MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shewanella halifaxensis HAW-EB4 chromosome

Total Repeats: 94782

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010334	CTA	2	6	55127	55132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621987
1002	NC_010334	TGC	2	6	55242	55247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621987
1003	NC_010334	TGC	2	6	55313	55318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621987
1004	NC_010334	ATG	2	6	55349	55354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621987
1005	NC_010334	GCG	2	6	55376	55381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621987
1006	NC_010334	AGTTG	2	10	55473	55482	20 %	40 %	40 %	0 %	167621987
1007	NC_010334	ACTCG	2	10	55483	55492	20 %	20 %	20 %	40 %	167621987
1008	NC_010334	TCG	2	6	55584	55589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621987
1009	NC_010334	AAG	2	6	55634	55639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	167621987
1010	NC_010334	GCTA	2	8	55689	55696	25 %	25 %	25 %	25 %	167621987
1011	NC_010334	TGC	2	6	55770	55775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621987
1012	NC_010334	GCT	2	6	55782	55787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621987
1013	NC_010334	TCG	2	6	55813	55818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621987
1014	NC_010334	AAC	2	6	55847	55852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_010334	T	6	6	55888	55893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_010334	T	6	6	56025	56030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_010334	GATA	2	8	56050	56057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_010334	CAT	2	6	56086	56091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621988
1019	NC_010334	TCA	2	6	56096	56101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167621988
1020	NC_010334	AAGC	2	8	56185	56192	50 %	0 %	25 %	25 %	167621988
1021	NC_010334	TTA	2	6	56207	56212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167621988
1022	NC_010334	GTG	3	9	56213	56221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621988
1023	NC_010334	GTA	2	6	56270	56275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621988
1024	NC_010334	ACC	2	6	56276	56281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621988
1025	NC_010334	TGC	2	6	56417	56422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621988
1026	NC_010334	GC	3	6	56444	56449	0 %	0 %	50 %	50 %	167621988
1027	NC_010334	GTCT	2	8	56564	56571	0 %	50 %	25 %	25 %	167621988
1028	NC_010334	AGC	2	6	56684	56689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621988
1029	NC_010334	GGCGA	2	10	56830	56839	20 %	0 %	60 %	20 %	167621988
1030	NC_010334	CAA	2	6	56884	56889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	167621988
1031	NC_010334	GCTT	2	8	56978	56985	0 %	50 %	25 %	25 %	167621988
1032	NC_010334	TCAA	2	8	56996	57003	50 %	25 %	0 %	25 %	167621988
1033	NC_010334	TGA	2	6	57059	57064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621988
1034	NC_010334	GGC	2	6	57103	57108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621988
1035	NC_010334	GTC	2	6	57126	57131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621988
1036	NC_010334	T	6	6	57166	57171	0 %	100 %	0 %	0 %	167621988
1037	NC_010334	TGGC	2	8	57195	57202	0 %	25 %	50 %	25 %	167621988
1038	NC_010334	CAGTA	2	10	57266	57275	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1039	NC_010334	AAT	2	6	57367	57372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_010334	ATT	2	6	57429	57434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_010334	AGA	2	6	57481	57486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_010334	TAT	2	6	57495	57500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_010334	TAAG	2	8	57502	57509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_010334	GCG	2	6	57542	57547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621989
1045	NC_010334	CTC	2	6	57565	57570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	167621989
1046	NC_010334	TGC	2	6	57571	57576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621989
1047	NC_010334	CCG	2	6	57618	57623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167621989
1048	NC_010334	TTC	2	6	57628	57633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621989
1049	NC_010334	GA	3	6	57655	57660	50 %	0 %	50 %	0 %	167621989
1050	NC_010334	TGG	2	6	57676	57681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621989
1051	NC_010334	G	6	6	57721	57726	0 %	0 %	100 %	0 %	167621989
1052	NC_010334	ACC	2	6	57788	57793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167621989
1053	NC_010334	TAA	2	6	57796	57801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167621989
1054	NC_010334	ACG	2	6	57833	57838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621989
1055	NC_010334	G	6	6	57880	57885	0 %	0 %	100 %	0 %	167621989
1056	NC_010334	AT	3	6	57886	57891	50 %	50 %	0 %	0 %	167621989
1057	NC_010334	ATG	2	6	57894	57899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621989
1058	NC_010334	TGA	2	6	57907	57912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621989
1059	NC_010334	TTTTA	2	10	57938	57947	20 %	80 %	0 %	0 %	167621989
1060	NC_010334	GTC	2	6	58025	58030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621989
1061	NC_010334	CGA	2	6	58081	58086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621989
1062	NC_010334	CTT	2	6	58120	58125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	167621989
