MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010334	GGT	2	6	82515	82520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622013
1502	NC_010334	CAA	2	6	82591	82596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_010334	A	6	6	82617	82622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_010334	GTA	2	6	82693	82698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_010334	GCC	2	6	82724	82729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622014
1506	NC_010334	CAT	2	6	82731	82736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622014
1507	NC_010334	AAGCT	2	10	82753	82762	40 %	20 %	20 %	20 %	167622014
1508	NC_010334	TGA	2	6	82799	82804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622014
1509	NC_010334	GGT	2	6	82855	82860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622014
1510	NC_010334	TGC	2	6	82869	82874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622014
1511	NC_010334	TTG	2	6	82901	82906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622014
1512	NC_010334	GAT	2	6	82927	82932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622014
1513	NC_010334	ATT	2	6	83002	83007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167622014
1514	NC_010334	CTG	2	6	83192	83197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622014
1515	NC_010334	CGG	2	6	83214	83219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622014
1516	NC_010334	A	6	6	83338	83343	100 %	0 %	0 %	0 %	167622014
1517	NC_010334	GAA	2	6	83377	83382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622014
1518	NC_010334	CAA	2	6	83385	83390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622014
1519	NC_010334	TGG	2	6	83450	83455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622014
1520	NC_010334	GACC	2	8	83481	83488	25 %	0 %	25 %	50 %	167622014
1521	NC_010334	A	6	6	83563	83568	100 %	0 %	0 %	0 %	167622014
1522	NC_010334	GGC	2	6	83574	83579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622014
1523	NC_010334	GGC	2	6	83589	83594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622014
1524	NC_010334	GCT	2	6	83641	83646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622014
1525	NC_010334	GCG	2	6	83650	83655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622014
1526	NC_010334	ACC	2	6	83656	83661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622014
1527	NC_010334	AAC	2	6	83671	83676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622014
1528	NC_010334	GC	3	6	83887	83892	0 %	0 %	50 %	50 %	167622014
1529	NC_010334	TGGG	2	8	83932	83939	0 %	25 %	75 %	0 %	167622014
1530	NC_010334	TGA	2	6	84113	84118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622014
1531	NC_010334	CGG	2	6	84168	84173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622014
1532	NC_010334	GTG	2	6	84208	84213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622014
1533	NC_010334	CGA	2	6	84231	84236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622014
1534	NC_010334	GCTG	2	8	84467	84474	0 %	25 %	50 %	25 %	167622015
1535	NC_010334	CAG	2	6	84516	84521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622015
1536	NC_010334	TGGCTT	2	12	84560	84571	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	167622015
1537	NC_010334	GCC	2	6	84591	84596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622015
1538	NC_010334	GCT	2	6	84608	84613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622015
1539	NC_010334	CAGGTA	2	12	84643	84654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	167622015
1540	NC_010334	TGA	2	6	84682	84687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622015
1541	NC_010334	ACT	2	6	84854	84859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622015
1542	NC_010334	GGC	2	6	84944	84949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622015
1543	NC_010334	AAG	2	6	84952	84957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622015
1544	NC_010334	ACT	2	6	84965	84970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622015
1545	NC_010334	GTTT	2	8	85009	85016	0 %	75 %	25 %	0 %	167622015
1546	NC_010334	GGC	2	6	85070	85075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622015
1547	NC_010334	CGG	2	6	85144	85149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622015
1548	NC_010334	GGC	2	6	85397	85402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622015
1549	NC_010334	CGT	2	6	85449	85454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622015
1550	NC_010334	ATTG	2	8	85463	85470	25 %	50 %	25 %	0 %	167622015
1551	NC_010334	CGG	2	6	85511	85516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622015
1552	NC_010334	AAG	2	6	85627	85632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622015
1553	NC_010334	GCG	2	6	85656	85661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622015
1554	NC_010334	TTG	2	6	85713	85718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622015
1555	NC_010334	GCG	2	6	85722	85727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622015
1556	NC_010334	CAC	2	6	85747	85752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622015
1557	NC_010334	TGG	2	6	85801	85806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622015
1558	NC_010334	CTA	2	6	85808	85813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622015
1559	NC_010334	TTC	2	6	85827	85832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622015
1560	NC_010334	GGC	2	6	85847	85852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622015
1561	NC_010334	CAG	2	6	85894	85899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622015
1562	NC_010334	GTA	2	6	85920	85925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_010334	TAAG	2	8	85931	85938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_010334	TTG	2	6	86100	86105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622016
1565	NC_010334	AGAC	2	8	86120	86127	50 %	0 %	25 %	25 %	167622016
1566	NC_010334	CAT	2	6	86139	86144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622016
1567	NC_010334	GATG	2	8	86173	86180	25 %	25 %	50 %	0 %	167622016
1568	NC_010334	AAT	2	6	86195	86200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622016
