA	2	6	121321	121326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2203	NC_010334	TGG	2	6	121346	121351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2204	NC_010334	T	7	7	121492	121498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2205	NC_010334	TAA	2	6	121508	121513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2206	NC_010334	TTG	2	6	121530	121535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2207	NC_010334	AAC	2	6	121547	121552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2208	NC_010334	ATT	2	6	121580	121585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2209	NC_010334	TGG	2	6	121695	121700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622049
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2222	NC_010334	ATG	2	6	122024	122029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622050
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2224	NC_010334	TGC	2	6	122172	122177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622050
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2230	NC_010334	AACT	2	8	122484	122491	50 %	25 %	0 %	25 %	167622050
2231	NC_010334	TCT	2	6	122522	122527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622050
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2236	NC_010334	GCT	2	6	122641	122646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622050
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2240	NC_010334	AAG	2	6	122810	122815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622050
2241	NC_010334	GAA	3	9	122839	122847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622050
2242	NC_010334	GCTAA	2	10	122860	122869	40 %	20 %	20 %	20 %	167622050
2243	NC_010334	GTT	2	6	122893	122898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622050
2244	NC_010334	GGT	2	6	122908	122913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622050
2245	NC_010334	GCTC	2	8	122964	122971	0 %	25 %	25 %	50 %	167622050
2246	NC_010334	GT	3	6	122984	122989	0 %	50 %	50 %	0 %	167622050
2247	NC_010334	TGG	2	6	122991	122996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622050
2248	NC_010334	GACT	2	8	123039	123046	25 %	25 %	25 %	25 %	167622050
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2251	NC_010334	TTC	2	6	123280	123285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622050
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2253	NC_010334	GTT	2	6	123358	123363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622050
2254	NC_010334	CAA	2	6	123377	123382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622050
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2278	NC_010334	CGG	2	6	125114	125119	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622051
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2358	NC_010334	TGG	3	9	128745	128753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622054
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2362	NC_010334	GT	3	6	128981	128986	0 %	50 %	50 %	0 %	167622054
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2364	NC_010334	GTCA	2	8	129044	129051	25 %	25 %	25 %	25 %	167622054
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2368	NC_010334	GCA	2	6	129184	129189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622054
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2370	NC_010334	GTT	2	6	129253	129258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622054
2371	NC_010334	CCTGAT	2	12	129367	129378	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	167622054
2372	NC_010334	CAT	2	6	129381	129386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622054
2373	NC_010334	CA	3	6	129452	129457	50 %	0 %	0 %	50 %	167622054
2374	NC_010334	G	6	6	129467	129472	0 %	0 %	100 %	0 %	167622054
2375	NC_010334	TCT	2	6	129478	129483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622054
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2380	NC_010334	CGT	2	6	129946	129951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622054
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2383	NC_010334	TGA	2	6	130209	130214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622054
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2390	NC_010334	CGG	2	6	130883	130888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622055
2391	NC_010334	AGA	2	6	130892	130897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622055
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2393	NC_010334	TG	3	6	130975	130980	0 %	50 %	50 %	0 %	167622055
2394	NC_010334	ACT	2	6	130991	130996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622055
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2399	NC_010334	AAC	2	6	131256	131261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622056
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2444	NC_010334	AT	3	6	133917	133922	50 %	50 %	0 %	0 %	167622058
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2489	NC_010334	TAG	2	6	136615	136620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622060
2490	NC_010334	AGCT	2	8	136621	136628	25 %	25 %	25 %	25 %	167622060
2491	NC_010334	ATCA	2	8	136644	136651	50 %	25 %	0 %	25 %	167622060
2492	NC_010334	TGT	2	6	136691	136696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622060
2493	NC_010334	CAT	2	6	136722	136727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622060
2494	NC_010334	GGT	2	6	136728	136733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622060
2495	NC_010334	CAT	2	6	136749	136754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622060
2496	NC_010334	TCG	2	6	136781	136786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622060
2497	NC_010334	ATG	2	6	136794	136799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622060
2498	NC_010334	ATT	2	6	136881	136886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622060
2499	NC_010334	GCA	2	6	136982	136987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622060
2500	NC_010334	TAA	2	6	137017	137022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622060

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