1063	NC_010334	TAT	2	6	58140	58145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_010334	TAT	2	6	58174	58179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_010334	CTC	3	9	58180	58188	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_010334	A	6	6	58194	58199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_010334	AGTA	2	8	58212	58219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_010334	TGA	3	9	58309	58317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621990
1069	NC_010334	ATGC	2	8	58339	58346	25 %	25 %	25 %	25 %	167621990
1070	NC_010334	GCG	2	6	58351	58356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	167621990
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1073	NC_010334	TGC	2	6	58736	58741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621990
1074	NC_010334	TTCGC	2	10	58804	58813	0 %	40 %	20 %	40 %	167621990
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1086	NC_010334	ATG	2	6	59505	59510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621991
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1089	NC_010334	GCA	2	6	59640	59645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167621991
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1099	NC_010334	TGG	2	6	60236	60241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621992
1100	NC_010334	TGA	2	6	60242	60247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621992
1101	NC_010334	GTT	2	6	60316	60321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167621992
1102	NC_010334	GGT	2	6	60378	60383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621992
1103	NC_010334	TGC	2	6	60423	60428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621992
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1105	NC_010334	GTCA	2	8	60475	60482	25 %	25 %	25 %	25 %	167621992
1106	NC_010334	TGA	2	6	60531	60536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167621992
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1109	NC_010334	TGCCA	2	10	60615	60624	20 %	20 %	20 %	40 %	167621992
1110	NC_010334	GCT	2	6	60633	60638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167621992
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1114	NC_010334	TGACCA	2	12	60746	60757	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	167621992
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1119	NC_010334	CTGC	2	8	61150	61157	0 %	25 %	25 %	50 %	167621992
1120	NC_010334	GTG	2	6	61181	61186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167621992
1121	NC_010334	TTGG	2	8	61233	61240	0 %	50 %	50 %	0 %	167621992
1122	NC_010334	ATT	2	6	61252	61257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	167621992
1123	NC_010334	TCT	2	6	61353	61358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_010334	TTC	2	6	61361	61366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_010334	GATA	2	8	61438	61445	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1127	NC_010334	ATTA	2	8	61477	61484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1256	NC_010334	CCA	2	6	68480	68485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	167622001
1257	NC_010334	AGT	2	6	68551	68556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	167622001
1258	NC_010334	ACGCTC	2	12	68571	68582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	167622001
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1260	NC_010334	ATC	2	6	68662	68667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622001
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1262	NC_010334	ACG	2	6	68802	68807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	167622001
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1277	NC_010334	TGG	2	6	69485	69490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	167622002
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1301	NC_010334	GAA	2	6	71637	71642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1302	NC_010334	AAT	2	6	71672	71677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1304	NC_010334	CTG	2	6	71720	71725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1305	NC_010334	TTG	2	6	71804	71809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1307	NC_010334	GCTTA	2	10	71871	71880	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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1342	NC_010334	TTTA	2	8	73893	73900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1343	NC_010334	ATGG	2	8	73908	73915	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1344	NC_010334	TATT	2	8	73926	73933	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1355	NC_010334	AAT	2	6	74473	74478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622005
1356	NC_010334	TGAG	2	8	74517	74524	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1357	NC_010334	T	6	6	74531	74536	0 %	100 %	0 %	0 %	167622006
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1367	NC_010334	TTAA	2	8	74910	74917	50 %	50 %	0 %	0 %	167622007
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1371	NC_010334	CAT	2	6	75026	75031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	167622007
1372	NC_010334	CCG	2	6	75139	75144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	167622007
1373	NC_010334	A	7	7	75179	75185	100 %	0 %	0 %	0 %	167622007
1374	NC_010334	TTG	2	6	75225	75230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	167622007
1375	NC_010334	ATA	2	6	75309	75314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	167622007
1376	NC_010334	GTTT	2	8	75334	75341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1377	NC_010334	GCA	2	6	75384	75389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1378	NC_010334	A	6	6	75453	75458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_010334	TAAT	2	8	75486	75493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_010334	GCT	2	6	75523	75528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	167622008
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