1569	NC_010334	CCA	2	6	86240	86245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622016
1570	NC_010334	TCT	2	6	86365	86370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622016
1571	NC_010334	CAT	2	6	86431	86436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_010334	TGC	2	6	86539	86544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_010334	AGAA	2	8	86566	86573	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010334	T	6	6	86596	86601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_010334	TGC	2	6	86624	86629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_010334	GCT	2	6	86793	86798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622017
1577	NC_010334	TGT	2	6	86802	86807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622017
1578	NC_010334	TC	3	6	86844	86849	0 %	50 %	0 %	50 %	167622017
1579	NC_010334	TTG	2	6	86867	86872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622017
1580	NC_010334	AC	3	6	86915	86920	50 %	0 %	0 %	50 %	167622017
1581	NC_010334	TAA	2	6	87025	87030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622017
1582	NC_010334	GCG	2	6	87095	87100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167622017
1583	NC_010334	GGT	2	6	87262	87267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622017
1584	NC_010334	A	6	6	87297	87302	100 %	0 %	0 %	0 %	167622017
1585	NC_010334	CGAT	2	8	87315	87322	25 %	25 %	25 %	25 %	167622017
1586	NC_010334	GA	3	6	87430	87435	50 %	0 %	50 %	0 %	167622017
1587	NC_010334	GTC	2	6	87528	87533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622017
1588	NC_010334	A	7	7	87695	87701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_010334	GCA	2	6	87706	87711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_010334	TGC	2	6	87712	87717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1591	NC_010334	T	6	6	87722	87727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_010334	CTT	2	6	87760	87765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622018
1593	NC_010334	GAA	2	6	87858	87863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622018
1594	NC_010334	TTCA	2	8	87876	87883	25 %	50 %	0 %	25 %	167622018
1595	NC_010334	GTT	2	6	87894	87899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622018
1596	NC_010334	TGC	2	6	88067	88072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622018
1597	NC_010334	CGC	2	6	88175	88180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_010334	GTTATT	2	12	88185	88196	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_010334	GGCT	2	8	88221	88228	0 %	25 %	50 %	25 %	167622019
1600	NC_010334	TGA	2	6	88277	88282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622019
1601	NC_010334	CAT	2	6	88290	88295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622019
1602	NC_010334	AGA	2	6	88362	88367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622019
1603	NC_010334	CAT	2	6	88422	88427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622019
1604	NC_010334	AGA	2	6	88430	88435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622019
1605	NC_010334	AC	3	6	88440	88445	50 %	0 %	0 %	50 %	167622019
1606	NC_010334	TGT	2	6	88484	88489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622019
1607	NC_010334	TCT	2	6	88490	88495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167622019
1608	NC_010334	GAC	2	6	88564	88569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622019
1609	NC_010334	TGA	2	6	88631	88636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622019
1610	NC_010334	ATG	2	6	88654	88659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622019
1611	NC_010334	TAA	2	6	88679	88684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622019
1612	NC_010334	GAT	2	6	88743	88748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622019
1613	NC_010334	CGC	2	6	88760	88765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622019
1614	NC_010334	CAA	2	6	88820	88825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622019
1615	NC_010334	CAA	2	6	88832	88837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622019
1616	NC_010334	GAA	2	6	88884	88889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622019
1617	NC_010334	GCA	2	6	88897	88902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622019
1618	NC_010334	AG	3	6	88905	88910	50 %	0 %	50 %	0 %	167622019
1619	NC_010334	TAG	2	6	88917	88922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622019
1620	NC_010334	GGGC	2	8	88930	88937	0 %	0 %	75 %	25 %	167622019
1621	NC_010334	CGA	2	6	89000	89005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622019
1622	NC_010334	CAGT	2	8	89021	89028	25 %	25 %	25 %	25 %	167622019
1623	NC_010334	TG	3	6	89074	89079	0 %	50 %	50 %	0 %	167622019
1624	NC_010334	GTA	2	6	89095	89100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622019
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1879	NC_010334	AAT	2	6	103022	103027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622033
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1881	NC_010334	GCA	2	6	103085	103090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622033
1882	NC_010334	AGG	2	6	103232	103237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	167622033
1883	NC_010334	ATG	2	6	103272	103277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622033
1884	NC_010334	ATG	2	6	103321	103326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622033
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1893	NC_010334	ACA	2	6	103955	103960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167622033
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1994	NC_010334	AGAA	2	8	108700	108707	75 %	0 %	25 %	0 %	167622037
1995	NC_010334	GAA	2	6	108744	108749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167622037
1996	NC_010334	AG	3	6	108771	108776	50 %	0 %	50 %	0 %	167622037
1997	NC_010334	TTG	2	6	108803	108808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622037
1998	NC_010334	CCG	2	6	108867	108872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622037
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